{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016053476120598],
[350.6604057729783, 841.5459857181183, 0, 1, 0.2941272654430296, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593746, 0.7058727345569704, 1, 0.0008013148996108862],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016489087938152],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008018047335327607],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016543736372312],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008023323224069155],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016543937043075],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 2, 0, 0.294136291864561, 0.005705445125264335, 0, -0.02469837384263187, 1, 0.08651615819183422, 0.001603860220238232],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008013799106733379],
[350.5423251104074, 841.5066476336805, 1, 0, 0.2940670502013534, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.2940670502013534, 0.0008016927149736728],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008013149052597063],
[350.9803602103815, 840.7879961807412, 0, 1, 0.2945038424020669, 0, 0.001189360462497651, 0.005148637606965253, 0.705496157597933, 1, 0.0008016488961321066],
[350.3453798403837, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939788454925572, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060211545074428, 1, 0.0008016052589539364],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022514778413546],
[351.030353907789, 841.076296415185, 0, 1, 0.2944622058879425, 0, 0.001188952779031077, 0.005146872780830596, 0.7055377941120575, 1, 0.0008017991637273887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404097, 841.2260312807151, 1, 0, 0.2940563362788839, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940563362788839, 0.0008016194941855458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016194937870024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016050835629165],
[350.8770340433429, 840.8913223477797, 0, 1, 0.2944171425274776, 0, 0.001189214317502988, 0.005148004958042307, 0.7055828574725224, 1, 0.0008018047766794053],
[351.0423251104074, 840.7260312807151, 0, 1, 0.2945558364827066, 0, 0.001189448123161663, 0.005149017082326686, 0.7054441635172934, 1, 0.0008022514777257318],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008048961476753703],
[350.4063297258131, 841.3620266653095, 1, 0, 0.2940221796011627, 0.002853829726142455, 0, -0.01235397973549285, 1, 0.2940221796011627, 0.000801659827297341],
[350.5073170161656, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941308500813755, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058691499186245, 1, 0.0008024566017555511],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022514872518934],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008013853036127417],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 2, 0.294136291864561, 0, 0.002377482300393299, 0.01029191331616454, 0.4982435744627122, 1, 0.001604037129068778],
[350.4803602103815, 841.2879961807412, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160787, 1, 0.0008022070765569574],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022569157689753],
[350.357351043002, 841.5079783423884, 0, 1, 0.2939571631164663, 0, 0.00118834286273769, 0.005144232506444278, 0.7060428368835336, 1, 0.0008023322131973094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.4050600566804, 836.7877637323027, 1, 2.333333333333333, 0.2945600858894064, 0.002862007779274233, 0.002788441029450559, -0.0003184640373608549, 0.7474821178950024, 0.6874879541259351, 0.001605589573502076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.1108533970685, 837.2376971786956, 0, 2.166666666666667, 0.2942734268336539, 0, 0.002587875192395003, 0.01120268577762956, 0.4699435422424475, 1, 0.0008040729136534016],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2941209993136049, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7058790006863951, 1, 0.0008016227403760463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 0, 0.294136291864561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001914421626566639],
[348.3640064401934, 837.4569172823435, 0.75, 1.75, 0.2937745484761786, 0.00215292046863274, 0.002089659735188501, -0.0002738501922043336, 0.7460510449168163, 0.5808606723354159, 0.0008051724886667644],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0006102498843069431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008017870745946426],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008049231379872913],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.000801710687523611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.3487467926608, 839.4299766542323, 0, 1.5, 0.2938719712106855, 0, 0.001786926892912071, 0.007735450514660797, 0.5933694407297316, 1, 0.0008026505189942536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4063297258131, 841.3620266653095, 1, 0, 0.2940221796011627, 0.002853829726142455, 0, -0.01235397973549285, 1, 0.2940221796011627, 0.0008021684769754079],
[349.1149960365577, 836.7371572834627, 1.6875, 1.5625, 0.2944001029632095, 0.004833650857619685, 0.001867372551104085, -0.01284075982278718, 0.8994548134462511, 0.3778716750495328, 0.0008051169352341431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022089071003866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4803602103815, 841.2260312807151, 0, 1, 0.2940995892216795, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.7059004107783204, 1, 0.0008025614081235041],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008015680811635015],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[351.4080337267733, 840.8300119672825, 1, 1, 0.2947465357240825, 0.002845694759436034, 0.001189301030847256, -0.00717038384229156, 0.9131244796786522, 0.5026175511268172, 0.001605284963710898],
[351.5911485411937, 840.2405162558476, 1, 0, 0.2950006774665335, 0.002844212671875147, 0, -0.01231234834717101, 1, 0.2950006774665335, 0.0008026040532740577],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[351.1892766830236, 840.5454151197497, 0, 1, 0.2946874661773661, 0, 0.001189703711437809, 0.005150123501660402, 0.7053125338226338, 1, 0.0008054615563264397],
[351.3803728155663, 840.4512919814748, 0, 1, 0.2948238272184213, 0, 0.001189836947769297, 0.005150700270107431, 0.7051761727815786, 1, 0.0008022342596763544],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[351.6392829856161, 840.1923818114251, 0, 1, 0.2950410644153319, 0, 0.00119020360294631, 0.005152287488358487, 0.7049589355846682, 1, 0.0008025480156171359],
[351.3803728155663, 840.4186227639191, 0, 1, 0.2948319088360328, 0, 0.001189883199769252, 0.005150900490977281, 0.7051680911639672, 1, 0.0008019598251802253],
[351.4423377155923, 840.3893270814489, 0, 1, 0.2948758185372092, 0, 0.001189924678687741, 0.005151080049594171, 0.7051241814627908, 1, 0.0008019206270054635],
[351.4423377155923, 840.3893270814489, 1, 0, 0.2948758185372092, 0.002845416993581628, 0, -0.01231756175069701, 1, 0.2948758185372092, 0.0008027397877685646],
[351.4423377155923, 840.3893270814489, 0, 1, 0.2948758185372092, 0, 0.001189924678687741, 0.005151080049594171, 0.7051241814627908, 1, 0.0008021643877979129],
[351.4423377155923, 840.5729704401464, 0, 1, 0.2948303896024092, 0, 0.001189664711055809, 0.005149954672411591, 0.7051696103975909, 1, 0.000802744529747311],
[351.4423377155923, 840.4512919814748, 0, 1, 0.2948604883515614, 0, 0.001189836947769297, 0.005150700270107431, 0.7051395116484386, 1, 0.0008027398141997322],
[350.9923314129999, 840.807679181082, 1, 0, 0.2945060650217977, 0.002849065094881906, 0, -0.01233335406273434, 1, 0.2945060650217977, 0.0008018541966712547],
[350.6911359360088, 841.0772204551138, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265668, 0.0008023087584501165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016651309829147],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008017111329608065],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 0, 0.294136291864561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001698289686573254],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008138502517724449],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0006315535883269623],
[350.6604057729783, 841.2049236124121, 0, 1, 0.2942114323887611, 0, 0.001188770978307722, 0.005146085781371011, 0.705788567611239, 1, 0.0008017620135787417],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.605633516326, 841.1627228747966, 0, 0, 0.2941894132665341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002089165142391723],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5739793133667, 841.1943770777559, 0, 1, 0.2941628525655475, 0, 0.001188785882608872, 0.00514615030078949, 0.7058371474344525, 1, 0.0005929644868823059],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.2260312807151, 1, 0, 0.2940563362788839, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940563362788839, 0.0008014045409838962],
[350.9803602103814, 840.7879961807411, 0, 1, 0.2945038424020669, 0, 0.001189360462497652, 0.005148637606965253, 0.705496157597933, 1, 0.0008016053543273586],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008018558746390918],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016598275038866],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008016592966035885],
[350.5739793133667, 841.1943770777558, 0, 1, 0.2941628525655476, 0, 0.001188785882608872, 0.005146150300789491, 0.7058371474344525, 1, 0.0008017991661661779],
[350.7833351388175, 840.7150605123094, 1, 0, 0.2944052097922653, 0.002850762564316986, 0, -0.01234070225972399, 1, 0.2944052097922653, 0.0008011105444985534],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6791647333903, 840.9542112877344, 0, 1, 0.2942844433447403, 0, 0.001189125384685002, 0.005147619975637382, 0.7057155566552598, 1, 0.0008013857275275428],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022569152721849],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008049022329238163],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016053497004464],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008013148996077526],
[350.2085402174008, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463974, 1, 0.0008016486912665821],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008015780178382984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2723643704118, 841.2260312807151, 0, 1, 0.2939763625774719, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.7060236374225282, 1, 0.0008011901576150951],
[350.4073447404096, 841.2260312807151, 1, 0, 0.2940563362788839, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940563362788839, 0.0008016898929757106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.946398083709, 841.1628228385059, 0, 3, 0.2943911446404358, 0, 0.003566491431321814, 0.01543903003943944, 0.3513112582717232, 1, 0.002408029857885213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017129796705439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016194667178138],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008017157312343804],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008028484719346053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008016569879969736],
[350.5423251104074, 841.5066476336805, 1, 1, 0.2940670502013534, 0.002852722562632168, 0.00118834474191262, -0.007204946280087443, 0.9135245699858747, 0.5016586703885815, 0.001604181702537248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008017254754364967],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.8160043563732, 840.6823912947536, 1, 0, 0.2944326283919671, 0.00285049709130191, 0, -0.01233955305021841, 1, 0.2944326283919672, 0.0008013332867434289],
[350.8160043563732, 840.6823912947536, 1, 0, 0.2944326283919671, 0.00285049709130191, 0, -0.01233955305021841, 1, 0.2944326283919672, 0.0008015672270097893],
[350.8160043563732, 840.6823912947536, 0, 0, 0.2944326283919671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003461125792651028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6791647333903, 840.9542112877344, 0, 1, 0.2942844433447403, 0, 0.001189125384685002, 0.005147619975637382, 0.7057155566552598, 1, 0.0004552689593677613],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008026454504151556],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008014390598493642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008025458667198348],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008021387781735152],
[350.7548297686523, 840.5057581545138, 0, 1, 0.2944400522644297, 0, 0.00118975984435334, 0.005150366496151141, 0.7055599477355703, 1, 0.0008024863154756228],
[350.7668009712707, 840.2958266672753, 0, 1, 0.2944990404633185, 0, 0.00119005708259451, 0.005151653214547267, 0.7055009595366815, 1, 0.0008025330759209908],
[350.5698557012469, 840.6897172073228, 0, 1, 0.2942850271039572, 0, 0.001189499502053966, 0.005149239497065915, 0.7057149728960428, 1, 0.0008031758192529739],
[350.2668009712707, 840.6228238024883, 0, 1, 0.2941219687238548, 0, 0.001189594157670597, 0.005149649252966557, 0.7058780312761452, 1, 0.0008020893719879037],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008024922608718417],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008023140220268172],
[350.8848816338415, 840.8127263747022, 0, 1, 0.2944412066247312, 0, 0.001189325480730601, 0.005148486173949718, 0.7055587933752688, 1, 0.000802558713450098],
[350.5818269038653, 840.6440617725522, 0, 1, 0.2943033980678511, 0, 0.001189564103850845, 0.005149519152604648, 0.7056966019321489, 1, 0.0008026497246362245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.4601027197433, 0, 1, 0.2944584275963047, 0, 0.001189824474432496, 0.005150646274121384, 0.7055415724036953, 1, 0.0008027596180754884],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008025259827719022],
[348.6377599149764, 837.2024450607406, 1.5, 0.5, 0.2940006237367501, 0.004302459952604705, 0.0005972271138836964, -0.0160396294794769, 0.956781816621201, 0.2940006237367501, 0.0008032419209394],
[350.8848816338415, 840.8127263747023, 0, 1, 0.2944412066247311, 0, 0.001189325480730601, 0.005148486173949717, 0.7055587933752689, 1, 0.0008022413229963303],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008024653450198581],
[350.8848816338415, 840.4716642689961, 0, 1, 0.2945254993902207, 0, 0.001189808107177241, 0.005150575421702304, 0.7054745006097793, 1, 0.0008024881894159769],
[350.7668009712707, 840.2958266672753, 0, 1, 0.2944990404633185, 0, 0.00119005708259451, 0.005151653214547267, 0.7055009595366815, 1, 0.0008025502124344086],
[351.2548297686523, 840.3430370717689, 0, 1, 0.2947763163591601, 0, 0.001189990225282959, 0.005151363795082429, 0.7052236836408399, 1, 0.0008025079087354241],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008025587135240484],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.00080222967433498],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008021067451405246],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.000802504814836358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008024136311226715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.8848816338415, 840.8127263747023, 0, 1, 0.2944412066247311, 0, 0.001189325480730601, 0.005148486173949717, 0.7055587933752689, 1, 0.0008025298630511737],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008022190517870173],
[350.933016078264, 840.3265568303058, 0, 1, 0.2945898812140739, 0, 0.001190013563027187, 0.005151464822139728, 0.7054101187859261, 1, 0.0008030260166910202],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.000802621977340145],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008039654048312581],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008024822341293809],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008054764118917555],
[350.5818269038653, 840.7094002076637, 0, 1, 0.2942872564871526, 0, 0.001189471653050376, 0.005149118941160686, 0.7057127435128474, 1, 0.0008024859236618513],
[350.7668009712707, 840.7733882902645, 0, 1, 0.2943810071472794, 0, 0.001189381126861695, 0.005148727061193127, 0.7056189928527206, 1, 0.0008025165435085511],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008021347371208071],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008026347406013674],
[350.7048360712447, 840.554736837325, 0, 1, 0.2943983360527938, 0, 0.001189690517672418, 0.005150066387001884, 0.7056016639472062, 1, 0.0008026397651111869],
[350.7375052888005, 840.5220676197692, 0, 1, 0.2944257601493541, 0, 0.001189736758288629, 0.0051502665585925, 0.7055742398506459, 1, 0.0008021347463270614],
[350.7960966537409, 840.4634762548288, 0, 1, 0.2944749445305527, 0, 0.001189819698597824, 0.005150625599950037, 0.7055250554694473, 1, 0.0008026347373065417],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008021347461450837],
[350.6179901456694, 840.7385557571681, 1, 0, 0.2943014762049785, 0.002852106931491266, 0, -0.01234652190785365, 1, 0.2943014762049785, 0.000802223015853972],
[350.9036405942536, 840.2209519443182, 0, 1, 0.2945986026922623, 0, 0.001190163132311738, 0.005152112294514646, 0.7054013973077377, 1, 0.0008021347462930851],
[350.6015099042062, 840.6580630043635, 0, 1, 0.2943115991489414, 0, 0.001189544291559135, 0.005149433386923516, 0.7056884008510586, 1, 0.0008021347463270614],
[351.2048360712447, 840.054736837325, 0, 1, 0.2948180598572197, 0, 0.001190398620648035, 0.00515313170296355, 0.7051819401427804, 1, 0.0008021350628060322],
[350.5853209281136, 840.8316707274647, 1, 1, 0.2942591245412277, 0.002852372704460854, 0.001189298684640205, -0.007199302239822334, 0.9134115676242304, 0.5019298167066855, 0.001261519187014094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4038408849565, 841.1705695176304, 0, 0, 0.2940679472686634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000341544847300498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4331365674267, 841.1412738351602, 0, 1, 0.2940925329615202, 0, 0.001188860933479733, 0.005146475189457253, 0.7059074670384798, 1, 0.0008025198361253288],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.473082997682, 841.1983003991728, 0, 1, 0.2941021223474041, 0, 0.001188780338150316, 0.005146126299312454, 0.7058978776525959, 1, 0.0008021995138471214],
[350.4453521161396, 841.5066476336805, 0, 2, 0.2940096179961064, 0, 0.00237668948382524, 0.01028848128245698, 0.4984224194820037, 1, 0.001605487446931437],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9713416230612, 838.8073225130724, 0, 1.5, 0.294395712323269, 0, 0.001788253344648911, 0.007741192608425859, 0.5927094024808883, 1, 0.0008019957643430092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.936215650455, 840.8321407406676, 1, 0, 0.2944668011769919, 0.002849520669009651, 0, -0.01233532620336019, 1, 0.2944668011769919, 0.0008013533370636516],
[351.1331609204789, 840.6351954706438, 0, 1, 0.2946320558332072, 0, 0.001189576650356797, 0.005149573465333565, 0.7053679441667928, 1, 0.0008014979037575839],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008014160217428094],
[350.936215650455, 840.8321407406676, 1, 0, 0.2944668011769919, 0.002849520669009651, 0, -0.01233532620336019, 1, 0.2944668011769919, 0.0008014160638835265],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008018667721716009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4696381317317, 841.298718259391, 1, 0, 0.2940753010031357, 0.002853314213838198, 0, -0.01235174812773369, 1, 0.2940753010031356, 0.0008010587146840146],
[350.4706531463282, 841.2977032447944, 1, 0, 0.2940761526909583, 0.002853305950220263, 0, -0.01235171235525309, 1, 0.2940761526909583, 0.0008011455767893196],
[350.4875528537552, 841.000187184402, 0, 1, 0.2941595965079178, 0, 0.001189060377439292, 0.005147338564946052, 0.7058404034920822, 1, 0.0008017490060609869],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.605633516326, 841.1627228747966, 1, 0, 0.2941894132665341, 0.002852207450207542, 0, -0.01234695704460078, 1, 0.2941894132665341, 0.0008017084191078758],
[350.4706531463282, 841.1627228747966, 1, 0, 0.294109463698099, 0.002853305950220262, 0, -0.01235171235525309, 1, 0.294109463698099, 0.0008011981193306303],
[350.605633516326, 841.1627228747966, 0, 0, 0.2941894132665341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002167536865639462],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5739793133667, 841.1943770777559, 0, 1, 0.2941628525655475, 0, 0.001188785882608872, 0.00514615030078949, 0.7058371474344525, 1, 0.0005846715971825803],
[350.3040185733711, 841.4643378177516, 0, 1, 0.293936331414396, 0, 0.001188404493282976, 0.005144499299694265, 0.706063668585604, 1, 0.0008009912635307376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017835104381822],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022140696140972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.9803602103815, 840.7879961807412, 1, 0, 0.2945038424020669, 0.002849162270505931, 0, -0.01233377472752699, 1, 0.294503842402067, 0.0008024054804571698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016290739767488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5460436163776, 840.9523520347493, 0, 1, 0.2942060559173579, 0, 0.001189128013710197, 0.005147631356457928, 0.7057939440826422, 1, 0.0008006375472984856],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4092039933947, 841.2241720277301, 0, 1, 0.2940578965347668, 0, 0.001188743777523117, 0.005145968031549173, 0.7059421034652332, 1, 0.000801239746064023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.000801711203006985],
[350.6791647333903, 840.9542112877344, 0, 1, 0.2942844433447403, 0, 0.001189125384685002, 0.005147619975637382, 0.7057155566552598, 1, 0.000801710916846817],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008017620044636695],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.000802243783106934],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0423251104074, 841.3560831459043, 0, 1, 0.2938079509630342, 0, 0.001188557401594949, 0.005145161226427384, 0.7061920490369658, 1, 0.000801672772284722],
[348.3839891277165, 837.4048430606645, 0.75, 1.75, 0.2937993508378482, 0.002152796980934311, 0.00208978968118199, -0.000272753099877637, 0.7460246230600879, 0.5808974713893001, 0.0008029906346523515],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 0, 0.294136291864561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001724395700382263],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0006292131644205268],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008017108105485752],
[350.1800887733191, 841.5882676178035, 0, 1, 0.2938323432531167, 0, 0.001188229492350929, 0.005143741735937605, 0.7061676567468833, 1, 0.000802384466458939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008015828239422862],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008017110025924271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.874755324394, 841.8316361667027, 1, 1, 0.2935914062578962, 0.002858165628648538, 0.001187885982229796, -0.007230494768289929, 0.9138040861715111, 0.5009868986873033, 0.001602121925562612],
[350.2085402174007, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463975, 1, 0.0008017036049575558],
[350.357351043002, 841.4426595510798, 0, 1, 0.29397327397938, 0, 0.001188435110401358, 0.005144631838526764, 0.70602672602062, 1, 0.0008018047335356726],
[350.6773054804053, 841.0910509107174, 1, 0, 0.2942495524401367, 0.00285162451168622, 0, -0.01234443355463448, 1, 0.2942495524401367, 0.0008022460491128653],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3055132116686, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2939136700891457, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7060863299108543, 1, 0.0008016196688860312],
[350.473082997682, 841.2952733934407, 0, 1, 0.294078191553075, 0, 0.001188643311837959, 0.005145533124369117, 0.705921808446925, 1, 0.0008022856926962695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.530353907789, 841.2390174979299, 0, 1, 0.294125996453769, 0, 0.001188722799584674, 0.005145877219885101, 0.705874003546231, 1, 0.000801173649468248],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017147391431685],
[350.530353907789, 841.2390174979299, 0, 1, 0.294125996453769, 0, 0.001188722799584674, 0.005145877219885101, 0.705874003546231, 1, 0.0008017108515957663],
[350.2085402174007, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463975, 1, 0.0008016053497004464],
[350.5423251104074, 841.1933620631594, 0, 1, 0.294144355063988, 0, 0.001188787317041283, 0.005146156510322169, 0.705855644936012, 1, 0.0008018674964028904],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022505875236127],
[350.4423528346515, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2940284814018075, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7059715185981925, 1, 0.0008023433033321051],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008014394655204315],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.6690601126681, 839.1097041619918, 0.5, 1, 0.2941414084949782, 0.001429923482045833, 0.001191739286341215, -0.001031078588920209, 0.7783728958478695, 0.4069701448530108, 0.00080142399618013],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017130269059821],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017130499112283],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016053475511277],
[350.3453798403837, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2939710372083457, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7060289627916543, 1, 0.0008030869231729185],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008016598357254556],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008023842578218143],
[349.9399341564252, 841.4345316946496, 1, 1, 0.2937279119092424, 0.002857633274723639, 0.001188446590117949, -0.007225763432020487, 0.9137239137654363, 0.5011797375839211, 0.001603503646333666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2411296334163, 841.3302814876824, 1, 0, 0.2939321356358235, 0.00285517580715509, 0, -0.01235980680267913, 1, 0.2939321356358235, 0.0008017134501475399],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017108614932706],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008013067703430722],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008015067789093633],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016050516375709],
[350.4803602103814, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160787, 1, 0.0008022614605260754],
[350.7085402174008, 841.4978512736959, 0, 1, 0.2941676396976604, 0, 0.001188357163938558, 0.005144294415094293, 0.7058323603023395, 1, 0.0008021378340276186],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016053475226108],
[350.3935142848061, 841.540133173381, 1, 0, 0.2939706543497824, 0.002853934103321279, 0, -0.0123544315751875, 1, 0.2939706543497824, 0.0008017417037614729],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008021433588347947],
[350.840451335575, 841.8039752554954, 0, 1, 0.294170201539767, 0, 0.001187925015080252, 0.005142423680414739, 0.7058297984602331, 1, 0.0008016173080579699],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6604057729783, 841.5459857181182, 0, 1, 0.2941272654430297, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593747, 0.7058727345569703, 1, 0.0008016870426845635],
[350.4803602103815, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160786, 1, 0.0008022288396155008],
[350.6911359360088, 841.0772204551138, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265668, 0.0008022557226683046],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008018047335580395],
[350.857351043002, 841.191621701086, 0, 1, 0.2943313228443383, 0, 0.001188789776552656, 0.005146167157332176, 0.7056686771556617, 1, 0.0008016926012650245],
[350.8770340433429, 840.8913223477797, 0, 1, 0.2944171425274776, 0, 0.001189214317502988, 0.005148004958042307, 0.7055828574725224, 1, 0.0008013371357541227],
[350.7085402174007, 841.0598161737219, 0, 1, 0.294275761171748, 0, 0.001188976076100453, 0.005146973631810011, 0.705724238828252, 1, 0.000802093357664993],
[350.2272991778128, 841.2604408603444, 0, 1, 0.2939411690183206, 0, 0.001188692527818514, 0.005145746176052219, 0.7060588309816793, 1, 0.000802207067475956],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016541565917392],
[350.357351043002, 841.4426595510798, 0, 1, 0.29397327397938, 0, 0.001188435110401358, 0.005144631838526764, 0.70602672602062, 1, 0.0008017991632061753],
[350.2117429762784, 841.5566134148442, 1, 0, 0.2938589039541032, 0.002855415388134872, 0, -0.01236084392782437, 1, 0.2938589039541033, 0.0008013522998888194],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008014609291170862],
[350.5423251104074, 841.2587004982709, 1, 0, 0.2941282291071851, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.2941282291071851, 0.0008015142132478158],
[350.5106709074482, 841.2576854836744, 0, 1, 0.2941097311635746, 0, 0.001188696421150742, 0.005145763029947533, 0.7058902688364255, 1, 0.0008023323334169116],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016598279886367],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008023843575534459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008013255193878347],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016053476565089],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022070671508144],
[350.3935142848061, 841.3748421063165, 1, 0, 0.2940114263025554, 0.002853934103321279, 0, -0.0123544315751875, 1, 0.2940114263025555, 0.0008016981266112939],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008018047318325358],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016541055180883],
[350.6604057729783, 841.5459857181183, 0, 1, 0.2941272654430296, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593746, 0.7058727345569704, 1, 0.0008013148996077526],
[350.3761100034142, 841.3922463877085, 0, 1, 0.293996822557374, 0, 0.001188506317110992, 0.005144940086156183, 0.7060031774426261, 1, 0.0008022505874572219],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.00080162713074632],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 1, 1, 0.2941849072902791, 0.002852722562632168, 0.001189019519816331, -0.007202025225452669, 0.9134552403226098, 0.5018250549031682, 0.001606125996951353],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017143644037401],
[350.5130294279372, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2941117101727305, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7058882898272695, 1, 0.0008016543736167873],
[350.4803602103814, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160787, 1, 0.0008018047318325358],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008013853037410547],
[350.4073447404096, 841.2260312807151, 1, 1, 0.2940563362788839, 0.002853821459538255, 0.001188741150196649, -0.007207987292002699, 0.9135308710942399, 0.5016435436520078, 0.001603860294378866],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016595619024452],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008017991735269429],
[350.2085402174008, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463974, 1, 0.000801605280749535],
[350.6604057729783, 841.2049236124121, 0, 1, 0.2942114323887611, 0, 0.001188770978307722, 0.005146085781371011, 0.705788567611239, 1, 0.0008013149002867422],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022460490970895],
[350.7076161774719, 841.0607402136507, 0, 1, 0.2942749858197899, 0, 0.001188974769819805, 0.005146967977035129, 0.7057250141802101, 1, 0.0008017471617602764],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017991599599108],
[350.5130294279372, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2941117101727305, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7058882898272695, 1, 0.0008022070768821384],
[350.5739793133667, 841.1943770777559, 0, 1, 0.2941628525655475, 0, 0.001188785882608872, 0.00514615030078949, 0.7058371474344525, 1, 0.0008018047335609507],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008016543937043075],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017144912331103],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 2, 0.294136291864561, 0, 0.002377482300393299, 0.01029191331616454, 0.4982435744627122, 1, 0.001604297576439058],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017143646094545],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016053475093762],
[350.9803602103815, 841.1252750979961, 0, 1, 0.2944205193020405, 0, 0.001188883546370062, 0.005146573078685309, 0.7055794806979595, 1, 0.0008049083211269679],
[350.7085402174008, 841.0598161737219, 0, 1, 0.2942757611717481, 0, 0.001188976076100453, 0.005146973631810011, 0.7057242388282519, 1, 0.0008022560245800825],
[350.8399467616101, 840.7314643594888, 0, 1, 0.2944346796903424, 0, 0.001189440436562999, 0.005148983807712137, 0.7055653203096576, 1, 0.0008021650839835083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6911359360088, 841.0772204551139, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265667, 0.0008020764640006058],
[350.3453798403837, 841.2260312807151, 0, 1, 0.2940196253204486, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.7059803746795514, 1, 0.000802456649229755],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.000801648969385696],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016052587683909],
[350.6911359360088, 841.0772204551138, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265668, 0.0008021160459229236],
[350.6604057729783, 841.5459857181182, 0, 1, 0.2941272654430297, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593747, 0.7058727345569703, 1, 0.0008013350215289862],
[350.6773054804053, 841.0910509107173, 1, 0, 0.2942495524401368, 0.00285162451168622, 0, -0.01234443355463448, 1, 0.2942495524401367, 0.0008022079276281259],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008018047318578129],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008016485544992442],
[350.6911359360088, 840.9119293880493, 1, 0, 0.2943019753315571, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.294301975331557, 0.0008022070669384912],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008017417364055366],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017991637273887],
[350.7412094349565, 841.0271469561661, 0, 1, 0.2943031735605572, 0, 0.001189022261194762, 0.00514717356305116, 0.7056968264394428, 1, 0.000800954075374861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008014609264415202],
[350.5423251104074, 841.0686125337064, 0, 1, 0.2941751489823101, 0, 0.001188963641132101, 0.005146919801917632, 0.7058248510176899, 1, 0.0008044761881985972],
[350.6773054804053, 841.0910509107173, 1, 0, 0.2942495524401368, 0.00285162451168622, 0, -0.01234443355463448, 1, 0.2942495524401367, 0.0008022569152721849],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.00080179916220787],
[350.5423251104074, 841.2587004982709, 1, 0, 0.2941282291071851, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.2941282291071851, 0.0008017991621998825],
[350.3453798403837, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2939710372083457, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7060289627916543, 1, 0.0008022614515589994],
[350.3453798403837, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2939710372083457, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7060289627916543, 1, 0.0008022288395641295],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 1, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0.001188550439291267, -0.007208812862862389, 0.9135504570716364, 0.5015965196496071, 0.001603060485796633],
[350.4380749034402, 841.0496651347171, 0, 1, 0.2941180703145275, 0, 0.001188990426433167, 0.0051470357531475, 0.7058819296854726, 1, 0.0008028425389067069],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016052589187749],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017991637273887],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022614605260754]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1"],
["epi_isl_417281_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1"],
["epi_isl_422856_Netherlands_20200318_null_3"],
["epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1"],
["epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2"],
["epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7"],
["epi_isl_422012_England_20200402_null_8"],
["epi_isl_417377_Washington_20200315_null_7"],
["epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_421917_England_20200327_null_1"],
["Node233"],
["epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1"],
["epi_isl_421860_England_20200327_null_1"],
["Node230"],
["epi_isl_421871_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_2"],
["epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1"],
["epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2"],
["epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2"],
["epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1"],
["epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1"],
["epi_isl_420745_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_417259_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_421898_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_3929"],
["epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6"],
["Node224"],
["epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1"],
["Node223"],
["epi_isl_421426_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2"],
["Node219"],
["epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1"],
["epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_414485_USA_20200224_null_1"],
["epi_isl_420727_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1"],
["epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_41"],
["Node243"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4"],
["epi_isl_415137_England_20200302_null_1"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10"],
["epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1"],
["Node277"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node274"],
["epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_421672_India_20200312_null_74"],
["epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2"],
["epi_isl_421670_India_20200312_null_2"],
["epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1"],
["epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2"],
["epi_isl_422413_Taipei_20200316_null_5"],
["Node254"],
["epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3"],
["epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3"],
["epi_isl_421955_England_20200330_null_1"],
["Node287"],
["epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1"],
["Node294"],
["epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_420461_England_20200310_null_1"],
["epi_isl_422685_Netherlands_20200319_null_10"],
["Node300"],
["epi_isl_420641_England_20200325_null_1"],
["Node299"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6"],
["Node304"],
["epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1"],
["epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2"],
["epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4"],
["epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4"],
["epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2"],
["epi_isl_422417_Taipei_20200318_null_5"],
["Node120"],
["epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1"],
["epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2"],
["epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_421940_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_420648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420758_England_20200327_null_7"],
["Node309"],
["epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12"],
["epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2"],
["Node312"],
["epi_isl_417257_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3"],
["epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2"],
["epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1"],
["Node330"],
["epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1"],
["Node326"],
["epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2"],
["epi_isl_420743_England_20200327_null_1"],
["Node334"],
["epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1"],
["epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1"],
["epi_isl_421855_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_422796_Netherlands_20200330_null_31"],
["epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2"],
["Node523"],
["epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1"],
["Node522"],
["epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1"],
["epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1"],
["Node458"],
["epi_isl_420657_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_421783_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1"],
["epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_421963_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21"],
["epi_isl_421879_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1"],
["epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1"],
["epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2"],
["Node437"],
["epi_isl_420691_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1"],
["epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4"],
["epi_isl_417279_England_20200307_null_1"],
["epi_isl_422365_Wales_20200327_null_29"],
["epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1"],
["epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1"],
["epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_421803_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_421804_England_20200325_null_1"],
["Node423"],
["epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2"],
["epi_isl_421948_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_422940_Zuid_Holland_20200324_null_930"],
["epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1"],
["epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1"],
["epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2"],
["epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1"],
["Node415"],
["epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1"],
["epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4"],
["epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1"],
["epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2"],
["epi_isl_417297_England_20200306_null_2"],
["epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3"],
["epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1"],
["epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7"],
["epi_isl_421850_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1"],
["epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1"],
["Node352"],
["epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1"],
["Node351"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1"],
["Node348"],
["epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2"],
["epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_6"],
["epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1"],
["epi_isl_422007_England_20200331_null_6"],
["epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4"],
["epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1"],
["epi_isl_418669_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_421929_England_20200329_null_1"],
["Node495"],
["epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207"],
["epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1"],
["Node478"],
["epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1"],
["Node468"],
["epi_isl_422262_Wales_20200325_null_4"],
["Node467"],
["epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1"],
["Node492"],
["epi_isl_418922_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_421872_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_30"],
["Node519"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420524_England_20200326_null_8"],
["epi_isl_422872_Noord_Brabant_20200309_null_57"],
["Node513"],
["epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1"],
["Node512"],
["epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1"],
["epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8"],
["epi_isl_414617_USA_20200308_null_1"],
["epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2"],
["epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["Node543"],
["epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["Node539"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1"],
["epi_isl_422238_Wales_20200325_null_2"],
["Node556"],
["epi_isl_421842_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1"],
["epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4"],
["Node549"],
["epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4"],
["epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1"],
["Node552"],
["epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_5"],
["epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_421843_England_20200324_null_4"],
["epi_isl_421844_England_20200324_null_1"],
["Node565"],
["epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8"],
["epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_10"],
["epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3"],
["Node570"],
["epi_isl_422072_Wales_20200328_null_3"],
["epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1"],
["epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3"],
["epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1"],
["epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1"],
["epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1"],
["epi_isl_421878_England_20200327_null_1"],
["Node583"],
["epi_isl_421877_England_20200327_null_1"],
["epi_isl_421653_Latvia_20200325_null_2"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1"],
["epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12"],
["Node599"],
["epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_406034_California_20200123_null_1"],
["epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1"],
["Node43"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2"],
["epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1"],
["epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2"],
["Node57"],
["epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3"],
["epi_isl_422777_Netherlands_20200329_null_1"],
["epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_2"],
["epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2"],
["epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2"],
["epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_413607_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_421906_England_20200327_null_1"],
["Node622"],
["epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3"],
["epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1"],
["epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1"],
["epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1"],
["Node630"],
["epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10"],
["epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1"],
["epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2"],
["epi_isl_422508_New_York_20200320_null_2"],
["epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3"],
["epi_isl_416650_USA_20200310_null_1"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_418060_USA_20200314_null_1"],
["epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_27"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1"],
["epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1"],
["epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1"],
["epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_421989_England_20200402_null_16"],
["epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_1"],
["epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1"],
["epi_isl_418908_Washington_20200316_null_4"],
["epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1"],
["epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1"],
["epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2"],
["epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5"],
["epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_420772_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_417253_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4"],
["Node81"],
["epi_isl_421720_New_York_20200318_null_8"],
["epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1"],
["epi_isl_418754_England_20200317_null_2"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3"],
["epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1"],
["epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_422203_Wales_20200327_null_6"],
["epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1"],
["epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1"],
["epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1"],
["epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4"],
["Node17"],
["epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2"],
["epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1"],
["epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1"],
["epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016053476120598],
[350.6604057729783, 841.5459857181183, 0, 1, 0.2941272654430296, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593746, 0.7058727345569704, 1, 0.0008013148996108862],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016489087938152],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008018047335327607],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016543736372312],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008023323224069155],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016543937043075],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 2, 0, 0.294136291864561, 0.005705445125264335, 0, -0.02469837384263187, 1, 0.08651615819183422, 0.001603860220238232],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008013799106733379],
[350.5423251104074, 841.5066476336805, 1, 0, 0.2940670502013534, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.2940670502013534, 0.0008016927149736728],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008013149052597063],
[350.9803602103815, 840.7879961807412, 0, 1, 0.2945038424020669, 0, 0.001189360462497651, 0.005148637606965253, 0.705496157597933, 1, 0.0008016488961321066],
[350.3453798403837, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939788454925572, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060211545074428, 1, 0.0008016052589539364],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022514778413546],
[351.030353907789, 841.076296415185, 0, 1, 0.2944622058879425, 0, 0.001188952779031077, 0.005146872780830596, 0.7055377941120575, 1, 0.0008017991637273887],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404097, 841.2260312807151, 1, 0, 0.2940563362788839, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940563362788839, 0.0008016194941855458],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016194937870024],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016050835629165],
[350.8770340433429, 840.8913223477797, 0, 1, 0.2944171425274776, 0, 0.001189214317502988, 0.005148004958042307, 0.7055828574725224, 1, 0.0008018047766794053],
[351.0423251104074, 840.7260312807151, 0, 1, 0.2945558364827066, 0, 0.001189448123161663, 0.005149017082326686, 0.7054441635172934, 1, 0.0008022514777257318],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008048961476753703],
[350.4063297258131, 841.3620266653095, 1, 0, 0.2940221796011627, 0.002853829726142455, 0, -0.01235397973549285, 1, 0.2940221796011627, 0.000801659827297341],
[350.5073170161656, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941308500813755, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058691499186245, 1, 0.0008024566017555511],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022514872518934],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008013853036127417],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 2, 0.294136291864561, 0, 0.002377482300393299, 0.01029191331616454, 0.4982435744627122, 1, 0.001604037129068778],
[350.4803602103815, 841.2879961807412, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160787, 1, 0.0008022070765569574],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022569157689753],
[350.357351043002, 841.5079783423884, 0, 1, 0.2939571631164663, 0, 0.00118834286273769, 0.005144232506444278, 0.7060428368835336, 1, 0.0008023322131973094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.4050600566804, 836.7901950275129, 1, 1, 0.2945594821418169, 0.002862007779274233, 0.001195042683270352, -0.007216146368915451, 0.9132347114803445, 0.5023536757639785, 0.001605589573502076],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.1108201632534, 837.237699985305, 0, 1, 0.2942734063675796, 0, 0.001194403930947629, 0.005170470341573368, 0.7057265936324204, 1, 0.0008040729136534016],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2941209993136049, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7058790006863951, 1, 0.0008016227403760463],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 0, 0.294136291864561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001914421626566639],
[348.3643220858204, 837.4566016367165, 1, 1, 0.2937748146593946, 0.002870558023888702, 0.001194091727315315, -0.007257276236693928, 0.9136963582718383, 0.5012459875906276, 0.0008051724886667644],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0006102498843069431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008017870745946426],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008049231379872913],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.000801710687523611],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.3488544444062, 839.4299257587842, 0, 1, 0.2938720477368332, 0, 0.001191284667503451, 0.005156967322445761, 0.7061279522631668, 1, 0.0008026505189942536],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4063297258131, 841.3620266653095, 1, 0, 0.2940221796011627, 0.002853829726142455, 0, -0.01235397973549285, 1, 0.2940221796011627, 0.0008021684769754079],
[349.1144831779463, 836.7378726570547, 1, 0, 0.2943996202057737, 0.002864389901264257, 0, -0.01239969381165616, 1, 0.2943996202057737, 0.0008051169352341431],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022089071003866],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4803602103815, 841.2260312807151, 0, 1, 0.2940995892216795, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.7059004107783204, 1, 0.0008025614081235041],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008015680811635015],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[351.4080337267733, 840.8300119672825, 1, 1, 0.2947465357240825, 0.002845694759436034, 0.001189301030847256, -0.00717038384229156, 0.9131244796786522, 0.5026175511268172, 0.001605284963710898],
[351.5911485411937, 840.2405162558476, 1, 0, 0.2950006774665335, 0.002844212671875147, 0, -0.01231234834717101, 1, 0.2950006774665335, 0.0008026040532740577],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[351.1892766830236, 840.5454151197497, 0, 1, 0.2946874661773661, 0, 0.001189703711437809, 0.005150123501660402, 0.7053125338226338, 1, 0.0008054615563264397],
[351.3803728155663, 840.4512919814748, 0, 1, 0.2948238272184213, 0, 0.001189836947769297, 0.005150700270107431, 0.7051761727815786, 1, 0.0008022342596763544],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[351.6392829856161, 840.1923818114251, 0, 1, 0.2950410644153319, 0, 0.00119020360294631, 0.005152287488358487, 0.7049589355846682, 1, 0.0008025480156171359],
[351.3803728155663, 840.4186227639191, 0, 1, 0.2948319088360328, 0, 0.001189883199769252, 0.005150900490977281, 0.7051680911639672, 1, 0.0008019598251802253],
[351.4423377155923, 840.3893270814489, 0, 1, 0.2948758185372092, 0, 0.001189924678687741, 0.005151080049594171, 0.7051241814627908, 1, 0.0008019206270054635],
[351.4423377155923, 840.3893270814489, 1, 0, 0.2948758185372092, 0.002845416993581628, 0, -0.01231756175069701, 1, 0.2948758185372092, 0.0008027397877685646],
[351.4423377155923, 840.3893270814489, 0, 1, 0.2948758185372092, 0, 0.001189924678687741, 0.005151080049594171, 0.7051241814627908, 1, 0.0008021643877979129],
[351.4423377155923, 840.5729704401464, 0, 1, 0.2948303896024092, 0, 0.001189664711055809, 0.005149954672411591, 0.7051696103975909, 1, 0.000802744529747311],
[351.4423377155923, 840.4512919814748, 0, 1, 0.2948604883515614, 0, 0.001189836947769297, 0.005150700270107431, 0.7051395116484386, 1, 0.0008027398141997322],
[350.9923314129999, 840.807679181082, 1, 0, 0.2945060650217977, 0.002849065094881906, 0, -0.01233335406273434, 1, 0.2945060650217977, 0.0008018541966712547],
[350.6911359360088, 841.0772204551138, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265668, 0.0008023087584501165],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016651309829147],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008017111329608065],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 0, 0.294136291864561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001698289686573254],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008138502517724449],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0006315535883269623],
[350.6604057729783, 841.2049236124121, 0, 1, 0.2942114323887611, 0, 0.001188770978307722, 0.005146085781371011, 0.705788567611239, 1, 0.0008017620135787417],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.605633516326, 841.1627228747966, 0, 0, 0.2941894132665341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002089165142391723],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5739793133667, 841.1943770777559, 0, 1, 0.2941628525655475, 0, 0.001188785882608872, 0.00514615030078949, 0.7058371474344525, 1, 0.0005929644868823059],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.2260312807151, 1, 0, 0.2940563362788839, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940563362788839, 0.0008014045409838962],
[350.9803602103814, 840.7879961807411, 0, 1, 0.2945038424020669, 0, 0.001189360462497652, 0.005148637606965253, 0.705496157597933, 1, 0.0008016053543273586],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008018558746390918],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016598275038866],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008016592966035885],
[350.5739793133667, 841.1943770777558, 0, 1, 0.2941628525655476, 0, 0.001188785882608872, 0.005146150300789491, 0.7058371474344525, 1, 0.0008017991661661779],
[350.7833351388175, 840.7150605123094, 1, 0, 0.2944052097922653, 0.002850762564316986, 0, -0.01234070225972399, 1, 0.2944052097922653, 0.0008011105444985534],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6791647333903, 840.9542112877344, 0, 1, 0.2942844433447403, 0, 0.001189125384685002, 0.005147619975637382, 0.7057155566552598, 1, 0.0008013857275275428],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022569152721849],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008049022329238163],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016053497004464],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008013148996077526],
[350.2085402174008, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463974, 1, 0.0008016486912665821],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008015780178382984],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2723643704118, 841.2260312807151, 0, 1, 0.2939763625774719, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.7060236374225282, 1, 0.0008011901576150951],
[350.4073447404096, 841.2260312807151, 1, 0, 0.2940563362788839, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940563362788839, 0.0008016898929757106],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.946398083709, 841.1628228385059, 0, 3, 0.2943911446404358, 0, 0.003566491431321814, 0.01543903003943944, 0.3513112582717232, 1, 0.002408029857885213],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017129796705439],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016194667178138],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008017157312343804],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008028484719346053],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008016569879969736],
[350.5423251104074, 841.5066476336805, 1, 1, 0.2940670502013534, 0.002852722562632168, 0.00118834474191262, -0.007204946280087443, 0.9135245699858747, 0.5016586703885815, 0.001604181702537248],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008017254754364967],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.8160043563732, 840.6823912947536, 1, 0, 0.2944326283919671, 0.00285049709130191, 0, -0.01233955305021841, 1, 0.2944326283919672, 0.0008013332867434289],
[350.8160043563732, 840.6823912947536, 1, 0, 0.2944326283919671, 0.00285049709130191, 0, -0.01233955305021841, 1, 0.2944326283919672, 0.0008015672270097893],
[350.8160043563732, 840.6823912947536, 0, 0, 0.2944326283919671, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003461125792651028],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6791647333903, 840.9542112877344, 0, 1, 0.2942844433447403, 0, 0.001189125384685002, 0.005147619975637382, 0.7057155566552598, 1, 0.0004552689593677613],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008026454504151556],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008014390598493642],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008025458667198348],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008021387781735152],
[350.7548297686523, 840.5057581545138, 0, 1, 0.2944400522644297, 0, 0.00118975984435334, 0.005150366496151141, 0.7055599477355703, 1, 0.0008024863154756228],
[350.7668009712707, 840.2958266672753, 0, 1, 0.2944990404633185, 0, 0.00119005708259451, 0.005151653214547267, 0.7055009595366815, 1, 0.0008025330759209908],
[350.5698557012469, 840.6897172073228, 0, 1, 0.2942850271039572, 0, 0.001189499502053966, 0.005149239497065915, 0.7057149728960428, 1, 0.0008031758192529739],
[350.2668009712707, 840.6228238024883, 0, 1, 0.2941219687238548, 0, 0.001189594157670597, 0.005149649252966557, 0.7058780312761452, 1, 0.0008020893719879037],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008024922608718417],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008023140220268172],
[350.8848816338415, 840.8127263747022, 0, 1, 0.2944412066247312, 0, 0.001189325480730601, 0.005148486173949718, 0.7055587933752688, 1, 0.000802558713450098],
[350.5818269038653, 840.6440617725522, 0, 1, 0.2943033980678511, 0, 0.001189564103850845, 0.005149519152604648, 0.7056966019321489, 1, 0.0008026497246362245],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.4601027197433, 0, 1, 0.2944584275963047, 0, 0.001189824474432496, 0.005150646274121384, 0.7055415724036953, 1, 0.0008027596180754884],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008025259827719022],
[348.6377599149764, 837.2019571861794, 1, 0, 0.2940007446935904, 0.002868306635069803, 0, -0.01241664901035628, 1, 0.2940007446935904, 0.0008032419209394],
[350.8848816338415, 840.8127263747023, 0, 1, 0.2944412066247311, 0, 0.001189325480730601, 0.005148486173949717, 0.7055587933752689, 1, 0.0008022413229963303],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008024653450198581],
[350.8848816338415, 840.4716642689961, 0, 1, 0.2945254993902207, 0, 0.001189808107177241, 0.005150575421702304, 0.7054745006097793, 1, 0.0008024881894159769],
[350.7668009712707, 840.2958266672753, 0, 1, 0.2944990404633185, 0, 0.00119005708259451, 0.005151653214547267, 0.7055009595366815, 1, 0.0008025502124344086],
[351.2548297686523, 840.3430370717689, 0, 1, 0.2947763163591601, 0, 0.001189990225282959, 0.005151363795082429, 0.7052236836408399, 1, 0.0008025079087354241],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008025587135240484],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.00080222967433498],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008021067451405246],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.000802504814836358],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008024136311226715],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.8848816338415, 840.8127263747023, 0, 1, 0.2944412066247311, 0, 0.001189325480730601, 0.005148486173949717, 0.7055587933752689, 1, 0.0008025298630511737],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008022190517870173],
[350.933016078264, 840.3265568303058, 0, 1, 0.2945898812140739, 0, 0.001190013563027187, 0.005151464822139728, 0.7054101187859261, 1, 0.0008030260166910202],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.000802621977340145],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008039654048312581],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 0, 1, 0.2944503523399534, 0, 0.001189778226997769, 0.00515044607301401, 0.7055496476600467, 1, 0.0008024822341293809],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008054764118917555],
[350.5818269038653, 840.7094002076637, 0, 1, 0.2942872564871526, 0, 0.001189471653050376, 0.005149118941160686, 0.7057127435128474, 1, 0.0008024859236618513],
[350.7668009712707, 840.7733882902645, 0, 1, 0.2943810071472794, 0, 0.001189381126861695, 0.005148727061193127, 0.7056189928527206, 1, 0.0008025165435085511],
[350.6318206012729, 840.6277523072969, 1, 0, 0.2943370433911167, 0.002851994431894895, 0, -0.01234603490692255, 1, 0.2943370433911168, 0.0008021347371208071],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008026347406013674],
[350.7048360712447, 840.554736837325, 0, 1, 0.2943983360527938, 0, 0.001189690517672418, 0.005150066387001884, 0.7056016639472062, 1, 0.0008026397651111869],
[350.7375052888005, 840.5220676197692, 0, 1, 0.2944257601493541, 0, 0.001189736758288629, 0.0051502665585925, 0.7055742398506459, 1, 0.0008021347463270614],
[350.7960966537409, 840.4634762548288, 0, 1, 0.2944749445305527, 0, 0.001189819698597824, 0.005150625599950037, 0.7055250554694473, 1, 0.0008026347373065417],
[350.7668009712707, 840.492771937299, 1, 0, 0.2944503523399534, 0.002850896941304044, 0, -0.0123412839659694, 1, 0.2944503523399533, 0.0008021347461450837],
[350.6179901456694, 840.7385557571681, 1, 0, 0.2943014762049785, 0.002852106931491266, 0, -0.01234652190785365, 1, 0.2943014762049785, 0.000802223015853972],
[350.9036405942536, 840.2209519443182, 0, 1, 0.2945986026922623, 0, 0.001190163132311738, 0.005152112294514646, 0.7054013973077377, 1, 0.0008021347462930851],
[350.6015099042062, 840.6580630043635, 0, 1, 0.2943115991489414, 0, 0.001189544291559135, 0.005149433386923516, 0.7056884008510586, 1, 0.0008021347463270614],
[351.2048360712447, 840.054736837325, 0, 1, 0.2948180598572197, 0, 0.001190398620648035, 0.00515313170296355, 0.7051819401427804, 1, 0.0008021350628060322],
[350.5853209281136, 840.8316707274647, 1, 1, 0.2942591245412277, 0.002852372704460854, 0.001189298684640205, -0.007199302239822334, 0.9134115676242304, 0.5019298167066855, 0.001261519187014094],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4038408849565, 841.1705695176304, 0, 0, 0.2940679472686634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000341544847300498],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4331365674267, 841.1412738351602, 0, 1, 0.2940925329615202, 0, 0.001188860933479733, 0.005146475189457253, 0.7059074670384798, 1, 0.0008025198361253288],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.473082997682, 841.1983003991728, 0, 1, 0.2941021223474041, 0, 0.001188780338150316, 0.005146126299312454, 0.7058978776525959, 1, 0.0008021995138471214],
[350.4453521161396, 841.5066476336805, 0, 2, 0.2940096179961064, 0, 0.00237668948382524, 0.01028848128245698, 0.4984224194820037, 1, 0.001605487446931437],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9713416230612, 838.807430077002, 0, 1, 0.294395685685546, 0, 0.001192168743555599, 0.00516079441049268, 0.705604314314454, 1, 0.0008019957643430092],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.936215650455, 840.8321407406676, 1, 0, 0.2944668011769919, 0.002849520669009651, 0, -0.01233532620336019, 1, 0.2944668011769919, 0.0008013533370636516],
[351.1331609204789, 840.6351954706438, 0, 1, 0.2946320558332072, 0, 0.001189576650356797, 0.005149573465333565, 0.7053679441667928, 1, 0.0008014979037575839],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008014160217428094],
[350.936215650455, 840.8321407406676, 1, 0, 0.2944668011769919, 0.002849520669009651, 0, -0.01233532620336019, 1, 0.2944668011769919, 0.0008014160638835265],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008018667721716009],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4696381317317, 841.298718259391, 1, 0, 0.2940753010031357, 0.002853314213838198, 0, -0.01235174812773369, 1, 0.2940753010031356, 0.0008010587146840146],
[350.4706531463282, 841.2977032447944, 1, 0, 0.2940761526909583, 0.002853305950220263, 0, -0.01235171235525309, 1, 0.2940761526909583, 0.0008011455767893196],
[350.4875528537552, 841.000187184402, 0, 1, 0.2941595965079178, 0, 0.001189060377439292, 0.005147338564946052, 0.7058404034920822, 1, 0.0008017490060609869],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.605633516326, 841.1627228747966, 1, 0, 0.2941894132665341, 0.002852207450207542, 0, -0.01234695704460078, 1, 0.2941894132665341, 0.0008017084191078758],
[350.4706531463282, 841.1627228747966, 1, 0, 0.294109463698099, 0.002853305950220262, 0, -0.01235171235525309, 1, 0.294109463698099, 0.0008011981193306303],
[350.605633516326, 841.1627228747966, 0, 0, 0.2941894132665341, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002167536865639462],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5739793133667, 841.1943770777559, 0, 1, 0.2941628525655475, 0, 0.001188785882608872, 0.00514615030078949, 0.7058371474344525, 1, 0.0005846715971825803],
[350.3040185733711, 841.4643378177516, 0, 1, 0.293936331414396, 0, 0.001188404493282976, 0.005144499299694265, 0.706063668585604, 1, 0.0008009912635307376],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017835104381822],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022140696140972],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.9803602103815, 840.7879961807412, 1, 0, 0.2945038424020669, 0.002849162270505931, 0, -0.01233377472752699, 1, 0.294503842402067, 0.0008024054804571698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016290739767488],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5460436163776, 840.9523520347493, 0, 1, 0.2942060559173579, 0, 0.001189128013710197, 0.005147631356457928, 0.7057939440826422, 1, 0.0008006375472984856],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4092039933947, 841.2241720277301, 0, 1, 0.2940578965347668, 0, 0.001188743777523117, 0.005145968031549173, 0.7059421034652332, 1, 0.000801239746064023],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.000801711203006985],
[350.6791647333903, 840.9542112877344, 0, 1, 0.2942844433447403, 0, 0.001189125384685002, 0.005147619975637382, 0.7057155566552598, 1, 0.000801710916846817],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008017620044636695],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.000802243783106934],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0423251104074, 841.3560831459043, 0, 1, 0.2938079509630342, 0, 0.001188557401594949, 0.005145161226427384, 0.7061920490369658, 1, 0.000801672772284722],
[348.3839861960501, 837.4052266531941, 0, 2, 0.293799254050342, 0, 0.002388329970178568, 0.01033887193162675, 0.4987194935798534, 1, 0.0008029906346523515],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 0, 0.294136291864561, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001724395700382263],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0006292131644205268],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008017108105485752],
[350.1800887733191, 841.5882676178035, 0, 1, 0.2938323432531167, 0, 0.001188229492350929, 0.005143741735937605, 0.7061676567468833, 1, 0.000802384466458939],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008015828239422862],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008017110025924271],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.874755324394, 841.8316361667027, 1, 1, 0.2935914062578962, 0.002858165628648538, 0.001187885982229796, -0.007230494768289929, 0.9138040861715111, 0.5009868986873033, 0.001602121925562612],
[350.2085402174007, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463975, 1, 0.0008017036049575558],
[350.357351043002, 841.4426595510798, 0, 1, 0.29397327397938, 0, 0.001188435110401358, 0.005144631838526764, 0.70602672602062, 1, 0.0008018047335356726],
[350.6773054804053, 841.0910509107174, 1, 0, 0.2942495524401367, 0.00285162451168622, 0, -0.01234443355463448, 1, 0.2942495524401367, 0.0008022460491128653],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3055132116686, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2939136700891457, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7060863299108543, 1, 0.0008016196688860312],
[350.473082997682, 841.2952733934407, 0, 1, 0.294078191553075, 0, 0.001188643311837959, 0.005145533124369117, 0.705921808446925, 1, 0.0008022856926962695],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.530353907789, 841.2390174979299, 0, 1, 0.294125996453769, 0, 0.001188722799584674, 0.005145877219885101, 0.705874003546231, 1, 0.000801173649468248],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017147391431685],
[350.530353907789, 841.2390174979299, 0, 1, 0.294125996453769, 0, 0.001188722799584674, 0.005145877219885101, 0.705874003546231, 1, 0.0008017108515957663],
[350.2085402174007, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463975, 1, 0.0008016053497004464],
[350.5423251104074, 841.1933620631594, 0, 1, 0.294144355063988, 0, 0.001188787317041283, 0.005146156510322169, 0.705855644936012, 1, 0.0008018674964028904],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022505875236127],
[350.4423528346515, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2940284814018075, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7059715185981925, 1, 0.0008023433033321051],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008014394655204315],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.6692942559966, 839.1094700186634, 0, 1, 0.2941416054562089, 0, 0.00119173961888162, 0.005158936767243061, 0.7058583945437911, 1, 0.00080142399618013],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017130269059821],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017130499112283],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016053475511277],
[350.3453798403837, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2939710372083457, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7060289627916543, 1, 0.0008030869231729185],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008016598357254556],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008023842578218143],
[349.9399341564252, 841.4345316946496, 1, 1, 0.2937279119092424, 0.002857633274723639, 0.001188446590117949, -0.007225763432020487, 0.9137239137654363, 0.5011797375839211, 0.001603503646333666],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2411296334163, 841.3302814876824, 1, 0, 0.2939321356358235, 0.00285517580715509, 0, -0.01235980680267913, 1, 0.2939321356358235, 0.0008017134501475399],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017108614932706],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008013067703430722],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008015067789093633],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016050516375709],
[350.4803602103814, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160787, 1, 0.0008022614605260754],
[350.7085402174008, 841.4978512736959, 0, 1, 0.2941676396976604, 0, 0.001188357163938558, 0.005144294415094293, 0.7058323603023395, 1, 0.0008021378340276186],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016053475226108],
[350.3935142848061, 841.540133173381, 1, 0, 0.2939706543497824, 0.002853934103321279, 0, -0.0123544315751875, 1, 0.2939706543497824, 0.0008017417037614729],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008021433588347947],
[350.840451335575, 841.8039752554954, 0, 1, 0.294170201539767, 0, 0.001187925015080252, 0.005142423680414739, 0.7058297984602331, 1, 0.0008016173080579699],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6604057729783, 841.5459857181182, 0, 1, 0.2941272654430297, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593747, 0.7058727345569703, 1, 0.0008016870426845635],
[350.4803602103815, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160786, 1, 0.0008022288396155008],
[350.6911359360088, 841.0772204551138, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265668, 0.0008022557226683046],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008018047335580395],
[350.857351043002, 841.191621701086, 0, 1, 0.2943313228443383, 0, 0.001188789776552656, 0.005146167157332176, 0.7056686771556617, 1, 0.0008016926012650245],
[350.8770340433429, 840.8913223477797, 0, 1, 0.2944171425274776, 0, 0.001189214317502988, 0.005148004958042307, 0.7055828574725224, 1, 0.0008013371357541227],
[350.7085402174007, 841.0598161737219, 0, 1, 0.294275761171748, 0, 0.001188976076100453, 0.005146973631810011, 0.705724238828252, 1, 0.000802093357664993],
[350.2272991778128, 841.2604408603444, 0, 1, 0.2939411690183206, 0, 0.001188692527818514, 0.005145746176052219, 0.7060588309816793, 1, 0.000802207067475956],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016541565917392],
[350.357351043002, 841.4426595510798, 0, 1, 0.29397327397938, 0, 0.001188435110401358, 0.005144631838526764, 0.70602672602062, 1, 0.0008017991632061753],
[350.2117429762784, 841.5566134148442, 1, 0, 0.2938589039541032, 0.002855415388134872, 0, -0.01236084392782437, 1, 0.2938589039541033, 0.0008013522998888194],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008014609291170862],
[350.5423251104074, 841.2587004982709, 1, 0, 0.2941282291071851, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.2941282291071851, 0.0008015142132478158],
[350.5106709074482, 841.2576854836744, 0, 1, 0.2941097311635746, 0, 0.001188696421150742, 0.005145763029947533, 0.7058902688364255, 1, 0.0008023323334169116],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016598279886367],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008023843575534459],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008013255193878347],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016053476565089],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022070671508144],
[350.3935142848061, 841.3748421063165, 1, 0, 0.2940114263025554, 0.002853934103321279, 0, -0.0123544315751875, 1, 0.2940114263025555, 0.0008016981266112939],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008018047318325358],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016541055180883],
[350.6604057729783, 841.5459857181183, 0, 1, 0.2941272654430296, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593746, 0.7058727345569704, 1, 0.0008013148996077526],
[350.3761100034142, 841.3922463877085, 0, 1, 0.293996822557374, 0, 0.001188506317110992, 0.005144940086156183, 0.7060031774426261, 1, 0.0008022505874572219],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.00080162713074632],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 1, 1, 0.2941849072902791, 0.002852722562632168, 0.001189019519816331, -0.007202025225452669, 0.9134552403226098, 0.5018250549031682, 0.001606125996951353],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017143644037401],
[350.5130294279372, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2941117101727305, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7058882898272695, 1, 0.0008016543736167873],
[350.4803602103814, 841.2879961807411, 0, 1, 0.2940842977839214, 0, 0.001188653593703673, 0.005145577633668155, 0.7059157022160787, 1, 0.0008018047318325358],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008013853037410547],
[350.4073447404096, 841.2260312807151, 1, 1, 0.2940563362788839, 0.002853821459538255, 0.001188741150196649, -0.007207987292002699, 0.9135308710942399, 0.5016435436520078, 0.001603860294378866],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008016595619024452],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008017991735269429],
[350.2085402174008, 841.5598161737219, 0, 1, 0.2938562165536026, 0, 0.001188269663999227, 0.005143915635495969, 0.7061437834463974, 1, 0.000801605280749535],
[350.6604057729783, 841.2049236124121, 0, 1, 0.2942114323887611, 0, 0.001188770978307722, 0.005146085781371011, 0.705788567611239, 1, 0.0008013149002867422],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008022460490970895],
[350.7076161774719, 841.0607402136507, 0, 1, 0.2942749858197899, 0, 0.001188974769819805, 0.005146967977035129, 0.7057250141802101, 1, 0.0008017471617602764],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017991599599108],
[350.5130294279372, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2941117101727305, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7058882898272695, 1, 0.0008022070768821384],
[350.5739793133667, 841.1943770777559, 0, 1, 0.2941628525655475, 0, 0.001188785882608872, 0.00514615030078949, 0.7058371474344525, 1, 0.0008018047335609507],
[350.4803602103815, 841.2553269631853, 0, 1, 0.2940923595580274, 0, 0.001188699753747606, 0.005145777456468411, 0.7059076404419726, 1, 0.0008016543937043075],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017144912331103],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 2, 0.294136291864561, 0, 0.002377482300393299, 0.01029191331616454, 0.4982435744627122, 1, 0.001604297576439058],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008017143646094545],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.0008016053475093762],
[350.9803602103815, 841.1252750979961, 0, 1, 0.2944205193020405, 0, 0.001188883546370062, 0.005146573078685309, 0.7055794806979595, 1, 0.0008049083211269679],
[350.7085402174008, 841.0598161737219, 0, 1, 0.2942757611717481, 0, 0.001188976076100453, 0.005146973631810011, 0.7057242388282519, 1, 0.0008022560245800825],
[350.8399467616101, 840.7314643594888, 0, 1, 0.2944346796903424, 0, 0.001189440436562999, 0.005148983807712137, 0.7055653203096576, 1, 0.0008021650839835083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.6911359360088, 841.0772204551139, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265667, 0.0008020764640006058],
[350.3453798403837, 841.2260312807151, 0, 1, 0.2940196253204486, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.7059803746795514, 1, 0.000802456649229755],
[350.4073447404096, 841.361011650713, 1, 0, 0.2940230312889853, 0.002853821459538255, 0, -0.01235394395008497, 1, 0.2940230312889853, 0.000801648969385696],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 1, 0, 0.294136291864561, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.294136291864561, 0.0008016052587683909],
[350.6911359360088, 841.0772204551138, 1, 0, 0.2942611574265667, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.2942611574265668, 0.0008021160459229236],
[350.6604057729783, 841.5459857181182, 0, 1, 0.2941272654430297, 0, 0.00118828919271318, 0.005144000173593747, 0.7058727345569703, 1, 0.0008013350215289862],
[350.6773054804053, 841.0910509107173, 1, 0, 0.2942495524401368, 0.00285162451168622, 0, -0.01234443355463448, 1, 0.2942495524401367, 0.0008022079276281259],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.0008018047318578129],
[350.3770340433429, 841.3913223477797, 0, 1, 0.2939975979093322, 0, 0.001188507622362501, 0.00514494573647601, 0.7060024020906679, 1, 0.0008016485544992442],
[350.6911359360088, 840.9119293880493, 1, 0, 0.2943019753315571, 0.002851512050143383, 0, -0.01234394671843381, 1, 0.294301975331557, 0.0008022070669384912],
[350.7392703804313, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2943015465207764, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7056984534792236, 1, 0.0008017417364055366],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017991637273887],
[350.7412094349565, 841.0271469561661, 0, 1, 0.2943031735605572, 0, 0.001189022261194762, 0.00514717356305116, 0.7056968264394428, 1, 0.000800954075374861],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008014609264415202],
[350.5423251104074, 841.0686125337064, 0, 1, 0.2941751489823101, 0, 0.001188963641132101, 0.005146919801917632, 0.7058248510176899, 1, 0.0008044761881985972],
[350.6773054804053, 841.0910509107173, 1, 0, 0.2942495524401368, 0.00285162451168622, 0, -0.01234443355463448, 1, 0.2942495524401367, 0.0008022569152721849],
[350.5423251104074, 841.0290860106913, 0, 1, 0.2941849072902791, 0, 0.001189019519816331, 0.005147161695863265, 0.7058150927097209, 1, 0.00080179916220787],
[350.5423251104074, 841.2587004982709, 1, 0, 0.2941282291071851, 0.002852722562632168, 0, -0.01234918692131593, 1, 0.2941282291071851, 0.0008017991621998825],
[350.3453798403837, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2939710372083457, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7060289627916543, 1, 0.0008022614515589994],
[350.3453798403837, 841.4229765507389, 0, 1, 0.2939710372083457, 0, 0.001188462910888551, 0.005144752184408745, 0.7060289627916543, 1, 0.0008022288395641295],
[350.4073447404097, 841.361011650713, 1, 1, 0.2940230312889853, 0.002853821459538254, 0.001188550439291267, -0.007208812862862389, 0.9135504570716364, 0.5015965196496071, 0.001603060485796633],
[350.4380749034402, 841.0496651347171, 0, 1, 0.2941180703145275, 0, 0.001188990426433167, 0.0051470357531475, 0.7058819296854726, 1, 0.0008028425389067069],
[350.5423251104074, 841.1640663806892, 0, 1, 0.2941515860058441, 0, 0.001188828719589438, 0.00514633573833855, 0.7058484139941559, 1, 0.0008016052589187749],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008017991637273887],
[350.5423251104074, 841.2260312807151, 0, 1, 0.294136291864561, 0, 0.001188741150196649, 0.005145956658082272, 0.705863708135439, 1, 0.0008022614605260754]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.392521223066591, 0, 1, 0.2021287460922568, 0, 0.4179691241017539, 1.809351848119692, 0.7978712539077432, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 1, 0.2020364866507985, 0, 0.4177300437388062, 1.808316890101015, 0.7979635133492015, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6065782046747581, 2.393421795325241, 1, 0, 0.2021927348915861, 1.648592040223719, 0, -7.136611014472975, 1, 0.2021927348915861, 0.231004889699101],
[0.3707678100197489, 1.756202678526703, 0, 2, 0.1743173269287472, 0, 1.138820720668654, 4.929855476877752, 0.6817518766100893, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6067936793896924, 2.393206320610306, 0, 2, 0.2022645597965642, 0, 0.8356989461276233, 3.617667778444759, 0.6363818325565694, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 8.657825393242247, 0.1975308641975309, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849446433861, 2.000101673583564, 1, 1, 0.3332742439560259, 1.000215101615368, 0.499974582896233, -2.165497532847601, 0.8889282783155393, 0.5554767662275911, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9993160526790809, 2.000683947320918, 0, 1, 0.3331053508930271, 0, 0.4998290716227733, 2.163716414288171, 0.6668946491069729, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 6.493369044931685, 0.2962962962962963, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6136266633831945, 2.386373336616805, 0, 1, 0.2045422211277316, 0, 0.4190459156812882, 1.814013184859953, 0.7954577788722684, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876285227746948, 0, 1, 0.347670665743856, 0, 0.5329680078549703, 2.307171976096247, 0.652329334256144, 1, 0.231004889699101],
[0.9974834776452856, 2.002516522354714, 0, 3, 0.3324944925484286, 0, 1.498114980081347, 6.485208958272441, 0.2974161585741477, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3703577356395741, 1.755091530310341, 0, 1, 0.174249153613202, 0, 0.5697708539583555, 2.466488283864984, 0.8257508463867981, 1, 0.231004889699101],
[0.6067933343959593, 2.39320666560404, 0, 1, 0.2022644447986532, 0, 0.4178494128285417, 1.808833628469154, 0.7977355552013469, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9996771578752096, 2.000266085827422, 1, 1.5, 0.3332320236303452, 1.000322946385488, 0.7499002310882635, -1.08405807177249, 0.8165999679247489, 0.6369747499419329, 0.231004889699101],
[0.606219329113916, 2.393780670886083, 0, 1, 0.2020731097046387, 0, 0.4177492166104923, 1.808399887788687, 0.7979268902953613, 1, 0.231004889699101],
[0.9954347412166226, 2.001022384705611, 0, 3, 0.3322038992666224, 0, 1.499233603246951, 6.490051380296759, 0.2978047610685966, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 3, 0.3333333333333333, 1, 1.5, 2.164456348310561, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.065225140303359, 1.934774859696641, 1, 0, 0.3550750467677863, 0.9387686810651281, 0, -4.063847662653098, 1, 0.3550750467677863, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.273679245965813, 1.332430213986582, 0, 0, 0.4887282232531703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 2.260103730378418, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8751328572913326, 2.124867142708669, 2, 0, 0.291710952430444, 2.285367282620721, 0, -9.89315544617935, 1, 0.08509527976787679, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771835670744954, 0, 1, 0.2736608562401613, 0, 0.564386425056878, 2.443179561229324, 0.7263391437598388, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.328912696621123, 0.4444444444444445, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.439255168630432, 0.5, 0, 0.4099612098235173, 0.5000000000000002, 0, -2.164456348310562, 1, 0.2318601753739865, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9998982745133344, 2.000101725486665, 0, 1, 0.3332994248377782, 0, 0.4999745699217773, 2.164346263722067, 0.6667005751622218, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8747711876252583, 2.124253548407097, 1, 1, 0.2916852192364913, 1.143156078007896, 0.4707535975401169, -2.910771634936506, 0.9149197328789598, 0.4982901713519428, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8756017990580822, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3044934105079814, 1.142071659829545, 0, -4.943928508687277, 1, 0.3044934105079814, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.999316024875435, 2.000683975124564, 0, 1, 0.3331053416251452, 0, 0.4998290646766136, 2.163716384218852, 0.6668946583748548, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.0005772478285428682, 2.999422752171457, 0, 1, 0.0001924159428476227, 0, 0.3333974843246227, 1.4432486029144, 0.9998075840571524, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.392523090580537, 0, 2, 0.202128620208793, 0, 0.8359375957014095, 3.618700871614765, 0.6365987386899246, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.001526279800284891, 2.259752657767007, 0, 1, 0.0006749630817005175, 0, 0.442526307719075, 1.915657752073969, 0.9993250369182994, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 1.999999999999999, 0, 0, 0.23257252593046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8748988303558705, 2.125101169644132, 2.5, 0, 0.2916329434519567, 2.857473245201516, 0, -12.369752211408, 1, 0.07589352179836983, 0.231004889699101],
[0.8756020452750947, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3044934700591821, 1.142071338681972, 0, -4.94392711846747, 1, 0.3044934700591821, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999784976890342, 0, 1, 0.3333572265024898, 0, 0.5000537615574032, 2.164689077398994, 0.6666427734975102, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.328912696621123, 0.4444444444444445, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9993153211122804, 2.000684678887719, 0, 1, 0.3331051070374269, 0, 0.4998288888561642, 2.163715623107477, 0.6668948929625731, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 1.999999999999999, 0, 0, 0.23257252593046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8756018073242431, 2.124398192675759, 1, 0, 0.2918672691080809, 1.142071649047763, 0, -4.943928462013884, 1, 0.2918672691080808, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8737297332375175, 2.126055190145621, 1, 1, 0.2912641257801011, 1.144518678899253, 0.4703546759439985, -2.91839711199792, 0.9151652090335535, 0.4976934605937556, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9414086350595809, 2.058591364940419, 0, 0, 0.3138028783531936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3324302139865823, 2.667569786013417, 0, 0, 0.1108100713288608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.004212117699076074, 2.259444836030733, 0, 2, 0.001860757961640699, 0, 0.885173193036874, 3.831837474045983, 0.9962819464969105, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9982797459993663, 2.001720254000633, 1, 2, 0.3327599153331222, 1.001723218373936, 0.9991406121823494, -0.01117987673312949, 0.7415049688890635, 0.7029384885651384, 0.231004889699101],
[0.3712403338516614, 2.076045377967965, 0, 0, 0.1516947253272008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2302008167854476],
[0.9999253912977523, 1.438872329977219, 0, 0.6666666666666666, 0.4100075141840811, 0, 0.4633257953311409, 2.005696918081055, 0.7034463604386876, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.010736305205006, 1.92870487470438, 2, 2, 0.3438532167655637, 1.978755477269952, 1.036965284959187, -4.076927521047319, 0.8793165822409015, 0.4261048022845964, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999892436070458, 0, 0.5, 0.333345285309594, 0, 0.2500134462143566, 1.08228638164333, 0.8164892618341076, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6056996372253766, 2.393326427190975, 0, 2, 0.2019654461866951, 0, 0.835657007451082, 3.6174862295754, 0.6368591490800006, 1, 0.231004889699101],
[0.8756017723916691, 2.1241832044749, 1, 1, 0.2918881783674644, 1.142071694611287, 0.4707691869012781, -2.906009948899456, 0.9148012913293233, 0.4985776480642521, 0.231004889699101],
[0.66930792365045, 2.330692076349549, 0, 1, 0.2231026412168167, 0, 0.4290571071774749, 1.8573507588361, 0.7768973587831833, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9998983354334577, 2.000101664566541, 0, 1, 0.333299445144486, 0, 0.4999745851502596, 2.164346329644836, 0.666700554855514, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1.5, 0.3333333333333333, 0, 0.7500000000000002, 3.246684522465842, 0.5443310539518175, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999784924874562, 0, 1, 0.3333572322828495, 0, 0.5000537745641449, 2.164689133704043, 0.6666427677171505, 1, 0.231004889699101],
[0.9410384625046047, 2.058961537495395, 1, 1, 0.3136794875015349, 1.062655821036759, 0.4856817292548557, -2.497670471536122, 0.9016051791207743, 0.5289641541238443, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.440715995758801, 1, 0, 0.4097158381957122, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.4097158381957122, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9988416772346594, 2.00115832276534, 0, 1, 0.3329472257448866, 0, 0.4997105869255414, 2.163203504377968, 0.6670527742551134, 1, 0.231004889699101],
[0.9754128636911038, 1.961389061792432, 0, 1, 0.3321343721642054, 0, 0.5098427535259842, 2.207064769018906, 0.6678656278357946, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999784973071972, 0, 1, 0.333357226926814, 0, 0.500053762512201, 2.16468908153223, 0.6666427730731861, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8756020759766598, 2.12394396917682, 1, 2, 0.2919115302101846, 1.142071298637095, 0.9416444261357528, -0.8676304331151213, 0.7941119055734427, 0.6449720312127982, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.80553722816395, 2.000853546595833, 1, 0, 0.2870367289576418, 1.241407553911923, 0, -5.373944921810693, 1, 0.2870367289576418, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999461513190661, 2.000053848680933, 0, 1.75, 0.3333153837730221, 0, 0.8749764418363799, 3.787696628309877, 0.491881806408085, 1, 0.231004889699101],
[0.9993158584579275, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3331812672012868, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6668187327987132, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9993165843182675, 2.000573573090983, 0, 2, 0.3331177249440667, 0, 0.9997132956774508, 4.327671578639062, 0.4447319687837775, 1, 0.231004889699101],
[0.9995695285790404, 2.000215191833224, 0, 2, 0.3332137542328931, 0, 0.9998924156590236, 4.328446973401511, 0.4446038975441927, 1, 0.231004889699101],
[1.000475157977855, 1.875126340009023, 0, 1, 0.3479185689248868, 0, 0.5332973990409564, 2.308597881783417, 0.6520814310751133, 1, 0.231004889699101],
[1.001423816833491, 1.873457239259434, 0, 2, 0.3483357388686072, 0, 1.067545048848079, 4.621309316173465, 0.4246663092359241, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6069314998352525, 2.393068500164746, 0, 2, 0.2023104999450842, 0, 0.8357470752978085, 3.617876125420652, 0.6363085384978615, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849637103956, 2.000101664569089, 1, 3, 0.3332742491951435, 1.000215082540156, 1.499923755448868, 2.163195218766215, 0.5926976310596607, 0.802399100847496, 0.231004889699101],
[0.8742506560699673, 2.125411221135377, 2, 2, 0.2914497339561715, 2.287673433372794, 0.9409943732825579, -5.829656081498423, 0.9226195152390932, 0.3332508020661428, 0.231004889699101],
[0.6075667400553818, 2.392433259944617, 0, 3, 0.2025222466851274, 0, 1.253953474994512, 5.428255118875918, 0.5071725384667247, 1, 0.231004889699101],
[1.002578747433469, 1.870947742767998, 0, 1, 0.3489018635645766, 0, 0.5344884718803192, 2.313753932120335, 0.6510981364354234, 1, 0.231004889699101],
[0.8049917610827746, 2.001398760399417, 0, 2, 0.2868423887982701, 0, 0.9993011085911048, 4.325887256727595, 0.5085937784149578, 1, 0.231004889699101],
[0.606578233299132, 2.393421766700867, 1, 0, 0.2021927444330441, 1.648591962426804, 0, -7.136610677696924, 1, 0.202192744433044, 0.231004889699101],
[1.001898076898634, 1.872299835502309, 0, 2, 0.3485835378892558, 0, 1.068204975547322, 4.624166081240658, 0.4243434071088785, 1, 0.231004889699101],
[0.999426048044599, 2.0005739519554, 1, 1, 0.3331420160148664, 1.000574281565428, 0.4998565531769422, -2.167563331844204, 0.8890163971655506, 0.5553004291952832, 0.231004889699101],
[1.001520099227417, 1.998049620112977, 0, 3, 0.3338879215808499, 0, 1.501464212800866, 6.499707494315906, 0.2955574602652824, 1, 0.231004889699101],
[0.9997848154583923, 2.000215184541607, 0, 1, 0.3332616051527975, 0, 0.499946209652024, 2.164223494590252, 0.6667383948472025, 1, 0.231004889699101],
[0.8756018074784718, 2.12439819252153, 1, 0, 0.2918672691594905, 1.142071648846598, 0, -4.943928461143059, 1, 0.2918672691594905, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 1, 0.2020364866507985, 0, 0.4177300437388062, 1.808316890101015, 0.7979635133492015, 1, 0.231004889699101],
[0.5307835130581536, 2.438559794459516, 1, 1, 0.1787545117179062, 1.884007274902749, 0.4100781134307354, -6.380510661016324, 0.9680468245404928, 0.3255558479763054, 0.231004889699101],
[1.009038516900443, 1.38517874945646, 1, 2, 0.4214481831199136, 0.9910424461018517, 1.44385697570425, 1.960194566410342, 0.6168583349538056, 0.8063458602540292, 0.231004889699101],
[0.9994263959297286, 2.00057360407027, 0, 1, 0.3331421319765763, 0, 0.499856640098344, 2.163835755812096, 0.6668578680234237, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393206460223469, 0, 1, 0.202082566853063, 0, 0.4178494486876086, 1.808833783699925, 0.797917433146937, 1, 0.231004889699101],
[0.9997848817812603, 2.000101703303436, 1, 1, 0.3332742266831508, 1.000215164504545, 0.4999745754670205, -2.165497837249766, 0.8889282898287479, 0.5554767431950494, 0.231004889699101],
[0.9993156931725383, 2.000684306827461, 0, 1, 0.3331052310575129, 0, 0.4998289818075931, 2.163716025486097, 0.6668947689424871, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8057067803469576, 2.00068404490802, 0, 1, 0.2870971402472976, 0, 0.4998290472426766, 2.163716308748861, 0.7129028597527024, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.874665635613711, 2.125334364386291, 1, 0, 0.2915552118712368, 1.143294030636459, 0, -4.949220045193305, 1, 0.2915552118712368, 0.231004889699101],
[0.3708770042129886, 1.754574565569684, 1, 1, 0.1744932745049142, 2.696311684575936, 0.5699387302330551, -9.204882879806663, 0.9695520971525529, 0.3185386461623809, 0.231004889699101],
[1.00083827952863, 1.999161720471369, 1, 1, 0.3336127598428767, 0.999162422595362, 0.500209657758061, -2.159922958718405, 0.888702526470019, 0.5559280461557725, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.068819159258423, 0, 0, 0.1516947253272009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8759485900705484, 2.123714548577542, 0, 1, 0.2920156529527269, 0, 0.4708730750419341, 2.038368433046059, 0.7079843470472731, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.001739557448463802, 2.998260442551536, 0, 2, 0.0005798524828212673, 0, 0.6670534592711996, 2.887616189164136, 0.9988406312632594, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997850373379004, 2.000101629759576, 0, 1, 0.3332742694260636, 0, 0.4999745938511164, 2.164346367310086, 0.6667257305739364, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849233831436, 2.000101683634953, 0, 1, 0.333274238114265, 0, 0.4999745803836412, 2.164346309010562, 0.666725761885735, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9998982653404852, 2.000101734659514, 0, 2, 0.3332994217801618, 0, 0.9999491352575967, 4.328692507591922, 0.4444896609986665, 1, 0.231004889699101],
[0.9994254356303128, 2.000574564369686, 0, 1, 0.3331418118767711, 0, 0.4998564001612539, 2.16383471714538, 0.6668581881232289, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.3725915997079994, 2.067149561426362, 1, 1, 0.1527176758106431, 2.683903772344039, 0.4837579334656298, -9.524239256338875, 0.9766773114949951, 0.2821126631162816, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.934661564888472, 0, 0, 0.3551128117038425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9988417399596293, 2.001158260040369, 0, 1, 0.3329472466532099, 0, 0.4997106025886363, 2.163203572182139, 0.66705275334679, 1, 0.231004889699101],
[0.6682593697295167, 1.45567043032243, 0, 1, 0.3146334543228183, 0, 0.686968684098708, 2.973827458776002, 0.6853665456771818, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8751330580240937, 2.124866941975908, 2, 0, 0.2917110193413644, 2.28536675841691, 0, -9.893153176946814, 1, 0.08509531880517773, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.0015210211043, 1.998478978895699, 0, 1, 0.3338403403681002, 0, 0.5003805446843232, 2.166103693026159, 0.6661596596318998, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3711774366808585, 1.757312613591829, 0, 1, 0.1743853285258749, 0, 0.5690507154308005, 2.463370867049725, 0.8256146714741252, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.870843433718866, 1.125738895814626, 1, 0, 0.624325724436251, 0.5345182723346326, 0, -2.313882935685377, 1, 0.624325724436251, 0.231004889699101],
[0.9410381776279505, 2.05896182237205, 1, 1, 0.3136793925426501, 1.062656142730227, 0.4856816620562391, -2.497672155016004, 0.9016052386940738, 0.5289640237793743, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8756019246591581, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3044934408864476, 1.142071496004609, 0, -4.943927799503432, 1, 0.3044934408864476, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 2.260103730378418, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9994227560836336, 1.439344537985579, 0, 1, 0.4098065274674254, 0, 0.6947606869718214, 3.00755835894553, 0.5901934725325746, 1, 0.231004889699101],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.934774957082464, 1, 0, 0.3407416291278857, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3407416291278857, 0.231004889699101],
[0.9998414797410548, 1.999777859395676, 1.75, 1, 0.3333227875603716, 1.750277454435303, 0.5000555413200722, -5.412101513278471, 0.9267228949777765, 0.3339285102106284, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997848008704014, 2.000215199129598, 0, 2, 0.3332616002901339, 0, 0.9998924120116219, 4.328446957612228, 0.4445400936476732, 1, 0.231004889699101],
[0.003474647098600884, 2.996525352901398, 0, 3, 0.001158215699533628, 0, 1.001159558718646, 4.333932325080747, 0.9965293757385147, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9988417398600006, 2.001158260139999, 0, 1, 0.3329472466200003, 0, 0.4997106025637578, 2.163203572074442, 0.6670527533799997, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9998753481735613, 1.934910137592658, 1, 3, 0.3406979327869042, 1.000124667366454, 1.550459601050252, 2.382351881817937, 0.5795015602614373, 0.8110539793241457, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.439742162029485, 0, 1, 0.4098793780602438, 0, 0.6945688098696665, 3.006727739721821, 0.5901206219397562, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.003389313759655266, 2.259063835923902, 0, 2, 0.001498070251810217, 0, 0.8853224810188017, 3.832483728686403, 0.9970061037108588, 1, 0.231004889699101],
[0.9754155648362265, 1.961385898406319, 0, 1, 0.3321353441983315, 0, 0.5098435758167364, 2.207068328643784, 0.6678646558016685, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8751330351276801, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3043800145716795, 1.142683409104882, 0, -4.946576717892431, 1, 0.3043800145716795, 0.231004889699101],
[0.994211703722978, 2.005788296277021, 0, 1, 0.3314039012409927, 0, 0.4985571018916192, 2.15821016836926, 0.6685960987590073, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9404641637878659, 2.059535836212134, 2, 0, 0.3134880545959553, 2.126609473288901, 0, -9.205906749675078, 0.9999999999999999, 0.09827476037435678, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9754150149220018, 1.961386542426149, 0, 1, 0.3321351463061652, 0, 0.509843408409973, 2.20706760395452, 0.6678648536938347, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 1, 0.2020364866507985, 0, 0.4177300437388062, 1.808316890101015, 0.7979635133492015, 1, 0.231004889699101],
[0.8751329861942032, 2.124867013805798, 2, 0, 0.2917109953980676, 2.285366945997136, 0, -9.893153988965238, 0.9999999999999999, 0.08509530483613148, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6067934954985307, 2.393206504501468, 0, 1, 0.2022644984995103, 0, 0.4178494409567515, 1.808833750233719, 0.7977355015004897, 1, 0.231004889699101],
[1.001524695687513, 1.998260281179026, 0, 2, 0.3338654948307885, 0, 1.000870616724638, 4.332681520414297, 0.4437351789770302, 1, 0.231004889699101],
[0.606578226949837, 2.393421773050162, 1, 0, 0.2021927423166124, 1.648591979683271, 0, -7.13661075239866, 1, 0.2021927423166124, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393206647082072, 0, 1, 0.2020825542632377, 0, 0.4178494160624427, 1.80883364246843, 0.7979174457367624, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849233835995, 2.0002150766164, 0, 1, 0.3332616411278666, 0, 0.4999462366275222, 2.164223611364828, 0.6667383588721334, 1, 0.231004889699101],
[0.6699915404977461, 2.330008459502253, 0, 1, 0.2233305134992487, 0, 0.4291829911268324, 1.857895699462775, 0.7766694865007513, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8746654578812201, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3042668688571138, 1.14329426295442, 0, -4.949221050877477, 1, 0.3042668688571138, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8758165243339648, 2.124183475666037, 1, 1, 0.2919388414446548, 1.141791656375145, 0.4707691267989222, -2.904797948001332, 0.9147717128559527, 0.4986493957452622, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.003535542711508, 2.00685527358984, 0, 1, 0.3333572296584668, 0, 0.4982920358831912, 2.164689108140582, 0.6666427703415332, 1, 0.2301910394473285],
[1.003535542711508, 2.007071085423015, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2301910394473285],
[0.3738504853026438, 2.07353917469818, 1, 0, 0.1527547866254031, 2.67486612780633, 0, -11.62020091758777, 1, 0.1527547866254031, 0.2301910394473285],
[1.003535542711508, 2.007071085423015, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4982384566559772, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.2301910394473285],
[0.6699300075047804, 2.144824982188736, 0, 0.6666666666666666, 0.2380065085443637, 0, 0.3108256721191074, 1.350294402707319, 0.8342588860874562, 1, 0.2301910394473285],
[0.3716673805876725, 2.444645314414197, 0, 1, 0.1319695008467182, 0, 0.4090572951846093, 1.777033963471059, 0.8680304991532818, 1, 0.2301910394473285],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 1, 0.2920233999826841, 0, 0.4708253540091302, 2.038161852861258, 0.7079766000173159, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3701254794489625, 2.43572295023717, 0, 3.666666666666667, 0.1319121430555553, 0, 1.505370989056714, 6.516619587652706, 0.5952967312250427, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6067927841075017, 2.391839499326315, 0, 3, 0.2023565168226117, 0, 1.254264761847515, 5.429602652486174, 0.507488802226128, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.77064929613825, 0, 1, 0.2737940125644099, 0, 0.5647645765770668, 2.444816546146316, 0.7262059874355901, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6676305036277524, 1.457820322783329, 1, 1, 0.3141124204482662, 1.4978344976244, 0.6859555902546071, -3.514552910231982, 0.9013333873201317, 0.529558228216664, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.231004889699101],
[1.273162772721411, 1.333520357952402, 1, 0, 0.4884225312005243, 0.7854455230908772, 0, -3.400125097412316, 1, 0.4884225312005244, 0.231004889699101],
[1.001520016662763, 1.998479983337236, 3, 1, 0.3338400055542545, 2.995446870843895, 0.5003802931916852, -10.80092538691366, 0.9875790871184195, 0.1115619998518779, 0.231004889699101],
[0.3708744603166437, 1.754574843788769, 1, 1, 0.1744922636358727, 2.696330179075216, 0.5699386398591207, -9.204963332100283, 0.9695524499312291, 0.3185369772029745, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 1.753981665241157, 0, 0, 0.1741809615373078, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3704649391805554, 1.753464860871391, 1, 0, 0.1744242861376561, 2.699310769359, 0, -11.6850806616043, 1, 0.174424286137656, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9994263882434243, 2.000573611756575, 1, 1, 0.3331421294144749, 1.000573940975867, 0.4998566381778696, -2.167561489500134, 0.8890163216091893, 0.555300580438139, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2.75, 0, 0.3333333333333333, 2.750000000000001, 0, -11.90450991570809, 1, 0.0732819804361311, 0.231004889699101],
[1.002346347941153, 2.008146790344469, 0, 2, 0.3329508827620036, 0, 0.9959431300621844, 4.326430727765644, 0.4449545248079903, 1, 0.2301997172104342],
[0.9996843543729755, 2.000315645627024, 0, 0.75, 0.3332281181243252, 0, 0.3749408257839743, 1.623086101217854, 0.7378752745712795, 1, 0.231004889699101],
[0.9992565905313641, 2.000743409468635, 1, 1, 0.3330855301771214, 1.000743962537431, 0.4998142166893773, -2.168481136916829, 0.8890540295866258, 0.5552250899408688, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.328912696621123, 0.4444444444444445, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999570245785375, 1, 1, 0.3333810906429266, 1, 0.5001074616447035, -2.163991156232406, 0.8888570484017326, 0.555619229687586, 0.231004889699101],
[0.6066450175816517, 2.392386143599671, 0.4375, 2.0625, 0.2022803315397008, 0.7211795816671559, 0.8621099923679912, 0.6100754442228753, 0.7259959491613157, 0.4316370624541696, 0.231004889699101],
[0.9765516687715537, 1.959648664449151, 1.25, 0.5, 0.3325902724424729, 1.280014196865209, 0.2551477767779092, -4.436557258256548, 0.9483961682220921, 0.3997376224170694, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393206954303476, 0, 1, 0.2020825335638257, 0, 0.4178493624221655, 1.808833410264353, 0.7979174664361743, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393207080263816, 0, 1, 0.2020825250770973, 0, 0.4178493404297319, 1.808833315061028, 0.7979174749229027, 1, 0.231004889699101],
[0.8756017818351852, 2.124398218164817, 1, 0, 0.2918672606117282, 1.142071682293847, 0, -4.943928605933278, 1, 0.2918672606117283, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8761780424655273, 2.123821957534474, 0, 0.5, 0.2920593474885089, 0, 0.2354246306881795, 1.019132672883399, 0.8413920920186325, 1, 0.231004889699101],
[0.6062193298768066, 2.393780670123193, 0, 1, 0.2020731099589356, 0, 0.4177492167436277, 1.808399888365019, 0.7979268900410644, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.8756017444328084, 2.124398255567193, 1, 0, 0.2918672481442693, 1.142071731078806, 0, -4.943928817119107, 1, 0.2918672481442692, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.999426387857666, 2.000573612142333, 0, 1, 0.3331421292858888, 0, 0.4998566380814853, 2.163835747081291, 0.6668578707141113, 1, 0.231004889699101],
[0.3716957688371697, 1.756799822212625, 1, 2, 0.1746283950035554, 2.690372298636722, 1.13843363069167, -6.718207004044605, 0.9191653834495068, 0.4377252622231431, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101]
],
"RESOLVED": [
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.392521223066591, 0, 1, 0.2021287460922568, 0, 0.4179691241017539, 1.809351848119692, 0.7978712539077432, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 1, 0.2020364866507985, 0, 0.4177300437388062, 1.808316890101015, 0.7979635133492015, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6065782046747581, 2.393421795325241, 1, 0, 0.2021927348915861, 1.648592040223719, 0, -7.136611014472975, 1, 0.2021927348915861, 0.231004889699101],
[0.3707678100197489, 1.756202678526703, 0, 2, 0.1743173269287472, 0, 1.138820720668654, 4.929855476877752, 0.6817518766100893, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6067936793896924, 2.393206320610306, 0, 2, 0.2022645597965642, 0, 0.8356989461276233, 3.617667778444759, 0.6363818325565694, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 4, 0.3333333333333333, 0, 2.000000000000001, 8.657825393242247, 0.1975308641975309, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849446433861, 2.000101673583564, 1, 1, 0.3332742439560259, 1.000215101615368, 0.499974582896233, -2.165497532847601, 0.8889282783155393, 0.5554767662275911, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9993160526790809, 2.000683947320918, 0, 1, 0.3331053508930271, 0, 0.4998290716227733, 2.163716414288171, 0.6668946491069729, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 6.493369044931685, 0.2962962962962963, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6136266633831945, 2.386373336616805, 0, 1, 0.2045422211277316, 0, 0.4190459156812882, 1.814013184859953, 0.7954577788722684, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876285227746948, 0, 1, 0.347670665743856, 0, 0.5329680078549703, 2.307171976096247, 0.652329334256144, 1, 0.231004889699101],
[0.9974834776452856, 2.002516522354714, 0, 3, 0.3324944925484286, 0, 1.498114980081347, 6.485208958272441, 0.2974161585741477, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3703577356395741, 1.755091530310341, 0, 1, 0.174249153613202, 0, 0.5697708539583555, 2.466488283864984, 0.8257508463867981, 1, 0.231004889699101],
[0.6067933343959593, 2.39320666560404, 0, 1, 0.2022644447986532, 0, 0.4178494128285417, 1.808833628469154, 0.7977355552013469, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997848096206553, 2.000215190379344, 1, 1, 0.3332616032068852, 1.000215236696211, 0.4999462081929038, -2.16562094921428, 0.8889367038279767, 0.5554599102417469, 0.231004889699101],
[0.606219329113916, 2.393780670886083, 0, 1, 0.2020731097046387, 0, 0.4177492166104923, 1.808399887788687, 0.7979268902953613, 1, 0.231004889699101],
[0.9954347412166226, 2.001022384705611, 0, 3, 0.3322038992666224, 0, 1.499233603246951, 6.490051380296759, 0.2978047610685966, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 3, 0.3333333333333333, 1, 1.5, 2.164456348310561, 0.5925925925925928, 0.802469135802469, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.065225140303359, 1.934774859696641, 1, 0, 0.3550750467677863, 0.9387686810651281, 0, -4.063847662653098, 1, 0.3550750467677863, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.273679245965813, 1.332430213986582, 0, 0, 0.4887282232531703, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 2.260103730378418, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8751328572913326, 2.124867142708669, 2, 0, 0.291710952430444, 2.285367282620721, 0, -9.89315544617935, 1, 0.08509527976787679, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771835670744954, 0, 1, 0.2736608562401613, 0, 0.564386425056878, 2.443179561229324, 0.7263391437598388, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.328912696621123, 0.4444444444444445, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9998982745133344, 2.000101725486665, 0, 1, 0.3332994248377782, 0, 0.4999745699217773, 2.164346263722067, 0.6667005751622218, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8747711876252583, 2.124253548407097, 1, 1, 0.2916852192364913, 1.143156078007896, 0.4707535975401169, -2.910771634936506, 0.9149197328789598, 0.4982901713519428, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8756017990580822, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3044934105079814, 1.142071659829545, 0, -4.943928508687277, 1, 0.3044934105079814, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.058591364940419, 0, 0, 0.501588345850918, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.999316024875435, 2.000683975124564, 0, 1, 0.3331053416251452, 0, 0.4998290646766136, 2.163716384218852, 0.6668946583748548, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.0005772478285428682, 2.999422752171457, 0, 1, 0.0001924159428476227, 0, 0.3333974843246227, 1.4432486029144, 0.9998075840571524, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.392523090580537, 0, 2, 0.202128620208793, 0, 0.8359375957014095, 3.618700871614765, 0.6365987386899246, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.001526279800284891, 2.259752657767007, 0, 1, 0.0006749630817005175, 0, 0.442526307719075, 1.915657752073969, 0.9993250369182994, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 1.999999999999999, 0, 0, 0.23257252593046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8751329736843309, 2.124867026315671, 2, 0, 0.2917109912281101, 2.285366978666056, 0, -9.89315413038614, 0.9999999999999999, 0.08509530240328667, 0.231004889699101],
[0.8756020452750947, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3044934700591821, 1.142071338681972, 0, -4.94392711846747, 1, 0.3044934700591821, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999784976890342, 0, 1, 0.3333572265024898, 0, 0.5000537615574032, 2.164689077398994, 0.6666427734975102, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.328912696621123, 0.4444444444444445, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9993153211122804, 2.000684678887719, 0, 1, 0.3331051070374269, 0, 0.4998288888561642, 2.163715623107477, 0.6668948929625731, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 1.999999999999999, 0, 0, 0.23257252593046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8756018073242431, 2.124398192675759, 1, 0, 0.2918672691080809, 1.142071649047763, 0, -4.943928462013884, 1, 0.2918672691080808, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8737297332375175, 2.126055190145621, 1, 1, 0.2912641257801011, 1.144518678899253, 0.4703546759439985, -2.91839711199792, 0.9151652090335535, 0.4976934605937556, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9414086350595809, 2.058591364940419, 0, 0, 0.3138028783531936, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3324302139865823, 2.667569786013417, 0, 0, 0.1108100713288608, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.004212117699076074, 2.259444836030733, 0, 2, 0.001860757961640699, 0, 0.885173193036874, 3.831837474045983, 0.9962819464969105, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9982797459993663, 2.001720254000633, 1, 2, 0.3327599153331222, 1.001723218373936, 0.9991406121823494, -0.01117987673312949, 0.7415049688890635, 0.7029384885651384, 0.231004889699101],
[0.3712403338516614, 2.076045377967965, 0, 0, 0.1516947253272008, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2302008167854476],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.010736305205006, 1.92870487470438, 2, 2, 0.3438532167655637, 1.978755477269952, 1.036965284959187, -4.076927521047319, 0.8793165822409015, 0.4261048022845964, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6056996372253766, 2.393326427190975, 0, 2, 0.2019654461866951, 0, 0.835657007451082, 3.6174862295754, 0.6368591490800006, 1, 0.231004889699101],
[0.8756017723916691, 2.1241832044749, 1, 1, 0.2918881783674644, 1.142071694611287, 0.4707691869012781, -2.906009948899456, 0.9148012913293233, 0.4985776480642521, 0.231004889699101],
[0.66930792365045, 2.330692076349549, 0, 1, 0.2231026412168167, 0, 0.4290571071774749, 1.8573507588361, 0.7768973587831833, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9998983354334577, 2.000101664566541, 0, 1, 0.333299445144486, 0, 0.4999745851502596, 2.164346329644836, 0.666700554855514, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999784924874562, 0, 1, 0.3333572322828495, 0, 0.5000537745641449, 2.164689133704043, 0.6666427677171505, 1, 0.231004889699101],
[0.9410384625046047, 2.058961537495395, 1, 1, 0.3136794875015349, 1.062655821036759, 0.4856817292548557, -2.497670471536122, 0.9016051791207743, 0.5289641541238443, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.440715995758801, 1, 0, 0.4097158381957122, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.4097158381957122, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9988416772346594, 2.00115832276534, 0, 1, 0.3329472257448866, 0, 0.4997105869255414, 2.163203504377968, 0.6670527742551134, 1, 0.231004889699101],
[0.9754128636911038, 1.961389061792432, 0, 1, 0.3321343721642054, 0, 0.5098427535259842, 2.207064769018906, 0.6678656278357946, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999784973071972, 0, 1, 0.333357226926814, 0, 0.500053762512201, 2.16468908153223, 0.6666427730731861, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8756020759766598, 2.12394396917682, 1, 2, 0.2919115302101846, 1.142071298637095, 0.9416444261357528, -0.8676304331151213, 0.7941119055734427, 0.6449720312127982, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.80553722816395, 2.000853546595833, 1, 0, 0.2870367289576418, 1.241407553911923, 0, -5.373944921810693, 1, 0.2870367289576418, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.328912696621123, 0.4444444444444445, 1, 0.231004889699101],
[0.9993158584579275, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3331812672012868, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6668187327987132, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9993165843182675, 2.000573573090983, 0, 2, 0.3331177249440667, 0, 0.9997132956774508, 4.327671578639062, 0.4447319687837775, 1, 0.231004889699101],
[0.9995695285790404, 2.000215191833224, 0, 2, 0.3332137542328931, 0, 0.9998924156590236, 4.328446973401511, 0.4446038975441927, 1, 0.231004889699101],
[1.000475157977855, 1.875126340009023, 0, 1, 0.3479185689248868, 0, 0.5332973990409564, 2.308597881783417, 0.6520814310751133, 1, 0.231004889699101],
[1.001423816833491, 1.873457239259434, 0, 2, 0.3483357388686072, 0, 1.067545048848079, 4.621309316173465, 0.4246663092359241, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6069314998352525, 2.393068500164746, 0, 2, 0.2023104999450842, 0, 0.8357470752978085, 3.617876125420652, 0.6363085384978615, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849637103956, 2.000101664569089, 1, 3, 0.3332742491951435, 1.000215082540156, 1.499923755448868, 2.163195218766215, 0.5926976310596607, 0.802399100847496, 0.231004889699101],
[0.8742506560699673, 2.125411221135377, 2, 2, 0.2914497339561715, 2.287673433372794, 0.9409943732825579, -5.829656081498423, 0.9226195152390932, 0.3332508020661428, 0.231004889699101],
[0.6075667400553818, 2.392433259944617, 0, 3, 0.2025222466851274, 0, 1.253953474994512, 5.428255118875918, 0.5071725384667247, 1, 0.231004889699101],
[1.002578747433469, 1.870947742767998, 0, 1, 0.3489018635645766, 0, 0.5344884718803192, 2.313753932120335, 0.6510981364354234, 1, 0.231004889699101],
[0.8049917610827746, 2.001398760399417, 0, 2, 0.2868423887982701, 0, 0.9993011085911048, 4.325887256727595, 0.5085937784149578, 1, 0.231004889699101],
[0.606578233299132, 2.393421766700867, 1, 0, 0.2021927444330441, 1.648591962426804, 0, -7.136610677696924, 1, 0.202192744433044, 0.231004889699101],
[1.001898076898634, 1.872299835502309, 0, 2, 0.3485835378892558, 0, 1.068204975547322, 4.624166081240658, 0.4243434071088785, 1, 0.231004889699101],
[0.999426048044599, 2.0005739519554, 1, 1, 0.3331420160148664, 1.000574281565428, 0.4998565531769422, -2.167563331844204, 0.8890163971655506, 0.5553004291952832, 0.231004889699101],
[1.001520099227417, 1.998049620112977, 0, 3, 0.3338879215808499, 0, 1.501464212800866, 6.499707494315906, 0.2955574602652824, 1, 0.231004889699101],
[0.9997848154583923, 2.000215184541607, 0, 1, 0.3332616051527975, 0, 0.499946209652024, 2.164223494590252, 0.6667383948472025, 1, 0.231004889699101],
[0.8756018074784718, 2.12439819252153, 1, 0, 0.2918672691594905, 1.142071648846598, 0, -4.943928461143059, 1, 0.2918672691594905, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 1, 0.2020364866507985, 0, 0.4177300437388062, 1.808316890101015, 0.7979635133492015, 1, 0.231004889699101],
[0.5307835130581536, 2.438559794459516, 1, 1, 0.1787545117179062, 1.884007274902749, 0.4100781134307354, -6.380510661016324, 0.9680468245404928, 0.3255558479763054, 0.231004889699101],
[1.009038516900443, 1.38517874945646, 1, 2, 0.4214481831199136, 0.9910424461018517, 1.44385697570425, 1.960194566410342, 0.6168583349538056, 0.8063458602540292, 0.231004889699101],
[0.9994263959297286, 2.00057360407027, 0, 1, 0.3331421319765763, 0, 0.499856640098344, 2.163835755812096, 0.6668578680234237, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393206460223469, 0, 1, 0.202082566853063, 0, 0.4178494486876086, 1.808833783699925, 0.797917433146937, 1, 0.231004889699101],
[0.9997848817812603, 2.000101703303436, 1, 1, 0.3332742266831508, 1.000215164504545, 0.4999745754670205, -2.165497837249766, 0.8889282898287479, 0.5554767431950494, 0.231004889699101],
[0.9993156931725383, 2.000684306827461, 0, 1, 0.3331052310575129, 0, 0.4998289818075931, 2.163716025486097, 0.6668947689424871, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8057067803469576, 2.00068404490802, 0, 1, 0.2870971402472976, 0, 0.4998290472426766, 2.163716308748861, 0.7129028597527024, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.874665635613711, 2.125334364386291, 1, 0, 0.2915552118712368, 1.143294030636459, 0, -4.949220045193305, 1, 0.2915552118712368, 0.231004889699101],
[0.3708770042129886, 1.754574565569684, 1, 1, 0.1744932745049142, 2.696311684575936, 0.5699387302330551, -9.204882879806663, 0.9695520971525529, 0.3185386461623809, 0.231004889699101],
[1.00083827952863, 1.999161720471369, 1, 1, 0.3336127598428767, 0.999162422595362, 0.500209657758061, -2.159922958718405, 0.888702526470019, 0.5559280461557725, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.068819159258423, 0, 0, 0.1516947253272009, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8759485900705484, 2.123714548577542, 0, 1, 0.2920156529527269, 0, 0.4708730750419341, 2.038368433046059, 0.7079843470472731, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.001739557448463802, 2.998260442551536, 0, 2, 0.0005798524828212673, 0, 0.6670534592711996, 2.887616189164136, 0.9988406312632594, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997850373379004, 2.000101629759576, 0, 1, 0.3332742694260636, 0, 0.4999745938511164, 2.164346367310086, 0.6667257305739364, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849233831436, 2.000101683634953, 0, 1, 0.333274238114265, 0, 0.4999745803836412, 2.164346309010562, 0.666725761885735, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9998982653404852, 2.000101734659514, 0, 2, 0.3332994217801618, 0, 0.9999491352575967, 4.328692507591922, 0.4444896609986665, 1, 0.231004889699101],
[0.9994254356303128, 2.000574564369686, 0, 1, 0.3331418118767711, 0, 0.4998564001612539, 2.16383471714538, 0.6668581881232289, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.3725915997079994, 2.067149561426362, 1, 1, 0.1527176758106431, 2.683903772344039, 0.4837579334656298, -9.524239256338875, 0.9766773114949951, 0.2821126631162816, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.065338435111527, 1.934661564888472, 0, 0, 0.3551128117038425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3046066817019545, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9988417399596293, 2.001158260040369, 0, 1, 0.3329472466532099, 0, 0.4997106025886363, 2.163203572182139, 0.66705275334679, 1, 0.231004889699101],
[0.6682593697295167, 1.45567043032243, 0, 1, 0.3146334543228183, 0, 0.686968684098708, 2.973827458776002, 0.6853665456771818, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8751330580240937, 2.124866941975908, 2, 0, 0.2917110193413644, 2.28536675841691, 0, -9.893153176946814, 1, 0.08509531880517773, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.0015210211043, 1.998478978895699, 0, 1, 0.3338403403681002, 0, 0.5003805446843232, 2.166103693026159, 0.6661596596318998, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3711774366808585, 1.757312613591829, 0, 1, 0.1743853285258749, 0, 0.5690507154308005, 2.463370867049725, 0.8256146714741252, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.870843433718866, 1.125738895814626, 1, 0, 0.624325724436251, 0.5345182723346326, 0, -2.313882935685377, 1, 0.624325724436251, 0.231004889699101],
[0.9410381776279505, 2.05896182237205, 1, 1, 0.3136793925426501, 1.062656142730227, 0.4856816620562391, -2.497672155016004, 0.9016052386940738, 0.5289640237793743, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.438767294069213, 0, 0, 0.4100432224230162, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8756019246591581, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3044934408864476, 1.142071496004609, 0, -4.943927799503432, 1, 0.3044934408864476, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 2.260103730378418, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3333333333333333, 2.000000000000001, 0, -8.657825393242247, 1, 0.1111111111111109, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9994227560836336, 1.439344537985579, 0, 1, 0.4098065274674254, 0, 0.6947606869718214, 3.00755835894553, 0.5901934725325746, 1, 0.231004889699101],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.934774957082464, 1, 0, 0.3407416291278857, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3407416291278857, 0.231004889699101],
[0.9997846993937364, 2.000215300606263, 1, 1, 0.3332615664645789, 1.000215346970597, 0.4999461806421045, -2.165621545847475, 0.8889367283175751, 0.5554598612467327, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997848008704014, 2.000215199129598, 0, 2, 0.3332616002901339, 0, 0.9998924120116219, 4.328446957612228, 0.4445400936476732, 1, 0.231004889699101],
[0.003474647098600884, 2.996525352901398, 0, 3, 0.001158215699533628, 0, 1.001159558718646, 4.333932325080747, 0.9965293757385147, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.771197508055796, 0, 0, 0.2737324662491851, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9988417398600006, 2.001158260139999, 0, 1, 0.3329472466200003, 0, 0.4997106025637578, 2.163203572074442, 0.6670527533799997, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9998753481735613, 1.934910137592658, 1, 3, 0.3406979327869042, 1.000124667366454, 1.550459601050252, 2.382351881817937, 0.5795015602614373, 0.8110539793241457, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.439742162029485, 0, 1, 0.4098793780602438, 0, 0.6945688098696665, 3.006727739721821, 0.5901206219397562, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.003389313759655266, 2.259063835923902, 0, 2, 0.001498070251810217, 0, 0.8853224810188017, 3.832483728686403, 0.9970061037108588, 1, 0.231004889699101],
[0.9754155648362265, 1.961385898406319, 0, 1, 0.3321353441983315, 0, 0.5098435758167364, 2.207068328643784, 0.6678646558016685, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.8751330351276801, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3043800145716795, 1.142683409104882, 0, -4.946576717892431, 1, 0.3043800145716795, 0.231004889699101],
[0.994211703722978, 2.005788296277021, 0, 1, 0.3314039012409927, 0, 0.4985571018916192, 2.15821016836926, 0.6685960987590073, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9404641637878659, 2.059535836212134, 2, 0, 0.3134880545959553, 2.126609473288901, 0, -9.205906749675078, 0.9999999999999999, 0.09827476037435678, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9754150149220018, 1.961386542426149, 0, 1, 0.3321351463061652, 0, 0.509843408409973, 2.20706760395452, 0.6678648536938347, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 1, 0.2020364866507985, 0, 0.4177300437388062, 1.808316890101015, 0.7979635133492015, 1, 0.231004889699101],
[0.8751329861942032, 2.124867013805798, 2, 0, 0.2917109953980676, 2.285366945997136, 0, -9.893153988965238, 0.9999999999999999, 0.08509530483613148, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6067934954985307, 2.393206504501468, 0, 1, 0.2022644984995103, 0, 0.4178494409567515, 1.808833750233719, 0.7977355015004897, 1, 0.231004889699101],
[1.001524695687513, 1.998260281179026, 0, 2, 0.3338654948307885, 0, 1.000870616724638, 4.332681520414297, 0.4437351789770302, 1, 0.231004889699101],
[0.606578226949837, 2.393421773050162, 1, 0, 0.2021927423166124, 1.648591979683271, 0, -7.13661075239866, 1, 0.2021927423166124, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393206647082072, 0, 1, 0.2020825542632377, 0, 0.4178494160624427, 1.80883364246843, 0.7979174457367624, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9997849233835995, 2.0002150766164, 0, 1, 0.3332616411278666, 0, 0.4999462366275222, 2.164223611364828, 0.6667383588721334, 1, 0.231004889699101],
[0.6699915404977461, 2.330008459502253, 0, 1, 0.2233305134992487, 0, 0.4291829911268324, 1.857895699462775, 0.7766694865007513, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.876070199948053, 1.123929800051948, 0, 0, 0.6253567333160175, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393890540047604, 0, 0, 0.2020364866507985, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6694178658709625, 2.330582134129037, 0, 0, 0.2231392886236542, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8746654578812201, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3042668688571138, 1.14329426295442, 0, -4.949221050877477, 1, 0.3042668688571138, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8758165243339648, 2.124183475666037, 1, 1, 0.2919388414446548, 1.141791656375145, 0.4707691267989222, -2.904797948001332, 0.9147717128559527, 0.4986493957452622, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[1.003535542711508, 2.00685527358984, 0, 1, 0.3333572296584668, 0, 0.4982920358831912, 2.164689108140582, 0.6666427703415332, 1, 0.2301910394473285],
[1.003535542711508, 2.007071085423015, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2301910394473285],
[0.3738504853026438, 2.07353917469818, 1, 0, 0.1527547866254031, 2.67486612780633, 0, -11.62020091758777, 1, 0.1527547866254031, 0.2301910394473285],
[1.003535542711508, 2.007071085423015, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4982384566559772, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.2301910394473285],
[0.6699300075047804, 2.146044927767893, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2301910394473285],
[0.3716673805876725, 2.444645314414197, 0, 1, 0.1319695008467182, 0, 0.4090572951846093, 1.777033963471059, 0.8680304991532818, 1, 0.2301910394473285],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 1, 0.2920233999826841, 0, 0.4708253540091302, 2.038161852861258, 0.7079766000173159, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3701254794489625, 2.436938597842297, 0, 3, 0.131855016222545, 0, 1.231052765406665, 5.329119946379453, 0.6542997895125333, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6067927841075017, 2.391839499326315, 0, 3, 0.2023565168226117, 0, 1.254264761847515, 5.429602652486174, 0.507488802226128, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.77064929613825, 0, 1, 0.2737940125644099, 0, 0.5647645765770668, 2.444816546146316, 0.7262059874355901, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101],
[0.6676305036277524, 1.457820322783329, 1, 1, 0.3141124204482662, 1.4978344976244, 0.6859555902546071, -3.514552910231982, 0.9013333873201317, 0.529558228216664, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 2, 0.3333333333333333, 1, 1, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.231004889699101],
[1.273162772721411, 1.333520357952402, 1, 0, 0.4884225312005243, 0.7854455230908772, 0, -3.400125097412316, 1, 0.4884225312005244, 0.231004889699101],
[1.001520016662763, 1.998479983337236, 3, 1, 0.3338400055542545, 2.995446870843895, 0.5003802931916852, -10.80092538691366, 0.9875790871184195, 0.1115619998518779, 0.231004889699101],
[0.3708744603166437, 1.754574843788769, 1, 1, 0.1744922636358727, 2.696330179075216, 0.5699386398591207, -9.204963332100283, 0.9695524499312291, 0.3185369772029745, 0.231004889699101],
[0.806054011464343, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2872553443986286, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 1.753981665241157, 0, 0, 0.1741809615373078, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3699481348107901, 2.436105876653553, 0, 0, 0.1318392779680432, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.3704649391805554, 1.753464860871391, 1, 0, 0.1744242861376561, 2.699310769359, 0, -11.6850806616043, 1, 0.174424286137656, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9994263882434243, 2.000573611756575, 1, 1, 0.3331421294144749, 1.000573940975867, 0.4998566381778696, -2.167561489500134, 0.8890163216091893, 0.555300580438139, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 3, 0, 0.3333333333333333, 3.000000000000001, 0, -12.98673808986337, 1, 0.03703703703703698, 0.231004889699101],
[1.002346347941153, 2.008146790344469, 0, 2, 0.3329508827620036, 0, 0.9959431300621844, 4.326430727765644, 0.4449545248079903, 1, 0.2301997172104342],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9992565905313641, 2.000743409468635, 1, 1, 0.3330855301771214, 1.000743962537431, 0.4998142166893773, -2.168481136916829, 0.8890540295866258, 0.5552250899408688, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 4.328912696621123, 0.4444444444444445, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999570245785375, 1, 1, 0.3333810906429266, 1, 0.5001074616447035, -2.163991156232406, 0.8888570484017326, 0.555619229687586, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393206959051931, 0, 1, 0.2020825332438929, 0, 0.4178493615930943, 1.808833406675376, 0.7979174667561071, 1, 0.231004889699101],
[0.9765743677894606, 1.95954322258896, 1, 0, 0.3326073761451752, 1.023987555872027, 0, -4.432752731796449, 1, 0.3326073761451751, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393206954303476, 0, 1, 0.2020825335638257, 0, 0.4178493624221655, 1.808833410264353, 0.7979174664361743, 1, 0.231004889699101],
[0.6061094599523954, 2.393207080263816, 0, 1, 0.2020825250770973, 0, 0.4178493404297319, 1.808833315061028, 0.7979174749229027, 1, 0.231004889699101],
[0.8756017818351852, 2.124398218164817, 1, 0, 0.2918672606117282, 1.142071682293847, 0, -4.943928605933278, 1, 0.2918672606117283, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 2.164456348310562, 0.6666666666666667, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 2.138484225450926, 0, 0, 0.2379033986110073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9760575947631847, 1.960633999318246, 0, 0, 0.332366393778059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6675697860134177, 1.456360014038529, 0, 0, 0.314308780825567, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.8760701999480529, 2.123929800051949, 0, 0, 0.2920233999826841, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.6062193298768066, 2.393780670123193, 0, 1, 0.2020731099589356, 0, 0.4177492167436277, 1.808399888365019, 0.7979268900410644, 1, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -2.164456348310562, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.231004889699101],
[0.8756017444328084, 2.124398255567193, 1, 0, 0.2918672481442693, 1.142071731078806, 0, -4.943928817119107, 1, 0.2918672481442692, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.876070199948053, 0, 0, 0.3476966591490227, 0, 0, 0, 1, 1, 0.231004889699101],
[0.999426387857666, 2.000573612142333, 0, 1, 0.3331421292858888, 0, 0.4998566380814853, 2.163835747081291, 0.6668578707141113, 1, 0.231004889699101],
[0.3716957688371697, 1.756799822212625, 1, 2, 0.1746283950035554, 2.690372298636722, 1.13843363069167, -6.718207004044605, 0.9191653834495068, 0.4377252622231431, 0.231004889699101],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -4.328912696621123, 1, 0.3333333333333333, 0.231004889699101]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node120":{
"Global MG94xREV":0.0008013857275275428,
"Nucleotide GTR":0.0007956250993968524,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node17":{
"Global MG94xREV":0.0008014609264415202,
"Nucleotide GTR":0.000795699757755933,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node219":{
"Global MG94xREV":0.0008049231379872913,
"Nucleotide GTR":0.0007991370817693468,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node223":{
"Global MG94xREV":0.0006102498843069431,
"Nucleotide GTR":0.000605863204422919,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node224":{
"Global MG94xREV":0.0001914421626566639,
"Nucleotide GTR":0.0001900660124836347,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node230":{
"Global MG94xREV":0.0008016194937870024,
"Nucleotide GTR":0.0007958571852664034,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node233":{
"Global MG94xREV":0.0008016194941855458,
"Nucleotide GTR":0.0007958571856620815,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAT", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node243":{
"Global MG94xREV":0.0008022089071003866,
"Nucleotide GTR":0.0007964423616801307,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.0008018541966712547,
"Nucleotide GTR":0.0007960902010279739,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node274":{
"Global MG94xREV":0.0008054615563264397,
"Nucleotide GTR":0.0007996716297777363,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node277":{
"Global MG94xREV":0.0008026040532740577,
"Nucleotide GTR":0.0007968346674111954,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node287":{
"Global MG94xREV":0.0008016651309829147,
"Nucleotide GTR":0.0007959024944069147,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.0006315535883269623,
"Nucleotide GTR":0.0006270137703067689,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "S", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "TCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node299":{
"Global MG94xREV":0.0005929644868823059,
"Nucleotide GTR":0.0005887020602052389,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.0002089165142391723,
"Nucleotide GTR":0.0002074147525936222,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node304":{
"Global MG94xREV":0.0008014045409838962,
"Nucleotide GTR":0.0007956437776158008,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node309":{
"Global MG94xREV":0.0008015780178382984,
"Nucleotide GTR":0.0007958160074606636,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node312":{
"Global MG94xREV":0.0008016898929757106,
"Nucleotide GTR":0.0007959270784022405,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node326":{
"Global MG94xREV":0.0008017157312343804,
"Nucleotide GTR":0.0007959527309268824,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node330":{
"Global MG94xREV":0.0008016194667178138,
"Nucleotide GTR":0.0007958571583917963,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node334":{
"Global MG94xREV":0.0008016569879969736,
"Nucleotide GTR":0.0007958944099554756,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node348":{
"Global MG94xREV":0.0008021995138471214,
"Nucleotide GTR":0.0007964330359487055,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node351":{
"Global MG94xREV":0.000341544847300498,
"Nucleotide GTR":0.0003390897089224766,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node352":{
"Global MG94xREV":0.001261519187014094,
"Nucleotide GTR":0.001252450965973348,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node384":{
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node415":{
"Global MG94xREV":0.000802621977340145,
"Nucleotide GTR":0.0007968524626331126,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.0008024136311226715,
"Nucleotide GTR":0.0007966456140778018,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node43":{
"Global MG94xREV":0.0008015067789093633,
"Nucleotide GTR":0.0007957452806209313,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node437":{
"Global MG94xREV":0.0008027596180754884,
"Nucleotide GTR":0.0007969891139609021,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node458":{
"Global MG94xREV":0.0008014390598493642,
"Nucleotide GTR":0.0007956780483481419,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node467":{
"Global MG94xREV":0.0005846715971825803,
"Nucleotide GTR":0.0005804687825650343,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node468":{
"Global MG94xREV":0.0002167536865639462,
"Nucleotide GTR":0.000215195588707495,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node478":{
"Global MG94xREV":0.0008017084191078758,
"Nucleotide GTR":0.0007959454713623846,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node492":{
"Global MG94xREV":0.0008017835104381822,
"Nucleotide GTR":0.0007960200229111424,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node495":{
"Global MG94xREV":0.0008018667721716009,
"Nucleotide GTR":0.0007961026861314247,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node512":{
"Global MG94xREV":0.000801711203006985,
"Nucleotide GTR":0.0007959482352498974,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node513":{
"Global MG94xREV":0.000801239746064023,
"Nucleotide GTR":0.0007954801672968247,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node519":{
"Global MG94xREV":0.0008016290739767488,
"Nucleotide GTR":0.0007958666965905465,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node522":{
"Global MG94xREV":0.0004552689593677613,
"Nucleotide GTR":0.0004519963341084426,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node523":{
"Global MG94xREV":0.0003461125792651028,
"Nucleotide GTR":0.0003436246065049043,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node539":{
"Global MG94xREV":0.0006292131644205268,
"Nucleotide GTR":0.0006246901701486625,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node543":{
"Global MG94xREV":0.000801672772284722,
"Nucleotide GTR":0.0007959100807804954,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node549":{
"Global MG94xREV":0.0008017110025924271,
"Nucleotide GTR":0.000795948036275985,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.0008017036049575558,
"Nucleotide GTR":0.0007959406918177839,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node556":{
"Global MG94xREV":0.0008015828239422862,
"Nucleotide GTR":0.0007958207790167707,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node565":{
"Global MG94xREV":0.0008016196688860312,
"Nucleotide GTR":0.0007958573591067606,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node57":{
"Global MG94xREV":0.0008016870426845635,
"Nucleotide GTR":0.000795924248599939,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.0008017147391431685,
"Nucleotide GTR":0.0007959517459671529,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node583":{
"Global MG94xREV":0.0008017130269059821,
"Nucleotide GTR":0.0007959500460380995,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node599":{
"Global MG94xREV":0.0008017134501475399,
"Nucleotide GTR":0.0007959504662372557,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node622":{
"Global MG94xREV":0.0008014609291170862,
"Nucleotide GTR":0.0007956997604122667,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node630":{
"Global MG94xREV":0.0008013255193878347,
"Nucleotide GTR":0.0007955653240533527,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node81":{
"Global MG94xREV":0.0008020764640006058,
"Nucleotide GTR":0.0007963108706255644,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TYA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013067703430722,
"Nucleotide GTR":0.0007955467097829817,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCT", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406034_California_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013332867434289,
"Nucleotide GTR":0.000795573035574602,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCT", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016543736167873,
"Nucleotide GTR":0.0007958918143683273,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "I", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ATC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008049083211269679,
"Nucleotide GTR":0.0007991223714175611,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "C", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGC", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022514778413546,
"Nucleotide GTR":0.0007964846264084003,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCC", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021387781735152,
"Nucleotide GTR":0.0007963727368633952,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023323224069155,
"Nucleotide GTR":0.000796564889836236,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "V", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GTT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000802744529747311,
"Nucleotide GTR":0.0007969741340926651,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "K", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "AAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016541565917392,
"Nucleotide GTR":0.0007958915989033279,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "S", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "TCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017108105485752,
"Nucleotide GTR":0.0007959478456126096,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGT", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017417364055366,
"Nucleotide GTR":0.0007959785491641877,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "G", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "GGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008029906346523515,
"Nucleotide GTR":0.000797218469913493,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "DAGV", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "I", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GNC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ATT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGN", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013149002867422,
"Nucleotide GTR":0.0007955547812859025,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021347371208071,
"Nucleotide GTR":0.0007963687248591226,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTT", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019206270054635,
"Nucleotide GTR":0.0007961561538387636,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "S", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "TCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026505189942536,
"Nucleotide GTR":0.0007968807991202842,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "RC", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "S", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "YGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "AGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001698289686573254,
"Nucleotide GTR":0.0001686081813377512,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "S", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "TCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017111329608065,
"Nucleotide GTR":0.0007959481657072331,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008013853036127417,
"Nucleotide GTR":0.0007956246785292922,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802243783106934,
"Nucleotide GTR":0.0007964769869862999,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCA", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008030869231729185,
"Nucleotide GTR":0.00079731406628003,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "H", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CAT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415137_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017620135787417,
"Nucleotide GTR":0.0007959986805783029,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "N", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAT", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008024859236618513,
"Nucleotide GTR":0.000796717386954077,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "F", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTT", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022413229963303,
"Nucleotide GTR":0.000796474544559794,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018558746390918,
"Nucleotide GTR":0.0007960918669340178,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "A", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "GCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008051169352341431,
"Nucleotide GTR":0.0007993294859368941,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "EDAGV", "MLV", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAA", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GNN", "NTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016227403760463,
"Nucleotide GTR":0.0007958604085178807,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "P", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "CCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008023087584501165,
"Nucleotide GTR":0.0007965414952650256,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAA", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017991637273887,
"Nucleotide GTR":0.0007960355636792791,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025614081235041,
"Nucleotide GTR":0.0007967923288082205,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "Y", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TAC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022569152721849,
"Nucleotide GTR":0.0007964900247531636,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACC", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017471617602764,
"Nucleotide GTR":0.000795983935519666,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "V", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "GTT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016595619024452,
"Nucleotide GTR":0.0007958969653588563,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "V", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GTT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017991621998825,
"Nucleotide GTR":0.0007960355621627528,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCT", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022614605260754,
"Nucleotide GTR":0.0007964945373342516,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "D", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GAC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013148996077526,
"Nucleotide GTR":0.000795554780611794,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016592966035885,
"Nucleotide GTR":0.0007958967019670547,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "I", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ATT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023842578218143,
"Nucleotide GTR":0.0007966164519220352,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "Y", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "TAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008013148996077526,
"Nucleotide GTR":0.000795554780611794,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "S", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "TCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022569157689753,
"Nucleotide GTR":0.0007964900252463824,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "P", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "CCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008023323334169116,
"Nucleotide GTR":0.0007965649007670892,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "F", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "TTT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022569152721849,
"Nucleotide GTR":0.0007964900247531636,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAC", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001605589573502076,
"Nucleotide GTR":0.001594048059664545,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "KQE", "K", "D", "K", "KQE", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "F", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "NAA", "AAG", "GAC", "AAA", "NAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "TTC", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014979037575839,
"Nucleotide GTR":0.0007957364692667052,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "G", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GGT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021650839835083,
"Nucleotide GTR":0.0007963988535784466,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "GV", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GKC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417257_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCY", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417259_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417279_England_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024881894159769,
"Nucleotide GTR":0.0007967196364212052,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417279_England_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013148996108862,
"Nucleotide GTR":0.0007955547806149047,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "H", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAT", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417281_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008025165435085511,
"Nucleotide GTR":0.0007967477866950966,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "V", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GTA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417297_England_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008015142132478158,
"Nucleotide GTR":0.0007957526615188764,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCT", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417377_Washington_20200315_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008016052589539364,
"Nucleotide GTR":0.0007958430527580675,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417377_Washington_20200315_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_27":{
"Global MG94xREV":0.0008017143644037401,
"Nucleotide GTR":0.0007959513739214773,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022070765569574,
"Nucleotide GTR":0.0007964405442952591,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "S", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "AGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008027397877685646,
"Nucleotide GTR":0.0007969694262008437,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCC", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "ED", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAM", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603060485796633,
"Nucleotide GTR":0.001591537151885797,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "S", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAT", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "TCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016052589187749,
"Nucleotide GTR":0.0007958430527231602,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "S", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "TCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016173080579699,
"Nucleotide GTR":0.0007958550152491207,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "S", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TCC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802558713450098,
"Nucleotide GTR":0.0007967896535050255,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002408029857885213,
"Nucleotide GTR":0.002390720135410277,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "Y", "V", "V", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TAT", "GTT", "GTA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018047318325358,
"Nucleotide GTR":0.0007960410917590277,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "F", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "TTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017991637273887,
"Nucleotide GTR":0.0007960355636792791,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "S", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "TCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008026347406013674,
"Nucleotide GTR":0.0007968651341477531,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGC", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008044761881985972,
"Nucleotide GTR":0.0007986933448049356,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "Q", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "CAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "KTRIQPLEAGVS", "SI", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "KQE", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "DAGV", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "NNA", "AKT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "NAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GNT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 18.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "VF", "QP", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "KTC", "CMA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017991599599108,
"Nucleotide GTR":0.0007960355599388834,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "S", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "TCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801710916846817,
"Nucleotide GTR":0.0007959479511467429,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603503646333666,
"Nucleotide GTR":0.001591977126836952,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACC", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001606125996951353,
"Nucleotide GTR":0.001594580627122996,
"amino-acid": [
["M", "S", "Y", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "TAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCA", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080162713074632,
"Nucleotide GTR":0.0007958647673287068,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGT", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017144912331103,
"Nucleotide GTR":0.0007959514998391539,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "D", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "GAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "TPAS", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "NCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022614605260754,
"Nucleotide GTR":0.0007964945373342516,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "T", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "ACG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009912635307376,
"Nucleotide GTR":0.0007952334709389387,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017991632061753,
"Nucleotide GTR":0.0007960355631618132,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "F", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTT", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016489087938152,
"Nucleotide GTR":0.0007958863888283278,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGT", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022079276281259,
"Nucleotide GTR":0.0007964413892486428,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAC", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016053543273586,
"Nucleotide GTR":0.0007958431474459151,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "L", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CTG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "KI", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AWA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022342596763544,
"Nucleotide GTR":0.0007964675320133185,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "F", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TTC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016981266112939,
"Nucleotide GTR":0.0007959352528517031,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAG", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008026347373065417,
"Nucleotide GTR":0.00079686513087661,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "T", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ACC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008022288396155008,
"Nucleotide GTR":0.000796462150913672,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "H", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CAC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802504814836358,
"Nucleotide GTR":0.0007967361423325146,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001724395700382263,
"Nucleotide GTR":0.0001712000168444466,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016050516375709,
"Nucleotide GTR":0.000795842846931962,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "V", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GTA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008017129796705439,
"Nucleotide GTR":0.000795949999142205,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAT", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008024653450198581,
"Nucleotide GTR":0.0007966969562382313,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013853037410547,
"Nucleotide GTR":0.0007956246786566834,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014160217428094,
"Nucleotide GTR":0.0007956551758471849,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "F", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "TTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418669_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016052587683909,
"Nucleotide GTR":0.0007958430525738577,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACT", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418754_England_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008016053476565089,
"Nucleotide GTR":0.0007958431408230184,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008013149052597063,
"Nucleotide GTR":0.0007955547862231195,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCT", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418908_Washington_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008022460490970895,
"Nucleotide GTR":0.0007964792366877627,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCC", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418908_Washington_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418922_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022140696140972,
"Nucleotide GTR":0.0007964474870839685,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCT", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418922_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022288395641295,
"Nucleotide GTR":0.0007964621508626718,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "S", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "AGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008028484719346053,
"Nucleotide GTR":0.0007970773291088187,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023433033321051,
"Nucleotide GTR":0.000796575791826872,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "S", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGT", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008013371357541227,
"Nucleotide GTR":0.0007955768569173199,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATT", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023322131973094,
"Nucleotide GTR":0.0007965647814116664,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "M", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "ATG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022505874572219,
"Nucleotide GTR":0.0007964837424246469,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "E", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GAA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026397651111869,
"Nucleotide GTR":0.0007968701225397185,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "H", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CAC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016926012650245,
"Nucleotide GTR":0.0007959297672234676,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "G", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GGG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "KAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "RC", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "YGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "SL", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TYA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "TS", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "WCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023843575534459,
"Nucleotide GTR":0.0007966165509367639,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "T", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "ACT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026454504151556,
"Nucleotide GTR":0.0007968757669758237,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "T", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "ACA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "QH", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAM", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801605280749535,
"Nucleotide GTR":0.0007958430743969944,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "I", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ATA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016053497004464,
"Nucleotide GTR":0.0007958431428522618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "I", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ATA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025198361253288,
"Nucleotide GTR":0.0007967510556434451,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "T", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ACC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008048961476753703,
"Nucleotide GTR":0.0007991102854727969,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "R", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "CGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603860220238232,
"Nucleotide GTR":0.001592331137569261,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGT", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACT", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "AS", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "KCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024054804571698,
"Nucleotide GTR":0.0007966375220020041,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTA", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016927149736728,
"Nucleotide GTR":0.00079592988011474,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGG", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021347463270614,
"Nucleotide GTR":0.0007963687339992001,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "I", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ATT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016053475093762,
"Nucleotide GTR":0.000795843140676943,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAT", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "DY", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "KAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008013533370636516,
"Nucleotide GTR":0.0007955929417664281,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCT", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024922608718417,
"Nucleotide GTR":0.0007967236786100869,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016053475226108,
"Nucleotide GTR":0.0007958431406900817,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCT", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008028425389067069,
"Nucleotide GTR":0.0007970714387295053,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "E", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAA", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAY", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021684769754079,
"Nucleotide GTR":0.0007964022221803854,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATT", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603860294378866,
"Nucleotide GTR":0.001592331211176947,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "V", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAT", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GTC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022070768821384,
"Nucleotide GTR":0.0007964405446181026,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "I", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "ATC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011105444985534,
"Nucleotide GTR":0.0007953518944753379,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGT", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023140220268172,
"Nucleotide GTR":0.0007965467210053798,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017108614932706,
"Nucleotide GTR":0.0007959478961910982,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008021067451405246,
"Nucleotide GTR":0.0007963409340945402,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802223015853972,
"Nucleotide GTR":0.0007964563690152852,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGG", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018674964028904,
"Nucleotide GTR":0.0007961034051566978,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008054764118917555,
"Nucleotide GTR":0.00079968637855629,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGC", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604181702537248,
"Nucleotide GTR":0.001592650308946193,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "A", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGG", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GCC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008022505875236127,
"Nucleotide GTR":0.0007964837424905591,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "N", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "AAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008049022329238163,
"Nucleotide GTR":0.0007991163269784466,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "R", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "CGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016053476120598,
"Nucleotide GTR":0.000795843140778888,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "L", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CTC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604297576439058,
"Nucleotide GTR":0.001592765349907713,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "P", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "S", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "CCT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "TCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008026497246362245,
"Nucleotide GTR":0.0007968800104723649,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802384466458939,
"Nucleotide GTR":0.0007966166590594064,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAY", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420461_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420524_England_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008006375472984856,
"Nucleotide GTR":0.0007948822973370428,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420524_England_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022070671508144,
"Nucleotide GTR":0.0007964405349567301,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCA", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016053497004464,
"Nucleotide GTR":0.0007958431428522618,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "L", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CTT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802207067475956,
"Nucleotide GTR":0.0007964405352795345,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008021160459229236,
"Nucleotide GTR":0.0007963501680198094,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAA", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420641_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "SG", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "PL", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "RGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CYT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420657_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008025259827719022,
"Nucleotide GTR":0.0007967571581058714,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTT", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420691_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "VF", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "KTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "PA", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "SCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "DY", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "KAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420743_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "PS", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "YCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420745_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022560245800825,
"Nucleotide GTR":0.000796489140463654,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "I", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATA", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420772_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGY", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008051724886667644,
"Nucleotide GTR":0.0007993846400328957,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "F", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "-", "ILVF", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTT", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTN", "---", "NTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0008031758192529739,
"Nucleotide GTR":0.0007974023233453867,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGY", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "YS", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TMT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "AS", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "KCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017490060609869,
"Nucleotide GTR":0.0007959857665629283,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "E", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAG", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008032419209394,
"Nucleotide GTR":0.0007974679498708248,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "PL", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGW", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CYT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010587146840146,
"Nucleotide GTR":0.0007953004372308071,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAT", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016050835629165,
"Nucleotide GTR":0.0007958428786278176,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGT", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011455767893196,
"Nucleotide GTR":0.0007953866749423043,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTT", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022070669384912,
"Nucleotide GTR":0.000796440534745933,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTA", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008022856926962695,
"Nucleotide GTR":0.0007965185953155171,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "K", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AAA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015672270097893,
"Nucleotide GTR":0.000795805294200232,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACC", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008025480156171359,
"Nucleotide GTR":0.0007967790325716594,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "T", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "ACT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013522998888194,
"Nucleotide GTR":0.0007955919120471556,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTC", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017991637273887,
"Nucleotide GTR":0.0007960355636792791,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "L", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TTG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017143646094545,
"Nucleotide GTR":0.0007959513741257119,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008015680811635015,
"Nucleotide GTR":0.0007958061422140031,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016543937043075,
"Nucleotide GTR":0.0007958918343114518,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "V", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GTT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080222967433498,
"Nucleotide GTR":0.0007964629796329087,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801710687523611,
"Nucleotide GTR":0.0007959477234719905,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008016598275038866,
"Nucleotide GTR":0.000795897229051065,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016598357254556,
"Nucleotide GTR":0.0007958972372135339,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "I", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ATT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008138502517724449,
"Nucleotide GTR":0.0008080000244805334,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421653_Latvia_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016053475511277,
"Nucleotide GTR":0.0007958431407183932,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "Y", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "TAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421653_Latvia_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421670_India_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019598251802253,
"Nucleotide GTR":0.0007961950702439597,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "C", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "TGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421670_India_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421672_India_20200312_null_74":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421672_India_20200312_null_74",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000802093357664993,
"Nucleotide GTR":0.0007963276428526507,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421720_New_York_20200318_null_8":{
"Global MG94xREV":0.000802456649229755,
"Nucleotide GTR":0.000796688322956371,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "Y", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TAT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421720_New_York_20200318_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008018047335356726,
"Nucleotide GTR":0.0007960410934499207,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421783_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025458667198348,
"Nucleotide GTR":0.000796776899121348,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421783_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421803_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421803_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421804_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "AV", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GYG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421804_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421842_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCY", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421842_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421843_England_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421843_England_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "SL", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TYG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421844_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021347461450837,
"Nucleotide GTR":0.0007963687338185313,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGT", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421850_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421855_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017254754364967,
"Nucleotide GTR":0.0007959624050844212,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "C", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "TGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421855_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "PS", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "KGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "YCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421860_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "TM", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "AYG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421871_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "DG", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "AV", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GRT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GYR", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421872_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421877_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017130499112283,
"Nucleotide GTR":0.0007959500688779753,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421877_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421878_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080142399618013,
"Nucleotide GTR":0.0007956630929615899,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "S", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "TCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTY", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421878_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421879_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020893719879037,
"Nucleotide GTR":0.0007963236858259397,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421879_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008040729136534016,
"Nucleotide GTR":0.0007982929691317932,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "-", "RG", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "L", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "SR", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "---", "NGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CTA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "MGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421898_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421906_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAY", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAY", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014160638835265,
"Nucleotide GTR":0.0007956552176849829,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGT", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421929_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421940_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "SI", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AKT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421940_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025298630511737,
"Nucleotide GTR":0.0007967610104924016,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "H", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAT", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421948_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAY", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421955_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025330759209908,
"Nucleotide GTR":0.0007967642002670374,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421963_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021378340276186,
"Nucleotide GTR":0.0007963717995043351,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "P", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CCA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421989_England_20200402_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0008017991735269429,
"Nucleotide GTR":0.0007960355734083911,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "S", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "TCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421989_England_20200402_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422007_England_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422007_England_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422012_England_20200402_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008016488961321066,
"Nucleotide GTR":0.0007958863762576352,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "L", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CTA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422012_England_20200402_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800954075374861,
"Nucleotide GTR":0.0007951965501039389,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "R", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CGA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011981193306303,
"Nucleotide GTR":0.000795438839790288,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAT", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008017108515957663,
"Nucleotide GTR":0.0007959478863647403,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "DY", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "KAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024863154756228,
"Nucleotide GTR":0.0007967177759513585,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801648969385696,
"Nucleotide GTR":0.0007958864489846532,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTT", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018047318578129,
"Nucleotide GTR":0.000796041091784123,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "Y", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "TAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATY", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "SI", "S", "R", "N", "S", "T", "PS", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AKT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "YCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022614515589994,
"Nucleotide GTR":0.0007964945284316342,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "S", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "AGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008013350215289862,
"Nucleotide GTR":0.0007955747578899403,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "H", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAT", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "KQE", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACN", "NAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCT", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "TI", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AYT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RM", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TYA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AKG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011901576150951,
"Nucleotide GTR":0.0007954309353062217,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "L", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CTT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019957643430092,
"Nucleotide GTR":0.0007962307510640458,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "PS", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "YCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "KE", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "RAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCK", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422203_Wales_20200327_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008016485544992442,
"Nucleotide GTR":0.0007958860370805437,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422203_Wales_20200327_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008017991661661779,
"Nucleotide GTR":0.0007960355661005374,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "I", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "ATT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422238_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422238_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "N", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCR", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "AAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021347463270614,
"Nucleotide GTR":0.0007963687339992001,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "I", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ATC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602121925562612,
"Nucleotide GTR":0.001590605338336051,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "S", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "TCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "SI", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AKT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCY", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAY", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016486912665821,
"Nucleotide GTR":0.0007958861728647514,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "I", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ATA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001605487446931437,
"Nucleotide GTR":0.001593946667213789,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "T", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "AGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "ACC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021350628060322,
"Nucleotide GTR":0.0007963690482032141,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "L", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CTA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "RM", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AKG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021347462930851,
"Nucleotide GTR":0.000796368733965468,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "L", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TTA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422365_Wales_20200327_null_29":{
"Global MG94xREV":0.0008025502124344086,
"Nucleotide GTR":0.0007967812135974761,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422365_Wales_20200327_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_41":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_41",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422413_Taipei_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008027398141997322,
"Nucleotide GTR":0.0007969694524420167,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "P", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "CCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422413_Taipei_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017870745946426,
"Nucleotide GTR":0.0007960235614472549,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422417_Taipei_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422417_Taipei_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014394655204315,
"Nucleotide GTR":0.0007956784511031095,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTT", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "GV", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GKC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "DV", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GWT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422508_New_York_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018047318325358,
"Nucleotide GTR":0.0007960410917590277,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "L", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CTT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422508_New_York_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024566017555511,
"Nucleotide GTR":0.0007966882758234275,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "R", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGA", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018047335609507,
"Nucleotide GTR":0.000796041093475018,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "I", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "ATT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022460491128653,
"Nucleotide GTR":0.0007964792367034237,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAC", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604037129068778,
"Nucleotide GTR":0.001592506774720073,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "L", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CTC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AGC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022514872518934,
"Nucleotide GTR":0.0007964846357512928,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "A", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GCC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018047766794053,
"Nucleotide GTR":0.0007960411362835226,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATT", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022514777257318,
"Nucleotide GTR":0.0007964846262936087,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "T", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ACG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008016541055180883,
"Nucleotide GTR":0.0007958915481968117,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "S", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "TCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025587135240484,
"Nucleotide GTR":0.0007967896535784465,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "-"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008016543937043075,
"Nucleotide GTR":0.0007958918343114518,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "C", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "TGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021643877979129,
"Nucleotide GTR":0.0007963981623972646,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "V", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GTG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008030260166910202,
"Nucleotide GTR":0.0007972535976142571,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATA", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422685_Netherlands_20200319_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422685_Netherlands_20200319_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008017620044636695,
"Nucleotide GTR":0.0007959986715287533,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000801173649468248,
"Nucleotide GTR":0.0007954145458254435,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022190517870173,
"Nucleotide GTR":0.0007964524334433667,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "S", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AGT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422777_Netherlands_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022557226683046,
"Nucleotide GTR":0.0007964888407221172,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAA", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422777_Netherlands_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018047335580395,
"Nucleotide GTR":0.0007960410934721283,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008039654048312581,
"Nucleotide GTR":0.0007981862331189523,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACA", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422796_Netherlands_20200330_null_31":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422796_Netherlands_20200330_null_31",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001605284963710898,
"Nucleotide GTR":0.001593745639510232,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017417037614729,
"Nucleotide GTR":0.000795978516754779,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTG", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018047335327607,
"Nucleotide GTR":0.0007960410934470306,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "C", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "TGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422856_Netherlands_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008016543736372312,
"Nucleotide GTR":0.0007958918143886239,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "V", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GTT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422856_Netherlands_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422872_Noord_Brabant_20200309_null_57":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422872_Noord_Brabant_20200309_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021433588347947,
"Nucleotide GTR":0.0007963772845973543,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "T", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "ACT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_3929":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_3929",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008013799106733379,
"Nucleotide GTR":0.0007956193243561368,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "C", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "TGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801659827297341,
"Nucleotide GTR":0.0007958972288460037,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATT", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008025079087354241,
"Nucleotide GTR":0.0007967392139916016,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "L", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TTG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422940_Zuid_Holland_20200324_null_930":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422940_Zuid_Holland_20200324_null_930",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016598279886367,
"Nucleotide GTR":0.0007958972295323306,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008024822341293809,
"Nucleotide GTR":0.0007967137239431968,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "S", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "TCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00080179916220787,
"Nucleotide GTR":0.000796035562170684,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "Y", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "TAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":9128.257598950615,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03561114985744156],
[0.02373243160753767],
[0.01703648489591286],
[0.03333034595489977],
[0.02770819660461109],
[0.0184656458305776],
[0.01325568746971527],
[0.02593355683023755],
[0.02277441638471441],
[0.01517761379274516],
[0.01089535166105677],
[0.02131577273023231],
[0.01615240041889329],
[0.01076448639747708],
[0.007727358618601537],
[0.01511788010549961],
[0.02728633298513583],
[0.01818450215684103],
[0.01305386660152941],
[0.02553871250650229],
[0.02123085275251333],
[0.01414893264990811],
[0.01015690601661266],
[0.01987107043697252],
[0.01745044210881026],
[0.01162954371107151],
[0.008348345801915263],
[0.01633278551467652],
[0.0123764545122395],
[0.008248072905013098],
[0.005920934348000552],
[0.01158377396515944],
[0.03337548762354213],
[0.02224251338597016],
[0.01596693712695107],
[0.03123787222146313],
[0.0259686804989427],
[0.01730637556906544],
[0.01242349755225817],
[0.024305452322853],
[0.02134464220403693],
[0.01422476565127857],
[0.01021134324427749],
[0.01997757196249142],
[0.0151383553305459],
[0.01008869368079976],
[0.007242236293134287],
[0.01416878203526635],
[0.01470211281649484],
[0.02064796876044094],
[0.01716507769449241],
[0.01143936755913218],
[0.008211826578194071],
[0.01606569796792482],
[0.009402449523767089],
[0.00674961133124533],
[0.01320500573363518],
[0.01000632455800877],
[0.006668541009386791],
[0.004787056803235885],
[0.009365444828110433]
],
"Log Likelihood":-4163.978180909688,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.041411751321813, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":399
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":9803.96768237843,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3169053404456202],
[0.2504445179316855],
[0.2221283662348492],
[0.2105217753878449]
],
"Log Likelihood":-4231.90805648536,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1839908079695035,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3065428052244183,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.2353892086420642,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.713631780226046,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.283676924976197
},
"display order":0,
"estimated parameters":669
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-11/sequences.N.compressed.fas",
"number of sequences":332,
"number of sites":419,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1,epi_isl_417281_England_20200306_null_1,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_422856_Netherlands_20200318_null_3,epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1,epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2,epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7,epi_isl_422012_England_20200402_null_8,epi_isl_417377_Washington_20200315_null_7,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1,(epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_421917_England_20200327_null_1)Node233,(epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1,epi_isl_421860_England_20200327_null_1)Node230,epi_isl_421871_England_20200327_null_1,epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1,epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_2,epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1,epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1,epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1,epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2,epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1,epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2,epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1,epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1,epi_isl_420745_England_20200328_null_1,epi_isl_417259_England_20200304_null_1,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1,epi_isl_421898_England_20200320_null_1,epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_3929,epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1,((epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6)Node224,epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1)Node223,(epi_isl_421426_New_York_20200317_null_1,epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2)Node219,epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1,epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_414485_USA_20200224_null_1,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1,(epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1,epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_41)Node243,epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4,(epi_isl_415137_England_20200302_null_1,(epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10,epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1)Node277,(epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node274,epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_421672_India_20200312_null_74,epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2,epi_isl_421670_India_20200312_null_2,epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1,epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1,epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2,epi_isl_422413_Taipei_20200316_null_5)Node254,epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3,(epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1,epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3,epi_isl_421955_England_20200330_null_1)Node287,epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1,(epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1)Node294,epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1,((epi_isl_420461_England_20200310_null_1,epi_isl_422685_Netherlands_20200319_null_10)Node300,epi_isl_420641_England_20200325_null_1)Node299,(epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6)Node304,epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2,epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4,epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1,epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4,(epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2,epi_isl_422417_Taipei_20200318_null_5)Node120,epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1,epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1,epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2,epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2,epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1,epi_isl_421940_England_20200330_null_1,(epi_isl_420648_England_20200323_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_7)Node309,(epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12,epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2)Node312,epi_isl_417257_England_20200303_null_1,epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3,(epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2,epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1)Node330,(epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1,epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1)Node326,epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1,(epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2,epi_isl_420743_England_20200327_null_1)Node334,epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1,epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1,epi_isl_421855_England_20200327_null_1,((epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,epi_isl_422796_Netherlands_20200330_null_31,epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2)Node523,epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1)Node522,epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1,(epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1,epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1)Node458,(epi_isl_420657_England_20200325_null_1,((epi_isl_421783_England_20200325_null_1,epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1,epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1,epi_isl_421963_England_20200401_null_1,epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21,epi_isl_421879_England_20200327_null_1,epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1,epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1,(epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1,epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2)Node437,epi_isl_420691_England_20200328_null_2,epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4,epi_isl_417279_England_20200307_null_1,epi_isl_422365_Wales_20200327_null_29,epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1,epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1,epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1,(epi_isl_421803_England_20200326_null_1,epi_isl_421804_England_20200325_null_1)Node423,epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2,epi_isl_421948_England_20200331_null_1,epi_isl_422940_Zuid_Holland_20200324_null_930,epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1,epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1,epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1,epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1,epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1,(epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2,epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1)Node415,epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1,epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4,epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1,epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2,epi_isl_417297_England_20200306_null_2,epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3,epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1,epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1,epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7,epi_isl_421850_England_20200327_null_1,epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1,epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1,epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1)Node352,epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1)Node351,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1)Node348,epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2,epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_6,(epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1,epi_isl_422007_England_20200331_null_6,epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4,epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1,epi_isl_418669_England_20200311_null_1,epi_isl_421929_England_20200329_null_1)Node495,((epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1,epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1,epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207,epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1,epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1,epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1,epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1,epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1,(epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1)Node478,epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1)Node468,epi_isl_422262_Wales_20200325_null_4)Node467,(epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1,epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1)Node492,epi_isl_418922_Washington_20200316_null_1,epi_isl_421872_England_20200327_null_1,(epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_30)Node519,epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1,((epi_isl_420524_England_20200326_null_8,epi_isl_422872_Noord_Brabant_20200309_null_57)Node513,epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1)Node512,epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1,epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8,epi_isl_414617_USA_20200308_null_1,epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2,(epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1)Node543,(epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1)Node539,epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,(epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1,epi_isl_422238_Wales_20200325_null_2)Node556,epi_isl_421842_England_20200323_null_1,(epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1,epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4)Node549,(epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4,epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1)Node552,epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_5,epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1,(epi_isl_421843_England_20200324_null_4,epi_isl_421844_England_20200324_null_1)Node565,epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8,(epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_10,epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3)Node570,epi_isl_422072_Wales_20200328_null_3,epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1,epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3,epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1,epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1,(epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1,epi_isl_421878_England_20200327_null_1)Node583,epi_isl_421877_England_20200327_null_1,epi_isl_421653_Latvia_20200325_null_2,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1,(epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1,epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12)Node599,epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1,(epi_isl_406034_California_20200123_null_1,epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1)Node43,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1,epi_isl_421969_England_20200401_null_1,epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2,epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1,(epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2)Node57,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3,epi_isl_422777_Netherlands_20200329_null_1,epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_2,epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1,epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2,epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2,epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1,epi_isl_413607_USA_20200218_null_1,epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1,(epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_421906_England_20200327_null_1)Node622,epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3,epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2,epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1,(epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1,epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1)Node630,epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10,epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1,epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2,epi_isl_422508_New_York_20200320_null_2,epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_418060_USA_20200314_null_1,epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1,epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_27,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1,epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1,epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1,epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1,epi_isl_421989_England_20200402_null_16,epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_1,epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1,epi_isl_418908_Washington_20200316_null_4,epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1,epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1,epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2,epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1,epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5,epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_420772_England_20200330_null_1,(epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4)Node81,epi_isl_421720_New_York_20200318_null_8,epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1,epi_isl_418754_England_20200317_null_2,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3,epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1,epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1,epi_isl_422203_Wales_20200327_null_6,epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1,epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1,(epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1,epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4)Node17,epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2,epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1,epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1,epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1,epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node120":"test",
"Node17":"test",
"Node219":"test",
"Node223":"test",
"Node224":"test",
"Node230":"test",
"Node233":"test",
"Node243":"test",
"Node254":"test",
"Node274":"test",
"Node277":"test",
"Node287":"test",
"Node294":"test",
"Node299":"test",
"Node300":"test",
"Node304":"test",
"Node309":"test",
"Node312":"test",
"Node326":"test",
"Node330":"test",
"Node334":"test",
"Node348":"test",
"Node351":"test",
"Node352":"test",
"Node415":"test",
"Node423":"test",
"Node43":"test",
"Node437":"test",
"Node458":"test",
"Node467":"test",
"Node468":"test",
"Node478":"test",
"Node492":"test",
"Node495":"test",
"Node512":"test",
"Node513":"test",
"Node519":"test",
"Node522":"test",
"Node523":"test",
"Node539":"test",
"Node543":"test",
"Node549":"test",
"Node552":"test",
"Node556":"test",
"Node565":"test",
"Node57":"test",
"Node570":"test",
"Node583":"test",
"Node599":"test",
"Node622":"test",
"Node630":"test",
"Node81":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":"test",
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":"test",
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416441_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":"test",
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":"test",
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417279_England_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417377_Washington_20200315_null_7":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":"test",
"epi_isl_417443_Hong_Kong_20200122_null_27":"test",
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7":"test",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":"test",
"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7":"test",
"epi_isl_418908_Washington_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_418922_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":"test",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_420524_England_20200326_null_8":"test",
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12":"test",
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21":"test",
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8":"test",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12":"test",
"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421653_Latvia_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_421670_India_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_421672_India_20200312_null_74":"test",
"epi_isl_421709_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421720_New_York_20200318_null_8":"test",
"epi_isl_421763_Luxembourg_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_421783_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421803_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421804_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_421842_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421843_England_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_421844_England_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421850_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421855_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421860_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421871_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421872_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421877_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421878_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421879_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421898_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421906_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421929_England_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421940_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421948_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421955_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421963_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421989_England_20200402_null_16":"test",
"epi_isl_422007_England_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_422012_England_20200402_null_8":"test",
"epi_isl_422053_Wales_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422056_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422072_Wales_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422094_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422097_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422099_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422103_Wales_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_422106_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422113_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422142_Wales_20200325_null_3":"test",
"epi_isl_422152_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422154_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422162_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422164_Wales_20200326_null_2":"test",
"epi_isl_422172_Wales_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_422177_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422186_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422197_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422203_Wales_20200327_null_6":"test",
"epi_isl_422224_Wales_20200329_null_4":"test",
"epi_isl_422226_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422238_Wales_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_422245_Wales_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422251_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422256_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422262_Wales_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_422270_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422274_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422276_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_422281_Wales_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_422287_Wales_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422288_Wales_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_422305_Wales_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_422312_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422365_Wales_20200327_null_29":"test",
"epi_isl_422370_Wales_20200326_null_207":"test",
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_41":"test",
"epi_isl_422413_Taipei_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_422415_Taipei_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_422417_Taipei_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_422421_Taipei_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422426_Dasman_20200316_null_6":"test",
"epi_isl_422429_Singapore_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_30":"test",
"epi_isl_422464_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422508_New_York_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_422510_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422511_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422515_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422543_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_422546_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422556_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_422571_Friesland_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_422581_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422607_Netherlands_20200401_null_3":"test",
"epi_isl_422608_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422614_Netherlands_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_422628_Zuid_Holland_20200331_null_5":"test",
"epi_isl_422644_Gelderland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_422657_Netherlands_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_422685_Netherlands_20200319_null_10":"test",
"epi_isl_422688_Netherlands_20200320_null_8":"test",
"epi_isl_422702_Netherlands_20200321_null_10":"test",
"epi_isl_422727_Netherlands_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_422748_Netherlands_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_422777_Netherlands_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422792_Netherlands_20200330_null_2":"test",
"epi_isl_422793_Netherlands_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_422796_Netherlands_20200330_null_31":"test",
"epi_isl_422800_Netherlands_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_422822_Netherlands_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_422827_Netherlands_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_422856_Netherlands_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_422872_Noord_Brabant_20200309_null_57":"test",
"epi_isl_422877_Noord_Brabant_20200312_null_6":"test",
"epi_isl_422883_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_422884_Noord_Brabant_20200101_null_3929":"test",
"epi_isl_422917_Zuid_Holland_20200319_null_6":"test",
"epi_isl_422919_Zuid_Holland_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_422937_Zuid_Holland_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_422940_Zuid_Holland_20200324_null_930":"test",
"epi_isl_422942_Zuid_Holland_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_422951_Zuid_Holland_20200327_null_4":"test",
"epi_isl_422953_Zuid_Holland_20200327_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":9
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":8
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":18
}
}
}