{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[111.8125810121714, 290.36102464792, 1, 0, 0.278020684198438, 0.008943537399348151, 0, -0.0974536775735147, 1, 0.2780206841984381, 0.002414035985461471],
[111.7197621361822, 290.4538435239092, 0, 1, 0.2777898911412038, 0, 0.003442887819515748, 0.0375155896937741, 0.7222101088587962, 1, 0.002414035970271449],
[111.677442892244, 290.4961627678474, 0, 1, 0.2776846648326081, 0, 0.003442386262427703, 0.03751012445328139, 0.7223153351673919, 1, 0.002428900622525674],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002412724419711699],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002409955291026291],
[111.6507304221216, 290.5228752379698, 0, 1, 0.2776182445858629, 0, 0.003442069748142522, 0.03750667554042754, 0.7223817554141371, 1, 0.002412812490772573],
[111.4534446764875, 290.5839430621886, 0, 1, 0.2772215920100748, 0, 0.0034413463781307, 0.03749879330493718, 0.7227784079899252, 1, 0.002432348597088123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[111.9801571466099, 290.363604563643, 0, 1, 0.2783196057784342, 0, 0.003443957797337566, 0.03752724875763242, 0.7216803942215657, 1, 0.002415484711049513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[111.8154437843658, 290.4087240437761, 1, 0, 0.2779928525631038, 0.008943308421048559, 0, -0.09745118250066115, 1, 0.2779928525631038, 0.002410016053509248],
[111.7887313142434, 290.5228752379698, 0, 1, 0.2778660359124765, 0, 0.003442069748142522, 0.03750667554042754, 0.7221339640875235, 1, 0.002411221475616548],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002414105667002898],
[112.033258859418, 290.0023459085517, 0, 1, 0.2786650175525542, 0, 0.003448247968019323, 0.03757399680504214, 0.7213349824474458, 1, 0.002410247926719702],
[111.8154437843658, 290.3396923297155, 0, 2, 0.2780405712701045, 0, 0.006888482880007879, 0.07506067896667955, 0.5212254167319972, 1, 0.004834117226563083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[111.9267322063651, 290.3159051677869, 1, 1, 0.2782567580031423, 0.008934416115680461, 0.00344452364544772, -0.05982087252705196, 0.9225731766255806, 0.4790866926318653, 0.004839402337464757],
[111.8520896311284, 290.3215160289631, 1, 0, 0.2781189219206578, 0.008940378345168623, 0, -0.09741925479048127, 1, 0.2781189219206578, 0.002413765528774087],
[111.7197621361822, 290.4538435239092, 0, 1, 0.2777898911412038, 0, 0.003442887819515748, 0.0375155896937741, 0.7222101088587962, 1, 0.00241403597509888],
[111.8154437843658, 290.3581618757257, 1, 0, 0.2780278024482536, 0.008943308421048559, 0, -0.09745118250066115, 1, 0.2780278024482536, 0.002411043057750541],
[111.9267322063651, 290.2468734537263, 0, 1, 0.2783045198171538, 0, 0.003445342883803462, 0.03754234141770994, 0.7216954801828461, 1, 0.00241058514454503],
[112.2887313142434, 289.8848743458481, 0, 1, 0.2792046263949689, 0, 0.003449645319565542, 0.03758922311214653, 0.7207953736050311, 1, 0.002410973378631982],
[111.5546381081283, 290.4538359115954, 0, 1, 0.2774932503105771, 0, 0.003442887909748134, 0.03751559067699555, 0.7225067496894229, 1, 0.002419157817061311],
[111.8154437843658, 290.3581618757257, 1, 0, 0.2780278024482536, 0.008943308421048559, 0, -0.09745118250066115, 1, 0.2780278024482536, 0.002409955332577758],
[112.1507304221216, 290.2096553274356, 0, 1, 0.2787320382278589, 0, 0.0034457847340459, 0.03754715605974022, 0.7212679617721411, 1, 0.002416828593864657],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002412722130394798],
[111.4532830627692, 290.5823217052005, 1, 0, 0.2772224194598218, 0.008972369162394359, 0, -0.09776784424094383, 1, 0.2772224194598218, 0.002414105660532046],
[111.9267322063651, 290.2284039077161, 1, 1, 0.278317301347643, 0.008934416115680462, 0.00344556213842519, -0.05980955653928677, 0.9225394797705653, 0.4791740824658512, 0.004838857366827719],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002413847181678824],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002413712079732622],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002413927014818508],
[111.9267322063651, 290.3159051677869, 0, 2, 0.2782567580031423, 0, 0.00688904729089544, 0.07506682909656656, 0.5209133073681347, 1, 0.004830139190404848],
[112.177442892244, 289.9961627678475, 1, 0, 0.2789279090260686, 0.008914448165488897, 0, -0.09713670536321377, 1, 0.2789279090260686, 0.002416258055013384],
[112.1241795657175, 290.1874269864957, 1, 0, 0.2786998379853248, 0.008918682873517804, 0, -0.09718284905920783, 1, 0.2786998379853247, 0.002409929530918049],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.00241226046557415],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002416901551388296],
[111.7887313142434, 290.2735859238487, 0, 1, 0.2780383202339369, 0, 0.003445025825609718, 0.03753888657813075, 0.7219616797660631, 1, 0.002413776014405209]
],
"NAMES": [
["epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_1"],
["epi_isl_420482_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2"],
["epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1"],
["epi_isl_415477_Netherlands_20200312_null_2"],
["epi_isl_416469_Kessel_Lo_20200303_null_2"],
["epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_2"],
["epi_isl_420335_Bierset_20200306_null_1"],
["epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3"],
["Node36"],
["epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2"],
["epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1"],
["epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_417451_Washington_20200314_null_4586"],
["epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1"],
["epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1"],
["epi_isl_415699_Switzerland_20200227_null_2"],
["epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1"],
["epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1"],
["epi_isl_420197_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_420484_England_20200319_null_2"],
["epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_2"],
["epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1"],
["epi_isl_415652_Bourgogne_France_Comt_20200305_null_1"],
["epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_417361_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_415527_Utrecht_20200312_null_1"],
["epi_isl_420198_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1"],
["epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1"],
["epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2"],
["epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[111.8125810121714, 290.36102464792, 1, 0, 0.278020684198438, 0.008943537399348151, 0, -0.0974536775735147, 1, 0.2780206841984381, 0.002414035985461471],
[111.7197621361822, 290.4538435239092, 0, 1, 0.2777898911412038, 0, 0.003442887819515748, 0.0375155896937741, 0.7222101088587962, 1, 0.002414035970271449],
[111.677442892244, 290.4961627678474, 0, 1, 0.2776846648326081, 0, 0.003442386262427703, 0.03751012445328139, 0.7223153351673919, 1, 0.002428900622525674],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002412724419711699],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002409955291026291],
[111.6507304221216, 290.5228752379698, 0, 1, 0.2776182445858629, 0, 0.003442069748142522, 0.03750667554042754, 0.7223817554141371, 1, 0.002412812490772573],
[111.4534446764875, 290.5839430621886, 0, 1, 0.2772215920100748, 0, 0.0034413463781307, 0.03749879330493718, 0.7227784079899252, 1, 0.002432348597088123],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[111.9801571466099, 290.363604563643, 0, 1, 0.2783196057784342, 0, 0.003443957797337566, 0.03752724875763242, 0.7216803942215657, 1, 0.002415484711049513],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[111.8154437843658, 290.4087240437761, 1, 0, 0.2779928525631038, 0.008943308421048559, 0, -0.09745118250066115, 1, 0.2779928525631038, 0.002410016053509248],
[111.7887313142434, 290.5228752379698, 0, 1, 0.2778660359124765, 0, 0.003442069748142522, 0.03750667554042754, 0.7221339640875235, 1, 0.002411221475616548],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002414105667002898],
[112.033258859418, 290.0023459085517, 0, 1, 0.2786650175525542, 0, 0.003448247968019323, 0.03757399680504214, 0.7213349824474458, 1, 0.002410247926719702],
[111.8154437843658, 290.3396923297155, 0, 2, 0.2780405712701045, 0, 0.006888482880007879, 0.07506067896667955, 0.5212254167319972, 1, 0.004834117226563083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[111.9267322063651, 290.3159051677869, 1, 1, 0.2782567580031423, 0.008934416115680461, 0.00344452364544772, -0.05982087252705196, 0.9225731766255806, 0.4790866926318653, 0.004839402337464757],
[111.8520896311284, 290.3215160289631, 1, 0, 0.2781189219206578, 0.008940378345168623, 0, -0.09741925479048127, 1, 0.2781189219206578, 0.002413765528774087],
[111.7197621361822, 290.4538435239092, 0, 1, 0.2777898911412038, 0, 0.003442887819515748, 0.0375155896937741, 0.7222101088587962, 1, 0.00241403597509888],
[111.8154437843658, 290.3581618757257, 1, 0, 0.2780278024482536, 0.008943308421048559, 0, -0.09745118250066115, 1, 0.2780278024482536, 0.002411043057750541],
[111.9267322063651, 290.2468734537263, 0, 1, 0.2783045198171538, 0, 0.003445342883803462, 0.03754234141770994, 0.7216954801828461, 1, 0.00241058514454503],
[112.2887313142434, 289.8848743458481, 0, 1, 0.2792046263949689, 0, 0.003449645319565542, 0.03758922311214653, 0.7207953736050311, 1, 0.002410973378631982],
[111.5546381081283, 290.4538359115954, 0, 1, 0.2774932503105771, 0, 0.003442887909748134, 0.03751559067699555, 0.7225067496894229, 1, 0.002419157817061311],
[111.8154437843658, 290.3581618757257, 1, 0, 0.2780278024482536, 0.008943308421048559, 0, -0.09745118250066115, 1, 0.2780278024482536, 0.002409955332577758],
[112.1507304221216, 290.2096553274356, 0, 1, 0.2787320382278589, 0, 0.0034457847340459, 0.03754715605974022, 0.7212679617721411, 1, 0.002416828593864657],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002412722130394798],
[111.4532830627692, 290.5823217052005, 1, 0, 0.2772224194598218, 0.008972369162394359, 0, -0.09776784424094383, 1, 0.2772224194598218, 0.002414105660532046],
[111.9267322063651, 290.2284039077161, 1, 1, 0.278317301347643, 0.008934416115680462, 0.00344556213842519, -0.05980955653928677, 0.9225394797705653, 0.4791740824658512, 0.004838857366827719],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002413847181678824],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002413712079732622],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 1, 0, 0.2779613822015084, 0.008945445468818793, 0, -0.09747446894259794, 1, 0.2779613822015083, 0.002413927014818508],
[111.9267322063651, 290.3159051677869, 0, 2, 0.2782567580031423, 0, 0.00688904729089544, 0.07506682909656656, 0.5209133073681347, 1, 0.004830139190404848],
[112.177442892244, 289.9961627678475, 1, 0, 0.2789279090260686, 0.008914448165488897, 0, -0.09713670536321377, 1, 0.2789279090260686, 0.002416258055013384],
[112.1241795657175, 290.1874269864957, 1, 0, 0.2786998379853248, 0.008918682873517804, 0, -0.09718284905920783, 1, 0.2786998379853247, 0.002409929530918049],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.00241226046557415],
[111.7887313142434, 290.3848743458481, 0, 1, 0.2779613822015084, 0, 0.003443705538219601, 0.03752450000424219, 0.7220386177984917, 1, 0.002416901551388296],
[111.7887313142434, 290.2735859238487, 0, 1, 0.2780383202339369, 0, 0.003445025825609718, 0.03753888657813075, 0.7219616797660631, 1, 0.002413776014405209]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.448273609311322, 0.6666666666666667, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.777423156001225, 0, 0, 0.3600459648502905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9981857894318392, 2.001814210568161, 0, 1, 0.3327285964772797, 0, 0.4995468584050949, 5.443335930525716, 0.6672714035227203, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.115335494257283, 1.612286612634209, 1, 0, 0.4089039649001688, 0.896591209684323, 0, -9.769748452127221, 1, 0.4089039649001689, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2, 0, 0, 0.2799080702994191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2, 0, 0, 0.2657851284808693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.768599050092135, 1.22777077898797, 1, 0, 0.5902472494976032, 0.565419279145211, 0, -6.161117873525368, 1, 0.5902472494976032, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 10.89654721862264, 0.4444444444444445, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.669736719264595, 0, 0, 0.3745687703150968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.997072911476151, 0, 1, 0.3336588830291315, 0, 0.5007328446815907, 5.456259085988192, 0.6663411169708684, 1, 0.09177218984477571],
[0.8149896061476688, 2.185010393852332, 1, 0, 0.2716632020492229, 1.227009513319866, 0, -13.3701670995891, 1, 0.2716632020492229, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.2558118035263755, 2.249880873747752, 0, 0, 0.1020922501177064, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9798100192828757, 1.882126552595915, 0, 0, 0.3423590966027785, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9981857894282115, 2.001814210571789, 0, 2, 0.3327285964760704, 0, 0.9990937168083792, 10.8866718610317, 0.4452511259607948, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.2574782356069093, 1.965098608391866, 1, 0, 0.1158467192268881, 3.883823413823198, 0, -42.32026521751666, 1, 0.1158467192268882, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.6174715627036143, 2.382528437296387, 0, 0, 0.205823854234538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.01313564263155278, 2.986864357368448, 0, 1, 0.004378547543850925, 0, 0.3347992678452401, 3.648156030835949, 0.9956214524561491, 1, 0.09177218984477571],
[0.7178274094321435, 2.277819643348058, 0, 1, 0.2396234926160416, 0, 0.4390163211210822, 4.783762072841874, 0.7603765073839583, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.999026159243616, 2, 0, 0.3334415729978861, 2, 0, -21.79309443724529, 1, 0.1111832826033046, 0.09177218984477571],
[0.7312745664091498, 2.268725433590851, 0, 1, 0.2437581888030499, 0, 0.4407761226607482, 4.80293783341425, 0.7562418111969501, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.963060907979564, 0, 0, 0.3374888438192364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.777423156001225, 1.222576843998775, 0, 0, 0.5924743853337416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2, 0, 0, 0.2799080702994191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.185637751978339, 0, 0, 0.2623716420771554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.185637751978339, 0, 0, 0.2623716420771554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.6174715627036143, 2.382528437296387, 0, 0, 0.205823854234538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7246996903527433, 2.275300309647257, 1, 0, 0.2415665634509144, 1.379881919796676, 0, -15.03594849518814, 1, 0.2415665634509144, 0.09177218984477571],
[0.7247000069609252, 2.275299993039075, 1, 0, 0.241566668986975, 1.379881316951496, 0, -15.03594192625718, 1, 0.241566668986975, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.669736719264595, 0, 0, 0.3745687703150968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.106526653052886, 1.617471562703614, 0, 0, 0.4062141622018591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.2558118035263755, 2.249880873747752, 0, 0, 0.1020922501177064, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2, 0, 0, 0.2657851284808693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.623893682626653, 2.372481947456007, 0, 1, 0.2082161116126291, 0, 0.4214995191311326, 4.592889412839124, 0.7917838883873709, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7312753858996101, 2.134301419899164, 0, 1, 0.2551930851826421, 0, 0.4685373821506643, 5.105439708294555, 0.7448069148173579, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9963717736624539, 2.003628226337546, 0, 1, 0.3321239245541512, 0, 0.4990945859391843, 5.438407722245238, 0.6678760754458488, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9970545704757466, 2.002945429524253, 0, 1, 0.3323515234919155, 0, 0.4992647254685932, 5.440261655661198, 0.6676484765080845, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.185637751978339, 0, 0, 0.2623716420771554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.009533277960931816, 2.483761984872161, 0, 1, 0.003823565585288643, 0, 0.402615067824814, 4.387114097482044, 0.9961764344147114, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7437096459515389, 2.058176148919998, 0, 1, 0.2654318199952319, 0, 0.4858670627024501, 5.438414216065399, 0.7345681800047681, 1, 0.08933984124768758],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7172193715789065, 2.145096296129177, 1, 1, 0.2505731215010255, 1.394273550920094, 0.466179537862472, -10.11302023660335, 0.9372131107812323, 0.4383593537832834, 0.09177218984477571],
[0.734892315505678, 2.265107684494323, 0, 2, 0.2449641051685593, 0, 0.8829602290835427, 9.621217828374689, 0.5700792024839144, 1, 0.09177218984477571],
[0.7348937012414888, 2.132493082059759, 0, 2, 0.256293885959605, 0, 0.9378693965413547, 10.219538164314, 0.5530987840610649, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 1, 0.2413327385855, 0, 0.439366966635477, 4.787582898246474, 0.7586672614145, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9941378616025814, 2.004889251614551, 0, 1, 0.3314867869054189, 0, 0.4987806679070642, 5.434987099585465, 0.668513213094581, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.448273609311322, 0.6666666666666667, 1, 0.09177218984477571],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.010234336600331, 1.989765663399669, 1, 0, 0.3367447788667771, 0.9898693439437306, 0, -10.78615804654988, 1, 0.3367447788667771, 0.09177218984477571],
[0.2558118035263755, 1.9667650404724, 0, 0, 0.1150969444395581, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571]
],
"RESOLVED": [
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.448273609311322, 0.6666666666666667, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.777423156001225, 0, 0, 0.3600459648502905, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9981857894318392, 2.001814210568161, 0, 1, 0.3327285964772797, 0, 0.4995468584050949, 5.443335930525716, 0.6672714035227203, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.115335494257283, 1.612286612634209, 1, 0, 0.4089039649001688, 0.896591209684323, 0, -9.769748452127221, 1, 0.4089039649001689, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2, 0, 0, 0.2799080702994191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2, 0, 0, 0.2657851284808693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.768599050092135, 1.22777077898797, 1, 0, 0.5902472494976032, 0.565419279145211, 0, -6.161117873525368, 1, 0.5902472494976032, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 10.89654721862264, 0.4444444444444445, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.669736719264595, 0, 0, 0.3745687703150968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.997072911476151, 0, 1, 0.3336588830291315, 0, 0.5007328446815907, 5.456259085988192, 0.6663411169708684, 1, 0.09177218984477571],
[0.8149896061476688, 2.185010393852332, 1, 0, 0.2716632020492229, 1.227009513319866, 0, -13.3701670995891, 1, 0.2716632020492229, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.2558118035263755, 2.249880873747752, 0, 0, 0.1020922501177064, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9798100192828757, 1.882126552595915, 0, 0, 0.3423590966027785, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9981857894282115, 2.001814210571789, 0, 2, 0.3327285964760704, 0, 0.9990937168083792, 10.8866718610317, 0.4452511259607948, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.2574782356069093, 1.965098608391866, 1, 0, 0.1158467192268881, 3.883823413823198, 0, -42.32026521751666, 1, 0.1158467192268882, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.6174715627036143, 2.382528437296387, 0, 0, 0.205823854234538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.01313564263155278, 2.986864357368448, 0, 1, 0.004378547543850925, 0, 0.3347992678452401, 3.648156030835949, 0.9956214524561491, 1, 0.09177218984477571],
[0.7178274094321435, 2.277819643348058, 0, 1, 0.2396234926160416, 0, 0.4390163211210822, 4.783762072841874, 0.7603765073839583, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.999026159243616, 2, 0, 0.3334415729978861, 2, 0, -21.79309443724529, 1, 0.1111832826033046, 0.09177218984477571],
[0.7312745664091498, 2.268725433590851, 0, 1, 0.2437581888030499, 0, 0.4407761226607482, 4.80293783341425, 0.7562418111969501, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.963060907979564, 0, 0, 0.3374888438192364, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.777423156001225, 1.222576843998775, 0, 0, 0.5924743853337416, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2, 0, 0, 0.2799080702994191, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.185637751978339, 0, 0, 0.2623716420771554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.185637751978339, 0, 0, 0.2623716420771554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.6174715627036143, 2.382528437296387, 0, 0, 0.205823854234538, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7246996903527433, 2.275300309647257, 1, 0, 0.2415665634509144, 1.379881919796676, 0, -15.03594849518814, 1, 0.2415665634509144, 0.09177218984477571],
[0.7247000069609252, 2.275299993039075, 1, 0, 0.241566668986975, 1.379881316951496, 0, -15.03594192625718, 1, 0.241566668986975, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 1.669736719264595, 0, 0, 0.3745687703150968, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.106526653052886, 1.617471562703614, 0, 0, 0.4062141622018591, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.2558118035263755, 2.249880873747752, 0, 0, 0.1020922501177064, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2, 0, 0, 0.2657851284808693, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.623893682626653, 2.372481947456007, 0, 1, 0.2082161116126291, 0, 0.4214995191311326, 4.592889412839124, 0.7917838883873709, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7312753858996101, 2.134301419899164, 0, 1, 0.2551930851826421, 0, 0.4685373821506643, 5.105439708294555, 0.7448069148173579, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 0, 0.2413327385855, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9963717736624539, 2.003628226337546, 0, 1, 0.3321239245541512, 0, 0.4990945859391843, 5.438407722245238, 0.6678760754458488, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.222576843998775, 0, 0, 0.2591410520004084, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.137938356122291, 0, 0, 0.252974934130428, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9970545704757466, 2.002945429524253, 0, 1, 0.3323515234919155, 0, 0.4992647254685932, 5.440261655661198, 0.6676484765080845, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -10.89654721862264, 1, 0.3333333333333333, 0.09177218984477571],
[0.7774231560012254, 2.185637751978339, 0, 0, 0.2623716420771554, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.009533277960931816, 2.483761984872161, 0, 1, 0.003823565585288643, 0, 0.402615067824814, 4.387114097482044, 0.9961764344147114, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.123164239977742, 0, 0, 0.1526637487373463, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7437096459515389, 2.058176148919998, 0, 1, 0.2654318199952319, 0, 0.4858670627024501, 5.438414216065399, 0.7345681800047681, 1, 0.08933984124768758],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.7172193715789065, 2.145096296129177, 1, 1, 0.2505731215010255, 1.394273550920094, 0.466179537862472, -10.11302023660335, 0.9372131107812323, 0.4383593537832834, 0.09177218984477571],
[0.734892315505678, 2.265107684494323, 0, 2, 0.2449641051685593, 0, 0.8829602290835427, 9.621217828374689, 0.5700792024839144, 1, 0.09177218984477571],
[0.7348937012414888, 2.132493082059759, 0, 2, 0.256293885959605, 0, 0.9378693965413547, 10.219538164314, 0.5530987840610649, 1, 0.09177218984477571],
[0.7239982157565001, 2.2760017842435, 0, 1, 0.2413327385855, 0, 0.439366966635477, 4.787582898246474, 0.7586672614145, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 1.84004840670239, 0, 0, 0.1721103314511975, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[0.9941378616025814, 2.004889251614551, 0, 1, 0.3314867869054189, 0, 0.4987806679070642, 5.434987099585465, 0.668513213094581, 1, 0.09177218984477571],
[0.3825284372963859, 2.287208281968209, 0, 0, 0.1432832063686628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 5.448273609311322, 0.6666666666666667, 1, 0.09177218984477571],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.09177218984477571],
[1.010234336600331, 1.989765663399669, 1, 0, 0.3367447788667771, 0.9898693439437306, 0, -10.78615804654988, 1, 0.3367447788667771, 0.09177218984477571],
[0.2558118035263755, 1.9667650404724, 0, 0, 0.1150969444395581, 0, 0, 0, 1, 1, 0.09177218984477571]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node36":{
"Global MG94xREV":0.002410016053509248,
"Nucleotide GTR":0.002399928764113543,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGC", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node37":{
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004838857366827719,
"Nucleotide GTR":0.004818603993605307,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "L", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCG", "CTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002416258055013384,
"Nucleotide GTR":0.002406144639287321,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTA", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_415477_Netherlands_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002412812490772573,
"Nucleotide GTR":0.002402713496694687,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "F", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "TTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415477_Netherlands_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002409955291026291,
"Nucleotide GTR":0.002399868255956171,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCC", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415527_Utrecht_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002413712079732622,
"Nucleotide GTR":0.002403609320362734,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "V", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GTT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415527_Utrecht_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004839402337464757,
"Nucleotide GTR":0.004819146683229938,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "R", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACA", "CGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002416828593864657,
"Nucleotide GTR":0.002406712790108648,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "C", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGT", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415652_Bourgogne_France_Comt_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002412722130394798,
"Nucleotide GTR":0.002402623514526545,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCT", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415652_Bourgogne_France_Comt_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415699_Switzerland_20200227_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00241403597509888,
"Nucleotide GTR":0.002403931860042463,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "I", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ATT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415699_Switzerland_20200227_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00241226046557415,
"Nucleotide GTR":0.002402163782036032,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "A", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "GCT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002409955332577758,
"Nucleotide GTR":0.002399868297333723,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAC", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416469_Kessel_Lo_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002432348597088123,
"Nucleotide GTR":0.002422167833281864,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "-", "G", "W", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "---", "GGC", "TGG", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416469_Kessel_Lo_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417361_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002413847181678824,
"Nucleotide GTR":0.002403743856830365,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCT", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417361_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417451_Washington_20200314_null_4586":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417451_Washington_20200314_null_4586",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002428900622525674,
"Nucleotide GTR":0.002418734290456164,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "N", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "AAC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004834117226563083,
"Nucleotide GTR":0.004813883693526613,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "G", "C", "D", "Q", "L", "C", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "GGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "TGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002412724419711699,
"Nucleotide GTR":0.002402625794261347,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "S", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "TCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002414035985461471,
"Nucleotide GTR":0.00240393187036168,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATT", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002411221475616548,
"Nucleotide GTR":0.002401129140842981,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "F", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TTT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002410247926719702,
"Nucleotide GTR":0.002400159666802587,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "L", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "TTA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002409929530918049,
"Nucleotide GTR":0.002399842603668654,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "CTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002414105667002898,
"Nucleotide GTR":0.002404001260246184,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "L", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CTT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002416901551388296,
"Nucleotide GTR":0.00240678544226351,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "S", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "TCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002411043057750541,
"Nucleotide GTR":0.002400951469757331,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAC", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420197_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002410973378631982,
"Nucleotide GTR":0.002400882082285559,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "T", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ACG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420197_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420198_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002413927014818508,
"Nucleotide GTR":0.002403823355822905,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTT", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420198_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420335_Bierset_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002415484711049513,
"Nucleotide GTR":0.002405374532208264,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "G", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGC", "AGT", "GGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420335_Bierset_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00241058514454503,
"Nucleotide GTR":0.00240049547317931,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "T", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "ACT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004830139190404848,
"Nucleotide GTR":0.004809922307714714,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "S", "H", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TCT", "CAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGC", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "-", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "---", "GGC", "TGC", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420482_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002414035970271449,
"Nucleotide GTR":0.00240393185523524,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "I", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ATT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420482_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420484_England_20200319_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002419157817061311,
"Nucleotide GTR":0.002409032264180012,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "E", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAG", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420484_England_20200319_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002413765528774087,
"Nucleotide GTR":0.00240366254568953,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAA", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002414105660532046,
"Nucleotide GTR":0.002404001253802415,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "P", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "TTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "CCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002413776014405209,
"Nucleotide GTR":0.002403672987432312,
"amino-acid": [
["A", "G", "N", "A", "T", "E", "V", "P", "A", "N", "S", "T", "V", "L", "S", "F", "C", "A", "F", "A", "V", "D", "A", "A", "K", "A", "Y", "K", "D", "Y", "L", "A", "S", "G", "G", "Q", "S", "I", "T", "N", "C", "V", "K", "M", "L", "C", "T", "H", "T", "G", "T", "G", "Q", "A", "I", "T", "V", "T", "P", "E", "A", "N", "M", "D", "Q", "E", "S", "F", "G", "G", "A", "S", "C", "C", "L", "Y", "C", "R", "C", "H", "I", "D", "H", "P", "N", "P", "K", "G", "F", "C", "D", "L", "K", "G", "K", "Y", "V", "Q", "I", "P", "T", "T", "C", "A", "N", "D", "P", "V", "G", "F", "T", "L", "K", "N", "T", "V", "C", "T", "V", "C", "G", "M", "W", "K", "G", "Y", "G", "C", "S", "C", "D", "Q", "L", "R", "E", "P", "M", "L", "Q"]
],
"codon": [
["GCT", "GGT", "AAT", "GCA", "ACA", "GAA", "GTG", "CCT", "GCC", "AAT", "TCA", "ACT", "GTA", "TTA", "TCT", "TTC", "TGT", "GCT", "TTT", "GCT", "GTA", "GAT", "GCT", "GCT", "AAA", "GCT", "TAC", "AAA", "GAT", "TAT", "CTA", "GCT", "AGT", "GGG", "GGA", "CAA", "TCA", "ATC", "ACT", "AAT", "TGT", "GTT", "AAG", "ATG", "TTG", "TGT", "ACA", "CAC", "ACT", "GGT", "ACT", "GGT", "CAG", "GCA", "ATA", "ACA", "GTT", "ACA", "CCG", "GAA", "GCC", "AAT", "ATG", "GAT", "CAA", "GAA", "TCC", "TTT", "GGT", "GGT", "GCA", "TCG", "TGT", "TGT", "CTG", "TAC", "TGC", "CGT", "TGC", "CAC", "ATA", "GAT", "CAT", "CCA", "AAT", "CCT", "AAA", "GGA", "TTT", "TGT", "GAC", "TTA", "AAA", "GGT", "AAG", "TAT", "GTA", "CAA", "ATA", "CCT", "ACA", "ACT", "TGT", "GCT", "AAT", "GAC", "CCT", "GTG", "GGT", "TTT", "ACA", "CTT", "AAA", "AAC", "ACA", "GTC", "TGT", "ACC", "GTC", "TGC", "GGT", "ATG", "TGG", "AAA", "GGT", "TAT", "GGC", "TGT", "AGT", "TGT", "GAT", "CAA", "CTC", "CGC", "GAA", "CCC", "ATG", "CTT", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":1770.314443862058,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02531779658205516],
[0.01257646911955535],
[0.009948478161789566],
[0.0358471770395155],
[0.02136109077899786],
[0.01061099838097671],
[0.008393714059520031],
[0.03024492279295104],
[0.01894042959039242],
[0.009408548926549061],
[0.007442529587605852],
[0.02681753645230373],
[0.01694759900058735],
[0.008418621849287022],
[0.006659458614641562],
[0.02399591053667654],
[0.01600411251561455],
[0.007949950391069029],
[0.006288721190423991],
[0.02266003887218965],
[0.01350296417681334],
[0.006707519409983741],
[0.005305909769717796],
[0.019118691701139],
[0.01197279412828387],
[0.005947416282500707],
[0.0047046385152355],
[0.01695214152555704],
[0.01071306819279688],
[0.00532165470505031],
[0.004209636672621952],
[0.01516851005967038],
[0.03072982432677599],
[0.01526486262114075],
[0.01207510239841513],
[0.0435100048878633],
[0.0259273181589657],
[0.01287924543995407],
[0.01018798605408901],
[0.03671019163109347],
[0.02298920729930212],
[0.01141975585219984],
[0.009033472799764282],
[0.03255015425158728],
[0.02057038172183696],
[0.0102182182269966],
[0.008083009620371881],
[0.02912536693164495],
[0.0128376456751357],
[0.03659161827635692],
[0.02180469828600655],
[0.01083135784610694],
[0.008568027001073956],
[0.03087302156087739],
[0.009603937026204504],
[0.007597089203982858],
[0.02737445840974505],
[0.01729955116540028],
[0.008593452052933877],
[0.006797756132527366],
[0.02449423555957493]
],
"Log Likelihood":-832.6005667098615,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.7758902392398105, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":52
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":1871.747592106105,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2781554045048647],
[0.201386112221778],
[0.2231107556977209],
[0.2973477275756364]
],
"Log Likelihood":-858.4716265070502,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.3567072154230202,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.9695923968593888,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":2.234904521744528,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":7.02273093109888,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.207709798679957
},
"display order":0,
"estimated parameters":77
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-09/sequences.nsp10.compressed.fas",
"number of sequences":36,
"number of sites":139,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_1,epi_isl_420482_England_20200318_null_1,epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2,epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1,epi_isl_415477_Netherlands_20200312_null_2,(epi_isl_416469_Kessel_Lo_20200303_null_2,epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_2,epi_isl_420335_Bierset_20200306_null_1,epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3)Node36,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2,epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1,epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_417451_Washington_20200314_null_4586,epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1,epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1,epi_isl_415699_Switzerland_20200227_null_2,epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1,epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1,epi_isl_420197_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_420484_England_20200319_null_2,epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_2,epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1,epi_isl_415652_Bourgogne_France_Comt_20200305_null_1,epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_417361_Washington_20200314_null_1,epi_isl_415527_Utrecht_20200312_null_1,epi_isl_420198_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1,epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2,epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node36":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_414934_Shandong_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_415477_Netherlands_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_415486_Netherlands_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_415527_Utrecht_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_415593_Washington_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415618_Washington_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415652_Bourgogne_France_Comt_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_415699_Switzerland_20200227_null_2":"test",
"epi_isl_416345_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_2":"test",
"epi_isl_416469_Kessel_Lo_20200303_null_2":"test",
"epi_isl_417361_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417451_Washington_20200314_null_4586":"test",
"epi_isl_417563_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418398_Finland_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_418957_Virginia_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_2":"test",
"epi_isl_419249_Hong_Kong_20200225_null_1":"test",
"epi_isl_419496_Wales_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419768_Victoria_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_420052_Ile_de_France_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420197_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420198_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420335_Bierset_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420364_Anderlecht_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420431_Saint_Saulve_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_2":"test",
"epi_isl_420482_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420484_England_20200319_null_2":"test",
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_421393_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421585_New_Jersey_20200318_null_1":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":1
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":1
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":2
}
}
}