{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[251.0933631245, 612.9083138831851, 0, 1, 0.2906167543495017, 0, 0.001631565402766899, 0.01623754458243266, 0.7093832456504983, 1, 0.001140871334064979],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141708011129068],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140871331882975],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140969745253759],
[250.4469208864598, 613.5547561212253, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039877, 0.7101314412330335, 1, 0.001141640837597983],
[250.5350683885862, 613.4666086190988, 1, 0, 0.2899705811408487, 0.003991457189733513, 0, -0.03972348516170936, 1, 0.2899705811408486, 0.001141044603112775],
[250.4469208864598, 613.5547561212253, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039877, 0.7101314412330335, 1, 0.001141902706690721],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141640621692853],
[250.2142539427263, 613.7874230649588, 0, 1, 0.2895992688455171, 0, 0.001629228560934797, 0.01621428803791013, 0.7104007311544829, 1, 0.001141708002463923],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330335, 1, 0.001141805439362222],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001145140553547619],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5012473610059, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2899623509204336, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.2899623509204337, 0.001141708007240016],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141805438409901],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141696209150017],
[250.5933631245, 613.2618716451449, 0, 1, 0.2900872195227515, 0, 0.001630624772607151, 0.01622818331249607, 0.7099127804772485, 1, 0.001141492596520473],
[250.5012473610059, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2899623509204335, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.2899623509204335, 0.001141708007240016],
[250.8063697062203, 613.3417495395048, 1, 0, 0.2902353938178302, 0.003987139565758799, 0, -0.03968051562358315, 1, 0.2902353938178301, 0.00114087132729302],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141902709276184],
[250.91417757036, 613.0422436970146, 0, 1, 0.2904245762793027, 0, 0.001631208958732431, 0.01623399720646415, 0.7095754237206973, 1, 0.001145324365605439],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141708011208404],
[250.685478887994, 613.3161981196911, 1, 0, 0.2901446670291176, 0.003989062327965151, 0, -0.03969965119546651, 1, 0.2901446670291177, 0.001140871325226496],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001142838360898648],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141716008211218],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140871328284485],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141454271745853],
[249.555573835552, 611.446103172133, 0, 1, 0.2898433075099859, 0, 0.001635467124268322, 0.01627637500671117, 0.7101566924900141, 1, 0.001140946367378546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001140948108335565],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330335, 1, 0.001141156402580973],
[250.5012473610059, 613.5004296466791, 1, 0, 0.2899314365089801, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141805438368745],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 2, 0.2900380517690488, 0, 0.00326047096971834, 0.03244861814350005, 0.5040459679358877, 1, 0.002284416203189978],
[250.6476895990461, 613.353987408639, 0, 1, 0.2901009295110623, 0, 0.001630379879366078, 0.01622574610408683, 0.7098990704889376, 1, 0.001145099657325841],
[250.5390366499539, 613.4626403577312, 0, 1, 0.2899751740270354, 0, 0.00163009111592658, 0.01622287229393207, 0.7100248259729647, 1, 0.001141805435763694],
[250.4724723062737, 613.4839489611009, 0, 1, 0.2899133175477126, 0, 0.001630034496735312, 0.0162223088126025, 0.7100866824522873, 1, 0.001142426909701661],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141048391984813],
[250.6689982024157, 613.3779345455798, 0, 1, 0.290110396440149, 0, 0.001630316227043362, 0.01622511262814641, 0.709889603559851, 1, 0.001140947570416857],
[250.2142539427263, 613.7874230649588, 0, 1, 0.2895992688455171, 0, 0.001629228560934797, 0.01621428803791013, 0.7104007311544829, 1, 0.001141805437812241],
[250.6854788879941, 613.316198119691, 1, 0, 0.2901446670291177, 0.00398906232796515, 0, -0.03969965119546651, 1, 0.2901446670291177, 0.001140969752031291],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141640806440226],
[250.3803565427797, 613.4748782268653, 1, 0, 0.2898406428127346, 0.003993923540200492, 0, -0.03974803059249354, 1, 0.2898406428127347, 0.001141708003066601],
[250.5481073841894, 613.5874994373251, 0, 1, 0.2899407285226469, 0, 0.001629759408262106, 0.0162195710974363, 0.7100592714773531, 1, 0.001141669138590608],
[250.0933631245, 613.9083138831851, 0, 1, 0.2894593491885959, 0, 0.001628907733265005, 0.0162110951204931, 0.7105406508114041, 1, 0.00114190271097834],
[250.5606198084001, 613.2618716451449, 0, 1, 0.2900603101764396, 0, 0.001630624772607151, 0.01622818331249607, 0.7099396898235604, 1, 0.001141331173860453],
[250.4727081630106, 613.5289688446744, 0, 1, 0.2898984050939322, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101015949060678, 1, 0.001141708005633734],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141805437694695],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141766595609708],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141331169827037],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001140770115206442],
[250.8646644421341, 613.1627998421018, 1, 0, 0.2903433916304402, 0.003986213053256314, 0, -0.03967129485435149, 1, 0.2903433916304402, 0.001140871331075135],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141766587268366],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141640635099335],
[250.5390366499539, 613.4626403577312, 0, 1, 0.2899751740270354, 0, 0.00163009111592658, 0.01622287229393207, 0.7100248259729647, 1, 0.00114157153232327],
[249.7020160735921, 611.2996609340929, 1, 0, 0.2900133910788694, 0.004004773432447098, 0, -0.03985601008799528, 1, 0.2900133910788694, 0.001141206731890211],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.00114192817211272],
[250.6516578604137, 613.2293641857819, 1, 0, 0.290146040327079, 0.003989600581684137, 0, -0.03970500796433638, 1, 0.290146040327079, 0.001141669145226369],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669666, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330334, 1, 0.001141805437878824],
[249.5854266017647, 611.6575603288992, 0, 1, 0.2897967593225326, 0, 0.001634901724197249, 0.01627074807392295, 0.7102032406774674, 1, 0.001140849949038803],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5350683885862, 613.5872635805882, 1, 0, 0.2899300933672936, 0.003991457189733513, 0, -0.03972348516170936, 1, 0.2899300933672937, 0.001140987735589703],
[250.9727081630106, 613.0289688446744, 0, 1, 0.2904771076743851, 0, 0.001631244281790824, 0.01623434874599451, 0.7095228923256149, 1, 0.001141739679715711],
[250.4727081630106, 613.5289688446744, 0, 1, 0.2898984050939321, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101015949060678, 1, 0.001141805440756768],
[250.6969136007242, 613.3047634069608, 0, 1, 0.2901579016246451, 0, 0.001630510734084167, 0.01622704838673832, 0.7098420983753549, 1, 0.001141044604944846],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141495518968932],
[250.9666013505591, 613.035075657126, 0, 3, 0.290470039618137, 0, 0.004893684095945461, 0.04870256107754001, 0.3572006295779689, 1, 0.003434712168308159],
[250.4727081630106, 613.5289688446744, 0, 1, 0.2898984050939321, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101015949060678, 1, 0.001141708006633285],
[250.3803565427796, 613.4748782268653, 1, 0, 0.2898406428127346, 0.003993923540200493, 0, -0.03974803059249355, 1, 0.2898406428127346, 0.001141805437591711],
[250.6854788879941, 613.316198119691, 1, 0, 0.2901446670291177, 0.00398906232796515, 0, -0.03969965119546651, 1, 0.2901446670291177, 0.001140969749758916],
[250.6189145443139, 613.2035769092312, 0, 1, 0.2901277948002952, 0, 0.00163077978938147, 0.01622972605897731, 0.7098722051997048, 1, 0.001145324396965227],
[250.8260300682335, 613.0835311759574, 0, 1, 0.2903382961834538, 0, 0.001631099106645218, 0.01623290394464298, 0.7096617038165463, 1, 0.001141708009420614],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330335, 1, 0.001141669140255946],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141048407238016],
[250.7398053625402, 613.2618716451449, 0, 1, 0.2902075447711312, 0, 0.001630624772607151, 0.01622818331249607, 0.7097924552288688, 1, 0.001140863179159402],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140947567932228],
[250.5012473610059, 613.5004296466792, 1, 0, 0.28993143650898, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141805433456948],
[250.5012473610059, 613.5004296466791, 1, 0, 0.2899314365089801, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141902705874352],
[250.5933631245, 613.353987408639, 0, 1, 0.2900562898536116, 0, 0.001630379879366078, 0.01622574610408683, 0.7099437101463884, 1, 0.001141640613444543],
[250.5350683885862, 613.4666086190988, 1, 0, 0.2899705811408487, 0.003991457189733513, 0, -0.03972348516170936, 1, 0.2899705811408486, 0.001141044601232221],
[250.5390366499539, 613.4626403577312, 0, 1, 0.2899751740270354, 0, 0.00163009111592658, 0.01622287229393207, 0.7100248259729647, 1, 0.00114180543765221],
[250.5933631245, 613.5874994373251, 1, 0, 0.2899779131669583, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2899779131669582, 0.001141048418536454],
[250.6261064405998, 613.4208263073957, 0, 1, 0.2900607558937964, 0, 0.00163020223167135, 0.01622397813183256, 0.7099392441062036, 1, 0.001141640800525573],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141669142746509],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 2, 0, 0.2900380517690488, 0.007981057339520833, 0, -0.07942848882775418, 0.9999999999999999, 0.08412207147398554, 0.002285941913057978],
[250.4469208864598, 613.5289688446745, 0, 1, 0.2898772105369721, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101227894630279, 1, 0.001141775877061195],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.00114180543614498],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141640593196673],
[250.5012473610059, 613.5004296466791, 1, 0, 0.2899314365089801, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141902698880003]
],
"NAMES": [
["epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_1"],
["epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_417503_Minnesota_20200314_null_2"],
["epi_isl_421630_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421924_England_20200328_null_3"],
["epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1"],
["epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_421918_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_422166_Wales_20200328_null_1"],
["epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1"],
["epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1"],
["epi_isl_422375_Wales_20200328_null_5022"],
["epi_isl_422147_Wales_20200328_null_4"],
["epi_isl_418672_England_20200315_null_1"],
["epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_1"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_421937_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1"],
["epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_2"],
["epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_2"],
["epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1"],
["epi_isl_421414_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1"],
["epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1"],
["epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1"],
["epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1"],
["Node149"],
["epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1"],
["epi_isl_420759_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_418186_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1"],
["epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1"],
["epi_isl_421990_England_20200331_null_10"],
["epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_414007_England_20200228_null_3"],
["epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_2"],
["epi_isl_421719_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_3"],
["epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1"],
["epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_418692_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1"],
["epi_isl_421969_England_20200401_null_1"],
["epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_418405_Finland_20200314_null_1"],
["epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_418877_Washington_20200324_null_2"],
["epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1"],
["Node25"],
["epi_isl_416703_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_420687_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4"],
["Node75"],
["epi_isl_418407_Helsinki_20200314_null_2"],
["epi_isl_420416_Lasne_20200323_null_2"],
["epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2"],
["epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1"],
["epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1"],
["epi_isl_422119_Wales_20200327_null_7"],
["epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2"],
["epi_isl_419462_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1"],
["epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1"],
["epi_isl_421589_New_York_20200318_null_10"],
["epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1"],
["epi_isl_417333_ARA_20200304_null_3"],
["epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1"],
["epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1"],
["epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_1"],
["epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2"],
["epi_isl_421801_England_20200326_null_3"],
["epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_421186_Li_ge_20200330_null_3"],
["epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2"],
["epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1"],
["epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_2"]
],
"RESOLVED": [
[251.0933631245, 612.9083138831851, 0, 1, 0.2906167543495017, 0, 0.001631565402766899, 0.01623754458243266, 0.7093832456504983, 1, 0.001140871334064979],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141708011129068],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140871331882975],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140969745253759],
[250.4469208864598, 613.5547561212253, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039877, 0.7101314412330335, 1, 0.001141640837597983],
[250.5350683885862, 613.4666086190988, 1, 0, 0.2899705811408487, 0.003991457189733513, 0, -0.03972348516170936, 1, 0.2899705811408486, 0.001141044603112775],
[250.4469208864598, 613.5547561212253, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039877, 0.7101314412330335, 1, 0.001141902706690721],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141640621692853],
[250.2142539427263, 613.7874230649588, 0, 1, 0.2895992688455171, 0, 0.001629228560934797, 0.01621428803791013, 0.7104007311544829, 1, 0.001141708002463923],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330335, 1, 0.001141805439362222],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001145140553547619],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5012473610059, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2899623509204336, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.2899623509204337, 0.001141708007240016],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141805438409901],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141696209150017],
[250.5933631245, 613.2618716451449, 0, 1, 0.2900872195227515, 0, 0.001630624772607151, 0.01622818331249607, 0.7099127804772485, 1, 0.001141492596520473],
[250.5012473610059, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2899623509204335, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.2899623509204335, 0.001141708007240016],
[250.8063697062203, 613.3417495395048, 1, 0, 0.2902353938178302, 0.003987139565758799, 0, -0.03968051562358315, 1, 0.2902353938178301, 0.00114087132729302],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141902709276184],
[250.91417757036, 613.0422436970146, 0, 1, 0.2904245762793027, 0, 0.001631208958732431, 0.01623399720646415, 0.7095754237206973, 1, 0.001145324365605439],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141708011208404],
[250.685478887994, 613.3161981196911, 1, 0, 0.2901446670291176, 0.003989062327965151, 0, -0.03969965119546651, 1, 0.2901446670291177, 0.001140871325226496],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001142838360898648],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141716008211218],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140871328284485],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141454271745853],
[249.555573835552, 611.446103172133, 0, 1, 0.2898433075099859, 0, 0.001635467124268322, 0.01627637500671117, 0.7101566924900141, 1, 0.001140946367378546],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001140948108335565],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330335, 1, 0.001141156402580973],
[250.5012473610059, 613.5004296466791, 1, 0, 0.2899314365089801, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141805438368745],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 2, 0.2900380517690488, 0, 0.00326047096971834, 0.03244861814350005, 0.5040459679358877, 1, 0.002284416203189978],
[250.6476895990461, 613.353987408639, 0, 1, 0.2901009295110623, 0, 0.001630379879366078, 0.01622574610408683, 0.7098990704889376, 1, 0.001145099657325841],
[250.5390366499539, 613.4626403577312, 0, 1, 0.2899751740270354, 0, 0.00163009111592658, 0.01622287229393207, 0.7100248259729647, 1, 0.001141805435763694],
[250.4724723062737, 613.4839489611009, 0, 1, 0.2899133175477126, 0, 0.001630034496735312, 0.0162223088126025, 0.7100866824522873, 1, 0.001142426909701661],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141048391984813],
[250.6689982024157, 613.3779345455798, 0, 1, 0.290110396440149, 0, 0.001630316227043362, 0.01622511262814641, 0.709889603559851, 1, 0.001140947570416857],
[250.2142539427263, 613.7874230649588, 0, 1, 0.2895992688455171, 0, 0.001629228560934797, 0.01621428803791013, 0.7104007311544829, 1, 0.001141805437812241],
[250.6854788879941, 613.316198119691, 1, 0, 0.2901446670291177, 0.00398906232796515, 0, -0.03969965119546651, 1, 0.2901446670291177, 0.001140969752031291],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141640806440226],
[250.3803565427797, 613.4748782268653, 1, 0, 0.2898406428127346, 0.003993923540200492, 0, -0.03974803059249354, 1, 0.2898406428127347, 0.001141708003066601],
[250.5481073841894, 613.5874994373251, 0, 1, 0.2899407285226469, 0, 0.001629759408262106, 0.0162195710974363, 0.7100592714773531, 1, 0.001141669138590608],
[250.0933631245, 613.9083138831851, 0, 1, 0.2894593491885959, 0, 0.001628907733265005, 0.0162110951204931, 0.7105406508114041, 1, 0.00114190271097834],
[250.5606198084001, 613.2618716451449, 0, 1, 0.2900603101764396, 0, 0.001630624772607151, 0.01622818331249607, 0.7099396898235604, 1, 0.001141331173860453],
[250.4727081630106, 613.5289688446744, 0, 1, 0.2898984050939322, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101015949060678, 1, 0.001141708005633734],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141805437694695],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141766595609708],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141331169827037],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001140770115206442],
[250.8646644421341, 613.1627998421018, 1, 0, 0.2903433916304402, 0.003986213053256314, 0, -0.03967129485435149, 1, 0.2903433916304402, 0.001140871331075135],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141766587268366],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141640635099335],
[250.5390366499539, 613.4626403577312, 0, 1, 0.2899751740270354, 0, 0.00163009111592658, 0.01622287229393207, 0.7100248259729647, 1, 0.00114157153232327],
[249.7020160735921, 611.2996609340929, 1, 0, 0.2900133910788694, 0.004004773432447098, 0, -0.03985601008799528, 1, 0.2900133910788694, 0.001141206731890211],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.00114192817211272],
[250.6516578604137, 613.2293641857819, 1, 0, 0.290146040327079, 0.003989600581684137, 0, -0.03970500796433638, 1, 0.290146040327079, 0.001141669145226369],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669666, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330334, 1, 0.001141805437878824],
[249.5854266017647, 611.6575603288992, 0, 1, 0.2897967593225326, 0, 0.001634901724197249, 0.01627074807392295, 0.7102032406774674, 1, 0.001140849949038803],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[250.5350683885862, 613.5872635805882, 1, 0, 0.2899300933672936, 0.003991457189733513, 0, -0.03972348516170936, 1, 0.2899300933672937, 0.001140987735589703],
[250.9727081630106, 613.0289688446744, 0, 1, 0.2904771076743851, 0, 0.001631244281790824, 0.01623434874599451, 0.7095228923256149, 1, 0.001141739679715711],
[250.4727081630106, 613.5289688446744, 0, 1, 0.2898984050939321, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101015949060678, 1, 0.001141805440756768],
[250.6969136007242, 613.3047634069608, 0, 1, 0.2901579016246451, 0, 0.001630510734084167, 0.01622704838673832, 0.7098420983753549, 1, 0.001141044604944846],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141495518968932],
[250.9666013505591, 613.035075657126, 0, 3, 0.290470039618137, 0, 0.004893684095945461, 0.04870256107754001, 0.3572006295779689, 1, 0.003434712168308159],
[250.4727081630106, 613.5289688446744, 0, 1, 0.2898984050939321, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101015949060678, 1, 0.001141708006633285],
[250.3803565427796, 613.4748782268653, 1, 0, 0.2898406428127346, 0.003993923540200493, 0, -0.03974803059249355, 1, 0.2898406428127346, 0.001141805437591711],
[250.6854788879941, 613.316198119691, 1, 0, 0.2901446670291177, 0.00398906232796515, 0, -0.03969965119546651, 1, 0.2901446670291177, 0.001140969749758916],
[250.6189145443139, 613.2035769092312, 0, 1, 0.2901277948002952, 0, 0.00163077978938147, 0.01622972605897731, 0.7098722051997048, 1, 0.001145324396965227],
[250.8260300682335, 613.0835311759574, 0, 1, 0.2903382961834538, 0, 0.001631099106645218, 0.01623290394464298, 0.7096617038165463, 1, 0.001141708009420614],
[250.4469208864598, 613.5547561212252, 0, 1, 0.2898685587669665, 0, 0.001629846382940305, 0.01622043668039878, 0.7101314412330335, 1, 0.001141669140255946],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 1, 0, 0.2900380517690488, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2900380517690488, 0.001141048407238016],
[250.7398053625402, 613.2618716451449, 0, 1, 0.2902075447711312, 0, 0.001630624772607151, 0.01622818331249607, 0.7097924552288688, 1, 0.001140863179159402],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001140947567932228],
[250.5012473610059, 613.5004296466792, 1, 0, 0.28993143650898, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141805433456948],
[250.5012473610059, 613.5004296466791, 1, 0, 0.2899314365089801, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141902705874352],
[250.5933631245, 613.353987408639, 0, 1, 0.2900562898536116, 0, 0.001630379879366078, 0.01622574610408683, 0.7099437101463884, 1, 0.001141640613444543],
[250.5350683885862, 613.4666086190988, 1, 0, 0.2899705811408487, 0.003991457189733513, 0, -0.03972348516170936, 1, 0.2899705811408486, 0.001141044601232221],
[250.5390366499539, 613.4626403577312, 0, 1, 0.2899751740270354, 0, 0.00163009111592658, 0.01622287229393207, 0.7100248259729647, 1, 0.00114180543765221],
[250.5933631245, 613.5874994373251, 1, 0, 0.2899779131669583, 0.003990528669760417, 0, -0.03971424441387709, 1, 0.2899779131669582, 0.001141048418536454],
[250.6261064405998, 613.4208263073957, 0, 1, 0.2900607558937964, 0, 0.00163020223167135, 0.01622397813183256, 0.7099392441062036, 1, 0.001141640800525573],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141669142746509],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 2, 0, 0.2900380517690488, 0.007981057339520833, 0, -0.07942848882775418, 0.9999999999999999, 0.08412207147398554, 0.002285941913057978],
[250.4469208864598, 613.5289688446745, 0, 1, 0.2898772105369721, 0, 0.001629914887121112, 0.0162211184426426, 0.7101227894630279, 1, 0.001141775877061195],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.00114180543614498],
[250.5933631245, 613.4083138831851, 0, 1, 0.2900380517690488, 0, 0.00163023548485917, 0.01622430907175003, 0.7099619482309512, 1, 0.001141640593196673],
[250.5012473610059, 613.5004296466791, 1, 0, 0.2899314365089801, 0.003991996089979009, 0, -0.03972884836489256, 1, 0.28993143650898, 0.001141902698880003]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 1, 0.2357051746398876, 0, 0.4361318725091156, 4.340439379063225, 0.7642948253601124, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7575563790344222, 1.351096570057758, 1, 0, 0.3592608159444001, 1.320033766034147, 0, -13.13714245836961, 1, 0.3592608159444001, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.998335919492553, 2.001664080507448, 0, 1, 0.3327786398308509, 0, 0.4995843257308623, 4.971926193079736, 0.6672213601691491, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903003927278438, 2, 1, 0, 0.3080304022958613, 1.123216397710486, 0, -11.1783911957277, 1, 0.3080304022958613, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.004310397993429346, 2.995689602006573, 0, 1, 0.001436799331143115, 0, 0.3338129555646153, 3.322148618119753, 0.9985632006688568, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.888926780241053, 1.109409281254128, 1, 0, 0.629991682553123, 0.5294011448513565, 0, -5.268666936021638, 1, 0.629991682553123, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2.267859627658968, 0, 0, 0.2205297898398079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903002142447322, 2.109699785755269, 1, 0, 0.2967667380815773, 1.123216622887516, 0, -11.17839343671789, 1, 0.2967667380815773, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7104448586281115, 2.287891516803071, 0, 3, 0.2369463494655247, 0, 1.311250982822812, 13.04973509259068, 0.4442886546227809, 1, 0.1004810422218692],
[0.708778231168308, 2.291221768831692, 0, 1, 0.236259410389436, 0, 0.4364483672437811, 4.34358917456362, 0.763740589610564, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9956920338831882, 2.004307966116813, 0, 1, 0.3318973446277292, 0, 0.4989253233061885, 4.965367717867878, 0.6681026553722708, 1, 0.1004810422218692],
[1.463348192779763, 1.247877203365535, 1, 0, 0.539736827067306, 0.6833643591689612, 0, -6.800928255302574, 1, 0.539736827067306, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9993827934561395, 2.000617206543862, 0, 1, 0.333127597818713, 0, 0.4998457459673338, 4.974527880230773, 0.666872402181287, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7081615053037992, 2.291838494696201, 1, 0, 0.2360538351012663, 1.412107255916153, 0, -14.05346943752953, 1, 0.2360538351012663, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9986290674100725, 2.001370932589928, 0, 1, 0.3328763558033574, 0, 0.499657501623611, 4.972654448789775, 0.6671236441966426, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.891347050907822, 1.108652949092179, 0, 0, 0.6304490169692737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903002142383202, 2.109699785761681, 1, 0, 0.2967667380794399, 1.123216622895606, 0, -11.1783934367984, 1, 0.2967667380794399, 0.1004810422218692],
[0.998625522577955, 2.000859938814504, 0, 1, 0.3329322763626133, 0, 0.4997851076934917, 4.973924400484731, 0.6670677236373868, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 2, 1, 0.3333333333333333, 2, 0.4999999999999999, -14.92818910743277, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.003656775383264066, 2.995827381021617, 0, 1, 0.001219134755373071, 0, 0.3337976034049688, 3.321995831491479, 0.9987808652446269, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9994858026856202, 1.643664804293322, 0, 1, 0.3781418281828475, 0, 0.6083965522580745, 6.054839189612427, 0.6218581718171525, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.99938275610647, 0, 1, 0.3334019301018156, 0, 0.5001543586118379, 4.977599232176175, 0.6665980698981844, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 1.467024057372208, 0, 0, 0.3042837807882073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.351824796660048, 1.596893441434377, 1, 0, 0.4584448860511165, 0.7397408321482924, 0, -7.361994021866262, 1, 0.4584448860511166, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9943178201294087, 2.005682179870592, 1, 1, 0.3314392733764695, 1.005714651548588, 0.4985834794945032, -5.047033359131603, 0.8901480080636779, 0.5530265548166169, 0.1004810422218692],
[1.891347050907822, 1.108652949092179, 0, 0, 0.6304490169692737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.002643660011025, 1.887656732714821, 0, 1, 0.3468994650294568, 0, 0.5297573349375889, 5.272211784665286, 0.6531005349705432, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983357777318567, 2.001664222268144, 0, 1, 0.3327785925772855, 0, 0.4995842903495926, 4.971925840960878, 0.6672214074227145, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7067436033406763, 2.291221086770779, 0, 1, 0.235741136535668, 0, 0.4364484971676778, 4.34359046758262, 0.7642588634643319, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.891347050907822, 0, 0, 0.3458595534859855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.349406762484872, 1.597647798486211, 1, 0, 0.457883196448263, 0.741066391395983, 0, -7.375186154614682, 1, 0.457883196448263, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983359625748319, 2.001371014088133, 0, 1, 0.3328111613373099, 0, 0.4996574812769642, 4.97265424629738, 0.6671888386626901, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9993826669919665, 2.000617333008035, 0, 1, 0.3331275556639888, 0, 0.4998457143707972, 4.974527565778057, 0.6668724443360112, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2, 0, 0, 0.308280893028029, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903003034080815, 2.10969969659192, 1, 0, 0.2967667678026937, 1.123216510397656, 0, -11.17839231720463, 1, 0.2967667678026937, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2.267859627658968, 0, 0, 0.2205297898398079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7081615053058823, 2.291838494694118, 1, 0, 0.2360538351019608, 1.412107255911999, 0, -14.05346943748819, 1, 0.2360538351019608, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2, 0, 0, 0.2428913818027653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9986289504125696, 2.001371049587431, 1, 1, 0.3328763168041898, 1.001372931945207, 0.4996574724142947, -4.993135505333331, 0.8891933577108768, 0.5549459913192561, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2, 0, 0, 0.308280893028029, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6424877169916651, 2.267514674713964, 0, 1, 0.2207859755795891, 0, 0.4410114788457301, 4.389001836505098, 0.7792140244204109, 1, 0.1004810422218692],
[1.888926573692686, 1.109409345800286, 2, 0, 0.6299916435020761, 1.058802405479518, 0, -10.53733502426864, 0.9999999999999998, 0.3968894708824471, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 1.641628891719971, 0, 0, 0.3785543090986174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2.267859627658968, 0, 0, 0.2205297898398079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.64200091319564, 2.268001790734475, 0, 1, 0.2206186655182771, 0, 0.440916759451128, 4.388059177148589, 0.7793813344817229, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.641628891719971, 0, 0, 0.3785543090986174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9986290674088723, 2.001370932591129, 0, 1, 0.3328763558029573, 0, 0.4996575016233113, 4.972654448786791, 0.6671236441970427, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.011527962542397, 2.023055925084794, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09933590166832158],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 1, 0.2357051746398876, 0, 0.4361318725091156, 4.340439379063225, 0.7642948253601124, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -19.90425214324369, 1, 0.1111111111111109, 0.1004810422218692],
[1, 1.891347050907822, 0, 0, 0.3458595534859855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.891347050907822, 0, 0, 0.3458595534859855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.998335919490391, 2.00166408050961, 0, 1, 0.3327786398301302, 0, 0.4995843257303227, 4.971926193074366, 0.6672213601698698, 1, 0.1004810422218692],
[0.7575563790355132, 1.884072512684459, 1, 0, 0.2867762316690389, 1.320033766032246, 0, -13.13714245835069, 1, 0.286776231669039, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.643663697377386, 1, 0, 0.378262939038743, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.378262939038743, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.015234319301639, 1.984765680698362, 0, 1, 0.3384114397672128, 0, 0.5038378130601989, 5.01425743522534, 0.6615885602327872, 1, 0.1004810422218692],
[0.997523966723027, 2.002476033276974, 1, 2, 0.3325079889076755, 1.002482179235359, 0.9987635141515665, -0.03700862373204211, 0.7418405176570918, 0.7026018815204322, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 1, 0.2357051746398876, 0, 0.4361318725091156, 4.340439379063225, 0.7642948253601124, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983361181342917, 2.00166388186571, 0, 1, 0.3327787060447637, 0, 0.499584375308766, 4.971926686485284, 0.6672212939552362, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903003927278438, 2, 1, 0, 0.3080304022958613, 1.123216397710486, 0, -11.1783911957277, 1, 0.3080304022958613, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7940749480957029, 2.205925051904298, 0, 1, 0.2646916493652342, 0, 0.4533245583918342, 4.511543156477834, 0.7353083506347657, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9956924015011424, 2.004307598498859, 0, 1, 0.3318974671670474, 0, 0.498925414816048, 4.965368628585535, 0.6681025328329526, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 1.467024057372208, 0, 0, 0.3042837807882073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.348744415639634, 1.599681031258833, 0, 0, 0.4574456569890267, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9993826669929876, 2.000617333007014, 0, 1, 0.3331275556643291, 0, 0.4998457143710522, 4.974527565780596, 0.6668724443356709, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[18.95472713325309, 44.84105402947596, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00456415945088851],
[0.9966740369160128, 2.003325963083988, 0, 2, 0.3322246789720041, 0, 0.9983397793742621, 9.935603346647797, 0.4459238793740429, 1, 0.1004810422218692],
[1.467752384491391, 1.241025858552103, 1, 0, 0.5418503298528684, 0.6813138309746453, 0, -6.780521140199327, 1, 0.5418503298528684, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7928990475514562, 2.207100952448545, 0, 0, 0.264299682517152, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9966706652915517, 2.003329334708449, 0, 1, 0.3322235550971838, 0, 0.4991690495789266, 4.967793312461134, 0.6677764449028162, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7081614150733362, 2.291838584926664, 1, 0, 0.2360538050244454, 1.412107435839951, 0, -14.05347122815385, 1, 0.2360538050244454, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.005677047674057036, 2.994322952325945, 0, 1, 0.001892349224685678, 0, 0.3339653123331988, 3.32366489188856, 0.9981076507753143, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 1, 0.2971156836359404, 0, 0.474236407859587, 4.719660518771688, 0.7028843163640597, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7074067695501106, 2.290550799537528, 0, 1, 0.2359629024921104, 0, 0.4365762157302533, 4.344861538819059, 0.7640370975078896, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983361593829141, 2.001663840617087, 0, 1, 0.3327787197943046, 0, 0.499584385603785, 4.971926788942612, 0.6672212802056954, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8909194174863523, 2.109080582513649, 1, 1, 0.2969731391621173, 1.122435969373536, 0.4741402525304073, -6.451920705715278, 0.9118069546161978, 0.5057532329404324, 0.1004810422218692]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 1, 0.2357051746398876, 0, 0.4361318725091156, 4.340439379063225, 0.7642948253601124, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7575563790344222, 1.351096570057758, 1, 0, 0.3592608159444001, 1.320033766034147, 0, -13.13714245836961, 1, 0.3592608159444001, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.998335919492553, 2.001664080507448, 0, 1, 0.3327786398308509, 0, 0.4995843257308623, 4.971926193079736, 0.6672213601691491, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903003927278438, 2, 1, 0, 0.3080304022958613, 1.123216397710486, 0, -11.1783911957277, 1, 0.3080304022958613, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.004310397993429346, 2.995689602006573, 0, 1, 0.001436799331143115, 0, 0.3338129555646153, 3.322148618119753, 0.9985632006688568, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.888926780241053, 1.109409281254128, 1, 0, 0.629991682553123, 0.5294011448513565, 0, -5.268666936021638, 1, 0.629991682553123, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2.267859627658968, 0, 0, 0.2205297898398079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903002142447322, 2.109699785755269, 1, 0, 0.2967667380815773, 1.123216622887516, 0, -11.17839343671789, 1, 0.2967667380815773, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7104448586281115, 2.287891516803071, 0, 3, 0.2369463494655247, 0, 1.311250982822812, 13.04973509259068, 0.4442886546227809, 1, 0.1004810422218692],
[0.708778231168308, 2.291221768831692, 0, 1, 0.236259410389436, 0, 0.4364483672437811, 4.34358917456362, 0.763740589610564, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9956920338831882, 2.004307966116813, 0, 1, 0.3318973446277292, 0, 0.4989253233061885, 4.965367717867878, 0.6681026553722708, 1, 0.1004810422218692],
[1.463348192779763, 1.247877203365535, 1, 0, 0.539736827067306, 0.6833643591689612, 0, -6.800928255302574, 1, 0.539736827067306, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9993827934561395, 2.000617206543862, 0, 1, 0.333127597818713, 0, 0.4998457459673338, 4.974527880230773, 0.666872402181287, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7081615053037992, 2.291838494696201, 1, 0, 0.2360538351012663, 1.412107255916153, 0, -14.05346943752953, 1, 0.2360538351012663, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9986290674100725, 2.001370932589928, 0, 1, 0.3328763558033574, 0, 0.499657501623611, 4.972654448789775, 0.6671236441966426, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.891347050907822, 1.108652949092179, 0, 0, 0.6304490169692737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903002142383202, 2.109699785761681, 1, 0, 0.2967667380794399, 1.123216622895606, 0, -11.1783934367984, 1, 0.2967667380794399, 0.1004810422218692],
[0.998625522577955, 2.000859938814504, 0, 1, 0.3329322763626133, 0, 0.4997851076934917, 4.973924400484731, 0.6670677236373868, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 2, 1, 0.3333333333333333, 2, 0.4999999999999999, -14.92818910743277, 0.962962962962963, 0.2592592592592592, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.003656775383264066, 2.995827381021617, 0, 1, 0.001219134755373071, 0, 0.3337976034049688, 3.321995831491479, 0.9987808652446269, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9994858026856202, 1.643664804293322, 0, 1, 0.3781418281828475, 0, 0.6083965522580745, 6.054839189612427, 0.6218581718171525, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.99938275610647, 0, 1, 0.3334019301018156, 0, 0.5001543586118379, 4.977599232176175, 0.6665980698981844, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 1.467024057372208, 0, 0, 0.3042837807882073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.351824796660048, 1.596893441434377, 1, 0, 0.4584448860511165, 0.7397408321482924, 0, -7.361994021866262, 1, 0.4584448860511166, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9943178201294087, 2.005682179870592, 1, 1, 0.3314392733764695, 1.005714651548588, 0.4985834794945032, -5.047033359131603, 0.8901480080636779, 0.5530265548166169, 0.1004810422218692],
[1.891347050907822, 1.108652949092179, 0, 0, 0.6304490169692737, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.002643660011025, 1.887656732714821, 0, 1, 0.3468994650294568, 0, 0.5297573349375889, 5.272211784665286, 0.6531005349705432, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983357777318567, 2.001664222268144, 0, 1, 0.3327785925772855, 0, 0.4995842903495926, 4.971925840960878, 0.6672214074227145, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7067436033406763, 2.291221086770779, 0, 1, 0.235741136535668, 0, 0.4364484971676778, 4.34359046758262, 0.7642588634643319, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.891347050907822, 0, 0, 0.3458595534859855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.349406762484872, 1.597647798486211, 1, 0, 0.457883196448263, 0.741066391395983, 0, -7.375186154614682, 1, 0.457883196448263, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983359625748319, 2.001371014088133, 0, 1, 0.3328111613373099, 0, 0.4996574812769642, 4.97265424629738, 0.6671888386626901, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9993826669919665, 2.000617333008035, 0, 1, 0.3331275556639888, 0, 0.4998457143707972, 4.974527565778057, 0.6668724443360112, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2, 0, 0, 0.308280893028029, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903003034080815, 2.10969969659192, 1, 0, 0.2967667678026937, 1.123216510397656, 0, -11.17839231720463, 1, 0.2967667678026937, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2.267859627658968, 0, 0, 0.2205297898398079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7081615053058823, 2.291838494694118, 1, 0, 0.2360538351019608, 1.412107255911999, 0, -14.05346943748819, 1, 0.2360538351019608, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2, 0, 0, 0.2428913818027653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9986289504125696, 2.001371049587431, 1, 1, 0.3328763168041898, 1.001372931945207, 0.4996574724142947, -4.993135505333331, 0.8891933577108768, 0.5549459913192561, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2, 0, 0, 0.308280893028029, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6424877169916651, 2.267514674713964, 0, 1, 0.2207859755795891, 0, 0.4410114788457301, 4.389001836505098, 0.7792140244204109, 1, 0.1004810422218692],
[1.888926573692686, 1.109409345800286, 2, 0, 0.6299916435020761, 1.058802405479518, 0, -10.53733502426864, 0.9999999999999998, 0.3968894708824471, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 1.641628891719971, 0, 0, 0.3785543090986174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 2.267859627658968, 0, 0, 0.2205297898398079, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.64200091319564, 2.268001790734475, 0, 1, 0.2206186655182771, 0, 0.440916759451128, 4.388059177148589, 0.7793813344817229, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.641628891719971, 0, 0, 0.3785543090986174, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9986290674088723, 2.001370932591129, 0, 1, 0.3328763558029573, 0, 0.4996575016233113, 4.972654448786791, 0.6671236441970427, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.011527962542397, 2.023055925084794, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09933590166832158],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 1, 0.2357051746398876, 0, 0.4361318725091156, 4.340439379063225, 0.7642948253601124, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -19.90425214324369, 1, 0.1111111111111109, 0.1004810422218692],
[1, 1.891347050907822, 0, 0, 0.3458595534859855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.891347050907822, 0, 0, 0.3458595534859855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.998335919490391, 2.00166408050961, 0, 1, 0.3327786398301302, 0, 0.4995843257303227, 4.971926193074366, 0.6672213601698698, 1, 0.1004810422218692],
[0.7575563790355132, 1.884072512684459, 1, 0, 0.2867762316690389, 1.320033766032246, 0, -13.13714245835069, 1, 0.286776231669039, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 1.643663697377386, 1, 0, 0.378262939038743, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.378262939038743, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.241309922978804, 0, 0, 0.239828185129625, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.015234319301639, 1.984765680698362, 0, 1, 0.3384114397672128, 0, 0.5038378130601989, 5.01425743522534, 0.6615885602327872, 1, 0.1004810422218692],
[0.997523966723027, 2.002476033276974, 1, 2, 0.3325079889076755, 1.002482179235359, 0.9987635141515665, -0.03700862373204211, 0.7418405176570918, 0.7026018815204322, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 1, 0.2357051746398876, 0, 0.4361318725091156, 4.340439379063225, 0.7642948253601124, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983361181342917, 2.00166388186571, 0, 1, 0.3327787060447637, 0, 0.499584375308766, 4.971926686485284, 0.6672212939552362, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8903003927278438, 2, 1, 0, 0.3080304022958613, 1.123216397710486, 0, -11.1783911957277, 1, 0.3080304022958613, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 1.716742216560058, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7940749480957029, 2.205925051904298, 0, 1, 0.2646916493652342, 0, 0.4533245583918342, 4.511543156477834, 0.7353083506347657, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9956924015011424, 2.004307598498859, 0, 1, 0.3318974671670474, 0, 0.498925414816048, 4.965368628585535, 0.6681025328329526, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.6416288917199715, 1.467024057372208, 0, 0, 0.3042837807882073, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.348744415639634, 1.599681031258833, 0, 0, 0.4574456569890267, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9993826669929876, 2.000617333007014, 0, 1, 0.3331275556643291, 0, 0.4998457143710522, 4.974527565780596, 0.6668724443356709, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2, 0, 0, 0.2612062609340817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[18.95472713325309, 44.84105402947596, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00456415945088851],
[0.9966740369160128, 2.003325963083988, 0, 2, 0.3322246789720041, 0, 0.9983397793742621, 9.935603346647797, 0.4459238793740429, 1, 0.1004810422218692],
[1.467752384491391, 1.241025858552103, 1, 0, 0.5418503298528684, 0.6813138309746453, 0, -6.780521140199327, 1, 0.5418503298528684, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999998, 0, -9.952126071621844, 1, 0.3333333333333333, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7928990475514562, 2.207100952448545, 0, 0, 0.264299682517152, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.9966706652915517, 2.003329334708449, 0, 1, 0.3322235550971838, 0, 0.4991690495789266, 4.967793312461134, 0.6677764449028162, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.350434585544725, 0, 0, 0.3595747531019194, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7081614150733362, 2.291838584926664, 1, 0, 0.2360538050244454, 1.412107435839951, 0, -14.05347122815385, 1, 0.2360538050244454, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.005677047674057036, 2.994322952325945, 0, 1, 0.001892349224685678, 0, 0.3339653123331988, 3.32366489188856, 0.9981076507753143, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1.465333887467118, 1.241781636452546, 0, 0, 0.5412897508509144, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 2.151270155831485, 0, 0, 0.2606019437771503, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.2417816364525457, 2.758218363547453, 0, 0, 0.08059387881751526, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7582183635474549, 1.883410528172517, 0, 0, 0.287026828758591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 1, 0.2971156836359404, 0, 0.474236407859587, 4.719660518771688, 0.7028843163640597, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.909488519378939, 2, 0, 0, 0.3125939536524031, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999999, 4.976063035810922, 0.6666666666666667, 1, 0.1004810422218692],
[0.7586900770211972, 2.241309922978804, 0, 0, 0.252896692340399, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7071155239196628, 2.292884476080337, 0, 0, 0.2357051746398876, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.7074067695501106, 2.290550799537528, 0, 1, 0.2359629024921104, 0, 0.4365762157302533, 4.344861538819059, 0.7640370975078896, 1, 0.1004810422218692],
[0.9983361593829141, 2.001663840617087, 0, 1, 0.3327787197943046, 0, 0.499584385603785, 4.971926788942612, 0.6672212802056954, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8913470509078215, 2.10865294909218, 0, 0, 0.2971156836359404, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1004810422218692],
[0.8909194174863523, 2.109080582513649, 1, 1, 0.2969731391621173, 1.122435969373536, 0.4741402525304073, -6.451920705715278, 0.9118069546161978, 0.5057532329404324, 0.1004810422218692]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node149":{
"Global MG94xREV":0.001140948108335565,
"Nucleotide GTR":0.001118811182710658,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node25":{
"Global MG94xREV":0.00114192817211272,
"Nucleotide GTR":0.001119772231075293,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCA", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node75":{
"Global MG94xREV":0.001140987735589703,
"Nucleotide GTR":0.001118850041108112,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node88":{
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002285941913057978,
"Nucleotide GTR":0.002241589566318876,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCA", "TGG", "CAA", "CCA", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141766587268366,
"Nucleotide GTR":0.001119613781335555,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "N", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "AAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00114190271097834,
"Nucleotide GTR":0.001119747263943432,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "M", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ATG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001140969752031291,
"Nucleotide GTR":0.001118832406470647,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAC", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414007_England_20200228_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140969749758916,
"Nucleotide GTR":0.001118832404242362,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAC", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141902709276184,
"Nucleotide GTR":0.001119747262274301,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "S", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "TCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141156402580973,
"Nucleotide GTR":0.001119015435585397,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "F", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "TTC", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140946367378546,
"Nucleotide GTR":0.001118809475532067,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "F", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TTT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140871328284485,
"Nucleotide GTR":0.001118735892362981,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "P", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CCT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001140871325226496,
"Nucleotide GTR":0.001118735889364323,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAC", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141805435763694,
"Nucleotide GTR":0.00111965187608385,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "F", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TTC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001142426909701661,
"Nucleotide GTR":0.001120261292048067,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "K", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "AAA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141669140255946,
"Nucleotide GTR":0.001119518225011459,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "S", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "AGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141495518968932,
"Nucleotide GTR":0.001119347972362764,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "G", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GGT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTC", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002284416203189978,
"Nucleotide GTR":0.002240093458608613,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "G", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "S", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GGT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "AGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00114180543614498,
"Nucleotide GTR":0.001119651876457739,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "S", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "TCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141640593196673,
"Nucleotide GTR":0.001119490231828497,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "S", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "TCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141805437812241,
"Nucleotide GTR":0.001119651878092652,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "I", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ATA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141669145226369,
"Nucleotide GTR":0.001119518229885445,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTA", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141331173860453,
"Nucleotide GTR":0.001119186815914152,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "E", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAG", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141696209150017,
"Nucleotide GTR":0.001119544768708907,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "N", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "AAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417333_ARA_20200304_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001141805433456948,
"Nucleotide GTR":0.001119651873821862,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417333_ARA_20200304_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141902705874352,
"Nucleotide GTR":0.001119747258938471,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAT", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00114180543765221,
"Nucleotide GTR":0.001119651877935726,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "F", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "TTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417503_Minnesota_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001140871331882975,
"Nucleotide GTR":0.001118735895891652,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "A", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GCG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417503_Minnesota_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140871331075135,
"Nucleotide GTR":0.001118735895099487,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "CTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141044604944846,
"Nucleotide GTR":0.001118905807071544,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "G", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "GGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141044603112775,
"Nucleotide GTR":0.001118905805275021,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAG", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003434712168308159,
"Nucleotide GTR":0.003368071128932827,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "L", "N", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CTA", "AAC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418186_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001145099657325841,
"Nucleotide GTR":0.001122882182436199,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "I"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "ATC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_418186_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141805439362222,
"Nucleotide GTR":0.001119651879612559,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "F", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TTT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001145140553547619,
"Nucleotide GTR":0.001122922285180506,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "-", "D", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "---", "GAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001141669138590608,
"Nucleotide GTR":0.001119518223378434,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "R", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "AGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141048391984813,
"Nucleotide GTR":0.001118909520634532,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTG", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141640635099335,
"Nucleotide GTR":0.001119490272918153,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACT", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418407_Helsinki_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141739679715711,
"Nucleotide GTR":0.001119587395849144,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "I", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATT", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418407_Helsinki_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418672_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141805438409901,
"Nucleotide GTR":0.001119651878678716,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTT", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418672_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141805437694695,
"Nucleotide GTR":0.001119651877977386,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCT", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418692_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418877_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141206731890211,
"Nucleotide GTR":0.001119064788394331,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCC", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418877_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141454271745853,
"Nucleotide GTR":0.001119307525427361,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "G", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GGT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001145324396965227,
"Nucleotide GTR":0.001123102561627775,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "E", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAA", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419462_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141708009420614,
"Nucleotide GTR":0.001119556340028063,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "L", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TTA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419462_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00114087132729302,
"Nucleotide GTR":0.001118735891390752,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "CTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141805437591711,
"Nucleotide GTR":0.0011196518778764,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "TTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141044601232221,
"Nucleotide GTR":0.001118905803430954,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAG", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141640806440226,
"Nucleotide GTR":0.001119490440934651,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGT", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00114157153232327,
"Nucleotide GTR":0.001119422510889318,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "S", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "AGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140849949038803,
"Nucleotide GTR":0.001118714927922117,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "T", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "ACA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141708011208404,
"Nucleotide GTR":0.001119556341781166,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGT", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141708005633734,
"Nucleotide GTR":0.001119556336314657,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "I", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ATT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141708011129068,
"Nucleotide GTR":0.001119556341703369,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "V", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GTT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140871334064979,
"Nucleotide GTR":0.00111873589803132,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "T", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ACG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCA", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141669142746509,
"Nucleotide GTR":0.0011195182274537,
"amino-acid": [
["S", "N", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AAT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420416_Lasne_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141805440756768,
"Nucleotide GTR":0.001119651880980049,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "I", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ATT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420416_Lasne_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001142838360898648,
"Nucleotide GTR":0.00112066476017862,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCA", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141902698880003,
"Nucleotide GTR":0.00111974725207983,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAT", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420687_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141805437878824,
"Nucleotide GTR":0.001119651878157942,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "F", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "TTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420687_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420759_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141805438368745,
"Nucleotide GTR":0.001119651878638357,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAT", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420759_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140947567932228,
"Nucleotide GTR":0.001118810652792345,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "S", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AGC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141902706690721,
"Nucleotide GTR":0.001119747259739002,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "F", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "TTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141766595609708,
"Nucleotide GTR":0.001119613789515057,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "T", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "ACT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421186_Li_ge_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001141775877061195,
"Nucleotide GTR":0.001119622890885788,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "C", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "TGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421186_Li_ge_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141048418536454,
"Nucleotide GTR":0.001118909546671012,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGG", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001145324365605439,
"Nucleotide GTR":0.001123102530876435,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "K", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "AAG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141331169827037,
"Nucleotide GTR":0.001119186811958995,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACG", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141492596520473,
"Nucleotide GTR":0.001119345106616293,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "Y", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "TAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141716008211218,
"Nucleotide GTR":0.001119564183624376,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCT", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTG", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141048407238016,
"Nucleotide GTR":0.001118909535591788,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTG", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001140863179159402,
"Nucleotide GTR":0.001118727901349011,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "R", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "CGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421630_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140969745253759,
"Nucleotide GTR":0.001118832399824616,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "T", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ACC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421630_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421719_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141708003066601,
"Nucleotide GTR":0.001119556333797334,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "TTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421719_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421801_England_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001141640800525573,
"Nucleotide GTR":0.001119490435134758,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "N", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAT", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421801_England_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421918_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001141640621692853,
"Nucleotide GTR":0.001119490259771788,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACT", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421918_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421924_England_20200328_null_3":{
"Global MG94xREV":0.001141640837597983,
"Nucleotide GTR":0.001119490471487878,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "F", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "TTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421924_England_20200328_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421937_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141708007240016,
"Nucleotide GTR":0.001119556337889774,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAT", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421937_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001140770115206442,
"Nucleotide GTR":0.001118636643043294,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCC", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421969_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_10":{
"Global MG94xREV":0.001140947570416857,
"Nucleotide GTR":0.001118810655228767,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "R", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AGG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141640613444543,
"Nucleotide GTR":0.001119490251683514,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "S", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "TCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0.001141708006633285,
"Nucleotide GTR":0.001119556337294814,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "I", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ATT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422147_Wales_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.001141708007240016,
"Nucleotide GTR":0.001119556337889774,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAT", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422147_Wales_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422166_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001141708002463923,
"Nucleotide GTR":0.001119556333206349,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "I", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ATA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422166_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422375_Wales_20200328_null_5022":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["S", "S", "Q", "A", "W", "Q", "P", "G", "V", "A", "M", "P", "N", "L", "Y", "K", "M", "Q", "R", "M", "L", "L", "E", "K", "C", "D", "L", "Q", "N", "Y", "G", "D", "S", "A", "T", "L", "P", "K", "G", "I", "M", "M", "N", "V", "A", "K", "Y", "T", "Q", "L", "C", "Q", "Y", "L", "N", "T", "L", "T", "L", "A", "V", "P", "Y", "N", "M", "R", "V", "I", "H", "F", "G", "A", "G", "S", "D", "K", "G", "V", "A", "P", "G", "T", "A", "V", "L", "R", "Q", "W", "L", "P", "T", "G", "T", "L", "L", "V", "D", "S", "D", "L", "N", "D", "F", "V", "S", "D", "A", "D", "S", "T", "L", "I", "G", "D", "C", "A", "T", "V", "H", "T", "A", "N", "K", "W", "D", "L", "I", "I", "S", "D", "M", "Y", "D", "P", "K", "T", "K", "N", "V", "T", "K", "E", "N", "D", "S", "K", "E", "G", "F", "F", "T", "Y", "I", "C", "G", "F", "I", "Q", "Q", "K", "L", "A", "L", "G", "G", "S", "V", "A", "I", "K", "I", "T", "E", "H", "S", "W", "N", "A", "D", "L", "Y", "K", "L", "M", "G", "H", "F", "A", "W", "W", "T", "A", "F", "V", "T", "N", "V", "N", "A", "S", "S", "S", "E", "A", "F", "L", "I", "G", "C", "N", "Y", "L", "G", "K", "P", "R", "E", "Q", "I", "D", "G", "Y", "V", "M", "H", "A", "N", "Y", "I", "F", "W", "R", "N", "T", "N", "P", "I", "Q", "L", "S", "S", "Y", "-", "S", "L", "F", "D", "M", "S", "K", "F", "P", "L", "K", "L", "R", "G", "T", "A", "V", "M", "S", "L", "K", "E", "G", "Q", "I", "N", "D", "M", "I", "L", "S", "L", "L", "S", "K", "G", "R", "L", "I", "I", "R", "E", "N", "N", "R", "V", "V", "I", "S", "S", "D", "V", "L", "V", "N", "N"]
],
"codon": [
["TCT", "AGT", "CAA", "GCG", "TGG", "CAA", "CCG", "GGT", "GTT", "GCT", "ATG", "CCT", "AAT", "CTT", "TAC", "AAA", "ATG", "CAA", "AGA", "ATG", "CTA", "TTA", "GAA", "AAG", "TGT", "GAC", "CTT", "CAA", "AAT", "TAT", "GGT", "GAT", "AGT", "GCA", "ACA", "TTA", "CCT", "AAA", "GGC", "ATA", "ATG", "ATG", "AAT", "GTC", "GCA", "AAA", "TAT", "ACT", "CAA", "CTG", "TGT", "CAA", "TAT", "TTA", "AAC", "ACA", "TTA", "ACA", "TTA", "GCT", "GTA", "CCC", "TAT", "AAT", "ATG", "AGA", "GTT", "ATA", "CAT", "TTT", "GGT", "GCT", "GGT", "TCT", "GAT", "AAA", "GGA", "GTT", "GCA", "CCA", "GGT", "ACA", "GCT", "GTT", "TTA", "AGA", "CAG", "TGG", "TTG", "CCT", "ACG", "GGT", "ACG", "CTG", "CTT", "GTC", "GAT", "TCA", "GAT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTT", "GTC", "TCT", "GAT", "GCA", "GAT", "TCA", "ACT", "TTG", "ATT", "GGT", "GAT", "TGT", "GCA", "ACT", "GTA", "CAT", "ACA", "GCT", "AAT", "AAA", "TGG", "GAT", "CTC", "ATT", "ATT", "AGT", "GAT", "ATG", "TAC", "GAC", "CCT", "AAG", "ACT", "AAA", "AAT", "GTT", "ACA", "AAA", "GAA", "AAT", "GAC", "TCT", "AAA", "GAG", "GGT", "TTT", "TTC", "ACT", "TAC", "ATT", "TGT", "GGG", "TTT", "ATA", "CAA", "CAA", "AAG", "CTA", "GCT", "CTT", "GGA", "GGT", "TCC", "GTG", "GCT", "ATA", "AAG", "ATA", "ACA", "GAA", "CAT", "TCT", "TGG", "AAT", "GCT", "GAT", "CTT", "TAT", "AAG", "CTC", "ATG", "GGA", "CAC", "TTC", "GCA", "TGG", "TGG", "ACA", "GCC", "TTT", "GTT", "ACT", "AAT", "GTG", "AAT", "GCG", "TCA", "TCA", "TCT", "GAA", "GCA", "TTT", "TTA", "ATT", "GGA", "TGT", "AAT", "TAT", "CTT", "GGC", "AAA", "CCA", "CGC", "GAA", "CAA", "ATA", "GAT", "GGT", "TAT", "GTC", "ATG", "CAT", "GCA", "AAT", "TAC", "ATA", "TTT", "TGG", "AGG", "AAT", "ACA", "AAT", "CCA", "ATT", "CAG", "TTG", "TCT", "TCC", "TAT", "---", "TCT", "TTA", "TTT", "GAC", "ATG", "AGT", "AAA", "TTT", "CCC", "CTT", "AAA", "TTA", "AGG", "GGT", "ACT", "GCT", "GTT", "ATG", "TCT", "TTA", "AAA", "GAA", "GGT", "CAA", "ATC", "AAT", "GAT", "ATG", "ATT", "TTA", "TCT", "CTT", "CTT", "AGT", "AAA", "GGT", "AGA", "CTT", "ATA", "ATT", "AGA", "GAA", "AAC", "AAC", "AGA", "GTT", "GTT", "ATT", "TCT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTT", "GTT", "AAC", "AAC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422375_Wales_20200328_null_5022",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":3953.263444866774,
"Equilibrium frequencies": [
[0.0366639698973233],
[0.01165974617539681],
[0.01684731348221667],
[0.05007784377714782],
[0.02218799303888256],
[0.007056147157532148],
[0.01019551552420913],
[0.03030568845221323],
[0.01754803060885063],
[0.00558056269820988],
[0.008063425032552829],
[0.02396815014543162],
[0.03147530392402593],
[0.01000966495377813],
[0.01446309043022705],
[0.04299085334075325],
[0.01666986962091703],
[0.005301293043311188],
[0.007659904805665162],
[0.02276870532567861],
[0.01008813154014153],
[0.003208191951702769],
[0.004635556787291867],
[0.01377897365411615],
[0.007978497232367555],
[0.002537293502341197],
[0.003666167203582271],
[0.01089750889218568],
[0.01431075833199819],
[0.004551056805791393],
[0.00657587905681265],
[0.01954648997610709],
[0.0307992596713329],
[0.009794671748955765],
[0.01415244405219253],
[0.04206747165111054],
[0.01863883701366888],
[0.005927457097324212],
[0.008564657100488942],
[0.02545803879864013],
[0.01474107558336027],
[0.004687904777787536],
[0.006773612407860162],
[0.02013424302490869],
[0.0264405644425584],
[0.0084085348912792],
[0.01214959752198176],
[0.03611410491668322],
[0.009651999500441771],
[0.04145470371732016],
[0.01836733789102503],
[0.005841115905529231],
[0.008439901629596479],
[0.02508720905250334],
[0.00461961929231042],
[0.00667494585347617],
[0.0198409613511459],
[0.02605542292095497],
[0.008286053545258078],
[0.01197262268898789],
[0.03558805558255594]
],
"Log Likelihood":-1873.208507230511,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5171100062549476, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":103
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":4195.704893478439,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3155020397420713],
[0.1597183839978945],
[0.1944861165942887],
[0.3302934596657455]
],
"Log Likelihood":-1922.447551183868,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2429364343549802,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.07029072152754345,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.903707248727307,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.5335207017074687
},
"display order":0,
"estimated parameters":175
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-10/sequences.methyltransferase.compressed.fas",
"number of sequences":85,
"number of sites":299,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_1,epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_417503_Minnesota_20200314_null_2,epi_isl_421630_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421924_England_20200328_null_3,epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1,epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1,epi_isl_421918_England_20200327_null_2,epi_isl_422166_Wales_20200328_null_1,epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1,epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1,epi_isl_422375_Wales_20200328_null_5022,epi_isl_422147_Wales_20200328_null_4,epi_isl_418672_England_20200315_null_1,epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_1,epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_421937_England_20200330_null_1,epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1,epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_2,epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_2,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1,epi_isl_421414_New_York_20200318_null_1,epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1,epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1,(epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1,epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1)Node149,epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1,epi_isl_420759_England_20200326_null_1,epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_418186_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1,epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_421990_England_20200331_null_10,epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1,epi_isl_414007_England_20200228_null_3,epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_2,epi_isl_421719_New_York_20200317_null_1,epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_3,epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1,epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1,epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_418692_England_20200317_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1,epi_isl_421969_England_20200401_null_1,epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_418405_Finland_20200314_null_1,epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1,(epi_isl_418877_Washington_20200324_null_2,epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1)Node25,epi_isl_416703_Washington_20200313_null_1,epi_isl_420687_England_20200328_null_2,(epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4)Node75,epi_isl_418407_Helsinki_20200314_null_2,epi_isl_420416_Lasne_20200323_null_2,epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2,epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1,epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1,epi_isl_422119_Wales_20200327_null_7,epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2,epi_isl_419462_Wales_20200319_null_1,epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1,epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1,epi_isl_421589_New_York_20200318_null_10,epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1,epi_isl_417333_ARA_20200304_null_3,epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1,epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1,epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_1,epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2,epi_isl_421801_England_20200326_null_3,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_421186_Li_ge_20200330_null_3,epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node149":"test",
"Node25":"test",
"Node75":"test",
"epi_isl_402121_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_402127_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_411929_South_Korea_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_414007_England_20200228_null_3":"test",
"epi_isl_414558_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414588_Minnesota_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414590_Minnesota_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415453_Wales_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_2":"test",
"epi_isl_415622_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_415742_Taoyuan_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_416153_Copenhagen_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416346_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416383_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416401_Shanghai_20200202_null_2":"test",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"test",
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416703_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416704_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417005_Li_ge_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417333_ARA_20200304_null_3":"test",
"epi_isl_417347_Washington_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417388_New_South_Wales_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_417503_Minnesota_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417538_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417969_Madrid_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_418022_Portugal_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418186_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418251_Madrid_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_418252_Madrid_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_418357_Ontario_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418405_Finland_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418407_Helsinki_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_418672_England_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418692_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418877_Washington_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_418992_Singapore_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_2":"test",
"epi_isl_419462_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419840_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419884_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_419936_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420103_Singapore_20200305_null_2":"test",
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420179_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420270_South_Yorkshire_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420282_South_Yorkshire_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420416_Lasne_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_420687_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420759_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_420841_Sud_Kivu_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421186_Li_ge_20200330_null_3":"test",
"epi_isl_421236_Hangzhou_20200120_null_2":"test",
"epi_isl_421245_Jiangxi_20200125_null_1":"test",
"epi_isl_421253_Jiangxi_20200126_null_1":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421414_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_4":"test",
"epi_isl_421552_Wyoming_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_10":"test",
"epi_isl_421630_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421719_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421801_England_20200326_null_3":"test",
"epi_isl_421918_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_421924_England_20200328_null_3":"test",
"epi_isl_421937_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_421969_England_20200401_null_1":"test",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_10":"test",
"epi_isl_422017_Wales_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_422119_Wales_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_422147_Wales_20200328_null_4":"test",
"epi_isl_422166_Wales_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_422375_Wales_20200328_null_5022":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":1
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":2
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":4
}
}
}