{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[349.7350270931487, 841.9757423210161, 1, 0, 0.2934730775866661, 0.002859307540087082, 0, -0.01530943801475651, 1, 0.2934730775866661, 0.0008012082950489841],
[349.69297907564, 842.0177903385248, 0, 1, 0.293437793842835, 0, 0.001187623363157161, 0.006358828495439661, 0.706562206157165, 1, 0.0008021459700474988],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011870153163671],
[350.0397654777297, 841.5108763424516, 1, 0, 0.2937682656467024, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937682656467024, 0.0008014314932986351],
[350.3744960974103, 841.6650177444795, 0, 1, 0.2939285921556148, 0, 0.001188121139547693, 0.006361493713045398, 0.7060714078443852, 1, 0.0008009174154519558],
[350.3207122965671, 841.3900571175977, 0, 1, 0.2939645434846426, 0, 0.001188509409566548, 0.006363572606519889, 0.7060354565153575, 1, 0.0008011326490148769],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008014314104001821],
[349.8873962854392, 841.8503843021599, 1, 0, 0.2935942805412475, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2935942805412475, 0.0008009114696945663],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.5328514816564, 842.1779179325084, 0, 1, 0.2933034260095542, 0, 0.001187397554254254, 0.006357619458862178, 0.7066965739904458, 1, 0.0008024326743692288],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011468433027761],
[349.8531066696235, 841.8576627445414, 0, 1, 0.2935721616761157, 0, 0.001187849257961136, 0.006360037991952657, 0.7064278383238842, 1, 0.00080193794388782],
[349.7272686914557, 841.9835007227091, 1, 1, 0.2934665672807326, 0.002859370971390403, 0.001187671728889769, -0.008950690184099408, 0.9138773738884632, 0.5008105084499285, 0.001603779276164227],
[350.2058792636689, 841.776003321645, 0, 1, 0.2938013441144761, 0, 0.001187964489429496, 0.006360654969664033, 0.706198655885524, 1, 0.0008012080257207521],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869324847258],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009115435157766],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008023577232045875],
[349.5935492785729, 841.9228029257927, 2, 0, 0.2934022253507533, 0.00572092935961557, 0, -0.03063126725261872, 1, 0.08608486584077424, 0.001602447296546652],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008010146949486235],
[349.5935492785729, 841.9228029257927, 1, 0, 0.2934022253507533, 0.002860464679807785, 0, -0.01531563362630936, 1, 0.2934022253507533, 0.0008010123012609292],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008014264063498914],
[349.7058792636689, 842.0391797663117, 0, 1, 0.2934401754921573, 0, 0.001187593195221066, 0.006358666968866812, 0.7065598245078426, 1, 0.000800905612681591],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008012082986162554],
[350.2272686914557, 841.4835007227092, 0, 1, 0.2938861321725107, 0, 0.001188377430028216, 0.00636286595550982, 0.7061138678274893, 1, 0.0008014162496721733],
[350.0535100713784, 841.6572593427865, 0, 1, 0.2937403261392542, 0, 0.001188132091655523, 0.006361552353332814, 0.7062596738607458, 1, 0.0008016154321923552],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008011329245864824],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011812330765362],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008009173245111406],
[350.1921346700203, 841.3242175343453, 0, 1, 0.2939045981384537, 0, 0.001188602418851894, 0.006364070601180779, 0.7060954018615464, 1, 0.000801370932421152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0397654777297, 841.6710039364351, 1, 0, 0.2937287926413608, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937287926413608, 0.000801246160742155],
[350.3207122965671, 841.7260799877041, 0, 1, 0.2938816786086573, 0, 0.00118803494839391, 0.00636103222434306, 0.7061183213913427, 1, 0.000803711938313825],
[349.7212824995, 841.9894869146648, 0, 1, 0.2934615440887726, 0, 0.00118766328504212, 0.006359042247061216, 0.7065384559112274, 1, 0.0008014373327399084],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869241260576],
[349.8873962854392, 841.6611702887468, 0, 1, 0.2936409023523047, 0, 0.001188126570763544, 0.006361522793115049, 0.7063590976476952, 1, 0.0008037060458698599],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008016439866060132],
[349.8873962854392, 842.0944862998747, 1, 1, 0.2935341563468744, 0.002858062366968477, 0.001187515197248179, -0.008944521702195394, 0.9138376990577288, 0.5009060117514774, 0.001603931563352121],
[349.7272686914556, 841.9835007227091, 0, 1, 0.2934665672807327, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504784, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011329245496106],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008009174154995202],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.00080117533671275],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008009056247007622],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011928154956945],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008022023392638748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011468433026635],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011329803627588],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008016745202251095],
[350.0818134952385, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2937640763851919, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7062359236148081, 1, 0.0008015894029349567],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869324847258],
[349.9115025340022, 841.7992668801626, 1, 1, 0.2936211633851525, 0.002857865468148839, 0.001187931659415853, -0.008941237616141594, 0.9137866124123496, 0.5010289391826546, 0.001607217654058839],
[349.8207122965671, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935516321989682, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.7064483678010318, 1, 0.000801132823190076],
[350.0818134952384, 841.6289559189263, 0, 1, 0.2937640763851919, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121296, 0.7062359236148081, 1, 0.0008012624078523604],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008009113806396847],
[349.5535100713784, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933207612474761, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066792387525238, 1, 0.0008011329802997106],
[349.8873962854392, 841.8503843021599, 1, 0, 0.2935942805412475, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2935942805412475, 0.0008009057115063489],
[349.8873962854392, 842.0944862998747, 1, 0, 0.2935341563468744, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2935341563468743, 0.0008012625096036728],
[350.0535100713784, 841.6572593427865, 0, 1, 0.2937403261392542, 0, 0.001188132091655523, 0.006361552353332814, 0.7062596738607458, 1, 0.0008012189847118613],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.000800748980793032],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 1, 1, 0.2936488413592728, 0.002858062366968477, 0.001188172047750136, -0.008941004762550503, 0.9137703579683567, 0.5010680406869022, 0.001605285789147483],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008009674675652957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008012221042101596],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011330025370175],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.000802432766994811],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011468432055687],
[350.3207122965671, 841.3900571175976, 0, 1, 0.2939645434846426, 0, 0.001188509409566548, 0.006363572606519889, 0.7060354565153574, 1, 0.0008011329245864824],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008016914950510186],
[349.8477234700014, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935676444729821, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.706432355527018, 1, 0.0008016914287837005],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008037175267295648],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008011754120938358],
[349.8477234700014, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935676444729821, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.706432355527018, 1, 0.0008011811347721524],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.000803711633185291],
[350.2272686914557, 841.4835007227091, 0, 1, 0.2938861321725107, 0, 0.001188377430028217, 0.006362865955509821, 0.7061138678274893, 1, 0.0008009173245267756],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 0, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.293525211790437, 0.0008011811350780175],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011869324669514],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008009114700011937],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008010460160999219],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 1, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0.001187897642094914, -0.008948062613518501, 0.9138429500433791, 0.5008933736242531, 0.001602814707642046],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 0, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.293525211790437, 0.0008011328349998528],
[349.8873962854392, 841.6289559189263, 0, 1, 0.2936488413592729, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121296, 0.7063511586407272, 1, 0.000801583512108515],
[349.6929790756399, 841.9835007227091, 0, 1, 0.2934462372999203, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504784, 0.7065537627000797, 1, 0.0008011869325581104],
[349.69297907564, 842.0177903385248, 0, 1, 0.293437793842835, 0, 0.001187623363157161, 0.006358828495439661, 0.706562206157165, 1, 0.0008016914210560067],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869238299424],
[349.7058792636689, 842.0391797663117, 0, 1, 0.2934401754921573, 0, 0.001187593195221066, 0.006358666968866812, 0.7065598245078426, 1, 0.0008009114700154242],
[349.5535100713784, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933207612474761, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066792387525238, 1, 0.0008011811964369949],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008015951955579133],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008014373410986605],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009056200590875],
[350.0114620538696, 841.8060967706186, 0, 1, 0.2936787257934783, 0, 0.001187922021278122, 0.006360427584703883, 0.7063212742065217, 1, 0.0008010460160452083],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 2, 0, 0.2936009351140134, 0.005716124733936955, 0, -0.0306055421013436, 1, 0.08620150909982316, 0.001602814707642046],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011327099829972],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011869241260576],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008009056246714298],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2936488413592728, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7063511586407272, 1, 0.0008010754555007947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2948400057069, 841.7475035827688, 0, 3, 0.2938610712025494, 0, 0.003564014133966494, 0.01908261098280264, 0.3521035982249043, 1, 0.002405941782035018],
[350.0397654777297, 841.6710039364351, 1, 0, 0.2937287926413608, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937287926413608, 0.0008016913973499482],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011812137971927],
[349.6929790756399, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2934856734686773, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7065143265313227, 1, 0.0008023890797519933],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 1, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0.001187717424988704, -0.00894902754036811, 0.9138614184972836, 0.5008489192252512, 0.001438980315933934],
[349.7879664883721, 841.6516897546436, 0, 1, 0.2935842907826014, 0, 0.001188139954060471, 0.006361594450588709, 0.7064157092173986, 1, 0.0007901229934115174],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000176060198946665],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008012189122749105],
[349.5535100713784, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933207612474761, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066792387525238, 1, 0.0008011330181551747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2762307050377, 841.4345387091271, 1, 0, 0.2939272176563703, 0.002854889690879667, 0, -0.01528578376013324, 1, 0.2939272176563703, 0.0008004590202433532],
[350.4706479148369, 841.2401214993279, 0, 1, 0.2940903589275487, 0, 0.001188721239564415, 0.006364706796590928, 0.7059096410724512, 1, 0.0008008481483129758],
[350.0818134952384, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2937640763851918, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7062359236148081, 1, 0.0008007727472675348],
[350.0818134952384, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2937640763851918, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7062359236148081, 1, 0.0008012428892775618],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2936488413592728, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7063511586407272, 1, 0.0008009290256829749],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008010306272914205],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011811352567358],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008009173244896893],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008016913941330047],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.3873962854392, 841.960339085185, 0, 1, 0.2932707100641325, 0, 0.001187704400763734, 0.006359262390778762, 0.7067292899358675, 1, 0.0008012197316674422],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008014163049896828],
[350.0397654777297, 841.6710039364351, 1, 0, 0.2937287926413608, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937287926413608, 0.0008016154321679058],
[350.1393231205281, 841.3159798517823, 1, 0, 0.2938753323326854, 0.002856005978099669, 0, -0.01529176063731826, 1, 0.2938753323326855, 0.0008003213729612777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0268652897008, 841.5561709035368, 0, 1, 0.2937494531710817, 0, 0.001188274811087595, 0.006362316508383705, 0.7062505468289183, 1, 0.000801033287224764],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008014145272002607],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009115588691975],
[347.7358466394703, 838.0002320555928, 0.75, 1.75, 0.2932658058462416, 0.002156809564639432, 0.002088304910975138, -0.0003667908171094881, 0.7465928592046674, 0.5801054274537486, 0.0008023113568104375],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002853537177502455],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0005159181657141827],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008010124719885189],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011330023039681],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008014145353806369],
[349.8207122965671, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935516321989682, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.7064483678010318, 1, 0.0008009114700350174],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.000801132924570319],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011812141110467],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009173364557738],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011329245864824],
[350.0475238794227, 841.6632455347421, 0, 1, 0.2937353029472942, 0, 0.001188123641260657, 0.006361507107833827, 0.7062646970527058, 1, 0.0008012623988965948],
[349.7058792636689, 842.1116795608194, 0, 1, 0.2934223251489853, 0, 0.001187490951938255, 0.006358119533105291, 0.7065776748510147, 1, 0.0008015892999909809],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011580181742031],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 2, 0.2936009351140134, 0, 0.002375795284189827, 0.01272059410508436, 0.4989996388717963, 1, 0.001604093812470626],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008007489813871158],
[349.7997684859635, 842.0177903385248, 0, 1, 0.2935011033324408, 0, 0.001187623363157161, 0.006358828495439661, 0.7064988966675592, 1, 0.0008016188425602967],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8744960974103, 841.8289948743731, 0, 1, 0.2935919033115381, 0, 0.001187889709298064, 0.006360254578390674, 0.7064080966884618, 1, 0.0008004228392436212],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008010121982738186],
[349.8744960974103, 841.8289948743731, 0, 1, 0.2935919033115381, 0, 0.001187889709298064, 0.006360254578390674, 0.7064080966884618, 1, 0.0008013048988091939],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008011329245864824],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2936488413592728, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7063511586407272, 1, 0.0008009173245267756],
[349.5689133072095, 841.8707429358062, 0, 1, 0.2934004349070522, 0, 0.001187830802282972, 0.006359939175698399, 0.7065995650929477, 1, 0.0008014255088030146],
[350.2022118111721, 842.3751896252484, 0, 1, 0.2936515578690029, 0, 0.001187119483474905, 0.006356130599304237, 0.7063484421309971, 1, 0.0008011571044256614],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008010665239337038],
[350.0151295063663, 841.6956399077985, 1, 0, 0.2937081198640429, 0.002857019356307029, 0, -0.01529718651425999, 1, 0.2937081198640429, 0.0008012020146442537],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1663342939624, 841.2889686783481, 1, 0, 0.2938980030727181, 0.002855785671161941, 0, -0.01529058105961978, 1, 0.2938980030727181, 0.000800714200567478],
[350.1663342939624, 841.2889686783481, 1, 0, 0.2938980030727181, 0.002855785671161941, 0, -0.01529058105961978, 1, 0.2938980030727181, 0.0008010920444941036],
[350.0268652897008, 841.5561709035368, 0, 1, 0.2937494531710817, 0, 0.001188274811087595, 0.006362316508383705, 0.7062505468289183, 1, 0.0008010306301471018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008010145233128649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8355207385248, 841.8752486756399, 1, 0, 0.2935574047975593, 0.002858486176272029, 0, -0.01530504023024477, 1, 0.2935574047975593, 0.0008005354074561148],
[349.8282422961435, 841.8825271180214, 1, 0, 0.2935512972397792, 0.002858545649248811, 0, -0.01530535866323557, 1, 0.2935512972397791, 0.0008005820385328946],
[349.8319097486402, 841.6077464943755, 0, 1, 0.2936211732718134, 0, 0.001188201990969534, 0.006361926611505509, 0.7063788267281866, 1, 0.0008010412737165696],
[349.8282422961435, 841.8825271180214, 1, 0, 0.2935512972397792, 0.002858545649248811, 0, -0.01530535866323557, 1, 0.2935512972397791, 0.0008006711606171235],
[349.9216859012549, 841.7890835129099, 0, 1, 0.2936297085519111, 0, 0.001187946030170471, 0.006360556134236963, 0.7063702914480889, 1, 0.0008010758463738413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.000801190419292414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 0, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.293525211790437, 0.0008012174024043467],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9559755170706, 841.7547938970941, 0, 0, 0.2936584819898087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002590045581790318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9216859012549, 841.7890835129099, 0, 1, 0.2936297085519111, 0, 0.001187946030170471, 0.006360556134236963, 0.7063702914480889, 1, 0.0004615335643347294],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 8.012936496977461e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008015458999477701],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008016515224008224],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008018438927469717],
[349.9330910558584, 841.2396938577016, 0, 1, 0.2937718989955366, 0, 0.001188721843847223, 0.006364710032070168, 0.7062281010044633, 1, 0.0008030119719206024],
[349.9459912438873, 841.2070609386199, 0, 1, 0.2937875956433086, 0, 0.001188767957896358, 0.006364956938066443, 0.7062124043566913, 1, 0.0008027453084667526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1275082656576, 841.0182654744681, 0, 1, 0.2939417794064604, 0, 0.001189034817734715, 0.006366385771480365, 0.7060582205935395, 1, 0.0008023457284111315],
[350.1275082656576, 840.8508594381032, 0, 1, 0.2939830963854643, 0, 0.001189271544145472, 0.006367653263088431, 0.7060169036145357, 1, 0.0008021138105820247],
[350.2515740340881, 841.3545268905998, 0, 1, 0.2939323437185262, 0, 0.001188559600072169, 0.006363841338869928, 0.7060676562814738, 1, 0.0008019117598185537],
[350.251574034088, 841.0280002897954, 0, 1, 0.2940129098015258, 0, 0.001189021054775141, 0.006366312081199226, 0.7059870901984742, 1, 0.0008018575946873741],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 0, 1, 0.2939351139482803, 0, 0.0011889966304616, 0.006366181307398588, 0.7060648860517197, 1, 0.0008015939931955766],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017900322591157],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.000801569002818797],
[348.0156459782944, 837.7233955979618, 1.5, 0.5, 0.2935010434637132, 0.004310151044454922, 0.0005968557194742103, -0.01988189930997978, 0.9569285687428558, 0.2935010434637132, 0.0008023996309461761],
[350.251574034088, 841.3545268905998, 0, 1, 0.2939323437185261, 0, 0.001188559600072169, 0.006363841338869928, 0.7060676562814738, 1, 0.0008016558144443357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008040892503508641],
[350.1275082656576, 841.3163898190516, 0, 1, 0.2938682289854359, 0, 0.001188613477760819, 0.006364129813307606, 0.7061317710145641, 1, 0.0008019850601163658],
[349.9459912438873, 841.2610832854884, 0, 1, 0.2937742721030637, 0, 0.00118869162007895, 0.006364548206558065, 0.7062257278969364, 1, 0.0008022383875366845],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017694371557366],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008024637635617112],
[350.1671810810954, 841.0056038324647, 0, 1, 0.2939684196247869, 0, 0.001189052719081772, 0.006366481619709112, 0.7060315803752131, 1, 0.000802463760233059],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017693446980105],
[349.9751390733671, 841.3044352505165, 1, 0, 0.293780861030877, 0.002857345817899267, 0, -0.01529893447016907, 1, 0.293780861030877, 0.0008018448150449452],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017693338626641],
[350.0608242767855, 841.1119606367745, 0, 1, 0.2938791321547767, 0, 0.001188902365914446, 0.006365676591756285, 0.7061208678452233, 1, 0.000802480602620971],
[349.9673806716741, 841.2054042418858, 0, 1, 0.2938006854287477, 0, 0.001188770299093862, 0.006364969473415501, 0.7061993145712524, 1, 0.0008017693446980105],
[349.9481278999328, 841.386859853606, 1, 1, 0.2937445231586949, 0.002857566365624189, 0.001188513925893722, -0.008936518549051743, 0.9137141551142711, 0.5012032014316606, 0.001004158292202863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.7687475342079, 841.7284430593096, 0, 0, 0.2935539842607421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006006493740327265],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8084203496458, 841.6887702438718, 0, 1, 0.2935872808692033, 0, 0.00118808761070943, 0.006361314191373143, 0.7064127191307967, 1, 0.0008020477674964654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8280719098236, 841.7759080940176, 0, 1, 0.2935774617912034, 0, 0.001187964623820418, 0.006360655689226183, 0.7064225382087965, 1, 0.0008017024755421673],
[350.3207122965671, 841.3900571175976, 1, 0, 0.2939645434846426, 0.002854527194365377, 0, -0.015283842864361, 1, 0.2939645434846426, 0.0008020648590662808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011161109444219],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9108678521081, 841.5444351202024, 0, 1, 0.2936835876085232, 0, 0.001188291382209859, 0.006362405234260713, 0.7063164123914768, 1, 0.0008000388461417873],
[349.7713988478465, 841.8116373453911, 0, 1, 0.2935350606914183, 0, 0.001187914202699131, 0.006360385722102972, 0.7064649393085817, 1, 0.0008006823493460121],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008010120866786772],
[350.0268652897008, 841.5561709035368, 0, 1, 0.2937494531710817, 0, 0.001188274811087595, 0.006362316508383705, 0.7062505468289183, 1, 0.0008010123597710833],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008010731100099943],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008015399854282632],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.7669415068934, 841.9438279072714, 1, 0, 0.293499857921764, 0.00285904664314964, 0, -0.01530804110818525, 1, 0.293499857921764, 0.0008013677459239521],
[348.4618457878921, 837.342827326814, 1.6875, 1.5625, 0.2938610832698114, 0.004842710960749422, 0.001866021835988281, -0.01593792797935356, 0.8998235207630938, 0.3771059689101481, 0.0008046512830815677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008017600090589086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6971308722182, 840.0264655368243, 0, 1.5, 0.2933374351494161, 0, 0.001785658025716387, 0.009560853625218971, 0.5940433356228294, 1, 0.0008021670806607487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935845071463303, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064154928536697, 1, 0.0008009707940115946],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000259405170964911],
[347.7141166417608, 838.0568005051184, 0.75, 1.75, 0.2932388639438103, 0.002156944351996793, 0.002088163951351782, -0.0003682672344762353, 0.7466215446791424, 0.5800654085819198, 0.0008049098922885343],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0005416826405702098],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008010950571033301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008036581332299832],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008010123810973111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.756183935252, 837.4268091236439, 1, 2.333333333333333, 0.2940154984315609, 0.002867332669822004, 0.002786313153474434, -0.0004337984795685577, 0.7482653049884725, 0.6866830498812632, 0.001604555591750368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0151295063663, 841.6956399077984, 1, 0, 0.2937081198640429, 0.002857019356307029, 0, -0.01529718651425999, 1, 0.293708119864043, 0.0008014264218005421],
[349.8873962854392, 841.7963619552913, 0, 1, 0.2936075899884497, 0, 0.001187935758806607, 0.006360501138820696, 0.7063924100115504, 1, 0.0008015093481382175],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008010148664487476],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008010172316096188],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002250759110874135],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008121939055641174],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0005757847564987409],
[350.0114620538696, 841.8060967706186, 0, 1, 0.2936787257934783, 0, 0.001187922021278122, 0.006360427584703883, 0.7063212742065217, 1, 0.0008010721586083915],
[349.8207122965671, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2935614052678469, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7064385947321532, 1, 0.0008024630593062146],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5280296943952, 841.1445295410773, 0, 1, 0.2941479410411862, 0, 0.001188856331914318, 0.006365430114362142, 0.7058520589588138, 1, 0.000804172352701222],
[350.9321978760433, 840.8471507697528, 1, 0, 0.2944607139524637, 0.002849553292779425, 0, -0.01525721136811443, 1, 0.2944607139524638, 0.0008020208918389118],
[350.7131446948807, 841.0662039509155, 0, 1, 0.294276910481283, 0, 0.001188967045997677, 0.006366022904879701, 0.705723089518717, 1, 0.0008014189782006479],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7798286837528, 840.9995199620433, 0, 1, 0.2943328637824942, 0, 0.001189061320802101, 0.006366527675441957, 0.7056671362175058, 1, 0.0008015050446942821],
[350.9742458935521, 840.8051027522441, 0, 1, 0.2944959956659424, 0, 0.001189336264404981, 0.006367999791325553, 0.7055040043340577, 1, 0.00080244321779116],
[350.7131446948807, 841.039192777481, 0, 1, 0.2942835802938076, 0, 0.001189005231370444, 0.006366227358786543, 0.7057164197061924, 1, 0.0008015046630911013],
[350.7798286837528, 841.1638437228689, 0, 1, 0.2942922864597305, 0, 0.001188829034274875, 0.00636528395606572, 0.7057077135402694, 1, 0.0008018140911274971],
[350.7798286837528, 840.9995199620433, 1, 0, 0.2943328637824942, 0.002850791061026359, 0, -0.0152638386846893, 1, 0.2943328637824942, 0.0008017972569399212],
[350.7798286837528, 841.0662039509153, 0, 1, 0.2943163958085482, 0, 0.001188967045997678, 0.006366022904879702, 0.7056836041914518, 1, 0.0008017972441252135],
[350.7798286837528, 840.9995199620433, 0, 0, 0.2943328637824942, 0, 0, 0, 1, 1, 2.088491974342768e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.333612484596, 841.4114465453845, 1, 0, 0.2939669099780029, 0.002854422083304865, 0, -0.01528328007381014, 1, 0.2939669099780029, 0.0007810421979031038],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.00080144289337845],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008016914395037622],
[349.6602994817019, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933840812234536, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066159187765464, 1, 0.000801416305137546],
[349.8280719098236, 841.8826975043412, 0, 1, 0.2935511542635434, 0, 0.001187813935319467, 0.006359848865814397, 0.7064488457364566, 1, 0.0008016153750324919]
],
"NAMES": [
["epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2"],
["epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1"],
["epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1"],
["epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1"],
["epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1"],
["epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3"],
["epi_isl_415600_USA_20200309_null_1"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1"],
["Node307"],
["epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2"],
["epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1"],
["epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_413607_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1"],
["epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1"],
["epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1"],
["epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1"],
["Node321"],
["epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12"],
["epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1"],
["epi_isl_420423_Soignies_20200325_null_4"],
["epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2"],
["epi_isl_421598_New_York_20200321_null_1"],
["epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1"],
["epi_isl_421615_New_York_20200320_null_1"],
["epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7"],
["epi_isl_417253_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4"],
["Node344"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1"],
["epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4"],
["epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2"],
["epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1"],
["epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_4"],
["epi_isl_420248_South_Yorkshire_20200325_null_1"],
["epi_isl_421008_Wales_20200323_null_2"],
["epi_isl_416650_USA_20200310_null_1"],
["epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10"],
["epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1"],
["epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1"],
["Node367"],
["epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1"],
["epi_isl_418881_Washington_20200324_null_2"],
["epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1"],
["epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2"],
["epi_isl_418898_Washington_20200324_null_1"],
["epi_isl_420598_Argentina_20200322_null_1"],
["epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1"],
["epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1"],
["epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_420772_England_20200330_null_1"],
["epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1"],
["epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1"],
["epi_isl_406034_California_20200123_null_1"],
["epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1"],
["Node399"],
["epi_isl_418060_USA_20200314_null_1"],
["epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1"],
["epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1"],
["Node283"],
["epi_isl_420670_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3"],
["epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2"],
["epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1"],
["epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1"],
["epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420516_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_417281_England_20200306_null_1"],
["epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1"],
["epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12"],
["epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_420766_England_20200327_null_7"],
["epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1"],
["epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1"],
["epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1"],
["epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4"],
["epi_isl_418922_Washington_20200316_null_2"],
["epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1"],
["epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1"],
["epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1"],
["epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2"],
["epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1"],
["epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2"],
["epi_isl_420743_England_20200327_null_1"],
["Node279"],
["epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1"],
["epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1"],
["epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3"],
["epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1"],
["epi_isl_421578_New_York_20200318_null_7"],
["epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1"],
["Node457"],
["epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2"],
["epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_2"],
["epi_isl_420676_England_20200328_null_5"],
["epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4"],
["epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1"],
["epi_isl_418669_England_20200311_null_1"],
["Node467"],
["epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2"],
["epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2"],
["epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1"],
["Node57"],
["epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2"],
["epi_isl_421613_New_York_20200320_null_13"],
["epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3"],
["epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1"],
["epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1"],
["Node54"],
["epi_isl_420440_Kain_20200325_null_2"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2"],
["epi_isl_421420_New_York_20200318_null_4"],
["Node489"],
["epi_isl_418908_Washington_20200316_null_5"],
["epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2"],
["epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["Node50"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_418754_England_20200317_null_2"],
["epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1"],
["epi_isl_420619_ARA_20200323_null_2"],
["epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_26"],
["epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4"],
["epi_isl_421590_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1"],
["epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1"],
["epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1"],
["epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1"],
["epi_isl_420929_Wales_20200320_null_3"],
["epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1"],
["epi_isl_419551_Duesseldorf_20200316_null_9"],
["epi_isl_419691_Riga_20200301_null_1"],
["Node505"],
["epi_isl_413557_California_20200228_null_1"],
["epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1"],
["epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1"],
["epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2"],
["Node23"],
["epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1"],
["epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1"],
["epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_26"],
["epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1"],
["epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2"],
["Node268"],
["epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1"],
["epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3"],
["epi_isl_420975_Wales_20200322_null_2"],
["epi_isl_421010_Wales_20200323_null_145"],
["epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1"],
["epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1"],
["epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1"],
["epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1"],
["Node248"],
["epi_isl_420648_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420758_England_20200327_null_7"],
["Node245"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6"],
["Node224"],
["epi_isl_420461_England_20200310_null_1"],
["epi_isl_421359_New_York_20200317_null_7"],
["Node154"],
["epi_isl_420641_England_20200325_null_1"],
["Node153"],
["epi_isl_420657_England_20200325_null_1"],
["Node152"],
["epi_isl_419548_Duesseldorf_20200315_null_2"],
["epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1"],
["epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1"],
["epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21"],
["epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1"],
["epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2"],
["Node211"],
["epi_isl_420768_England_20200327_null_25"],
["epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1"],
["epi_isl_417279_England_20200307_null_1"],
["epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4"],
["epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1"],
["epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5"],
["epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1"],
["epi_isl_417343_Washington_20200313_null_705"],
["epi_isl_420639_England_20200326_null_1"],
["epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1"],
["epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1"],
["epi_isl_417297_England_20200306_null_2"],
["epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2"],
["epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1"],
["epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3"],
["epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1"],
["epi_isl_420691_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1"],
["epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1"],
["Node163"],
["epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1"],
["Node162"],
["epi_isl_420706_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1"],
["epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1"],
["Node159"],
["epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_421573_KZN_20200331_null_25"],
["Node237"],
["epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1"],
["epi_isl_420124_Comunitat_Valenciana_20200309_null_52"],
["epi_isl_420524_England_20200326_null_8"],
["Node231"],
["epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1"],
["Node230"],
["epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1"],
["epi_isl_419581_Luxembourg_20200311_null_3"],
["epi_isl_414617_USA_20200308_null_1"],
["epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2"],
["epi_isl_417257_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1"],
["epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1"],
["epi_isl_421365_New_York_20200314_null_37"],
["Node140"],
["epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1"],
["epi_isl_414485_USA_20200224_null_1"],
["epi_isl_420745_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1"],
["epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5"],
["epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1"],
["Node130"],
["epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1"],
["Node129"],
["epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_421426_New_York_20200317_null_2"],
["Node125"],
["epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1"],
["epi_isl_420727_England_20200328_null_1"],
["epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1"],
["epi_isl_421636_New_South_Wales_20200326_null_3229"],
["epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2"],
["epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1"],
["epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_417259_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3"],
["epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1"],
["Node107"],
["epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1"],
["Node112"],
["epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1"],
["epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_417238_England_20200303_null_1"],
["epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1"],
["Node99"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10"],
["epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1"],
["epi_isl_421260_Jiangxi_20200126_null_64"],
["epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1"],
["epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2"],
["epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1"],
["epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_418832_British_Columbia_20200311_null_4"],
["Node81"],
["epi_isl_415137_England_20200302_null_1"],
["Node80"],
["epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4"],
["epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1"],
["epi_isl_418727_England_20200313_null_1"],
["epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8"]
],
"RESOLVED": [
[349.7350270931487, 841.9757423210161, 1, 0, 0.2934730775866661, 0.002859307540087082, 0, -0.01530943801475651, 1, 0.2934730775866661, 0.0008012082950489841],
[349.69297907564, 842.0177903385248, 0, 1, 0.293437793842835, 0, 0.001187623363157161, 0.006358828495439661, 0.706562206157165, 1, 0.0008021459700474988],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011870153163671],
[350.0397654777297, 841.5108763424516, 1, 0, 0.2937682656467024, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937682656467024, 0.0008014314932986351],
[350.3744960974103, 841.6650177444795, 0, 1, 0.2939285921556148, 0, 0.001188121139547693, 0.006361493713045398, 0.7060714078443852, 1, 0.0008009174154519558],
[350.3207122965671, 841.3900571175977, 0, 1, 0.2939645434846426, 0, 0.001188509409566548, 0.006363572606519889, 0.7060354565153575, 1, 0.0008011326490148769],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008014314104001821],
[349.8873962854392, 841.8503843021599, 1, 0, 0.2935942805412475, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2935942805412475, 0.0008009114696945663],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.5328514816564, 842.1779179325084, 0, 1, 0.2933034260095542, 0, 0.001187397554254254, 0.006357619458862178, 0.7066965739904458, 1, 0.0008024326743692288],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011468433027761],
[349.8531066696235, 841.8576627445414, 0, 1, 0.2935721616761157, 0, 0.001187849257961136, 0.006360037991952657, 0.7064278383238842, 1, 0.00080193794388782],
[349.7272686914557, 841.9835007227091, 1, 1, 0.2934665672807326, 0.002859370971390403, 0.001187671728889769, -0.008950690184099408, 0.9138773738884632, 0.5008105084499285, 0.001603779276164227],
[350.2058792636689, 841.776003321645, 0, 1, 0.2938013441144761, 0, 0.001187964489429496, 0.006360654969664033, 0.706198655885524, 1, 0.0008012080257207521],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869324847258],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009115435157766],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008023577232045875],
[349.5935492785729, 841.9228029257927, 2, 0, 0.2934022253507533, 0.00572092935961557, 0, -0.03063126725261872, 1, 0.08608486584077424, 0.001602447296546652],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008010146949486235],
[349.5935492785729, 841.9228029257927, 1, 0, 0.2934022253507533, 0.002860464679807785, 0, -0.01531563362630936, 1, 0.2934022253507533, 0.0008010123012609292],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008014264063498914],
[349.7058792636689, 842.0391797663117, 0, 1, 0.2934401754921573, 0, 0.001187593195221066, 0.006358666968866812, 0.7065598245078426, 1, 0.000800905612681591],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008012082986162554],
[350.2272686914557, 841.4835007227092, 0, 1, 0.2938861321725107, 0, 0.001188377430028216, 0.00636286595550982, 0.7061138678274893, 1, 0.0008014162496721733],
[350.0535100713784, 841.6572593427865, 0, 1, 0.2937403261392542, 0, 0.001188132091655523, 0.006361552353332814, 0.7062596738607458, 1, 0.0008016154321923552],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008011329245864824],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011812330765362],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008009173245111406],
[350.1921346700203, 841.3242175343453, 0, 1, 0.2939045981384537, 0, 0.001188602418851894, 0.006364070601180779, 0.7060954018615464, 1, 0.000801370932421152],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0397654777297, 841.6710039364351, 1, 0, 0.2937287926413608, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937287926413608, 0.000801246160742155],
[350.3207122965671, 841.7260799877041, 0, 1, 0.2938816786086573, 0, 0.00118803494839391, 0.00636103222434306, 0.7061183213913427, 1, 0.000803711938313825],
[349.7212824995, 841.9894869146648, 0, 1, 0.2934615440887726, 0, 0.00118766328504212, 0.006359042247061216, 0.7065384559112274, 1, 0.0008014373327399084],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869241260576],
[349.8873962854392, 841.6611702887468, 0, 1, 0.2936409023523047, 0, 0.001188126570763544, 0.006361522793115049, 0.7063590976476952, 1, 0.0008037060458698599],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008016439866060132],
[349.8873962854392, 842.0944862998747, 1, 1, 0.2935341563468744, 0.002858062366968477, 0.001187515197248179, -0.008944521702195394, 0.9138376990577288, 0.5009060117514774, 0.001603931563352121],
[349.7272686914556, 841.9835007227091, 0, 1, 0.2934665672807327, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504784, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011329245496106],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008009174154995202],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.00080117533671275],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008009056247007622],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011928154956945],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008022023392638748],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011468433026635],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011329803627588],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008016745202251095],
[350.0818134952385, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2937640763851919, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7062359236148081, 1, 0.0008015894029349567],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869324847258],
[349.9115025340022, 841.7992668801626, 1, 1, 0.2936211633851525, 0.002857865468148839, 0.001187931659415853, -0.008941237616141594, 0.9137866124123496, 0.5010289391826546, 0.001607217654058839],
[349.8207122965671, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935516321989682, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.7064483678010318, 1, 0.000801132823190076],
[350.0818134952384, 841.6289559189263, 0, 1, 0.2937640763851919, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121296, 0.7062359236148081, 1, 0.0008012624078523604],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008009113806396847],
[349.5535100713784, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933207612474761, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066792387525238, 1, 0.0008011329802997106],
[349.8873962854392, 841.8503843021599, 1, 0, 0.2935942805412475, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2935942805412475, 0.0008009057115063489],
[349.8873962854392, 842.0944862998747, 1, 0, 0.2935341563468744, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2935341563468743, 0.0008012625096036728],
[350.0535100713784, 841.6572593427865, 0, 1, 0.2937403261392542, 0, 0.001188132091655523, 0.006361552353332814, 0.7062596738607458, 1, 0.0008012189847118613],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.000800748980793032],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 1, 1, 0.2936488413592728, 0.002858062366968477, 0.001188172047750136, -0.008941004762550503, 0.9137703579683567, 0.5010680406869022, 0.001605285789147483],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008009674675652957],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008012221042101596],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011330025370175],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.000802432766994811],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011468432055687],
[350.3207122965671, 841.3900571175976, 0, 1, 0.2939645434846426, 0, 0.001188509409566548, 0.006363572606519889, 0.7060354565153574, 1, 0.0008011329245864824],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008016914950510186],
[349.8477234700014, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935676444729821, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.706432355527018, 1, 0.0008016914287837005],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008037175267295648],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008011754120938358],
[349.8477234700014, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935676444729821, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.706432355527018, 1, 0.0008011811347721524],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.000803711633185291],
[350.2272686914557, 841.4835007227091, 0, 1, 0.2938861321725107, 0, 0.001188377430028217, 0.006362865955509821, 0.7061138678274893, 1, 0.0008009173245267756],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 0, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.293525211790437, 0.0008011811350780175],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011869324669514],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008009114700011937],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008010460160999219],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 1, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0.001187897642094914, -0.008948062613518501, 0.9138429500433791, 0.5008933736242531, 0.001602814707642046],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 0, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.293525211790437, 0.0008011328349998528],
[349.8873962854392, 841.6289559189263, 0, 1, 0.2936488413592729, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121296, 0.7063511586407272, 1, 0.000801583512108515],
[349.6929790756399, 841.9835007227091, 0, 1, 0.2934462372999203, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504784, 0.7065537627000797, 1, 0.0008011869325581104],
[349.69297907564, 842.0177903385248, 0, 1, 0.293437793842835, 0, 0.001187623363157161, 0.006358828495439661, 0.706562206157165, 1, 0.0008016914210560067],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011869238299424],
[349.7058792636689, 842.0391797663117, 0, 1, 0.2934401754921573, 0, 0.001187593195221066, 0.006358666968866812, 0.7065598245078426, 1, 0.0008009114700154242],
[349.5535100713784, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933207612474761, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066792387525238, 1, 0.0008011811964369949],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008015951955579133],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008014373410986605],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009056200590875],
[350.0114620538696, 841.8060967706186, 0, 1, 0.2936787257934783, 0, 0.001187922021278122, 0.006360427584703883, 0.7063212742065217, 1, 0.0008010460160452083],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 2, 0, 0.2936009351140134, 0.005716124733936955, 0, -0.0306055421013436, 1, 0.08620150909982316, 0.001602814707642046],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011327099829972],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011869241260576],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008009056246714298],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2936488413592728, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7063511586407272, 1, 0.0008010754555007947],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2948400057069, 841.7475035827688, 0, 3, 0.2938610712025494, 0, 0.003564014133966494, 0.01908261098280264, 0.3521035982249043, 1, 0.002405941782035018],
[350.0397654777297, 841.6710039364351, 1, 0, 0.2937287926413608, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937287926413608, 0.0008016913973499482],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008011812137971927],
[349.6929790756399, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2934856734686773, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7065143265313227, 1, 0.0008023890797519933],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 1, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0.001187717424988704, -0.00894902754036811, 0.9138614184972836, 0.5008489192252512, 0.001438980315933934],
[349.7879664883721, 841.6516897546436, 0, 1, 0.2935842907826014, 0, 0.001188139954060471, 0.006361594450588709, 0.7064157092173986, 1, 0.0007901229934115174],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000176060198946665],
[349.8207122965671, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935449785928645, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064550214071355, 1, 0.0008012189122749105],
[349.5535100713784, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933207612474761, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066792387525238, 1, 0.0008011330181551747],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.2762307050377, 841.4345387091271, 1, 0, 0.2939272176563703, 0.002854889690879667, 0, -0.01528578376013324, 1, 0.2939272176563703, 0.0008004590202433532],
[350.4706479148369, 841.2401214993279, 0, 1, 0.2940903589275487, 0, 0.001188721239564415, 0.006364706796590928, 0.7059096410724512, 1, 0.0008008481483129758],
[350.0818134952384, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2937640763851918, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7062359236148081, 1, 0.0008007727472675348],
[350.0818134952384, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2937640763851918, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7062359236148081, 1, 0.0008012428892775618],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2936488413592728, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7063511586407272, 1, 0.0008009290256829749],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008010306272914205],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011811352567358],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008009173244896893],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008016913941330047],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.3873962854392, 841.960339085185, 0, 1, 0.2932707100641325, 0, 0.001187704400763734, 0.006359262390778762, 0.7067292899358675, 1, 0.0008012197316674422],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008014163049896828],
[350.0397654777297, 841.6710039364351, 1, 0, 0.2937287926413608, 0.002856818277875409, 0, -0.01529610989072725, 1, 0.2937287926413608, 0.0008016154321679058],
[350.1393231205281, 841.3159798517823, 1, 0, 0.2938753323326854, 0.002856005978099669, 0, -0.01529176063731826, 1, 0.2938753323326855, 0.0008003213729612777],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0268652897008, 841.5561709035368, 0, 1, 0.2937494531710817, 0, 0.001188274811087595, 0.006362316508383705, 0.7062505468289183, 1, 0.000801033287224764],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008014145272002607],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009115588691975],
[347.7358602373551, 838.000683814508, 0, 2, 0.2932657022183719, 0, 0.002386632897357756, 0.01277862135982914, 0.499473367660891, 1, 0.0008023113568104375],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002853537177502455],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0005159181657141827],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008010124719885189],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008011330023039681],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008014145353806369],
[349.8207122965671, 841.8630459441633, 0, 1, 0.2935516321989682, 0, 0.00118784166239116, 0.006359997323397031, 0.7064483678010318, 1, 0.0008009114700350174],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.000801132924570319],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011812141110467],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008009173364557738],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011329245864824],
[350.0475238794227, 841.6632455347421, 0, 1, 0.2937353029472942, 0, 0.001188123641260657, 0.006361507107833827, 0.7062646970527058, 1, 0.0008012623988965948],
[349.7058792636689, 842.1116795608194, 0, 1, 0.2934223251489853, 0, 0.001187490951938255, 0.006358119533105291, 0.7065776748510147, 1, 0.0008015892999909809],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008011580181742031],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 2, 0.2936009351140134, 0, 0.002375795284189827, 0.01272059410508436, 0.4989996388717963, 1, 0.001604093812470626],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008007489813871158],
[349.7997684859635, 842.0177903385248, 0, 1, 0.2935011033324408, 0, 0.001187623363157161, 0.006358828495439661, 0.7064988966675592, 1, 0.0008016188425602967],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8744960974103, 841.8289948743731, 0, 1, 0.2935919033115381, 0, 0.001187889709298064, 0.006360254578390674, 0.7064080966884618, 1, 0.0008004228392436212],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008010121982738186],
[349.8744960974103, 841.8289948743731, 0, 1, 0.2935919033115381, 0, 0.001187889709298064, 0.006360254578390674, 0.7064080966884618, 1, 0.0008013048988091939],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008011329245864824],
[349.8873962854392, 841.6289559189264, 0, 1, 0.2936488413592728, 0, 0.001188172047750136, 0.006361766288121295, 0.7063511586407272, 1, 0.0008009173245267756],
[349.5689133072095, 841.8707429358062, 0, 1, 0.2934004349070522, 0, 0.001187830802282972, 0.006359939175698399, 0.7065995650929477, 1, 0.0008014255088030146],
[350.2022118111721, 842.3751896252484, 0, 1, 0.2936515578690029, 0, 0.001187119483474905, 0.006356130599304237, 0.7063484421309971, 1, 0.0008011571044256614],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0114620538696, 842.1326233714231, 0, 1, 0.2935982876004493, 0, 0.001187461419077396, 0.006357961406881938, 0.7064017123995507, 1, 0.0008010665239337038],
[350.0151295063663, 841.6956399077985, 1, 0, 0.2937081198640429, 0.002857019356307029, 0, -0.01529718651425999, 1, 0.2937081198640429, 0.0008012020146442537],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1663342939624, 841.2889686783481, 1, 0, 0.2938980030727181, 0.002855785671161941, 0, -0.01529058105961978, 1, 0.2938980030727181, 0.000800714200567478],
[350.1663342939624, 841.2889686783481, 1, 0, 0.2938980030727181, 0.002855785671161941, 0, -0.01529058105961978, 1, 0.2938980030727181, 0.0008010920444941036],
[350.0268652897008, 841.5561709035368, 0, 1, 0.2937494531710817, 0, 0.001188274811087595, 0.006362316508383705, 0.7062505468289183, 1, 0.0008010306301471018],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008010145233128649],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8355207385248, 841.8752486756399, 1, 0, 0.2935574047975593, 0.002858486176272029, 0, -0.01530504023024477, 1, 0.2935574047975593, 0.0008005354074561148],
[349.8282422961435, 841.8825271180214, 1, 0, 0.2935512972397792, 0.002858545649248811, 0, -0.01530535866323557, 1, 0.2935512972397791, 0.0008005820385328946],
[349.8319097486402, 841.6077464943755, 0, 1, 0.2936211732718134, 0, 0.001188201990969534, 0.006361926611505509, 0.7063788267281866, 1, 0.0008010412737165696],
[349.8282422961435, 841.8825271180214, 1, 0, 0.2935512972397792, 0.002858545649248811, 0, -0.01530535866323557, 1, 0.2935512972397791, 0.0008006711606171235],
[349.9216859012549, 841.7890835129099, 0, 1, 0.2936297085519111, 0, 0.001187946030170471, 0.006360556134236963, 0.7063702914480889, 1, 0.0008010758463738413],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.000801190419292414],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.8233731287256, 1, 0, 0.293525211790437, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.293525211790437, 0.0008012174024043467],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9559755170706, 841.7547938970941, 0, 0, 0.2936584819898087, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002590045581790318],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9216859012549, 841.7890835129099, 0, 1, 0.2936297085519111, 0, 0.001187946030170471, 0.006360556134236963, 0.7063702914480889, 1, 0.0004615335643347294],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 8.012936496977461e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008015458999477701],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008016515224008224],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008018438927469717],
[349.9330910558584, 841.2396938577016, 0, 1, 0.2937718989955366, 0, 0.001188721843847223, 0.006364710032070168, 0.7062281010044633, 1, 0.0008030119719206024],
[349.9459912438873, 841.2070609386199, 0, 1, 0.2937875956433086, 0, 0.001188767957896358, 0.006364956938066443, 0.7062124043566913, 1, 0.0008027453084667526],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1275082656576, 841.0182654744681, 0, 1, 0.2939417794064604, 0, 0.001189034817734715, 0.006366385771480365, 0.7060582205935395, 1, 0.0008023457284111315],
[350.1275082656576, 840.8508594381032, 0, 1, 0.2939830963854643, 0, 0.001189271544145472, 0.006367653263088431, 0.7060169036145357, 1, 0.0008021138105820247],
[350.2515740340881, 841.3545268905998, 0, 1, 0.2939323437185262, 0, 0.001188559600072169, 0.006363841338869928, 0.7060676562814738, 1, 0.0008019117598185537],
[350.251574034088, 841.0280002897954, 0, 1, 0.2940129098015258, 0, 0.001189021054775141, 0.006366312081199226, 0.7059870901984742, 1, 0.0008018575946873741],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 0, 1, 0.2939351139482803, 0, 0.0011889966304616, 0.006366181307398588, 0.7060648860517197, 1, 0.0008015939931955766],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017900322591157],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.000801569002818797],
[348.0156459782944, 837.7228132135785, 1, 0, 0.2935011876189633, 0.002873434029636615, 0, -0.01538507472507627, 1, 0.2935011876189633, 0.0008023996309461761],
[350.251574034088, 841.3545268905998, 0, 1, 0.2939323437185261, 0, 0.001188559600072169, 0.006363841338869928, 0.7060676562814738, 1, 0.0008016558144443357],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008040892503508641],
[350.1275082656576, 841.3163898190516, 0, 1, 0.2938682289854359, 0, 0.001188613477760819, 0.006364129813307606, 0.7061317710145641, 1, 0.0008019850601163658],
[349.9459912438873, 841.2610832854884, 0, 1, 0.2937742721030637, 0, 0.00118869162007895, 0.006364548206558065, 0.7062257278969364, 1, 0.0008022383875366845],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017694371557366],
[350.1275082656576, 841.0452766479024, 1, 0, 0.2939351139482803, 0.002856102352407154, 0, -0.01529227664913789, 1, 0.2939351139482803, 0.0008024637635617112],
[350.1671810810954, 841.0056038324647, 0, 1, 0.2939684196247869, 0, 0.001189052719081772, 0.006366481619709112, 0.7060315803752131, 1, 0.000802463760233059],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017693446980105],
[349.9751390733671, 841.3044352505165, 1, 0, 0.293780861030877, 0.002857345817899267, 0, -0.01529893447016907, 1, 0.293780861030877, 0.0008018448150449452],
[349.9997750447305, 841.1730098688295, 1, 0, 0.2938278807890402, 0.002857144693513584, 0, -0.01529785760058694, 1, 0.2938278807890402, 0.0008017693338626641],
[350.0608242767855, 841.1119606367745, 0, 1, 0.2938791321547767, 0, 0.001188902365914446, 0.006365676591756285, 0.7061208678452233, 1, 0.000802480602620971],
[349.9673806716741, 841.2054042418858, 0, 1, 0.2938006854287477, 0, 0.001188770299093862, 0.006364969473415501, 0.7061993145712524, 1, 0.0008017693446980105],
[349.9481278999328, 841.386859853606, 1, 1, 0.2937445231586949, 0.002857566365624189, 0.001188513925893722, -0.008936518549051743, 0.9137141551142711, 0.5012032014316606, 0.001004158292202863],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.7687475342079, 841.7284430593096, 0, 0, 0.2935539842607421, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006006493740327265],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8084203496458, 841.6887702438718, 0, 1, 0.2935872808692033, 0, 0.00118808761070943, 0.006361314191373143, 0.7064127191307967, 1, 0.0008020477674964654],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8280719098236, 841.7759080940176, 0, 1, 0.2935774617912034, 0, 0.001187964623820418, 0.006360655689226183, 0.7064225382087965, 1, 0.0008017024755421673],
[350.3207122965671, 841.3900571175976, 1, 0, 0.2939645434846426, 0.002854527194365377, 0, -0.015283842864361, 1, 0.2939645434846426, 0.0008020648590662808],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008011161109444219],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.9108678521081, 841.5444351202024, 0, 1, 0.2936835876085232, 0, 0.001188291382209859, 0.006362405234260713, 0.7063164123914768, 1, 0.0008000388461417873],
[349.7713988478465, 841.8116373453911, 0, 1, 0.2935350606914183, 0, 0.001187914202699131, 0.006360385722102972, 0.7064649393085817, 1, 0.0008006823493460121],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008010120866786772],
[350.0268652897008, 841.5561709035368, 0, 1, 0.2937494531710817, 0, 0.001188274811087595, 0.006362316508383705, 0.7062505468289183, 1, 0.0008010123597710833],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008010731100099943],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008015399854282632],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.7669415068934, 841.9438279072714, 1, 0, 0.293499857921764, 0.00285904664314964, 0, -0.01530804110818525, 1, 0.293499857921764, 0.0008013677459239521],
[348.4612305046617, 837.3436724900822, 1, 0, 0.2938605074280135, 0.002869759710575958, 0, -0.01536540151430166, 1, 0.2938605074280134, 0.0008046512830815677],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008017600090589086],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.6972740760996, 840.026380339444, 0, 1, 0.2933375413039481, 0, 0.001190438804547915, 0.006373903063268283, 0.7066624586960519, 1, 0.0008021670806607487],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8900571175977, 0, 1, 0.2935845071463303, 0, 0.001187803551717581, 0.006359793269448071, 0.7064154928536697, 1, 0.0008009707940115946],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000259405170964911],
[347.7144986359684, 838.0564185109108, 1, 1, 0.2932391860922136, 0.002875922643211167, 0.001193237087518328, -0.009009513615461271, 0.9140107797399761, 0.5004891519244032, 0.0008049098922885343],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0005416826405702098],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008010950571033301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008036581332299832],
[349.7272686914557, 841.9835007227092, 0, 1, 0.2934665672807326, 0, 0.001187671728889769, 0.006359087457504783, 0.7065334327192674, 1, 0.0008010123810973111],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[348.756183935252, 837.4296204483149, 1, 1, 0.2940148015988882, 0.002867332669822004, 0.001194130199818647, -0.008958738835023584, 0.9135552964407664, 0.5015848996385428, 0.001604555591750368],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.0151295063663, 841.6956399077984, 1, 0, 0.2937081198640429, 0.002857019356307029, 0, -0.01529718651425999, 1, 0.293708119864043, 0.0008014264218005421],
[349.8873962854392, 841.7963619552913, 0, 1, 0.2936075899884497, 0, 0.001187935758806607, 0.006360501138820696, 0.7063924100115504, 1, 0.0008015093481382175],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.0008010148664487476],
[349.8873962854392, 841.7566891398535, 0, 1, 0.2936173649203032, 0, 0.001187991747379931, 0.006360800915455712, 0.7063826350796968, 1, 0.0008010172316096188],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 0, 0.2936009351140134, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002250759110874135],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0008121939055641174],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2936009351140134, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7063990648859866, 1, 0.0005757847564987409],
[350.0114620538696, 841.8060967706186, 0, 1, 0.2936787257934783, 0, 0.001187922021278122, 0.006360427584703883, 0.7063212742065217, 1, 0.0008010721586083915],
[349.8207122965671, 841.8233731287256, 0, 1, 0.2935614052678469, 0, 0.001187897642094914, 0.00636029705254218, 0.7064385947321532, 1, 0.0008024630593062146],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.5280296943952, 841.1445295410773, 0, 1, 0.2941479410411862, 0, 0.001188856331914318, 0.006365430114362142, 0.7058520589588138, 1, 0.000804172352701222],
[350.9321978760433, 840.8471507697528, 1, 0, 0.2944607139524637, 0.002849553292779425, 0, -0.01525721136811443, 1, 0.2944607139524638, 0.0008020208918389118],
[350.7131446948807, 841.0662039509155, 0, 1, 0.294276910481283, 0, 0.001188967045997677, 0.006366022904879701, 0.705723089518717, 1, 0.0008014189782006479],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.7798286837528, 840.9995199620433, 0, 1, 0.2943328637824942, 0, 0.001189061320802101, 0.006366527675441957, 0.7056671362175058, 1, 0.0008015050446942821],
[350.9742458935521, 840.8051027522441, 0, 1, 0.2944959956659424, 0, 0.001189336264404981, 0.006367999791325553, 0.7055040043340577, 1, 0.00080244321779116],
[350.7131446948807, 841.039192777481, 0, 1, 0.2942835802938076, 0, 0.001189005231370444, 0.006366227358786543, 0.7057164197061924, 1, 0.0008015046630911013],
[350.7798286837528, 841.1638437228689, 0, 1, 0.2942922864597305, 0, 0.001188829034274875, 0.00636528395606572, 0.7057077135402694, 1, 0.0008018140911274971],
[350.7798286837528, 840.9995199620433, 1, 0, 0.2943328637824942, 0.002850791061026359, 0, -0.0152638386846893, 1, 0.2943328637824942, 0.0008017972569399212],
[350.7798286837528, 841.0662039509153, 0, 1, 0.2943163958085482, 0, 0.001188967045997678, 0.006366022904879702, 0.7056836041914518, 1, 0.0008017972441252135],
[350.7798286837528, 840.9995199620433, 0, 0, 0.2943328637824942, 0, 0, 0, 1, 1, 2.088491974342768e-05],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[350.333612484596, 841.4114465453845, 1, 0, 0.2939669099780029, 0.002854422083304865, 0, -0.01528328007381014, 1, 0.2939669099780029, 0.0007810421979031038],
[349.759663064512, 841.9511063496527, 1, 0, 0.2934937503639839, 0.00285910613945083, 0, -0.01530835966606068, 1, 0.2934937503639838, 0.00080144289337845],
[349.8873962854392, 841.8233731287256, 1, 0, 0.2936009351140134, 0.002858062366968477, 0, -0.0153027710506718, 1, 0.2936009351140134, 0.0008016914395037622],
[349.6602994817019, 842.1572593427865, 0, 1, 0.2933840812234536, 0, 0.001187426681781966, 0.006357775414831864, 0.7066159187765464, 1, 0.000801416305137546],
[349.8280719098236, 841.8826975043412, 0, 1, 0.2935511542635434, 0, 0.001187813935319467, 0.006359848865814397, 0.7064488457364566, 1, 0.0008016153750324919]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.387163384983269, 0, 1, 0.2038353988029088, 0, 0.4189072295137473, 2.242932659135636, 0.7961646011970912, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 1, 0.2037218601338405, 0, 0.4186141960262288, 2.241363685546571, 0.7962781398661595, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6117135346208142, 2.388286465379186, 1, 0, 0.2039045115402714, 1.63475212399849, 0, -8.75286619608754, 1, 0.2039045115402714, 0.1867676355808125],
[0.3640987610429393, 1.772987882590372, 0, 2, 0.1703715486349802, 0, 1.128039294367854, 6.039800690627488, 0.688283367314321, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6120008898540407, 2.387999110145959, 0, 1, 0.2040002966180136, 0, 0.4187606250568821, 2.242147702703494, 0.7959997033819864, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 8.031370078307624, 0.2962962962962963, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991654731360872, 2.000834526863913, 0, 1, 0.333055157712029, 0, 0.4997914553020981, 2.676006759671395, 0.666944842287971, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6170005675684058, 2.382999432431594, 0, 1, 0.2056668558561353, 0, 0.4196392103121937, 2.246851864923995, 0.7943331441438647, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866918002893454, 0, 1, 0.3488066275319853, 0, 0.5356421644925723, 2.867960301723717, 0.6511933724680148, 1, 0.1867676355808125],
[0.9969539508449862, 2.003046049155014, 0, 3, 0.3323179836149954, 0, 1.497718937248373, 8.019156705554186, 0.2976521588376075, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3635660719976226, 1.771660085095298, 0, 1, 0.1702705218320352, 0, 0.5644423602545687, 3.022163655385251, 0.8297294781679648, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.999570558160007, 2.000371435338836, 1, 1.5, 0.333196628576876, 1.000429626339519, 0.7498607376114228, -1.341607650323748, 0.8166360831755825, 0.6369265704770721, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.996488415957792, 2.000790839366596, 0, 2, 0.3324643221640503, 0, 0.9996047366116259, 5.352130381171458, 0.445603881183901, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.053906600800831, 1.946093399199169, 1, 0, 0.3513022002669437, 0.9488506849090144, 0, -5.080380666373303, 1, 0.3513022002669437, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.278938008523216, 1.332227571878304, 0, 0, 0.4897958283926802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 2.273931912918699, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660836800308823, 2.133916319969116, 1, 0, 0.2886945600102943, 1.154622841945645, 0, -6.182135563021845, 1, 0.2886945600102943, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790706689637597, 0, 1, 0.2716201342927475, 0, 0.558438746996796, 2.990018828798446, 0.7283798657072525, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.35424671887175, 0.4444444444444445, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.458356042084921, 0.5, 0, 0.4067759034415147, 0.5, 0, -2.677123359435875, 1, 0.2297895764412914, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8652272426820795, 2.133625809402262, 1, 1, 0.2885193864636704, 1.155765734906987, 0.4686857440481335, -3.67879578665845, 0.9167565636346273, 0.4937953365619679, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660840823163698, 2, 1, 0, 0.3021837662265653, 1.154622305637425, 0, -6.182132691495316, 1, 0.3021837662265653, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.0007126155369634331, 2.999287384463037, 0, 1, 0.0002375385123211443, 0, 0.3334125316500907, 1.785172953618221, 0.9997624614876789, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.387165719802359, 0, 2, 0.2038352400750255, 0, 0.8378136395849325, 4.485860930773623, 0.6338783249463923, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.001864676661580022, 2.27351323406831, 0, 1, 0.0008195019617562677, 0, 0.4398478904873417, 2.35505412444451, 0.9991804980382437, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2, 0, 0, 0.2340585311742437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660836800382927, 2.133916319961705, 1, 0, 0.2886945600127644, 1.154622841935766, 0, -6.182135562968949, 1, 0.2886945600127644, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999713952515367, 0, 1, 0.3333651194179579, 0, 0.5000715221005166, 2.677506306407893, 0.6666348805820421, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991649999698109, 2.000835000030189, 0, 1, 0.333054999989937, 0, 0.4997913371092128, 2.676006126837527, 0.666945000010063, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2, 0, 0, 0.2340585311742437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8660841152882568, 2.133915884711741, 1, 0, 0.2886947050960857, 1.154622261680867, 0, -6.182132456141062, 1, 0.2886947050960857, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8638946828851255, 2.135819355535627, 1, 1, 0.2879923458770545, 1.157548506561387, 0.4682043906982091, -3.690918470533967, 0.9170604087162308, 0.4930451004703401, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9206543691244272, 2.079345630875571, 0, 0, 0.3068847897081425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3322275718783056, 2.667772428121695, 0, 0, 0.1107425239594352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.005248692405251565, 2.272954560980641, 0, 2, 0.002303873632631722, 0, 0.8799120027886179, 4.711265953826827, 0.9953975605684516, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9986249795582934, 2.001375020441706, 0, 2, 0.3328749931860978, 0, 0.9993129621247081, 5.350568148582227, 0.445055774716449, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.094739614161135, 0, 0, 0.1477084931734992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.00909893576842, 1.925417871501755, 1, 2, 0.3438722631502428, 0.9909831083495382, 1.038735554292988, 0.2556783770108152, 0.7265801063741791, 0.7175346425917135, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6106334657187015, 2.388203737315629, 0, 1, 0.2036234128017489, 0, 0.4187247446166434, 2.241955589974074, 0.7963765871982511, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660841960300092, 2.133629746161724, 1, 1, 0.2887222624291992, 1.154622154039803, 0.4686848792762391, -3.672677402754641, 0.9166394551777646, 0.4940839800361631, 0.1867676355808125],
[0.6795975801856212, 2.320402419814378, 0, 1, 0.2265325267285405, 0, 0.430959729855822, 2.30746471954639, 0.7734674732714595, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9998298146721557, 2.000170185327844, 0, 1, 0.3332766048907186, 0, 0.4999574572881116, 2.676895575260335, 0.6667233951092815, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -10.7084934377435, 1, 0.1111111111111109, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1.5, 0.3333333333333333, 0, 0.75, 4.015685039153812, 0.5443310539518175, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999714038453249, 0, 1, 0.3333651098674835, 0, 0.5000715006099002, 2.677506191341831, 0.6666348901325165, 1, 0.1867676355808125],
[0.920824738540698, 2.079175261459301, 0, 1, 0.3069415795135662, 0, 0.4809599356709039, 2.575178157474705, 0.6930584204864338, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.460101935677219, 1, 0, 0.4064872213210625, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.4064872213210624, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9734173425475003, 1.958151203303454, 0, 1, 0.3320465912097388, 0, 0.5106857929627564, 2.734337731345256, 0.6679534087902612, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999714098559108, 0, 1, 0.3333651031877815, 0, 0.5000714855791379, 2.677506110863421, 0.6666348968122185, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660844310956446, 2.133451418930683, 1, 2, 0.2887394831730525, 1.154621840661591, 0.9374481097874866, -1.162801735957809, 0.7980332364649683, 0.6401793340370796, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -10.7084934377435, 1, 0.1111111111111109, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7857670165134123, 2.001112639141863, 1, 0, 0.2819522597320966, 1.272641863280515, 0, -6.814038520768526, 1, 0.2819522597320967, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9999283851811062, 2.000071614818894, 0, 1.75, 0.3333094617270353, 0, 0.8749686696385929, 4.684798128528016, 0.4918894527127129, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991647469028903, 2, 0, 1, 0.3331476698419736, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6668523301580265, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991659982872775, 2.000686907747387, 0, 2, 0.3330716637063443, 0, 0.9996566640463698, 5.352408413468554, 0.4447934057514235, 1, 0.1867676355808125],
[0.9994273459017209, 2.00028614065846, 0, 2, 0.3331742682691273, 0, 0.9998569501369607, 5.353480794611936, 0.4446565564984139, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.001793455080482, 1.863482300196605, 0, 2, 0.3496324754207134, 0, 1.073259456120937, 5.746495921433604, 0.422977917027389, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6121794998809796, 2.38782050011902, 0, 2, 0.2040598332936599, 0, 0.8375838970727952, 4.484630832681828, 0.6335207489765166, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997139615110481, 2.000170175065593, 0, 3, 0.3332508576987528, 0, 1.499872379559714, 8.030686766983962, 0.296406277414092, 1, 0.1867676355808125],
[0.8644513298158453, 2.135088863049601, 2, 1, 0.2881946145852572, 2.313606250598355, 0.4683645806534136, -9.879879156828133, 0.9760636689322911, 0.2012957454924176, 0.1867676355808125],
[0.6124887014791192, 2.387511298520881, 0, 1, 0.2041629004930397, 0, 0.4188461854063364, 2.242605813923825, 0.7958370995069602, 1, 0.1867676355808125],
[1.002990473090642, 1.860902712948576, 0, 1, 0.3502192323303034, 0, 0.5373736053162677, 2.877230863072909, 0.6497807676696966, 1, 0.1867676355808125],
[0.7851920883904393, 2.001687322252791, 0, 2, 0.2817459863500917, 0, 0.9991570500377192, 5.349733356802035, 0.5158888281242026, 1, 0.1867676355808125],
[0.6117136880962747, 2.388286311903725, 1, 0, 0.2039045626987583, 1.634751713848546, 0, -8.752864000043548, 1, 0.2039045626987582, 0.1867676355808125],
[1.002390928210377, 1.862051353300282, 0, 2, 0.3499427915446538, 0, 1.074084233206146, 5.750911981435886, 0.4225743742647574, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993125929142007, 2.000687407085799, 1, 1, 0.3331041976380669, 1.000687879939344, 0.4998282072743186, -2.68172625898189, 0.8890415935158997, 0.5552499887920335, 0.1867676355808125],
[1.001858693141269, 1.997568760739862, 0, 3, 0.3340166443582112, 0, 1.501825648739548, 8.041145052081164, 0.2953861484386585, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997139307735836, 2.000286069226417, 0, 1, 0.3332379769245279, 0, 0.4999284929213832, 2.676740492894815, 0.6667620230754721, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660840862304056, 2.133915913769592, 1, 0, 0.2886946954101354, 1.154622300419417, 0, -6.182132663556818, 1, 0.2886946954101354, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 1, 0.2037218601338405, 0, 0.4186141960262288, 2.241363685546571, 0.7962781398661595, 1, 0.1867676355808125],
[0.500698228473181, 2.473159692844779, 1, 1, 0.1683665601116817, 1.997210980852438, 0.4043410552473218, -8.528618572760683, 0.9716527014361594, 0.3083858216595229, 0.1867676355808125],
[1.005945442711708, 1.417288785966034, 1, 1, 0.415125137639134, 0.9940896966582189, 0.7055725056897229, -1.544792223081164, 0.8276711201000899, 0.657921395378358, 0.1867676355808125],
[0.9993131385570623, 2.000686861442938, 0, 1, 0.3331043795190208, 0, 0.4998283435913498, 2.676204268673086, 0.6668956204809793, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388000005063216, 0, 1, 0.2037785387254029, 0, 0.418760468123838, 2.242146862445258, 0.7962214612745971, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997138287483895, 2.000170254051096, 1, 1, 0.3332508194168151, 1.000286253169038, 0.4999574401102228, -2.67888390567716, 0.8889438913580214, 0.5554455301916514, 0.1867676355808125],
[0.9991649779945554, 2.000835022005445, 0, 1, 0.3330549926648517, 0, 0.4997913316199833, 2.676006097446839, 0.6669450073351483, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7860450751366713, 2.000834451312769, 0, 1, 0.2820520469853658, 0, 0.4997914741741324, 2.676006860716923, 0.7179479530146342, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660844920475907, 2.133915507952407, 1, 0, 0.2886948306825304, 1.154621759403412, 0, -6.182129766823649, 1, 0.2886948306825304, 0.1867676355808125],
[0.3636904959591722, 1.769677481785017, 1, 0, 0.1704771515056378, 2.749590685240946, 0, -14.72198690469166, 1, 0.1704771515056378, 0.1867676355808125],
[1.001027284741239, 1.998972715258761, 1, 1, 0.333675761580413, 0.9989737694897053, 0.5002569531673438, -2.670252877440169, 0.8886604861337315, 0.5560120092945573, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.094739614161135, 0, 0, 0.1477084931734992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8668394671278469, 2.133160532872151, 1, 1, 0.2889464890426158, 1.153616139921919, 0.4687879719270683, -3.666738971477382, 0.9165099264699454, 0.4944029045551772, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.001457477882935465, 2.998542522117066, 0, 1, 0.0004858259609784881, 0, 0.3334953540341887, 1.785616405096528, 0.9995141740390215, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997140405435383, 2.000170128046189, 0, 1, 0.3332508804876666, 0, 0.4999574716060891, 2.676895651922318, 0.6667491195123334, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.999829706276501, 2.0001702937235, 0, 1, 0.3332765687588336, 0, 0.4999574301938105, 2.676895430190762, 0.6667234312411664, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993121282132625, 2.000687871786738, 0, 1, 0.3331040427377542, 0, 0.4998280911789296, 2.676202917194713, 0.6668959572622458, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[0.366361519577999, 2.092575177147801, 1, 1, 0.1489918467872021, 2.729544306814401, 0.4778800833158163, -12.0559657806682, 0.977801429590939, 0.275785123165343, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.945977653131383, 0, 0, 0.3513407822895392, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9985678071601694, 2.001432192839831, 0, 1, 0.3328559357200564, 0, 0.4996422080036099, 2.675207652813165, 0.6671440642799435, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8655359100801919, 2.134464089919806, 2, 0, 0.2885119700267308, 2.310707131509656, 0, -12.37209607715913, 1, 0.0832391568487052, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3646305582500462, 1.774313457061431, 0, 1, 0.1704722309886862, 0, 0.5635982729095524, 3.017644203487756, 0.8295277690113138, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.862850588675289, 1.134647511531324, 2, 0, 0.6214684801791485, 1.073623409283855, 0, -5.748444616461984, 0.9999999999999998, 0.3862230718561808, 0.1867676355808125],
[0.9203079891024681, 2.079692010897531, 1, 1, 0.3067693297008228, 1.086592762250441, 0.4808404296213222, -3.243347439428371, 0.9058925783549079, 0.5194312377565535, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660840575125949, 2, 1, 0, 0.3021837601874972, 1.154622338704644, 0, -6.182132868545368, 1, 0.3021837601874972, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 2.273931912918699, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9992871902612014, 1.458486467440584, 0, 1, 0.406582268928545, 0, 0.6856422889921245, 3.671097976155799, 0.593417731071455, 1, 0.1867676355808125],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.946093483708832, 1, 0, 0.339432541950808, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.339432541950808, 0.1867676355808125],
[0.9997714972305616, 1.999763145969618, 1.75, 1, 0.3333088682596155, 1.750399971241054, 0.500059220520905, -6.694632862014997, 0.9267293297314383, 0.3339114480662961, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.999713852785204, 2.000286147214796, 0, 2, 0.3332379509284012, 0, 0.9998569468597307, 5.353480777064838, 0.4445716300821571, 1, 0.1867676355808125],
[0.002171353950294152, 2.997828646049707, 0, 2, 0.0007237846500980504, 0, 0.6671495392625045, 3.572083231593064, 0.9985529545640236, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9985678072278438, 2.001432192772156, 0, 1, 0.3328559357426146, 0, 0.4996422080205044, 2.675207652903622, 0.6671440642573854, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9998893674006862, 1.94614169688799, 1, 2, 0.3394021806223251, 1.00011064484024, 1.027674399658634, 0.1475831437961692, 0.7326125604903067, 0.7117220617953444, 0.1867676355808125],
[1, 1.458937824674218, 0, 1, 0.4066796606101617, 0, 0.6854301691871627, 3.669962234386074, 0.5933203393898383, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.002088834723734627, 2.273252836028965, 0, 1, 0.000918031234862246, 0, 0.4398982744686031, 2.355323892710862, 0.9990819687651378, 1, 0.1867676355808125],
[0.9734212285618011, 1.958146583198564, 0, 1, 0.3320479999325943, 0, 0.5106869978888582, 2.734344182816883, 0.6679520000674057, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8655358329480651, 2, 1, 0, 0.3020502563590703, 1.155353668714029, 0, -6.186048589848529, 1, 0.3020502563590703, 0.1867676355808125],
[0.9985677210314133, 2.001432278968587, 0, 1, 0.3328559070104711, 0, 0.499642186502227, 2.675207537689456, 0.6671440929895289, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9196205648227691, 2.08037943517723, 2, 0, 0.3065401882742565, 2.174809999366906, 0, -11.64446930327973, 1, 0.09396688702721656, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9734199389480207, 1.95814811642785, 0, 1, 0.3320475324333597, 0, 0.5106865980211185, 2.73434204182635, 0.6679524675666404, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 1, 0.2037218601338405, 0, 0.4186141960262288, 2.241363685546571, 0.7962781398661595, 1, 0.1867676355808125],
[0.8655357589147917, 2.134464241085206, 2, 0, 0.2885119196382641, 2.310707535073535, 0, -12.3720982379397, 0.9999999999999998, 0.0832391277733564, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6120000010688851, 2.387999998931115, 0, 1, 0.204000000356295, 0, 0.4187604691991653, 2.242146868202826, 0.7959999996437049, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999713940091244, 0, 1, 0.3333651207986794, 0, 0.5000715252074363, 2.677506323043107, 0.6666348792013206, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.38800022634968, 0, 1, 0.203778523690078, 0, 0.4187604293189743, 2.242146654674444, 0.796221476309922, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997140426305817, 2.000285957369419, 0, 1, 0.3332380142101938, 0, 0.4999285208776362, 2.676740642579491, 0.6667619857898062, 1, 0.1867676355808125],
[0.6804317844823359, 2.319568215517664, 0, 1, 0.2268105948274453, 0, 0.4311147192439122, 2.308294570969033, 0.7731894051725546, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660841153495265, 2, 1, 0, 0.3021837742692717, 1.154622261599185, 0, -6.182132455703718, 1, 0.3021837742692717, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8663697271260348, 2.133630272873963, 1, 1, 0.2887899090420118, 1.154241623050762, 0.4686847635757517, -3.670640565444093, 0.9166003884355065, 0.4941802065195302, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.004367680226226, 2.008448114090217, 0, 1, 0.3333651138316938, 0, 0.497896855280714, 2.677506239103443, 0.6666348861683062, 1, 0.1859554416752484],
[1.004367680226226, 2.008735360452452, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1859554416752484],
[0.3652768244423997, 2.103231602664669, 1, 0, 0.1479747123531113, 2.737649730520173, 0, -14.7220737713134, 1, 0.1479747123531112, 0.1859554416752484],
[1.004367680226226, 2.008735360452452, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4978256567230229, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1859554416752484],
[0.6706890445516198, 2.126490529669185, 0, 0.6666666666666666, 0.2397733240771466, 0, 0.3135055893102798, 1.685917800984734, 0.8329688035371011, 1, 0.1859554416752484],
[0.3651541195494529, 2.433897291554052, 0, 1, 0.1304563817945358, 0, 0.4108636808422991, 2.209473824163905, 0.8695436182054642, 1, 0.1859554416752484],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 1, 0.288877340751937, 0, 0.4687423878263116, 2.509762392015138, 0.7111226592480631, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3633197641667222, 2.423070586232618, 0, 3.666666666666667, 0.1303908349074824, 0, 1.513231470638909, 8.10221463656185, 0.5991309159397535, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6119992294541731, 2.387167049483663, 0, 2, 0.2040564518719898, 0, 0.8378131729124672, 4.485858432094108, 0.6335261318066062, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.789303231756524, 0, 1, 0.2717752810895498, 0, 0.5588767640118325, 2.992364079964016, 0.7282247189104502, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6671187845694079, 1.466249193174781, 1, 0, 0.3127068520428508, 1.498983424137053, 0, -8.025927080328957, 1, 0.3127068520428508, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[1.278938008523216, 1.332227571878304, 0, 0, 0.4897958283926802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.00185869250192, 1.99814130749808, 3, 1, 0.3339528975006401, 2.994434267479542, 0.5004651053694115, -13.35332620319549, 0.9875622774798559, 0.1116626025344563, 0.1867676355808125],
[0.3642203830525749, 1.771006945298325, 1, 1, 0.1705768646816043, 2.74559043516148, 0.5646505241861435, -11.67729036239614, 0.9709035332353937, 0.3120572625986022, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 1.77033393420354, 0, 0, 0.1701694444314854, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 1.77033393420354, 0, 0, 0.1701694444314854, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993130922598427, 2.000686907740158, 1, 1, 0.3331043640866141, 1.000687379906736, 0.4998283320249909, -2.68172291373806, 0.8890414826264526, 0.5552502107996806, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1.75, 0, 0.3333333333333333, 1.75, 0, -9.369931758025562, 1, 0.1853591424428187, 0.1867676355808125],
[1.002948807514388, 2.010036212294959, 0, 2, 0.3328754709765704, 0, 0.9950069495098794, 5.350571980626131, 0.4450551372247327, 1, 0.185962725688524],
[0.9996180057924159, 2.000381994207584, 0, 0.75, 0.3332060019308053, 0, 0.3749283897634257, 2.007459100702691, 0.7378936304645953, 1, 0.1867676355808125],
[0.9990613121059401, 2.00093868789406, 1, 1, 0.3330204373686467, 1.00093956985691, 0.4997654381166851, -2.683409950453497, 0.8890973882947952, 0.5551382630320887, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.35424671887175, 0.4444444444444445, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6118110038896378, 2.38784831857041, 0.4375, 1.0625, 0.2039601628453881, 0.715090113153504, 0.4449612614573912, -1.446336517866505, 0.8296565925675441, 0.2897647825082973, 0.1867676355808125],
[0.9748233093268652, 1.956021139119338, 1.25, 0.5, 0.3326083408635593, 1.282283659038836, 0.2556209593036994, -5.497005391444869, 0.9483903505005227, 0.3997573150044939, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388000533928658, 0, 1, 0.2037785027916056, 0, 0.4187603753818404, 2.242146365881721, 0.7962214972083943, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[0.866084196264685, 2.133915803735313, 1, 0, 0.2886947320882285, 1.154622153726944, 0, -6.182131878129123, 1, 0.2886947320882285, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993130971556653, 2.000686902844335, 0, 1, 0.3331043657185551, 0, 0.4998283332481064, 2.676204213292809, 0.6668956342814449, 1, 0.1867676355808125],
[0.3642206041276977, 1.771007279904497, 1, 1, 0.1705769238269305, 2.745588768639225, 0.5646504175036062, -11.67728201062945, 0.9709035130577414, 0.3120573607116027, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125]
],
"RESOLVED": [
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.387163384983269, 0, 1, 0.2038353988029088, 0, 0.4189072295137473, 2.242932659135636, 0.7961646011970912, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 1, 0.2037218601338405, 0, 0.4186141960262288, 2.241363685546571, 0.7962781398661595, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6117135346208142, 2.388286465379186, 1, 0, 0.2039045115402714, 1.63475212399849, 0, -8.75286619608754, 1, 0.2039045115402714, 0.1867676355808125],
[0.3640987610429393, 1.772987882590372, 0, 2, 0.1703715486349802, 0, 1.128039294367854, 6.039800690627488, 0.688283367314321, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6120008898540407, 2.387999110145959, 0, 1, 0.2040002966180136, 0, 0.4187606250568821, 2.242147702703494, 0.7959997033819864, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 3, 0.3333333333333333, 0, 1.5, 8.031370078307624, 0.2962962962962963, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991654731360872, 2.000834526863913, 0, 1, 0.333055157712029, 0, 0.4997914553020981, 2.676006759671395, 0.666944842287971, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6170005675684058, 2.382999432431594, 0, 1, 0.2056668558561353, 0, 0.4196392103121937, 2.246851864923995, 0.7943331441438647, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866918002893454, 0, 1, 0.3488066275319853, 0, 0.5356421644925723, 2.867960301723717, 0.6511933724680148, 1, 0.1867676355808125],
[0.9969539508449862, 2.003046049155014, 0, 3, 0.3323179836149954, 0, 1.497718937248373, 8.019156705554186, 0.2976521588376075, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3635660719976226, 1.771660085095298, 0, 1, 0.1702705218320352, 0, 0.5644423602545687, 3.022163655385251, 0.8297294781679648, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997137620414343, 2.000286237958566, 1, 1, 0.333237920680478, 1.000286319914194, 0.499928450750414, -2.679039479231827, 0.8889524882205513, 0.5554283295815076, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.996488415957792, 2.000790839366596, 0, 2, 0.3324643221640503, 0, 0.9996047366116259, 5.352130381171458, 0.445603881183901, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.053906600800831, 1.946093399199169, 1, 0, 0.3513022002669437, 0.9488506849090144, 0, -5.080380666373303, 1, 0.3513022002669437, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.278938008523216, 1.332227571878304, 0, 0, 0.4897958283926802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 2.273931912918699, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660836800308823, 2.133916319969116, 1, 0, 0.2886945600102943, 1.154622841945645, 0, -6.182135563021845, 1, 0.2886945600102943, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790706689637597, 0, 1, 0.2716201342927475, 0, 0.558438746996796, 2.990018828798446, 0.7283798657072525, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.35424671887175, 0.4444444444444445, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8652272426820795, 2.133625809402262, 1, 1, 0.2885193864636704, 1.155765734906987, 0.4686857440481335, -3.67879578665845, 0.9167565636346273, 0.4937953365619679, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660840823163698, 2, 1, 0, 0.3021837662265653, 1.154622305637425, 0, -6.182132691495316, 1, 0.3021837662265653, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.079345630875572, 0, 0, 0.4940649516934884, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.0007126155369634331, 2.999287384463037, 0, 1, 0.0002375385123211443, 0, 0.3334125316500907, 1.785172953618221, 0.9997624614876789, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.387165719802359, 0, 2, 0.2038352400750255, 0, 0.8378136395849325, 4.485860930773623, 0.6338783249463923, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.001864676661580022, 2.27351323406831, 0, 1, 0.0008195019617562677, 0, 0.4398478904873417, 2.35505412444451, 0.9991804980382437, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2, 0, 0, 0.2340585311742437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660836800382927, 2.133916319961705, 1, 0, 0.2886945600127644, 1.154622841935766, 0, -6.182135562968949, 1, 0.2886945600127644, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999713952515367, 0, 1, 0.3333651194179579, 0, 0.5000715221005166, 2.677506306407893, 0.6666348805820421, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991649999698109, 2.000835000030189, 0, 1, 0.333054999989937, 0, 0.4997913371092128, 2.676006126837527, 0.666945000010063, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2, 0, 0, 0.2340585311742437, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8660841152882568, 2.133915884711741, 1, 0, 0.2886947050960857, 1.154622261680867, 0, -6.182132456141062, 1, 0.2886947050960857, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8638946828851255, 2.135819355535627, 1, 1, 0.2879923458770545, 1.157548506561387, 0.4682043906982091, -3.690918470533967, 0.9170604087162308, 0.4930451004703401, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9206543691244272, 2.079345630875571, 0, 0, 0.3068847897081425, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3322275718783056, 2.667772428121695, 0, 0, 0.1107425239594352, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.005248692405251565, 2.272954560980641, 0, 2, 0.002303873632631722, 0, 0.8799120027886179, 4.711265953826827, 0.9953975605684516, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9986249795582934, 2.001375020441706, 0, 2, 0.3328749931860978, 0, 0.9993129621247081, 5.350568148582227, 0.445055774716449, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.094739614161135, 0, 0, 0.1477084931734992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.00909893576842, 1.925417871501755, 1, 2, 0.3438722631502428, 0.9909831083495382, 1.038735554292988, 0.2556783770108152, 0.7265801063741791, 0.7175346425917135, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6106334657187015, 2.388203737315629, 0, 1, 0.2036234128017489, 0, 0.4187247446166434, 2.241955589974074, 0.7963765871982511, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660841960300092, 2.133629746161724, 1, 1, 0.2887222624291992, 1.154622154039803, 0.4686848792762391, -3.672677402754641, 0.9166394551777646, 0.4940839800361631, 0.1867676355808125],
[0.6795975801856212, 2.320402419814378, 0, 1, 0.2265325267285405, 0, 0.430959729855822, 2.30746471954639, 0.7734674732714595, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9998298146721557, 2.000170185327844, 0, 1, 0.3332766048907186, 0, 0.4999574572881116, 2.676895575260335, 0.6667233951092815, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -10.7084934377435, 1, 0.1111111111111109, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999714038453249, 0, 1, 0.3333651098674835, 0, 0.5000715006099002, 2.677506191341831, 0.6666348901325165, 1, 0.1867676355808125],
[0.920824738540698, 2.079175261459301, 0, 1, 0.3069415795135662, 0, 0.4809599356709039, 2.575178157474705, 0.6930584204864338, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.460101935677219, 1, 0, 0.4064872213210625, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.4064872213210624, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9734173425475003, 1.958151203303454, 0, 1, 0.3320465912097388, 0, 0.5106857929627564, 2.734337731345256, 0.6679534087902612, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999714098559108, 0, 1, 0.3333651031877815, 0, 0.5000714855791379, 2.677506110863421, 0.6666348968122185, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660844310956446, 2.133451418930683, 1, 2, 0.2887394831730525, 1.154621840661591, 0.9374481097874866, -1.162801735957809, 0.7980332364649683, 0.6401793340370796, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -10.7084934377435, 1, 0.1111111111111109, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7857670165134123, 2.001112639141863, 1, 0, 0.2819522597320966, 1.272641863280515, 0, -6.814038520768526, 1, 0.2819522597320967, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.35424671887175, 0.4444444444444445, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991647469028903, 2, 0, 1, 0.3331476698419736, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6668523301580265, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9991659982872775, 2.000686907747387, 0, 2, 0.3330716637063443, 0, 0.9996566640463698, 5.352408413468554, 0.4447934057514235, 1, 0.1867676355808125],
[0.9994273459017209, 2.00028614065846, 0, 2, 0.3331742682691273, 0, 0.9998569501369607, 5.353480794611936, 0.4446565564984139, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.001793455080482, 1.863482300196605, 0, 2, 0.3496324754207134, 0, 1.073259456120937, 5.746495921433604, 0.422977917027389, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6121794998809796, 2.38782050011902, 0, 2, 0.2040598332936599, 0, 0.8375838970727952, 4.484630832681828, 0.6335207489765166, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997139615110481, 2.000170175065593, 0, 3, 0.3332508576987528, 0, 1.499872379559714, 8.030686766983962, 0.296406277414092, 1, 0.1867676355808125],
[0.8644513298158453, 2.135088863049601, 2, 1, 0.2881946145852572, 2.313606250598355, 0.4683645806534136, -9.879879156828133, 0.9760636689322911, 0.2012957454924176, 0.1867676355808125],
[0.6124887014791192, 2.387511298520881, 0, 1, 0.2041629004930397, 0, 0.4188461854063364, 2.242605813923825, 0.7958370995069602, 1, 0.1867676355808125],
[1.002990473090642, 1.860902712948576, 0, 1, 0.3502192323303034, 0, 0.5373736053162677, 2.877230863072909, 0.6497807676696966, 1, 0.1867676355808125],
[0.7851920883904393, 2.001687322252791, 0, 2, 0.2817459863500917, 0, 0.9991570500377192, 5.349733356802035, 0.5158888281242026, 1, 0.1867676355808125],
[0.6117136880962747, 2.388286311903725, 1, 0, 0.2039045626987583, 1.634751713848546, 0, -8.752864000043548, 1, 0.2039045626987582, 0.1867676355808125],
[1.002390928210377, 1.862051353300282, 0, 2, 0.3499427915446538, 0, 1.074084233206146, 5.750911981435886, 0.4225743742647574, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993125929142007, 2.000687407085799, 1, 1, 0.3331041976380669, 1.000687879939344, 0.4998282072743186, -2.68172625898189, 0.8890415935158997, 0.5552499887920335, 0.1867676355808125],
[1.001858693141269, 1.997568760739862, 0, 3, 0.3340166443582112, 0, 1.501825648739548, 8.041145052081164, 0.2953861484386585, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997139307735836, 2.000286069226417, 0, 1, 0.3332379769245279, 0, 0.4999284929213832, 2.676740492894815, 0.6667620230754721, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660840862304056, 2.133915913769592, 1, 0, 0.2886946954101354, 1.154622300419417, 0, -6.182132663556818, 1, 0.2886946954101354, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 1, 0.2037218601338405, 0, 0.4186141960262288, 2.241363685546571, 0.7962781398661595, 1, 0.1867676355808125],
[0.500698228473181, 2.473159692844779, 1, 1, 0.1683665601116817, 1.997210980852438, 0.4043410552473218, -8.528618572760683, 0.9716527014361594, 0.3083858216595229, 0.1867676355808125],
[1.005945442711708, 1.417288785966034, 1, 1, 0.415125137639134, 0.9940896966582189, 0.7055725056897229, -1.544792223081164, 0.8276711201000899, 0.657921395378358, 0.1867676355808125],
[0.9993131385570623, 2.000686861442938, 0, 1, 0.3331043795190208, 0, 0.4998283435913498, 2.676204268673086, 0.6668956204809793, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388000005063216, 0, 1, 0.2037785387254029, 0, 0.418760468123838, 2.242146862445258, 0.7962214612745971, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997138287483895, 2.000170254051096, 1, 1, 0.3332508194168151, 1.000286253169038, 0.4999574401102228, -2.67888390567716, 0.8889438913580214, 0.5554455301916514, 0.1867676355808125],
[0.9991649779945554, 2.000835022005445, 0, 1, 0.3330549926648517, 0, 0.4997913316199833, 2.676006097446839, 0.6669450073351483, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7860450751366713, 2.000834451312769, 0, 1, 0.2820520469853658, 0, 0.4997914741741324, 2.676006860716923, 0.7179479530146342, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660844920475907, 2.133915507952407, 1, 0, 0.2886948306825304, 1.154621759403412, 0, -6.182129766823649, 1, 0.2886948306825304, 0.1867676355808125],
[0.3636904959591722, 1.769677481785017, 1, 0, 0.1704771515056378, 2.749590685240946, 0, -14.72198690469166, 1, 0.1704771515056378, 0.1867676355808125],
[1.001027284741239, 1.998972715258761, 1, 1, 0.333675761580413, 0.9989737694897053, 0.5002569531673438, -2.670252877440169, 0.8886604861337315, 0.5560120092945573, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.094739614161135, 0, 0, 0.1477084931734992, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8668394671278469, 2.133160532872151, 1, 1, 0.2889464890426158, 1.153616139921919, 0.4687879719270683, -3.666738971477382, 0.9165099264699454, 0.4944029045551772, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.001457477882935465, 2.998542522117066, 0, 1, 0.0004858259609784881, 0, 0.3334953540341887, 1.785616405096528, 0.9995141740390215, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997140405435383, 2.000170128046189, 0, 1, 0.3332508804876666, 0, 0.4999574716060891, 2.676895651922318, 0.6667491195123334, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.999829706276501, 2.0001702937235, 0, 1, 0.3332765687588336, 0, 0.4999574301938105, 2.676895430190762, 0.6667234312411664, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993121282132625, 2.000687871786738, 0, 1, 0.3331040427377542, 0, 0.4998280911789296, 2.676202917194713, 0.6668959572622458, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[0.366361519577999, 2.092575177147801, 1, 1, 0.1489918467872021, 2.729544306814401, 0.4778800833158163, -12.0559657806682, 0.977801429590939, 0.275785123165343, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.054022346868618, 1.945977653131383, 0, 0, 0.3513407822895392, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2, 0, 0, 0.302317149716984, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9985678071601694, 2.001432192839831, 0, 1, 0.3328559357200564, 0, 0.4996422080036099, 2.675207652813165, 0.6671440642799435, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8655359100801919, 2.134464089919806, 2, 0, 0.2885119700267308, 2.310707131509656, 0, -12.37209607715913, 1, 0.0832391568487052, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3646305582500462, 1.774313457061431, 0, 1, 0.1704722309886862, 0, 0.5635982729095524, 3.017644203487756, 0.8295277690113138, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.862850588675289, 1.134647511531324, 2, 0, 0.6214684801791485, 1.073623409283855, 0, -5.748444616461984, 0.9999999999999998, 0.3862230718561808, 0.1867676355808125],
[0.9203079891024681, 2.079692010897531, 1, 1, 0.3067693297008228, 1.086592762250441, 0.4808404296213222, -3.243347439428371, 0.9058925783549079, 0.5194312377565535, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.457773657701786, 0, 0, 0.4068722914603453, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660840575125949, 2, 1, 0, 0.3021837601874972, 1.154622338704644, 0, -6.182132868545368, 1, 0.3021837601874972, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 2.273931912918699, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9992871902612014, 1.458486467440584, 0, 1, 0.406582268928545, 0, 0.6856422889921245, 3.671097976155799, 0.593417731071455, 1, 0.1867676355808125],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.946093483708832, 1, 0, 0.339432541950808, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.339432541950808, 0.1867676355808125],
[0.999713480296472, 2.000286519703528, 1, 1, 0.3332378267654907, 1.000286601820597, 0.4999283803343406, -2.679041365653291, 0.8889525508126127, 0.5554282043435943, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.999713852785204, 2.000286147214796, 0, 2, 0.3332379509284012, 0, 0.9998569468597307, 5.353480777064838, 0.4445716300821571, 1, 0.1867676355808125],
[0.002171353950294152, 2.997828646049707, 0, 2, 0.0007237846500980504, 0, 0.6671495392625045, 3.572083231593064, 0.9985529545640236, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.790001229580091, 0, 0, 0.2716980980039124, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9985678072278438, 2.001432192772156, 0, 1, 0.3328559357426146, 0, 0.4996422080205044, 2.675207652903622, 0.6671440642573854, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9998893674006862, 1.94614169688799, 1, 2, 0.3394021806223251, 1.00011064484024, 1.027674399658634, 0.1475831437961692, 0.7326125604903067, 0.7117220617953444, 0.1867676355808125],
[1, 1.458937824674218, 0, 1, 0.4066796606101617, 0, 0.6854301691871627, 3.669962234386074, 0.5933203393898383, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.002088834723734627, 2.273252836028965, 0, 1, 0.000918031234862246, 0, 0.4398982744686031, 2.355323892710862, 0.9990819687651378, 1, 0.1867676355808125],
[0.9734212285618011, 1.958146583198564, 0, 1, 0.3320479999325943, 0, 0.5106869978888582, 2.734344182816883, 0.6679520000674057, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.8655358329480651, 2, 1, 0, 0.3020502563590703, 1.155353668714029, 0, -6.186048589848529, 1, 0.3020502563590703, 0.1867676355808125],
[0.9985677210314133, 2.001432278968587, 0, 1, 0.3328559070104711, 0, 0.499642186502227, 2.675207537689456, 0.6671440929895289, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.9196205648227691, 2.08037943517723, 2, 0, 0.3065401882742565, 2.174809999366906, 0, -11.64446930327973, 1, 0.09396688702721656, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9734199389480207, 1.95814811642785, 0, 1, 0.3320475324333597, 0, 0.5106865980211185, 2.73434204182635, 0.6679524675666404, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 1, 0.2037218601338405, 0, 0.4186141960262288, 2.241363685546571, 0.7962781398661595, 1, 0.1867676355808125],
[0.8655357589147917, 2.134464241085206, 2, 0, 0.2885119196382641, 2.310707535073535, 0, -12.3720982379397, 0.9999999999999998, 0.0832391277733564, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6120000010688851, 2.387999998931115, 0, 1, 0.204000000356295, 0, 0.4187604691991653, 2.242146868202826, 0.7959999996437049, 1, 0.1867676355808125],
[1, 1.999713940091244, 0, 1, 0.3333651207986794, 0, 0.5000715252074363, 2.677506323043107, 0.6666348792013206, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.38800022634968, 0, 1, 0.203778523690078, 0, 0.4187604293189743, 2.242146654674444, 0.796221476309922, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9997140426305817, 2.000285957369419, 0, 1, 0.3332380142101938, 0, 0.4999285208776362, 2.676740642579491, 0.6667619857898062, 1, 0.1867676355808125],
[0.6804317844823359, 2.319568215517664, 0, 1, 0.2268105948274453, 0, 0.4311147192439122, 2.308294570969033, 0.7731894051725546, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.866632022255809, 1.13336797774419, 0, 0, 0.62221067408527, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6797448120329295, 2.32025518796707, 0, 0, 0.2265816040109765, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8660841153495265, 2, 1, 0, 0.3021837742692717, 1.154622261599185, 0, -6.182132455703718, 1, 0.3021837742692717, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8663697271260348, 2.133630272873963, 1, 1, 0.2887899090420118, 1.154241623050762, 0.4686847635757517, -3.670640565444093, 0.9166003884355065, 0.4941802065195302, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.004367680226226, 2.008448114090217, 0, 1, 0.3333651138316938, 0, 0.497896855280714, 2.677506239103443, 0.6666348861683062, 1, 0.1859554416752484],
[1.004367680226226, 2.008735360452452, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1859554416752484],
[0.3652768244423997, 2.103231602664669, 1, 0, 0.1479747123531113, 2.737649730520173, 0, -14.7220737713134, 1, 0.1479747123531112, 0.1859554416752484],
[1.004367680226226, 2.008735360452452, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4978256567230229, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1859554416752484],
[0.6706890445516198, 2.127902331488249, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1859554416752484],
[0.3651541195494529, 2.433897291554052, 0, 1, 0.1304563817945358, 0, 0.4108636808422991, 2.209473824163905, 0.8695436182054642, 1, 0.1859554416752484],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 1, 0.288877340751937, 0, 0.4687423878263116, 2.509762392015138, 0.7111226592480631, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3633197641667222, 2.424476248568094, 0, 3, 0.1303250892486595, 0, 1.237380651500221, 6.625241293290445, 0.6577650956413934, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6119992294541731, 2.387167049483663, 0, 2, 0.2040564518719898, 0, 0.8378131729124672, 4.485858432094108, 0.6335261318066062, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.789303231756524, 0, 1, 0.2717752810895498, 0, 0.5588767640118325, 2.992364079964016, 0.7282247189104502, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125],
[0.6671187845694079, 1.466249193174781, 1, 0, 0.3127068520428508, 1.498983424137053, 0, -8.025927080328957, 1, 0.3127068520428508, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[1.278938008523216, 1.332227571878304, 0, 0, 0.4897958283926802, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1.00185869250192, 1.99814130749808, 3, 1, 0.3339528975006401, 2.994434267479542, 0.5004651053694115, -13.35332620319549, 0.9875622774798559, 0.1116626025344563, 0.1867676355808125],
[0.3642203830525749, 1.771006945298325, 1, 1, 0.1705768646816043, 2.74559043516148, 0.5646505241861435, -11.67729036239614, 0.9709035332353937, 0.3120572625986022, 0.1867676355808125],
[0.7864211793528721, 2, 0, 0, 0.2822334201233402, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 1.77033393420354, 0, 0, 0.1701694444314854, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 2.423387135812222, 0, 0, 0.1302868519054835, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.3630340435406502, 1.77033393420354, 0, 0, 0.1701694444314854, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993130922598427, 2.000686907740158, 1, 1, 0.3331043640866141, 1.000687379906736, 0.4998283320249909, -2.68172291373806, 0.8890414826264526, 0.5552502107996806, 0.1867676355808125],
[1, 2, 2, 0, 0.3333333333333333, 2, 0, -10.7084934377435, 1, 0.1111111111111109, 0.1867676355808125],
[1.002948807514388, 2.010036212294959, 0, 2, 0.3328754709765704, 0, 0.9950069495098794, 5.350571980626131, 0.4450551372247327, 1, 0.185962725688524],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9990613121059401, 2.00093868789406, 1, 1, 0.3330204373686467, 1.00093956985691, 0.4997654381166851, -2.683409950453497, 0.8890973882947952, 0.5551382630320887, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 2, 0.3333333333333333, 0, 1, 5.35424671887175, 0.4444444444444445, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9748534495845557, 1.955880201359406, 1, 0, 0.332631199450883, 1.025795210989058, 0, -5.492360642672517, 1, 0.332631199450883, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388000533928658, 0, 1, 0.2037785027916056, 0, 0.4187603753818404, 2.242146365881721, 0.7962214972083943, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5, 2.677123359435875, 0.6666666666666667, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 2.118648751231178, 0, 0, 0.2396523659344204, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9741996239421721, 1.95722114442642, 0, 0, 0.3323301910303167, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6677724281216938, 1.465595549622495, 0, 0, 0.3130132424823365, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0, 3.000000000000001, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.8666320222558103, 2.133367977744188, 0, 0, 0.288877340751937, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.6111655804015216, 2.388834419598478, 0, 0, 0.2037218601338405, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5, -2.677123359435875, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1867676355808125],
[0.866084196264685, 2.133915803735313, 1, 0, 0.2886947320882285, 1.154622153726944, 0, -6.182131878129123, 1, 0.2886947320882285, 0.1867676355808125],
[1, 1.866632022255809, 0, 0, 0.3488414251415081, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1867676355808125],
[0.9993130971556653, 2.000686902844335, 0, 1, 0.3331043657185551, 0, 0.4998283332481064, 2.676204213292809, 0.6668956342814449, 1, 0.1867676355808125],
[0.3642206041276977, 1.771007279904497, 1, 1, 0.1705769238269305, 2.745588768639225, 0.5646504175036062, -11.67728201062945, 0.9709035130577414, 0.3120573607116027, 0.1867676355808125],
[1, 2, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -5.35424671887175, 1, 0.3333333333333333, 0.1867676355808125]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node107":{
"Global MG94xREV":0.0008010148664487476,
"Nucleotide GTR":0.000795812004308396,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node112":{
"Global MG94xREV":0.0005757847564987409,
"Nucleotide GTR":0.0005720448400052297,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "S", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "TCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node125":{
"Global MG94xREV":0.0008036581332299832,
"Nucleotide GTR":0.0007984381021789919,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node129":{
"Global MG94xREV":0.0005416826405702098,
"Nucleotide GTR":0.0005381642288393475,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node130":{
"Global MG94xREV":0.000259405170964911,
"Nucleotide GTR":0.0002577202467524448,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node140":{
"Global MG94xREV":0.0008017600090589086,
"Nucleotide GTR":0.0007965523069655948,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node152":{
"Global MG94xREV":8.012936496977461e-05,
"Nucleotide GTR":7.960889767660188e-05,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node153":{
"Global MG94xREV":0.0004615335643347294,
"Nucleotide GTR":0.0004585357479283688,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node154":{
"Global MG94xREV":0.0002590045581790318,
"Nucleotide GTR":0.0002573222360819366,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node159":{
"Global MG94xREV":0.0008017024755421673,
"Nucleotide GTR":0.0007964951471484783,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node162":{
"Global MG94xREV":0.0006006493740327265,
"Nucleotide GTR":0.0005967479534490666,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node163":{
"Global MG94xREV":0.001004158292202863,
"Nucleotide GTR":0.0009976359448904033,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node211":{
"Global MG94xREV":0.0008023457284111315,
"Nucleotide GTR":0.0007971342218727679,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node224":{
"Global MG94xREV":0.0008012174024043467,
"Nucleotide GTR":0.0007960132247245463,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node23":{
"Global MG94xREV":0.0008010665239337038,
"Nucleotide GTR":0.000795863326260537,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node230":{
"Global MG94xREV":0.0008010120866786772,
"Nucleotide GTR":0.0007958092425938704,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node231":{
"Global MG94xREV":0.0008006823493460121,
"Nucleotide GTR":0.0007954816470165646,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node237":{
"Global MG94xREV":0.0008011161109444219,
"Nucleotide GTR":0.0007959125911868703,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node245":{
"Global MG94xREV":0.000801190419292414,
"Nucleotide GTR":0.000795986416877041,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node248":{
"Global MG94xREV":0.0008010758463738413,
"Nucleotide GTR":0.0007958725881482769,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node268":{
"Global MG94xREV":0.0008010306301471018,
"Nucleotide GTR":0.0007958276656162035,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node279":{
"Global MG94xREV":0.0008010754555007947,
"Nucleotide GTR":0.0007958721998140836,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node283":{
"Global MG94xREV":0.0008011468432055687,
"Nucleotide GTR":0.0007959431238316005,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node307":{
"Global MG94xREV":0.0008011468433027761,
"Nucleotide GTR":0.0007959431239281738,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.0008010146949486235,
"Nucleotide GTR":0.0007958118339222223,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node344":{
"Global MG94xREV":0.000801246160742155,
"Nucleotide GTR":0.0007960417962672363,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node367":{
"Global MG94xREV":0.0008011468433026635,
"Nucleotide GTR":0.0007959431239280644,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node399":{
"Global MG94xREV":0.0008012221042101596,
"Nucleotide GTR":0.0007960178959905421,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node457":{
"Global MG94xREV":0.000176060198946665,
"Nucleotide GTR":0.0001749166284813834,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node467":{
"Global MG94xREV":0.0008012428892775618,
"Nucleotide GTR":0.0007960385460519096,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node489":{
"Global MG94xREV":0.000801033287224764,
"Nucleotide GTR":0.0007958303054352481,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node50":{
"Global MG94xREV":0.0005159181657141827,
"Nucleotide GTR":0.0005125671029507473,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":0.0008010121982738186,
"Nucleotide GTR":0.0007958093534641639,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node54":{
"Global MG94xREV":0.0008012197316674422,
"Nucleotide GTR":0.0007960155388582913,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node57":{
"Global MG94xREV":0.0008010306272914205,
"Nucleotide GTR":0.0007958276627790703,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node80":{
"Global MG94xREV":0.0007810421979031038,
"Nucleotide GTR":0.0007759690649917221,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node81":{
"Global MG94xREV":2.088491974342768e-05,
"Nucleotide GTR":2.074926513476964e-05,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node99":{
"Global MG94xREV":0.000804172352701222,
"Nucleotide GTR":0.0007989489816210617,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "SL", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TYA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009674675652957,
"Nucleotide GTR":0.0007957649132967012,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCT", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406034_California_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800714200567478,
"Nucleotide GTR":0.0007955132913535898,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCT", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011811347721524,
"Nucleotide GTR":0.0007959771926628742,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "I", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ATC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000803711938313825,
"Nucleotide GTR":0.0007984915577806386,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "C", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGC", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014145353806369,
"Nucleotide GTR":0.0007962090772555639,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCC", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015458999477701,
"Nucleotide GTR":0.0007963395885654575,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015894029349567,
"Nucleotide GTR":0.0007963828089860475,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "V", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GTT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413557_California_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013048988091939,
"Nucleotide GTR":0.0007961001528106883,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413557_California_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008018140911274971,
"Nucleotide GTR":0.000796606037752878,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "K", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "AAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011869324847258,
"Nucleotide GTR":0.000795982952717346,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "S", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "TCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010124719885189,
"Nucleotide GTR":0.0007958096254009939,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGT", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012624078523604,
"Nucleotide GTR":0.0007960579378469728,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "G", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "GGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023113568104375,
"Nucleotide GTR":0.0007971000735272323,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "DAGV", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "I", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GNC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ATT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGN", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "S", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "TCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010460160452083,
"Nucleotide GTR":0.0007958429515777051,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017694371557366,
"Nucleotide GTR":0.0007965616738237494,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTT", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015050446942821,
"Nucleotide GTR":0.0007962989986806431,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "S", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "TCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021670806607487,
"Nucleotide GTR":0.0007969567344998718,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "RC", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "S", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "YGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "AGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002250759110874135,
"Nucleotide GTR":0.0002236139670142731,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "S", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "TCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010172316096188,
"Nucleotide GTR":0.0007958143541067489,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "S", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "TCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008009290256829749,
"Nucleotide GTR":0.0007957267211073933,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015399854282632,
"Nucleotide GTR":0.0007963337124627532,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCA", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008021459700474988,
"Nucleotide GTR":0.000796935761007187,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "H", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CAT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415137_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011869238299424,
"Nucleotide GTR":0.0007959829441187783,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "V", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GTC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010721586083915,
"Nucleotide GTR":0.0007958689243361094,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "N", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAT", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008022383875366845,
"Nucleotide GTR":0.0007970275782135615,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "F", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTT", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008019117598185537,
"Nucleotide GTR":0.0007967030720527938,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "I", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ATT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016439866060132,
"Nucleotide GTR":0.0007964370381177228,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "A", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "GCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008046512830815677,
"Nucleotide GTR":0.0007994248011868029,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "EDAGV", "MLV", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAA", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GNN", "NTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009707940115946,
"Nucleotide GTR":0.0007957682181366102,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "P", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "CCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008016913973499482,
"Nucleotide GTR":0.0007964841409128598,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAA", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010460160999219,
"Nucleotide GTR":0.0007958429516320637,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011869324669514,
"Nucleotide GTR":0.0007959829526996866,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "Y", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "TAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTT", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024630593062146,
"Nucleotide GTR":0.0007972507906640531,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "Y", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TAC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012623988965948,
"Nucleotide GTR":0.0007960579289493762,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "V", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "GTT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011869241260576,
"Nucleotide GTR":0.00079598294441297,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "V", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GTT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009057115063489,
"Nucleotide GTR":0.0007957035583642195,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCT", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014373410986605,
"Nucleotide GTR":0.0007962317348427454,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "D", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GAC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009056247007622,
"Nucleotide GTR":0.0007957034721224647,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "H", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAT", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011869241260576,
"Nucleotide GTR":0.00079598294441297,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "I", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ATT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801583512108515,
"Nucleotide GTR":0.0007963769564225141,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "Y", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "TAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008009115588691975,
"Nucleotide GTR":0.0007957093677464709,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "S", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "TCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014264063498914,
"Nucleotide GTR":0.0007962208711188631,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "P", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "CCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00080193794388782,
"Nucleotide GTR":0.000796729086047685,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "F", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "TTT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014264218005421,
"Nucleotide GTR":0.0007962208864691559,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAC", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604555591750368,
"Nucleotide GTR":0.001594133461163178,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "KQE", "K", "D", "K", "KQE", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "F", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "NAA", "AAG", "GAC", "AAA", "NAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "TTC", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008008481483129758,
"Nucleotide GTR":0.0007956463690632322,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "G", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GGT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "YTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417238_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801370932421152,
"Nucleotide GTR":0.000796165757512031,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "Y", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "TAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "GV", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GKC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417257_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCY", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417259_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417279_England_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018575946873741,
"Nucleotide GTR":0.0007966492587424385,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "N", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAT", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417279_England_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009114700011937,
"Nucleotide GTR":0.000795709279455694,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "H", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAT", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417281_England_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008019850601163658,
"Nucleotide GTR":0.0007967758962404112,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "V", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GTA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417297_England_20200306_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417343_Washington_20200313_null_705":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417343_Washington_20200313_null_705",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008009114696945663,
"Nucleotide GTR":0.0007957092791510603,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCT", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008020208918389118,
"Nucleotide GTR":0.0007968114952238159,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAA", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012189122749105,
"Nucleotide GTR":0.0007960147247879902,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "S", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "AGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0008017972569399212,
"Nucleotide GTR":0.0007965893129090372,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCC", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "ED", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAM", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001438980315933934,
"Nucleotide GTR":0.001429633652694492,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "S", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAT", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "TCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011580181742031,
"Nucleotide GTR":0.0007959542262150375,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "S", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "TCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011571044256614,
"Nucleotide GTR":0.0007959533184016011,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "S", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TCC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016558144443357,
"Nucleotide GTR":0.000796448789130239,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "H", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAT", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002405941782035018,
"Nucleotide GTR":0.002390314377433731,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "Y", "V", "V", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TAT", "GTT", "GTA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009056246714298,
"Nucleotide GTR":0.0007957034720933235,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "F", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "TTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000800748980793032,
"Nucleotide GTR":0.0007955478456698296,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "S", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "TCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009056200590875,
"Nucleotide GTR":0.0007957034675109396,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "S", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "TCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008024637635617112,
"Nucleotide GTR":0.0007972514903451734,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGC", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008037060458698599,
"Nucleotide GTR":0.0007984857036100874,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "Q", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "CAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "KTRIQPLEAGVS", "SI", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "KQE", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "DAGV", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "NNA", "AKT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "NAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GNT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 18.5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "VF", "QP", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "KTC", "CMA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009115435157766,
"Nucleotide GTR":0.000795709352492777,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "S", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "TCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010123597710833,
"Nucleotide GTR":0.0007958095139124491,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602447296546652,
"Nucleotide GTR":0.001592038860048993,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACC", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001605285789147483,
"Nucleotide GTR":0.001594858915681539,
"amino-acid": [
["M", "S", "Y", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "TAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCA", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011330025370175,
"Nucleotide GTR":0.0007959293730628657,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGT", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012082986162554,
"Nucleotide GTR":0.0007960041800686337,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "D", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "GAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "TPAS", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "NCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014314104001821,
"Nucleotide GTR":0.0007962258426661563,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "T", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "ACG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008005820385328946,
"Nucleotide GTR":0.0007953819877560646,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAT", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009114700154242,
"Nucleotide GTR":0.0007957092794698346,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "F", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTT", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011870153163671,
"Nucleotide GTR":0.0007959830350109672,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGT", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012020146442537,
"Nucleotide GTR":0.0007959979369131522,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAC", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011326490148769,
"Nucleotide GTR":0.0007959290218369706,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "L", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CTG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "KI", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AWA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAA", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014189782006479,
"Nucleotide GTR":0.0007962134912179582,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "F", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TTC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008012082950489841,
"Nucleotide GTR":0.0007960041765245323,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAG", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "W", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "TGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7":{
"Global MG94xREV":0.000802463760233059,
"Nucleotide GTR":0.0007972514870381406,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "T", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ACC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008016914950510186,
"Nucleotide GTR":0.0007964842379793297,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "H", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CAC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017693446980105,
"Nucleotide GTR":0.0007965615819665659,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTT", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002853537177502455,
"Nucleotide GTR":0.0002835002489609912,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "V", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GTC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011329245864824,
"Nucleotide GTR":0.000795929295618647,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "V", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GTA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008010145233128649,
"Nucleotide GTR":0.0007958116634012968,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAT", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008015939931955766,
"Nucleotide GTR":0.0007963873694313746,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "L", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CTC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009113806396847,
"Nucleotide GTR":0.0007957091906746195,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCT", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008007727472675348,
"Nucleotide GTR":0.0007955714577730522,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "F", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "TTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418669_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418727_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801416305137546,
"Nucleotide GTR":0.0007962108355173033,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "I", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "ATA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418727_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011330023039681,
"Nucleotide GTR":0.0007959293728313315,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACT", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418754_England_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0008011928154956945,
"Nucleotide GTR":0.0007959887975161717,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "S", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "TCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418832_British_Columbia_20200311_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008017972441252135,
"Nucleotide GTR":0.0007965893001775663,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "P", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "CCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418832_British_Columbia_20200311_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "Y", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "TAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418881_Washington_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016745202251095,
"Nucleotide GTR":0.0007964673734106489,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACC", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418881_Washington_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008009173245111406,
"Nucleotide GTR":0.0007957150959386223,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCT", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418898_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001607217654058839,
"Nucleotide GTR":0.001596778232477713,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "T", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "ACT", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418898_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418908_Washington_20200316_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0008014145272002607,
"Nucleotide GTR":0.0007962090691283227,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCC", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418908_Washington_20200316_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAT", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418922_Washington_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008015951955579133,
"Nucleotide GTR":0.0007963885639839627,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCT", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418922_Washington_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016914210560067,
"Nucleotide GTR":0.0007964841644649412,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "S", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "AGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023577232045875,
"Nucleotide GTR":0.0007971461387559898,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016188425602967,
"Nucleotide GTR":0.000796412057391078,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "S", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGT", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014162496721733,
"Nucleotide GTR":0.0007962107804121984,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATT", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015892999909809,
"Nucleotide GTR":0.0007963827067107285,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "M", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "ATG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014373327399084,
"Nucleotide GTR":0.0007962317265382861,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "E", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GAA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802480602620971,
"Nucleotide GTR":0.0007972682200290541,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "H", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CAC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012080257207521,
"Nucleotide GTR":0.0007960039089456791,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "G", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GGG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "KAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "RC", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "YGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "SL", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TYA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "TS", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "WCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008022023392638748,
"Nucleotide GTR":0.0007969917640864593,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "T", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "ACT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCK", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419548_Duesseldorf_20200315_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419548_Duesseldorf_20200315_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419551_Duesseldorf_20200316_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419551_Duesseldorf_20200316_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419581_Luxembourg_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008010731100099943,
"Nucleotide GTR":0.0007958698695580376,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCT", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419581_Luxembourg_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015046630911013,
"Nucleotide GTR":0.0007962986195561045,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "C", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "TGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419691_Riga_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008004228392436212,
"Nucleotide GTR":0.0007952238225199541,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "V", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "L", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GTT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TTG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419691_Riga_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "K", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAG", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGT", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000802432766994811,
"Nucleotide GTR":0.000797220695111445,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "T", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "ACA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "QH", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAM", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011330181551747,
"Nucleotide GTR":0.0007959293885795771,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "I", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ATA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011329802997106,
"Nucleotide GTR":0.0007959293509699978,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "I", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ATA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020477674964654,
"Nucleotide GTR":0.0007968381963148944,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "T", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ACC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010950571033301,
"Nucleotide GTR":0.0007958916740975879,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000803711633185291,
"Nucleotide GTR":0.0007984912546340177,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "R", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "CGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602814707642046,
"Nucleotide GTR":0.001592403884685212,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGT", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACT", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "AS", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "KCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011329245496106,
"Nucleotide GTR":0.0007959292955820134,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "I", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ATT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008020648590662808,
"Nucleotide GTR":0.0007968551768691918,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTA", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012625096036728,
"Nucleotide GTR":0.0007960580389373745,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGG", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017693446980105,
"Nucleotide GTR":0.0007965615819665659,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "I", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ATT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011329245864824,
"Nucleotide GTR":0.000795929295618647,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAT", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "DY", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "KAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008004590202433532,
"Nucleotide GTR":0.0007952597685118697,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCT", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016515224008224,
"Nucleotide GTR":0.0007964445249649991,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011327099829972,
"Nucleotide GTR":0.0007959290824090827,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCT", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007901229934115174,
"Nucleotide GTR":0.0007849908776658167,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "E", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAA", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAY", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008013677459239521,
"Nucleotide GTR":0.000796162591712207,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATT", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001602814707642046,
"Nucleotide GTR":0.001592403884685212,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "V", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAT", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GTC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420124_Comunitat_Valenciana_20200309_null_52":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420124_Comunitat_Valenciana_20200309_null_52",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016914287837005,
"Nucleotide GTR":0.0007964841721424397,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "I", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "ATC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008003213729612777,
"Nucleotide GTR":0.000795123015295388,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGT", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018438927469717,
"Nucleotide GTR":0.0007966356458007666,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420248_South_Yorkshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009174154995202,
"Nucleotide GTR":0.0007957151863360011,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "Y", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "TAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420248_South_Yorkshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "S", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "TCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000801569002818797,
"Nucleotide GTR":0.0007963625413755344,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009173245267756,
"Nucleotide GTR":0.0007957150959541555,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "Y", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "TAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008018448150449452,
"Nucleotide GTR":0.0007966365621081035,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGG", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008015093481382175,
"Nucleotide GTR":0.0007963032741722567,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008040892503508641,
"Nucleotide GTR":0.0007988664190485417,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGC", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603931563352121,
"Nucleotide GTR":0.001593513486040175,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "A", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGG", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GCC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008016913941330047,
"Nucleotide GTR":0.0007964841377168116,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "N", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "AAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008037175267295648,
"Nucleotide GTR":0.0007984971098977309,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "R", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "CGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011329803627588,
"Nucleotide GTR":0.0007959293510326362,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "L", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CTC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001604093812470626,
"Nucleotide GTR":0.001593674681295848,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "P", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "S", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "CCT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "TCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420423_Soignies_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000800905612681591,
"Nucleotide GTR":0.0007957034601813625,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420423_Soignies_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420440_Kain_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008014163049896828,
"Nucleotide GTR":0.0007962108353704009,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "H", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAT", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420440_Kain_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008027453084667526,
"Nucleotide GTR":0.0007975312065209503,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "F", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTT", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "C", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TGC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008024326743692288,
"Nucleotide GTR":0.0007972206030874974,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAY", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420461_England_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420516_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009173245267756,
"Nucleotide GTR":0.0007957150959541555,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "I", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATT", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420516_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420524_England_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008000388461417873,
"Nucleotide GTR":0.0007948423235830279,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "L", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAT", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TTA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420524_England_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420598_Argentina_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000801132823190076,
"Nucleotide GTR":0.0007959291948808439,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "C", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "TGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420598_Argentina_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016914395037622,
"Nucleotide GTR":0.0007964841827928715,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCA", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420619_ARA_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008009114700350174,
"Nucleotide GTR":0.0007957092794892997,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "C", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "TGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420619_ARA_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011869324847258,
"Nucleotide GTR":0.000795982952717346,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "L", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CTT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014255088030146,
"Nucleotide GTR":0.0007962199794018568,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "E", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GAG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420639_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATY", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420639_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008016154321679058,
"Nucleotide GTR":0.0007964086691503365,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAA", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420641_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "SG", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "PL", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "RGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CYT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420648_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "SI", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AKT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420657_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420670_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011329245864824,
"Nucleotide GTR":0.000795929295618647,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "L", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CTA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420670_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420676_England_20200328_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "G", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GGT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420676_England_20200328_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008017693338626641,
"Nucleotide GTR":0.0007965615712015997,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTT", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420691_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "KR", "RG", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "VF", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "ARR", "SGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "KTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420706_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "PA", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "SCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420727_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "DY", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "KAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420743_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "PS", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "YCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420745_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGT", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420758_England_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420766_England_20200327_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008011869325581104,
"Nucleotide GTR":0.000795982952790255,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "C", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "TGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420766_England_20200327_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420768_England_20200327_null_25":{
"Global MG94xREV":0.0008021138105820247,
"Nucleotide GTR":0.0007969038104283028,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "Y", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "TAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420768_England_20200327_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008012189847118613,
"Nucleotide GTR":0.0007960147967544388,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "I", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATA", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420772_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGY", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0008011328349998528,
"Nucleotide GTR":0.0007959292066139119,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAT", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008049098922885343,
"Nucleotide GTR":0.0007996817306396135,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "F", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "-", "ILVF", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTT", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTN", "---", "NTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "H", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAT", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0008030119719206024,
"Nucleotide GTR":0.0007977961379055885,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "N", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "AAT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGY", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "YS", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TMT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420929_Wales_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008007489813871158,
"Nucleotide GTR":0.0007955478462600552,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "L", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CTT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420929_Wales_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "AS", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "KCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010412737165696,
"Nucleotide GTR":0.0007958382400520932,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "E", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAG", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008023996309461761,
"Nucleotide GTR":0.0007971877742926407,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "PL", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGW", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CYT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008005354074561148,
"Nucleotide GTR":0.0007953356595638808,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATT", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420975_Wales_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "SI", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AKT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420975_Wales_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011811350780175,
"Nucleotide GTR":0.0007959771929667525,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAT", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011754120938358,
"Nucleotide GTR":0.0007959715071552877,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGT", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008006711606171235,
"Nucleotide GTR":0.0007954705309622511,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTT", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421008_Wales_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00080117533671275,
"Nucleotide GTR":0.0007959714322638272,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCT", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421008_Wales_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421010_Wales_20200323_null_145":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "I", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "ATT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421010_Wales_20200323_null_145",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008014314932986351,
"Nucleotide GTR":0.0007962259250261574,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTA", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAT", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0008016153750324919,
"Nucleotide GTR":0.0007964086123860358,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "K", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AAA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_26":{
"Global MG94xREV":0.000801132924570319,
"Nucleotide GTR":0.0007959292956025863,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTT", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008010920444941036,
"Nucleotide GTR":0.0007958886810562758,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACC", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421260_Jiangxi_20200126_null_64":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421260_Jiangxi_20200126_null_64",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00080244321779116,
"Nucleotide GTR":0.0007972310780263407,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "T", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "ACT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "CTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001603779276164227,
"Nucleotide GTR":0.001593362188009009,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "I", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ATT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTC", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009174154519558,
"Nucleotide GTR":0.0007957151862887478,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "L", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TTG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011329245864824,
"Nucleotide GTR":0.000795929295618647,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421359_New_York_20200317_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "I", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "ATT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421359_New_York_20200317_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421365_New_York_20200314_null_37":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "N", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AAT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421365_New_York_20200314_null_37",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011811964369949,
"Nucleotide GTR":0.0007959772539271837,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "I", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ATA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00080144289337845,
"Nucleotide GTR":0.0007962372510586022,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAT", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421420_New_York_20200318_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "L", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TTA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421420_New_York_20200318_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "G", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GGT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "S", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "TCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0008011811352567358,
"Nucleotide GTR":0.0007959771931443106,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "V", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GTT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "L", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TTA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008017900322591157,
"Nucleotide GTR":0.0007965821351549738,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "K", "R", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AAA", "CGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAT", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008010123810973111,
"Nucleotide GTR":0.0007958095351001562,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "I", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ATT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCG", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0008010123012609292,
"Nucleotide GTR":0.0007958094557823378,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "TTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0008011812141110467,
"Nucleotide GTR":0.0007959772714864351,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "L", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CTC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011812137971927,
"Nucleotide GTR":0.000795977271174622,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "I", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ATT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421573_KZN_20200331_null_25":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "L", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CTC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421573_KZN_20200331_null_25",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421578_New_York_20200318_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0008023890797519933,
"Nucleotide GTR":0.0007971772916320278,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "Y", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TAT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421578_New_York_20200318_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421590_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008009173364557738,
"Nucleotide GTR":0.0007957151078056725,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "L", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CTT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421590_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421598_New_York_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008016154321923552,
"Nucleotide GTR":0.0007964086691746274,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "I", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATA", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421598_New_York_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421613_New_York_20200320_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0008009173244896893,
"Nucleotide GTR":0.0007957150959173103,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "S", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "TCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421613_New_York_20200320_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421615_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008011812330765362,
"Nucleotide GTR":0.000795977290328737,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "V", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GTT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421615_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008121939055641174,
"Nucleotide GTR":0.0008069184317884316,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421636_New_South_Wales_20200326_null_3229":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "S", "D", "N", "G", "P", "Q", "N", "Q", "R", "N", "A", "P", "R", "I", "T", "F", "G", "G", "P", "S", "D", "S", "T", "G", "S", "N", "Q", "N", "G", "E", "R", "S", "G", "A", "R", "S", "K", "Q", "R", "R", "P", "Q", "G", "L", "P", "N", "N", "T", "A", "S", "W", "F", "T", "A", "L", "T", "Q", "H", "G", "K", "E", "D", "L", "K", "F", "P", "R", "G", "Q", "G", "V", "P", "I", "N", "T", "N", "S", "S", "P", "D", "D", "Q", "I", "G", "Y", "Y", "R", "R", "A", "T", "R", "R", "I", "R", "G", "G", "D", "G", "K", "M", "K", "D", "L", "S", "P", "R", "W", "Y", "F", "Y", "Y", "L", "G", "T", "G", "P", "E", "A", "G", "L", "P", "Y", "G", "A", "N", "K", "D", "G", "I", "I", "W", "V", "A", "T", "E", "G", "A", "L", "N", "T", "P", "K", "D", "H", "I", "G", "T", "R", "N", "P", "A", "N", "N", "A", "A", "I", "V", "L", "Q", "L", "P", "Q", "G", "T", "T", "L", "P", "K", "G", "F", "Y", "A", "E", "G", "S", "R", "G", "G", "S", "Q", "A", "S", "S", "R", "S", "S", "S", "R", "S", "R", "N", "S", "S", "R", "N", "S", "T", "P", "G", "S", "S", "R", "G", "T", "S", "P", "A", "R", "M", "A", "G", "N", "G", "G", "D", "A", "A", "L", "A", "L", "L", "L", "L", "D", "R", "L", "N", "Q", "L", "E", "S", "K", "M", "S", "G", "K", "G", "Q", "Q", "Q", "Q", "G", "Q", "T", "V", "T", "K", "K", "S", "A", "A", "E", "A", "S", "K", "K", "P", "R", "Q", "K", "R", "T", "A", "T", "K", "A", "Y", "N", "V", "T", "Q", "A", "F", "G", "R", "R", "G", "P", "E", "Q", "T", "Q", "G", "N", "F", "G", "D", "Q", "E", "L", "I", "R", "Q", "G", "T", "D", "Y", "K", "H", "W", "P", "Q", "I", "A", "Q", "F", "A", "P", "S", "A", "S", "A", "F", "F", "G", "M", "S", "R", "I", "G", "M", "E", "V", "T", "P", "S", "G", "T", "W", "L", "T", "Y", "T", "G", "A", "I", "K", "L", "D", "D", "K", "D", "P", "N", "F", "K", "D", "Q", "V", "I", "L", "L", "N", "K", "H", "I", "D", "A", "Y", "K", "T", "F", "P", "P", "T", "E", "P", "K", "K", "D", "K", "K", "K", "K", "A", "D", "E", "T", "Q", "A", "L", "P", "Q", "R", "Q", "K", "K", "Q", "Q", "T", "V", "T", "L", "L", "P", "A", "A", "D", "L", "D", "D", "F", "S", "K", "Q", "L", "Q", "Q", "S", "M", "S", "S", "A", "D", "S", "T", "Q", "A"]
],
"codon": [
["ATG", "TCT", "GAT", "AAT", "GGA", "CCC", "CAA", "AAT", "CAG", "CGA", "AAT", "GCA", "CCC", "CGC", "ATT", "ACG", "TTT", "GGT", "GGA", "CCC", "TCA", "GAT", "TCA", "ACT", "GGC", "AGT", "AAC", "CAG", "AAT", "GGA", "GAA", "CGC", "AGT", "GGG", "GCG", "CGA", "TCA", "AAA", "CAA", "CGT", "CGG", "CCC", "CAA", "GGT", "TTA", "CCC", "AAT", "AAT", "ACT", "GCG", "TCT", "TGG", "TTC", "ACC", "GCT", "CTC", "ACT", "CAA", "CAT", "GGC", "AAG", "GAA", "GAC", "CTT", "AAA", "TTC", "CCT", "CGA", "GGA", "CAA", "GGC", "GTT", "CCA", "ATT", "AAC", "ACC", "AAT", "AGC", "AGT", "CCA", "GAT", "GAC", "CAA", "ATT", "GGC", "TAC", "TAC", "CGA", "AGA", "GCT", "ACC", "AGA", "CGA", "ATT", "CGT", "GGT", "GGT", "GAC", "GGT", "AAA", "ATG", "AAA", "GAT", "CTC", "AGT", "CCA", "AGA", "TGG", "TAT", "TTC", "TAC", "TAC", "CTA", "GGA", "ACT", "GGG", "CCA", "GAA", "GCT", "GGA", "CTT", "CCC", "TAT", "GGT", "GCT", "AAC", "AAA", "GAC", "GGC", "ATC", "ATA", "TGG", "GTT", "GCA", "ACT", "GAG", "GGA", "GCC", "TTG", "AAT", "ACA", "CCA", "AAA", "GAT", "CAC", "ATT", "GGC", "ACC", "CGC", "AAT", "CCT", "GCT", "AAC", "AAT", "GCT", "GCA", "ATC", "GTG", "CTA", "CAA", "CTT", "CCT", "CAA", "GGA", "ACA", "ACA", "TTG", "CCA", "AAA", "GGC", "TTC", "TAC", "GCA", "GAA", "GGG", "AGC", "AGA", "GGC", "GGC", "AGT", "CAA", "GCC", "TCT", "TCT", "CGT", "TCC", "TCA", "TCA", "CGT", "AGT", "CGC", "AAC", "AGT", "TCA", "AGA", "AAT", "TCA", "ACT", "CCA", "GGC", "AGC", "AGT", "AGG", "GGA", "ACT", "TCT", "CCT", "GCT", "AGA", "ATG", "GCT", "GGC", "AAT", "GGC", "GGT", "GAT", "GCT", "GCT", "CTT", "GCT", "TTG", "CTG", "CTG", "CTT", "GAC", "AGA", "TTG", "AAC", "CAG", "CTT", "GAG", "AGC", "AAA", "ATG", "TCT", "GGT", "AAA", "GGC", "CAA", "CAA", "CAA", "CAA", "GGC", "CAA", "ACT", "GTC", "ACT", "AAG", "AAA", "TCT", "GCT", "GCT", "GAG", "GCT", "TCT", "AAG", "AAG", "CCT", "CGG", "CAA", "AAA", "CGT", "ACT", "GCC", "ACT", "AAA", "GCA", "TAC", "AAT", "GTA", "ACA", "CAA", "GCT", "TTC", "GGC", "AGA", "CGT", "GGT", "CCA", "GAA", "CAA", "ACC", "CAA", "GGA", "AAT", "TTT", "GGG", "GAC", "CAG", "GAA", "CTA", "ATC", "AGA", "CAA", "GGA", "ACT", "GAT", "TAC", "AAA", "CAT", "TGG", "CCG", "CAA", "ATT", "GCA", "CAA", "TTT", "GCC", "CCC", "AGC", "GCT", "TCA", "GCG", "TTC", "TTC", "GGA", "ATG", "TCG", "CGC", "ATT", "GGC", "ATG", "GAA", "GTC", "ACA", "CCT", "TCG", "GGA", "ACG", "TGG", "TTG", "ACC", "TAC", "ACA", "GGT", "GCC", "ATC", "AAA", "TTG", "GAT", "GAC", "AAA", "GAT", "CCA", "AAT", "TTC", "AAA", "GAT", "CAA", "GTC", "ATT", "TTG", "CTG", "AAT", "AAG", "CAT", "ATT", "GAC", "GCA", "TAC", "AAA", "ACA", "TTC", "CCA", "CCA", "ACA", "GAG", "CCT", "AAA", "AAG", "GAC", "AAA", "AAG", "AAG", "AAG", "GCT", "GAT", "GAA", "ACT", "CAA", "GCC", "TTA", "CCG", "CAG", "AGA", "CAG", "AAG", "AAA", "CAG", "CAA", "ACT", "GTG", "ACT", "CTT", "CTT", "CCT", "GCT", "GCA", "GAT", "TTG", "GAT", "GAT", "TTC", "TCC", "AAA", "CAA", "TTG", "CAA", "CAA", "TCC", "ATG", "AGC", "AGT", "GCT", "GAC", "TCA", "ACT", "CAG", "GCC"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421636_New_South_Wales_20200326_null_3229",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":7998.437484062595,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03560272216526841],
[0.02372727684736503],
[0.01704969471312536],
[0.03333470085465245],
[0.02770386129688741],
[0.01846311592919437],
[0.01326702984378775],
[0.02593902580155596],
[0.0227789906368936],
[0.01518095764240098],
[0.01090857138477599],
[0.02132788709601899],
[0.01614270306556355],
[0.01075823311833961],
[0.007730536947003038],
[0.01511435488494718],
[0.0272766173197612],
[0.01817838106876473],
[0.01306242809046649],
[0.02553899880071759],
[0.02122499564407237],
[0.01414530454703014],
[0.01016438277778306],
[0.0198728871672254],
[0.0174518624628962],
[0.01163071661310294],
[0.008357476874566089],
[0.01634011612529733],
[0.01236754684043394],
[0.008242296935710124],
[0.005922662233546297],
[0.01157968967423363],
[0.03338788970744799],
[0.02225121154389503],
[0.01598903937696128],
[0.0312609611815484],
[0.02598041411432451],
[0.01731453217083296],
[0.01244169271983158],
[0.02432536839629237],
[0.02136191787530021],
[0.01423655576292933],
[0.0102299531077999],
[0.02000108696040818],
[0.01513847135146597],
[0.01008896733049652],
[0.007249623041961664],
[0.01417409633890673],
[0.0146743970902487],
[0.02061621484726538],
[0.01713375977441108],
[0.01141871848215832],
[0.008205141508160133],
[0.01604227772090542],
[0.009388831347478341],
[0.006746526759782975],
[0.01319046793090926],
[0.009983633453510329],
[0.00665354839426135],
[0.004781036172457329],
[0.009347640134661559]
],
"Log Likelihood":-3689.323123354109,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.967924321429414, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":309
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":8544.785868426226,
"Equilibrium frequencies": [
[0.3168598146525201],
[0.2504296493812427],
[0.2222266248982205],
[0.2104839110680167]
],
"Log Likelihood":-3754.559359133897,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1576685353286168,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.3376812028880407,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.3301913387553929,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":3.80762857421327,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":2.248441116612102
},
"display order":0,
"estimated parameters":517
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-09/sequences.N.compressed.fas",
"number of sequences":256,
"number of sites":419,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2,epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1,epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1,epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1,epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1,epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1,epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3,(epi_isl_415600_USA_20200309_null_1,epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1)Node307,epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2,epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1,epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1,epi_isl_413607_USA_20200218_null_1,epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1,epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1,(epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1,epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1)Node321,epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12,epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1,epi_isl_420423_Soignies_20200325_null_4,epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1,epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2,epi_isl_421598_New_York_20200321_null_1,epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1,epi_isl_421615_New_York_20200320_null_1,epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7,(epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4)Node344,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1,epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1,epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4,epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2,epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1,epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_4,epi_isl_420248_South_Yorkshire_20200325_null_1,epi_isl_421008_Wales_20200323_null_2,epi_isl_416650_USA_20200310_null_1,epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10,(epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1,epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1)Node367,epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1,epi_isl_418881_Washington_20200324_null_2,epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1,epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2,epi_isl_418898_Washington_20200324_null_1,epi_isl_420598_Argentina_20200322_null_1,epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1,epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1,epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_420772_England_20200330_null_1,epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1,epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1,(epi_isl_406034_California_20200123_null_1,epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1)Node399,epi_isl_418060_USA_20200314_null_1,(epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1,epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1)Node283,epi_isl_420670_England_20200327_null_2,epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3,epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2,epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1,epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1,epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1,epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420516_England_20200323_null_1,epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_417281_England_20200306_null_1,epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1,epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12,epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1,epi_isl_420766_England_20200327_null_7,epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1,epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1,epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1,epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4,epi_isl_418922_Washington_20200316_null_2,epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1,epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1,epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1,epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2,epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1,epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1,(epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2,epi_isl_420743_England_20200327_null_1)Node279,epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1,epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1,epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3,epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1,epi_isl_421578_New_York_20200318_null_7,(epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1)Node457,epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2,epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_2,(epi_isl_420676_England_20200328_null_5,epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4,epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1,epi_isl_418669_England_20200311_null_1)Node467,epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2,(epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2,epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1)Node57,epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2,epi_isl_421613_New_York_20200320_null_13,epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3,(epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1,epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1)Node54,epi_isl_420440_Kain_20200325_null_2,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,(epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2,epi_isl_421420_New_York_20200318_null_4)Node489,epi_isl_418908_Washington_20200316_null_5,epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2,(epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1)Node50,epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,epi_isl_418754_England_20200317_null_2,epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1,epi_isl_420619_ARA_20200323_null_2,epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_26,epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4,epi_isl_421590_New_York_20200318_null_1,epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1,epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1,epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1,epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1,epi_isl_420929_Wales_20200320_null_3,epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1,(epi_isl_419551_Duesseldorf_20200316_null_9,epi_isl_419691_Riga_20200301_null_1)Node505,epi_isl_413557_California_20200228_null_1,epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1,epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1,(epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2)Node23,epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1,(epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1,epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_26,epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1,epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2)Node268,epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1,epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3,(epi_isl_420975_Wales_20200322_null_2,epi_isl_421010_Wales_20200323_null_145,epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1,epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1,epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1,epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1,epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1,epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1,epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1)Node248,(epi_isl_420648_England_20200323_null_1,epi_isl_420758_England_20200327_null_7)Node245,(epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6)Node224,(((epi_isl_420461_England_20200310_null_1,epi_isl_421359_New_York_20200317_null_7)Node154,epi_isl_420641_England_20200325_null_1)Node153,epi_isl_420657_England_20200325_null_1)Node152,(epi_isl_419548_Duesseldorf_20200315_null_2,((epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1,epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1,epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21,(epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1,epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2)Node211,epi_isl_420768_England_20200327_null_25,epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1,epi_isl_417279_England_20200307_null_1,epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4,epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1,epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5,epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1,epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1,epi_isl_417343_Washington_20200313_null_705,epi_isl_420639_England_20200326_null_1,epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1,epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1,epi_isl_417297_England_20200306_null_2,epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2,epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1,epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3,epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1,epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1,epi_isl_420691_England_20200328_null_2,epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1,epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1)Node163,epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1)Node162,epi_isl_420706_England_20200328_null_1,epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1,epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1)Node159,(epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_421573_KZN_20200331_null_25)Node237,epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1,((epi_isl_420124_Comunitat_Valenciana_20200309_null_52,epi_isl_420524_England_20200326_null_8)Node231,epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1)Node230,epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1,epi_isl_419581_Luxembourg_20200311_null_3,epi_isl_414617_USA_20200308_null_1,epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2,epi_isl_417257_England_20200303_null_1,(epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1,epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_421365_New_York_20200314_null_37)Node140,epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_414485_USA_20200224_null_1,epi_isl_420745_England_20200328_null_1,epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1,((epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5,epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1)Node130,epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1)Node129,(epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_421426_New_York_20200317_null_2)Node125,epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1,epi_isl_420727_England_20200328_null_1,epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1,epi_isl_421636_New_South_Wales_20200326_null_3229,epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1,epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2,epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1,epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1,epi_isl_417259_England_20200304_null_1,epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,(epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3,epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1)Node107,epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1,(epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1)Node112,epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1,epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1,(((epi_isl_417238_England_20200303_null_1,epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1)Node99,epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10,epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1,epi_isl_421260_Jiangxi_20200126_null_64,epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1,epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2,epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1,epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2,epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,epi_isl_418832_British_Columbia_20200311_null_4)Node81,epi_isl_415137_England_20200302_null_1)Node80,epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4,epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1,epi_isl_418727_England_20200313_null_1,epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node107":"test",
"Node112":"test",
"Node125":"test",
"Node129":"test",
"Node130":"test",
"Node140":"test",
"Node152":"test",
"Node153":"test",
"Node154":"test",
"Node159":"test",
"Node162":"test",
"Node163":"test",
"Node211":"test",
"Node224":"test",
"Node23":"test",
"Node230":"test",
"Node231":"test",
"Node237":"test",
"Node245":"test",
"Node248":"test",
"Node268":"test",
"Node279":"test",
"Node283":"test",
"Node307":"test",
"Node321":"test",
"Node344":"test",
"Node367":"test",
"Node399":"test",
"Node457":"test",
"Node467":"test",
"Node489":"test",
"Node50":"test",
"Node505":"test",
"Node54":"test",
"Node57":"test",
"Node80":"test",
"Node81":"test",
"Node99":"test",
"epi_isl_404253_Illinois_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406534_Guangdong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_406595_Guandong_20200116_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_412980_Hubei_20200118_null_1":"test",
"epi_isl_413020_Zurich_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_413520_Beijing_20200128_null_1":"test",
"epi_isl_413557_California_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413598_NSW_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_413607_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413868_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413871_Guangdong_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_414379_Singapore_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414452_Noord_Brabant_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414470_Zuid_Holland_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_414476_New_York_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_414485_USA_20200224_null_1":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414571_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_414578_Talca_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_414617_USA_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_414936_Shandong_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_415137_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415490_Netherlands_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_415495_Netherlands_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_415497_Netherlands_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_415532_Zuid_Holland_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_416329_Shanghai_20200201_null_2":"test",
"epi_isl_416344_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416355_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416356_Shanghai_20200201_null_3":"test",
"epi_isl_416362_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416378_Shanghai_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_416390_Shanghai_20200131_null_5":"test",
"epi_isl_416398_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416566_unknown_20200215_null_1":"test",
"epi_isl_416613_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416621_unknown_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_416640_Washington_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416650_USA_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_416684_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416692_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416718_Washington_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_417086_Washington_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_417121_Washington_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_417177_Hong_Kong_20200123_null_2":"test",
"epi_isl_417192_Minnesota_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417238_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417257_England_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417259_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417279_England_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_417281_England_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417297_England_20200306_null_2":"test",
"epi_isl_417343_Washington_20200313_null_705":"test",
"epi_isl_417346_Washington_20200312_null_3":"test",
"epi_isl_417348_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_10":"test",
"epi_isl_417513_Wisconsin_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417527_Luxembourg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417556_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417603_Reykjavik_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_417618_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417642_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417719_Reykjavik_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417732_Reykjavik_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_417758_Reykjavik_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417773_Reykjavik_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_417867_Reykjavik_20200309_null_3":"test",
"epi_isl_417875_Reykjavik_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417964_Utah_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417981_Madrid_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_417991_Portugal_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418030_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418060_USA_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418062_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418063_Washington_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418069_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418125_Wales_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418183_Baranya_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418188_Wisconsin_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_418209_Dakar_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_418213_Touba_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_418260_Abruzzo_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418304_Derbyshire_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_418324_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418347_Ontario_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_418360_Ontario_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418371_Ontario_20200307_null_7":"test",
"epi_isl_418374_Ontario_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418429_ARA_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418432_ARA_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418626_Li_ge_20200316_null_4":"test",
"epi_isl_418631_Li_ge_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418669_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_418727_England_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418754_England_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_418799_Queensland_20200228_null_10":"test",
"epi_isl_418832_British_Columbia_20200311_null_4":"test",
"epi_isl_418840_British_Columbia_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_418881_Washington_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_418884_Washington_20200315_null_7":"test",
"epi_isl_418898_Washington_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_418908_Washington_20200316_null_5":"test",
"epi_isl_418917_Illinois_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_418922_Washington_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_419176_ARA_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419183_ARA_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419213_Hong_Kong_20200209_null_1":"test",
"epi_isl_419217_Hong_Kong_20200210_null_2":"test",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_1":"test",
"epi_isl_419311_Chiba_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419406_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419423_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419435_Wales_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419438_Wales_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419505_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419516_Connecticut_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419544_Duesseldorf_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419548_Duesseldorf_20200315_null_2":"test",
"epi_isl_419551_Duesseldorf_20200316_null_9":"test",
"epi_isl_419581_Luxembourg_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_419657_Austria_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_419691_Riga_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419692_Belarus_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_419760_Victoria_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419772_Victoria_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_419813_Victoria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419826_Victoria_20200312_null_2":"test",
"epi_isl_419872_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419890_Victoria_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419904_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419941_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419958_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_4":"test",
"epi_isl_419969_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419984_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419988_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419991_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_419997_Victoria_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420017_Victoria_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_420023_Virginia_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420042_Ile_de_France_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_420053_Hauts_de_France_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420067_Estonia_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420077_Dakar_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420081_Saint_Petersburg_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420124_Comunitat_Valenciana_20200309_null_52":"test",
"epi_isl_420125_Comunitat_Valenciana_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_420205_South_Yorkshire_20200329_null_2":"test",
"epi_isl_420208_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420216_South_Yorkshire_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_420248_South_Yorkshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420250_South_Yorkshire_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420289_South_Yorkshire_20200317_null_5":"test",
"epi_isl_420307_New_York_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_420320_Ukkel_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420343_Andenne_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_420367_Knokke_Heist_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_420382_Oudergem_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420383_Bassilly_20200324_null_3":"test",
"epi_isl_420394_Sint_Pieter_Woluwe_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420395_Trazegnies_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420412_Koersel_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420423_Soignies_20200325_null_4":"test",
"epi_isl_420440_Kain_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_420450_Sint_Agatha_Berchem_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_420454_Bonheiden_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_420461_England_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_420516_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420524_England_20200326_null_8":"test",
"epi_isl_420598_Argentina_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420614_ARA_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420619_ARA_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420621_ARA_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420622_ARA_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420639_England_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420641_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420648_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420657_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420670_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420676_England_20200328_null_5":"test",
"epi_isl_420691_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420706_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420727_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420743_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420745_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420758_England_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_420766_England_20200327_null_7":"test",
"epi_isl_420768_England_20200327_null_25":"test",
"epi_isl_420772_England_20200330_null_1":"test",
"epi_isl_420798_Texas_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420811_Utah_20200327_null_12":"test",
"epi_isl_420842_Kinshasa_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420890_Japan_20200309_null_2":"test",
"epi_isl_420902_Munich_20200313_null_21":"test",
"epi_isl_420914_Wales_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_420923_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420929_Wales_20200320_null_3":"test",
"epi_isl_420934_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420937_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420946_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420967_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420975_Wales_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420990_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420995_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_421008_Wales_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421010_Wales_20200323_null_145":"test",
"epi_isl_421175_Madrid_20200329_null_1":"test",
"epi_isl_421193_Li_ge_20200331_null_6":"test",
"epi_isl_421194_Li_ge_20200330_null_8":"test",
"epi_isl_421238_Jiangxi_20200129_null_26":"test",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_2":"test",
"epi_isl_421260_Jiangxi_20200126_null_64":"test",
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_2":"test",
"epi_isl_421288_Wisconsin_20200326_null_1":"test",
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421343_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421359_New_York_20200317_null_7":"test",
"epi_isl_421365_New_York_20200314_null_37":"test",
"epi_isl_421399_New_York_20200317_null_4":"test",
"epi_isl_421412_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_421420_New_York_20200318_null_4":"test",
"epi_isl_421426_New_York_20200317_null_2":"test",
"epi_isl_421434_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_421460_Portugal_20200320_null_26":"test",
"epi_isl_421494_Portugal_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421505_Ile_de_France_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_421515_Comunitat_Valenciana_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_421517_Comunitat_Valenciana_20200316_null_12":"test",
"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_4":"test",
"epi_isl_421520_Comunitat_Valenciana_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421573_KZN_20200331_null_25":"test",
"epi_isl_421578_New_York_20200318_null_7":"test",
"epi_isl_421590_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421598_New_York_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_421613_New_York_20200320_null_13":"test",
"epi_isl_421615_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421625_New_York_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_421636_New_South_Wales_20200326_null_3229":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":5
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":6
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":12
}
}
}