{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.000524280578910944],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.0005244985269834812],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172582, 0, 0.0007874053770267952, 0.007008959817847892, 0.6826855622827418, 1, 0.0005244985270038641],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005244985291267329],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270025062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3956458509648, 1269.887901459406, 0, 1, 0.3173686327036374, 0, 0.0007874710821724971, 0.007009544681425772, 0.6826313672963626, 1, 0.0005242726280433731],
[590.3464332155766, 1269.940884441251, 0, 1, 0.3173415351555278, 0, 0.0007874382282290097, 0.007009252237436337, 0.6826584648444722, 1, 0.0005242027429990842],
[590.8318256400803, 1270.284168987017, 0, 1, 0.3174610434522983, 0, 0.0007872254290923313, 0.0070073580408233, 0.6825389565477017, 1, 0.000524913962655474],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005243570956663491],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157275, 0, 0.0007872050057638288, 0.007007176245914353, 0.6828593296842725, 1, 0.0005244985269823945],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005243570956663491],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005242805789378355],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005242805789266443],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985269834812],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985290950339],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157275, 0, 0.0007872050057638288, 0.007007176245914353, 0.6828593296842725, 1, 0.0005244985290926877],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985269834812],
[590.6954347136094, 1269.569909740094, 0, 1, 0.3175328920009938, 0, 0.0007876683216324176, 0.007011300376128159, 0.6824671079990061, 1, 0.0005240018305792919],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005240569645454774],
[590.2681164348062, 1269.968381264915, 0, 1, 0.3173081041925063, 0, 0.0007874211789461866, 0.007009100476041613, 0.6826918958074937, 1, 0.0005243504399410822],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244245809592742],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005244985290737734],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005242805789611265],
[589.9339799036695, 1270.389176492766, 0, 1, 0.3171137110642698, 0, 0.0007871603588128449, 0.007006778828402908, 0.6828862889357302, 1, 0.0005240705690848085],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244321006923589],
[590.3206896659967, 1269.970398337286, 1, 0, 0.317327053530966, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.317327053530966, 0.0005244985270006093],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985270082032],
[590.306450487511, 1269.984637515772, 1, 0, 0.3173193992565475, 0.001694035359386873, 0, -0.01507917790552763, 1, 0.3173193992565475, 0.0005244245809580054],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242805789321469],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172582, 0, 0.0007874053770267952, 0.007008959817847892, 0.6826855622827418, 1, 0.0005244245812903562],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172582, 0, 0.0007874053770267952, 0.007008959817847892, 0.6826855622827418, 1, 0.0005244669573834046],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242776338799424],
[590.2972205801883, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173221891098736, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826778108901264, 1, 0.0005240866262032845],
[590.306450487511, 1269.984637515772, 1, 0, 0.3173193992565475, 0.001694035359386873, 0, -0.01507917790552763, 1, 0.3173193992565475, 0.0005244245813116977],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985269834812],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005242805789321469],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244900837908154],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243646128845376],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269676515],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244245809580054],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243570957540314],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.000524291235980993],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 2, 0.3173144377172582, 0, 0.00157481075405359, 0.01401791963569578, 0.4660595769493033, 1, 0.001049500842892937],
[590.2734941029797, 1270.017593900304, 0, 1, 0.3173016835427306, 0, 0.0007873906667142598, 0.00700882887641356, 0.6826983164572694, 1, 0.0005244245834379601],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243570957697921],
[590.2972205801883, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173221891098736, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826778108901264, 1, 0.0005244985269460787],
[590.3721767651564, 1269.905537342347, 1, 0, 0.3173570119601183, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699366, 1, 0.3173570119601183, 0.0005242805791669286],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985290894313],
[590.294946116417, 1269.996141886866, 0, 0, 0.3173132150786153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002021815211553752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3206896659967, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0003220796386175657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.0005244271012632142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3590237187016, 1270.382851649194, 0, 1, 0.3172707786790573, 0, 0.0007871642778409782, 0.007006813712989061, 0.6827292213209426, 1, 0.0005242307711016086],
[590.3873039350216, 1269.930039071155, 0, 4, 0.317358383049306, 0, 0.003149779812221511, 0.02803724838950114, 0.2171556059441088, 1, 0.002120059411126014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.8676230260451, 1269.45553337039, 1, 4, 0.317615582537065, 0.001692426460733525, 0.003150957158286628, 0.0129828717843509, 0.4923009849815713, 0.8520395972254946, 0.002633147307273081],
[591.2568872854881, 1269.034200717795, 0, 1, 0.3178303068258555, 0, 0.0007880008272703578, 0.007014260120528598, 0.6821696931741446, 1, 0.0005231710656578562],
[590.8035454237604, 1269.487542579523, 0, 1, 0.3175866127799875, 0, 0.0007877194272958831, 0.007011755284809437, 0.6824133872200124, 1, 0.0005253988225473985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[591.2442375983439, 1269.04685040494, 0, 1, 0.3178235069829569, 0, 0.0007879929725848265, 0.007014190203333623, 0.6821764930170431, 1, 0.000524587383009373],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.7972205801883, 1269.493867423095, 0, 1, 0.3175832128585381, 0, 0.0007877155027380067, 0.007011720351001184, 0.6824167871414619, 1, 0.0005241438038556564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3426628691204, 1269.849999863387, 0, 1, 0.3173556560544347, 0, 0.000787494586059442, 0.007009753897420439, 0.6826443439455654, 1, 0.0005244852906641995],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.000524527490215798],
[590.2639363376961, 1270.027151665587, 0, 1, 0.3172965457633017, 0, 0.0007873847410967097, 0.007008776130500824, 0.6827034542366983, 1, 0.0005243351837769301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3881051580524, 1269.902982845231, 0, 1, 0.3173632927477694, 0, 0.0007874617301547631, 0.007009461435973778, 0.6826367072522306, 1, 0.0005241348653432995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2404672518877, 1270.050620751396, 0, 1, 0.317283929949594, 0, 0.000787370191125432, 0.007008646616317899, 0.682716070050406, 1, 0.0005244298589926073],
[590.289679887276, 1270.001408116007, 0, 1, 0.3173103842156524, 0, 0.0007874007017704468, 0.007008918201820316, 0.6826896157843476, 1, 0.0005243708326535697],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 1, 0, 0.317336838481711, 0.001693942263784709, 0, -0.01507834923029398, 1, 0.317336838481711, 0.000524280746747473],
[590.3514830257893, 1269.994195281056, 0, 1, 0.3173342943248512, 0, 0.0007874051737525423, 0.007008958008435469, 0.6826657056751488, 1, 0.0005243364761244565],
[590.8388925226642, 1269.452195480619, 0, 1, 0.3176056136229909, 0, 0.0007877413608484851, 0.007011950522730507, 0.682394386377009, 1, 0.0005241734698327051],
[590.296004730848, 1269.995083272435, 0, 1, 0.3173137841371018, 0, 0.0007874046231921381, 0.007008953107712331, 0.6826862158628982, 1, 0.0005243148580817223],
[590.296004730848, 1269.995083272435, 0, 1, 0.3173137841371018, 0, 0.0007874046231921381, 0.007008953107712331, 0.6826862158628982, 1, 0.0005243148580985716],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 1, 0.317336838481711, 0, 0.0007874312147801324, 0.007009189808371461, 0.682663161518289, 1, 0.0005242409365739476],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 1, 0.317336838481711, 0, 0.0007874312147801324, 0.007009189808371461, 0.682663161518289, 1, 0.0005243148599516395],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 1, 0.317336838481711, 0, 0.0007874312147801324, 0.007009189808371461, 0.682663161518289, 1, 0.0005241734698777238],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 1, 0, 0.317336838481711, 0.001693942263784709, 0, -0.01507834923029398, 1, 0.317336838481711, 0.0005242409345037437],
[590.3388925226642, 1269.925940477726, 0, 1, 0.3173413172416513, 0, 0.0007874474944765804, 0.00700933471941929, 0.6826586827583487, 1, 0.0005241734719793905],
[590.3388925226642, 1270.001408116007, 0, 1, 0.317328443790631, 0, 0.0007874007017704468, 0.007008918201820316, 0.682671556209369, 1, 0.0005244985269866377],
[590.2639363376961, 1270.027151665587, 0, 1, 0.3172965457633017, 0, 0.0007873847410967097, 0.007008776130500824, 0.6827034542366983, 1, 0.0005243186126904956],
[589.9664219388228, 1270.324666064461, 0, 1, 0.3171366168141217, 0, 0.0007872003328865981, 0.007007134651064102, 0.6828633831858784, 1, 0.0005243223650359359],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.9664219388228, 1270.324666064461, 0, 1, 0.3171366168141217, 0, 0.0007872003328865981, 0.007007134651064102, 0.6828633831858784, 1, 0.000524592555361846],
[590.3426628691204, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173388652325138, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826611347674862, 1, 0.0005241922414815626],
[590.3646360722439, 1269.926451931039, 1, 0, 0.3173506769340616, 0.001693868397424856, 0, -0.01507769172100689, 1, 0.3173506769340616, 0.0005244985269834812],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 1, 0, 0.317336838481711, 0.001693942263784709, 0, -0.01507834923029398, 1, 0.317336838481711, 0.0005243148602008354],
[590.296004730848, 1269.995083272435, 0, 1, 0.3173137841371018, 0, 0.0007874046231921381, 0.007008953107712331, 0.6826862158628982, 1, 0.0005245623206697512],
[590.4172093034346, 1269.928469003411, 0, 1, 0.3173696244672068, 0, 0.0007874459266077878, 0.007009320763292385, 0.6826303755327932, 1, 0.0006078996174649437],
[590.3881051580524, 1269.902982845231, 0, 1, 0.3173632927477694, 0, 0.0007874617301547631, 0.007009461435973778, 0.6826367072522306, 1, 0.0005224311241959323],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 0, 0.317336838481711, 0, 0, 0, 1, 1, 1.703464776569788e-06],
[590.3388925226642, 1269.978450483513, 0, 1, 0.3173323598481896, 0, 0.0007874149357568034, 0.00700904490331529, 0.6826676401518104, 1, 0.0005245533001221142],
[590.3426628691204, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173388652325138, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826611347674862, 1, 0.0005244976484551196],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2644279784004, 1270.026660024883, 0, 1, 0.3172968100449012, 0, 0.0007873850459016407, 0.007008778843671924, 0.6827031899550988, 1, 0.0005243238766166193],
[590.3073157702165, 1269.983772233067, 1, 0, 0.3173198643895104, 0.001694032876240451, 0, -0.01507915580220703, 1, 0.3173198643895103, 0.0005241391755309445],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2568872854881, 1270.034200717795, 0, 1, 0.3172927565432955, 0, 0.0007873803708867227, 0.007008737229793401, 0.6827072434567045, 1, 0.000524421592923265],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005241404121495669],
[590.252058324601, 1269.987542579523, 0, 1, 0.317298942586602, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.682701057413398, 1, 0.0005243630072944567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3206896659968, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173314449070457, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173314449070457, 0.0005244637830424875],
[589.8957277410152, 1270.395360262268, 0, 1, 0.3170986151281148, 0, 0.0007871565272353906, 0.007006744722244632, 0.6829013848718852, 1, 0.0005242572988310375],
[590.2807888279817, 1270.064889478864, 0, 1, 0.3172962937539723, 0, 0.0007873613453012804, 0.007008567876665055, 0.6827037062460277, 1, 0.000524578125624825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3073157702165, 1269.983772233067, 1, 0, 0.3173198643895104, 0.001694032876240451, 0, -0.01507915580220703, 1, 0.3173198643895103, 0.0005244378846497432],
[589.5977217014376, 1270.693366301846, 0, 1, 0.3169384218973353, 0, 0.000786971921408816, 0.007005101483757378, 0.6830615781026647, 1, 0.0005243193410247056],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.6014920478938, 1270.68959595539, 0, 1, 0.3169404486481382, 0, 0.0007869742564848286, 0.007005122269053517, 0.6830595513518618, 1, 0.0005240980494273986],
[589.546901744332, 1270.770441261845, 0, 1, 0.3169066309899872, 0, 0.0007869241898694336, 0.007004676609288221, 0.6830933690100127, 1, 0.0005240905309789465],
[589.6014920478938, 1270.68959595539, 0, 1, 0.3169404486481382, 0, 0.0007869742564848286, 0.007005122269053517, 0.6830595513518618, 1, 0.0005241644314551365],
[589.6014920478938, 1270.640383320002, 0, 1, 0.3169488332969011, 0, 0.0007870047364519795, 0.00700539358148196, 0.683051166703099, 1, 0.0005241644314496193],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157273, 0, 0.0007872050057638287, 0.007007176245914351, 0.6828593296842727, 1, 0.0005240675993057291],
[589.425836128378, 1270.801115088602, 1, 0, 0.3168569489560236, 0.00169656628316204, 0, -0.01510170650840454, 1, 0.3168569489560236, 0.0005242496428824561],
[588.5417277886721, 1268.699242906229, 1, 0.5, 0.3168903427585191, 0.001699114867789069, 0.0003941044363316889, -0.0116163363152216, 0.9574601252277559, 0.4354068072224798, 0.0005249952720301573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.5298964587281, 1270.777900064707, 0, 1, 0.3168991161357537, 0, 0.000786919571035254, 0.007004635495493326, 0.6831008838642463, 1, 0.000524635950338352],
[589.4515796779577, 1270.775371539022, 1, 0, 0.3168707878854956, 0.001696492187782994, 0, -0.01510104696054066, 1, 0.3168707878854956, 0.0005246876811193035],
[589.4515796779577, 1270.775371539022, 1, 0, 0.3168707878854956, 0.001696492187782994, 0, -0.01510104696054066, 1, 0.3168707878854956, 0.0005246876828360196],
[589.8240502617991, 1270.40290095518, 0, 1, 0.3170710164563147, 0, 0.0007871518549336812, 0.007006703132517291, 0.6829289835436853, 1, 0.0005244647096375819],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.00052410202754687],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.4563628574469, 1267.79183735402, 1, 0, 0.3173815771044124, 0.001696478421494007, 0, -0.01510092442217712, 1, 0.3173815771044124, 0.0005247708673568062],
[589.4213894005445, 1267.869698602739, 0, 1, 0.3173554179028626, 0, 0.000788724583529407, 0.007020702518162135, 0.6826445820971374, 1, 0.0005248340555224657],
[589.5354630308725, 1267.755624972411, 1, 0, 0.3174168372630614, 0.001696250798652349, 0, -0.01509889827478551, 1, 0.3174168372630615, 0.0005250601825236646],
[589.4963455855125, 1267.794742417771, 0, 1, 0.3173957757043146, 0, 0.0007887712155146913, 0.00702111760513083, 0.6826042242956853, 1, 0.0005256624684638289],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.0838922736056, 1268.23926412283, 0, 1, 0.3171682268887133, 0, 0.0007884947488135405, 0.007018656682135034, 0.6828317731112867, 1, 0.0005247853558535013],
[589.4213894005445, 1267.869698602739, 0, 1, 0.3173554179028627, 0, 0.0007887245835294071, 0.007020702518162136, 0.6826445820971373, 1, 0.000525086486890877],
[589.4963455855125, 1267.794742417771, 0, 1, 0.3173957757043146, 0, 0.0007887712155146913, 0.00702111760513083, 0.6826042242956853, 1, 0.0005250188087632887],
[589.4234064729158, 1267.813091226806, 0, 1, 0.3173658320859759, 0, 0.0007887597997843237, 0.007021015989879306, 0.6826341679140242, 1, 0.0005250864869027639],
[589.5392333773286, 1267.751854625955, 0, 1, 0.3174188672875851, 0, 0.0007887978994872354, 0.007021355128135878, 0.6825811327124149, 1, 0.0005250188105007698],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005248619661227125],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005252559206700627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005242956724619834],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.000524285812435698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.1987953094118, 1270.092292693872, 0, 1, 0.3172615291851413, 0, 0.0007873443573765773, 0.007008416661439573, 0.6827384708148587, 1, 0.0005244210622651385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2480079448001, 1270.043080058483, 1, 0, 0.3172879834511997, 0.001694203091818854, 0, -0.01508067094826039, 1, 0.3172879834511997, 0.0005245134156932552],
[590.2480079448001, 1270.043080058483, 1, 0, 0.3172879834511997, 0.001694203091818854, 0, -0.01508067094826039, 1, 0.3172879834511997, 0.0005263834614907134],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005244015765885927],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005243407053531128],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242809028653883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3206896659967, 1269.983772233067, 1, 0, 0.3173247722382909, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173247722382909, 0.0005241742035470193],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005241318585037676],
[590.3822719551845, 1269.908816048099, 1, 1, 0.3173601571079195, 0.001693817798234818, 0.0007874581130257499, -0.008067812081922629, 0.8992825306804368, 0.5340028448962755, 0.001049389684867526],
[590.3956458509648, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173673462493751, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826326537506249, 1, 0.0005240092298605386],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005244245834366922],
[590.3206896659968, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0005244985269792388],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243570957983285],
[590.4339799036695, 1269.911698403176, 0, 1, 0.3173786392435629, 0, 0.0007874563257094406, 0.007009413329190146, 0.6826213607564371, 1, 0.0005243709145709871],
[590.2734941029797, 1269.963003596742, 0, 1, 0.3173109950443845, 0, 0.0007874245132872667, 0.007009130156131859, 0.6826890049556155, 1, 0.0005244320985770702],
[590.6439476144499, 1269.621396839254, 0, 1, 0.3175052147132816, 0, 0.0007876363792304688, 0.007011016046076224, 0.6824947852867185, 1, 0.0005244985290939478],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269708075],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244245834208674],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985291197561],
[589.973962631735, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157273, 0, 0.0007872050057638287, 0.007007176245914351, 0.6828593296842727, 1, 0.0005244985269429219],
[590.3590237187017, 1270.012909591037, 0, 1, 0.3173338691841096, 0, 0.0007873935709220585, 0.007008854727742948, 0.6826661308158903, 1, 0.0005240705712609322],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244321006923589],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157273, 0, 0.0007872050057638287, 0.007007176245914351, 0.6828593296842727, 1, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.9709097906, 0, 1, 0.3173364132925875, 0, 0.0007874196111821848, 0.007009086520847487, 0.6826635867074125, 1, 0.0005244245813074502],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270006093],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985271706322],
[590.473962631735, 1269.817125371548, 0, 1, 0.3174094454570073, 0, 0.0007875149736285058, 0.007009935374022607, 0.6825905545429927, 1, 0.0005243570957697921],
[590.4739626317352, 1269.87171567511, 0, 1, 0.3174001313396458, 0, 0.0007874811192785436, 0.007009634025079016, 0.6825998686603542, 1, 0.0005243709158172174],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005242880978568317],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005243570957682667],
[590.3206896659968, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173314449070457, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173314449070457, 0.000524498527196277],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985270094635],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005244985290950339],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005243570957540314],
[590.4247499963469, 1269.947183313392, 0, 1, 0.317369198827859, 0, 0.000787434322576252, 0.007009217471908897, 0.682630801172141, 1, 0.0005239772199389434],
[590.9722148340662, 1269.345620960778, 0, 1, 0.317672713481009, 0, 0.0007878074997754292, 0.007012539247540969, 0.682327286518991, 1, 0.000524456445528299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.6839303425155, 1269.620531556548, 0, 1, 0.3175200309628483, 0, 0.0007876369160271891, 0.007011020824284187, 0.6824799690371517, 1, 0.0005241769903673165],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005240729184223304],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270006093],
[590.3464332155766, 1269.9709097906, 0, 1, 0.3173364132925875, 0, 0.0007874196111821848, 0.007009086520847487, 0.6826635867074125, 1, 0.0005244245809580054],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985270006093],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005243570957864828],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242805789266443],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005240785997066036],
[590.3206896659967, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0005246224838736083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005241819000700896],
[590.3206896659967, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0005241238121742365],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005244985270037665],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005243570957527713],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985291109036],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005244985269746205],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.863809481252, 1, 0, 0.3173546837156028, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173546837156027, 0.000524334389712852],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005241044878091441],
[590.3502035620327, 1269.940884441251, 0, 1, 0.3173429187341195, 0, 0.0007874382282290098, 0.007009252237436338, 0.6826570812658805, 1, 0.000524357095669134],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985290939478],
[590.3206896659968, 1269.970398337286, 1, 0, 0.317327053530966, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.317327053530966, 0.0005244985270006093],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356673, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356672, 0.0005242805787177556],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.0005244985269834812],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358638, 0.007009503058452618, 0.6826507127742056, 1, 0.0005246337488551687],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243646128479167],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005242805789044966],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270138045],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269834812],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.000524280578910944],
[590.3206896659967, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173314449070456, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173314449070457, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005241693971346392],
[590.3956458509647, 1269.908816048099, 1, 1, 0.3173650646670321, 0.001693779429146456, 0.0007874581130257498, -0.008067470545775654, 0.8992794157288906, 0.5340095450629547, 0.001049177228708343],
[590.4213894005445, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173811847017258, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826188152982742, 1, 0.0005240792553689429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.4213894005445, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173811847017258, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826188152982742, 1, 0.0005243111601158681],
[590.3572526142409, 1269.835410118266, 0, 1, 0.3173634991910155, 0, 0.0007875036339606131, 0.007009834435828728, 0.6826365008089845, 1, 0.0005242749250140838],
[590.3572526142409, 1269.803341725114, 0, 1, 0.3173689704054338, 0, 0.0007875235220608508, 0.00701001146649106, 0.6826310295945662, 1, 0.0005245614685739588],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.1026260071835, 1270.090036725323, 1, 0, 0.3172266173442269, 0.001694620487907855, 0, -0.0150843863310877, 1, 0.3172266173442269, 0.0005245441338667471],
[591.0105255799792, 1269.63292451714, 0, 1, 0.3176377105184395, 0, 0.0007876292278575833, 0.00701095238930341, 0.6823622894815604, 1, 0.0005247598662539393],
[590.3930913538489, 1269.799571378658, 1, 0, 0.3173827653349618, 0.001693786757746214, 0, -0.01507696501879753, 1, 0.3173827653349618, 0.0005242736564369271],
[590.4322087992089, 1269.841299239753, 1, 0, 0.317390000044468, 0.001693674540611105, 0, -0.01507596613637458, 1, 0.317390000044468, 0.0005241623292858059],
[589.5862635165781, 1267.594145477374, 0, 1.5, 0.3174631073326695, 0, 0.001183344057995079, 0.01053334304687423, 0.5638832529140265, 1, 0.0005243132177648087],
[590.0597382153675, 1270.13292451714, 0, 1, 0.3172035617797818, 0, 0.0007873191700625864, 0.007008192460695163, 0.6827964382202183, 1, 0.0005242681228175694],
[590.3893210073927, 1269.803341725114, 0, 1, 0.3173807384769208, 0, 0.0007875235220608508, 0.00701001146649106, 0.6826192615230793, 1, 0.000524310337587667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.000524044895879371],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.0005244770363078606],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.000524195809017184],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.0005241099009597436]
],
"NAMES": [
["epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1"],
["epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1"],
["epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1"],
["epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2"],
["epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1"],
["Node448"],
["epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1"],
["epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2"],
["epi_isl_418751_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3"],
["epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2"],
["epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1"],
["epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1"],
["epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1"],
["epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1"],
["epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1"],
["epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4"],
["Node437"],
["epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1"],
["epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1"],
["epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4"],
["epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_3"],
["epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1"],
["epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1"],
["epi_isl_418710_England_20200316_null_2"],
["epi_isl_418722_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2"],
["epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1"],
["epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1"],
["epi_isl_420509_England_20200323_null_1"],
["epi_isl_420510_England_20200323_null_1"],
["Node426"],
["epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1"],
["epi_isl_420734_England_20200327_null_3"],
["epi_isl_420738_England_20200327_null_6"],
["epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1"],
["epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1"],
["epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1"],
["epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1"],
["epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1"],
["epi_isl_406034_California_20200123_null_1"],
["epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1"],
["epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1"],
["epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1"],
["epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1"],
["epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1"],
["epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_5"],
["epi_isl_420306_Alaska_20200318_null_1"],
["epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2"],
["epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1"],
["epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1"],
["Node363"],
["epi_isl_414525_England_20200302_null_1"],
["epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1"],
["epi_isl_420527_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1"],
["epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_418687_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1"],
["epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1"],
["epi_isl_420477_England_20200318_null_6"],
["epi_isl_420526_England_20200327_null_1"],
["Node158"],
["epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1"],
["epi_isl_414483_USA_20200217_null_1"],
["epi_isl_420769_England_20200331_null_1"],
["epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1"],
["epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_2828"],
["epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1"],
["epi_isl_420511_England_20200323_null_7"],
["epi_isl_420910_England_20200325_null_1"],
["Node169"],
["epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1"],
["epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1"],
["epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1"],
["epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2"],
["Node258"],
["epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2"],
["epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1"],
["epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1"],
["Node254"],
["epi_isl_413609_USA_20200221_null_1"],
["epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1"],
["Node251"],
["epi_isl_421348_New_York_20200317_null_1"],
["epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1"],
["epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1"],
["epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1"],
["epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1"],
["Node235"],
["epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_520"],
["epi_isl_417939_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_417938_California_20200318_null_1"],
["epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1"],
["epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_421354_New_York_20200313_null_4"],
["epi_isl_421418_New_York_20200318_null_6"],
["epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3"],
["epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1"],
["epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2"],
["epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1"],
["epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1"],
["epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1"],
["epi_isl_420702_England_20200327_null_2"],
["epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1"],
["epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1"],
["epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6"],
["Node213"],
["epi_isl_420761_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4"],
["epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1"],
["epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1"],
["epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1"],
["epi_isl_420825_Utah_20200325_null_5"],
["Node243"],
["epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1"],
["Node187"],
["epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1"],
["epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1"],
["Node248"],
["epi_isl_418730_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1"],
["Node262"],
["epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_69"],
["Node265"],
["epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7"],
["epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1"],
["epi_isl_421200_Li_ge_20200331_null_11"],
["Node294"],
["epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6"],
["epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_46"],
["epi_isl_420539_Western_Australia_20200314_null_3"],
["epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1"],
["epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1"],
["epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8"],
["Node270"],
["epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2"],
["epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_420840_SudKivu_20200320_null_13"],
["epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1"],
["epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1"],
["epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1"],
["Node282"],
["epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1"],
["Node281"],
["epi_isl_420458_England_20200311_null_1"],
["epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1"],
["epi_isl_420944_Wales_20200321_null_1"],
["epi_isl_420640_England_20200323_null_2"],
["epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1"],
["epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_110"],
["epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1"],
["epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5"],
["epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1"],
["epi_isl_418741_England_20200318_null_2"],
["epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1"],
["Node300"],
["epi_isl_420943_Wales_20200321_null_5"],
["epi_isl_421250_Jiangxi_20200203_null_6"],
["epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1"],
["Node321"],
["epi_isl_414482_USA_20200218_null_1"],
["epi_isl_418691_England_20200317_null_1"],
["epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1"],
["epi_isl_421461_Portugal_20200320_null_99"],
["epi_isl_420488_England_20200320_null_1"],
["epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1"],
["epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1"],
["Node328"],
["epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1"],
["epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1"],
["Node339"],
["epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1"],
["epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1"],
["epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2"],
["Node349"],
["epi_isl_417232_England_20200304_null_1"],
["epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1"],
["epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1"],
["epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1"],
["epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1"],
["epi_isl_420485_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1"],
["epi_isl_420656_England_20200325_null_1"],
["epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5"],
["epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1"],
["epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1"],
["epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1"],
["epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1"],
["epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3"],
["epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1"],
["epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1"],
["epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1"],
["epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1"],
["epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3"],
["epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1"],
["epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5"],
["epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1"],
["epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4"],
["epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2"],
["epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1"],
["epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2"],
["epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9"],
["epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2"],
["epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2"],
["Node20"],
["epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2"],
["epi_isl_413693_China_20200101_null_1"],
["epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4"],
["epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3"],
["epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1"],
["epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1"],
["epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12"],
["epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1"],
["epi_isl_420729_England_20200328_null_1"],
["Node37"],
["epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5"],
["epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1"],
["epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1"],
["epi_isl_421365_New_York_20200314_null_5"],
["epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2"],
["epi_isl_421212_Li_ge_20200331_null_1"],
["epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1"],
["epi_isl_418729_England_20200318_null_3"],
["epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2"],
["epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5"],
["epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1"],
["epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1"],
["epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1"],
["epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1"],
["epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2"],
["epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1"],
["epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1"],
["epi_isl_420489_England_20200320_null_2"],
["epi_isl_420500_England_20200322_null_1"],
["epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1"],
["epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1"],
["epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1"],
["epi_isl_416675_USA_20200311_null_1"],
["epi_isl_420693_England_20200328_null_27"],
["Node69"],
["epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3"],
["epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5"],
["epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_139"],
["epi_isl_420746_England_20200325_null_2"],
["epi_isl_420694_England_20200328_null_2"],
["epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1"],
["epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1"],
["epi_isl_418765_England_20200318_null_1"],
["epi_isl_420983_Wales_20200323_null_2"],
["Node75"],
["epi_isl_420492_England_20200320_null_17"],
["Node74"],
["epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1"],
["epi_isl_421463_Portugal_20200320_null_4"],
["Node94"],
["epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1"]
],
"RESOLVED": [
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.000524280578910944],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.0005244985269834812],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172582, 0, 0.0007874053770267952, 0.007008959817847892, 0.6826855622827418, 1, 0.0005244985270038641],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005244985291267329],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270025062],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3956458509648, 1269.887901459406, 0, 1, 0.3173686327036374, 0, 0.0007874710821724971, 0.007009544681425772, 0.6826313672963626, 1, 0.0005242726280433731],
[590.3464332155766, 1269.940884441251, 0, 1, 0.3173415351555278, 0, 0.0007874382282290097, 0.007009252237436337, 0.6826584648444722, 1, 0.0005242027429990842],
[590.8318256400803, 1270.284168987017, 0, 1, 0.3174610434522983, 0, 0.0007872254290923313, 0.0070073580408233, 0.6825389565477017, 1, 0.000524913962655474],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005243570956663491],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157275, 0, 0.0007872050057638288, 0.007007176245914353, 0.6828593296842725, 1, 0.0005244985269823945],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005243570956663491],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005242805789378355],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005242805789266443],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985269834812],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985290950339],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157275, 0, 0.0007872050057638288, 0.007007176245914353, 0.6828593296842725, 1, 0.0005244985290926877],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985269834812],
[590.6954347136094, 1269.569909740094, 0, 1, 0.3175328920009938, 0, 0.0007876683216324176, 0.007011300376128159, 0.6824671079990061, 1, 0.0005240018305792919],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005240569645454774],
[590.2681164348062, 1269.968381264915, 0, 1, 0.3173081041925063, 0, 0.0007874211789461866, 0.007009100476041613, 0.6826918958074937, 1, 0.0005243504399410822],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244245809592742],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005244985290737734],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005242805789611265],
[589.9339799036695, 1270.389176492766, 0, 1, 0.3171137110642698, 0, 0.0007871603588128449, 0.007006778828402908, 0.6828862889357302, 1, 0.0005240705690848085],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244321006923589],
[590.3206896659967, 1269.970398337286, 1, 0, 0.317327053530966, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.317327053530966, 0.0005244985270006093],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985270082032],
[590.306450487511, 1269.984637515772, 1, 0, 0.3173193992565475, 0.001694035359386873, 0, -0.01507917790552763, 1, 0.3173193992565475, 0.0005244245809580054],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242805789321469],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172582, 0, 0.0007874053770267952, 0.007008959817847892, 0.6826855622827418, 1, 0.0005244245812903562],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172582, 0, 0.0007874053770267952, 0.007008959817847892, 0.6826855622827418, 1, 0.0005244669573834046],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242776338799424],
[590.2972205801883, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173221891098736, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826778108901264, 1, 0.0005240866262032845],
[590.306450487511, 1269.984637515772, 1, 0, 0.3173193992565475, 0.001694035359386873, 0, -0.01507917790552763, 1, 0.3173193992565475, 0.0005244245813116977],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985269834812],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005242805789321469],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244900837908154],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243646128845376],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269676515],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244245809580054],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243570957540314],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.000524291235980993],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 2, 0.3173144377172582, 0, 0.00157481075405359, 0.01401791963569578, 0.4660595769493033, 1, 0.001049500842892937],
[590.2734941029797, 1270.017593900304, 0, 1, 0.3173016835427306, 0, 0.0007873906667142598, 0.00700882887641356, 0.6826983164572694, 1, 0.0005244245834379601],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243570957697921],
[590.2972205801883, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173221891098736, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826778108901264, 1, 0.0005244985269460787],
[590.3721767651564, 1269.905537342347, 1, 0, 0.3173570119601183, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699366, 1, 0.3173570119601183, 0.0005242805791669286],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985290894313],
[590.294946116417, 1269.996141886866, 0, 0, 0.3173132150786153, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002021815211553752],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3206896659967, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0003220796386175657],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.0005244271012632142],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3590237187016, 1270.382851649194, 0, 1, 0.3172707786790573, 0, 0.0007871642778409782, 0.007006813712989061, 0.6827292213209426, 1, 0.0005242307711016086],
[590.3873039350216, 1269.930039071155, 0, 4, 0.317358383049306, 0, 0.003149779812221511, 0.02803724838950114, 0.2171556059441088, 1, 0.002120059411126014],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.8676230260451, 1269.45553337039, 1, 4, 0.317615582537065, 0.001692426460733525, 0.003150957158286628, 0.0129828717843509, 0.4923009849815713, 0.8520395972254946, 0.002633147307273081],
[591.2568872854881, 1269.034200717795, 0, 1, 0.3178303068258555, 0, 0.0007880008272703578, 0.007014260120528598, 0.6821696931741446, 1, 0.0005231710656578562],
[590.8035454237604, 1269.487542579523, 0, 1, 0.3175866127799875, 0, 0.0007877194272958831, 0.007011755284809437, 0.6824133872200124, 1, 0.0005253988225473985],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[591.2442375983439, 1269.04685040494, 0, 1, 0.3178235069829569, 0, 0.0007879929725848265, 0.007014190203333623, 0.6821764930170431, 1, 0.000524587383009373],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.7972205801883, 1269.493867423095, 0, 1, 0.3175832128585381, 0, 0.0007877155027380067, 0.007011720351001184, 0.6824167871414619, 1, 0.0005241438038556564],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3426628691204, 1269.849999863387, 0, 1, 0.3173556560544347, 0, 0.000787494586059442, 0.007009753897420439, 0.6826443439455654, 1, 0.0005244852906641995],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.000524527490215798],
[590.2639363376961, 1270.027151665587, 0, 1, 0.3172965457633017, 0, 0.0007873847410967097, 0.007008776130500824, 0.6827034542366983, 1, 0.0005243351837769301],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3881051580524, 1269.902982845231, 0, 1, 0.3173632927477694, 0, 0.0007874617301547631, 0.007009461435973778, 0.6826367072522306, 1, 0.0005241348653432995],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2404672518877, 1270.050620751396, 0, 1, 0.317283929949594, 0, 0.000787370191125432, 0.007008646616317899, 0.682716070050406, 1, 0.0005244298589926073],
[590.289679887276, 1270.001408116007, 0, 1, 0.3173103842156524, 0, 0.0007874007017704468, 0.007008918201820316, 0.6826896157843476, 1, 0.0005243708326535697],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 1, 0, 0.317336838481711, 0.001693942263784709, 0, -0.01507834923029398, 1, 0.317336838481711, 0.000524280746747473],
[590.3514830257893, 1269.994195281056, 0, 1, 0.3173342943248512, 0, 0.0007874051737525423, 0.007008958008435469, 0.6826657056751488, 1, 0.0005243364761244565],
[590.8388925226642, 1269.452195480619, 0, 1, 0.3176056136229909, 0, 0.0007877413608484851, 0.007011950522730507, 0.682394386377009, 1, 0.0005241734698327051],
[590.296004730848, 1269.995083272435, 0, 1, 0.3173137841371018, 0, 0.0007874046231921381, 0.007008953107712331, 0.6826862158628982, 1, 0.0005243148580817223],
[590.296004730848, 1269.995083272435, 0, 1, 0.3173137841371018, 0, 0.0007874046231921381, 0.007008953107712331, 0.6826862158628982, 1, 0.0005243148580985716],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 1, 0.317336838481711, 0, 0.0007874312147801324, 0.007009189808371461, 0.682663161518289, 1, 0.0005242409365739476],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 1, 0.317336838481711, 0, 0.0007874312147801324, 0.007009189808371461, 0.682663161518289, 1, 0.0005243148599516395],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 1, 0.317336838481711, 0, 0.0007874312147801324, 0.007009189808371461, 0.682663161518289, 1, 0.0005241734698777238],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 1, 0, 0.317336838481711, 0.001693942263784709, 0, -0.01507834923029398, 1, 0.317336838481711, 0.0005242409345037437],
[590.3388925226642, 1269.925940477726, 0, 1, 0.3173413172416513, 0, 0.0007874474944765804, 0.00700933471941929, 0.6826586827583487, 1, 0.0005241734719793905],
[590.3388925226642, 1270.001408116007, 0, 1, 0.317328443790631, 0, 0.0007874007017704468, 0.007008918201820316, 0.682671556209369, 1, 0.0005244985269866377],
[590.2639363376961, 1270.027151665587, 0, 1, 0.3172965457633017, 0, 0.0007873847410967097, 0.007008776130500824, 0.6827034542366983, 1, 0.0005243186126904956],
[589.9664219388228, 1270.324666064461, 0, 1, 0.3171366168141217, 0, 0.0007872003328865981, 0.007007134651064102, 0.6828633831858784, 1, 0.0005243223650359359],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.9664219388228, 1270.324666064461, 0, 1, 0.3171366168141217, 0, 0.0007872003328865981, 0.007007134651064102, 0.6828633831858784, 1, 0.000524592555361846],
[590.3426628691204, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173388652325138, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826611347674862, 1, 0.0005241922414815626],
[590.3646360722439, 1269.926451931039, 1, 0, 0.3173506769340616, 0.001693868397424856, 0, -0.01507769172100689, 1, 0.3173506769340616, 0.0005244985269834812],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 1, 0, 0.317336838481711, 0.001693942263784709, 0, -0.01507834923029398, 1, 0.317336838481711, 0.0005243148602008354],
[590.296004730848, 1269.995083272435, 0, 1, 0.3173137841371018, 0, 0.0007874046231921381, 0.007008953107712331, 0.6826862158628982, 1, 0.0005245623206697512],
[590.4172093034346, 1269.928469003411, 0, 1, 0.3173696244672068, 0, 0.0007874459266077878, 0.007009320763292385, 0.6826303755327932, 1, 0.0006078996174649437],
[590.3881051580524, 1269.902982845231, 0, 1, 0.3173632927477694, 0, 0.0007874617301547631, 0.007009461435973778, 0.6826367072522306, 1, 0.0005224311241959323],
[590.3388925226642, 1269.952195480619, 0, 0, 0.317336838481711, 0, 0, 0, 1, 1, 1.703464776569788e-06],
[590.3388925226642, 1269.978450483513, 0, 1, 0.3173323598481896, 0, 0.0007874149357568034, 0.00700904490331529, 0.6826676401518104, 1, 0.0005245533001221142],
[590.3426628691204, 1269.948425134163, 0, 1, 0.3173388652325138, 0, 0.0007874335525825433, 0.007009210617936189, 0.6826611347674862, 1, 0.0005244976484551196],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2644279784004, 1270.026660024883, 0, 1, 0.3172968100449012, 0, 0.0007873850459016407, 0.007008778843671924, 0.6827031899550988, 1, 0.0005243238766166193],
[590.3073157702165, 1269.983772233067, 1, 0, 0.3173198643895104, 0.001694032876240451, 0, -0.01507915580220703, 1, 0.3173198643895103, 0.0005241391755309445],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2568872854881, 1270.034200717795, 0, 1, 0.3172927565432955, 0, 0.0007873803708867227, 0.007008737229793401, 0.6827072434567045, 1, 0.000524421592923265],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005241404121495669],
[590.252058324601, 1269.987542579523, 0, 1, 0.317298942586602, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.682701057413398, 1, 0.0005243630072944567],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3206896659968, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173314449070457, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173314449070457, 0.0005244637830424875],
[589.8957277410152, 1270.395360262268, 0, 1, 0.3170986151281148, 0, 0.0007871565272353906, 0.007006744722244632, 0.6829013848718852, 1, 0.0005242572988310375],
[590.2807888279817, 1270.064889478864, 0, 1, 0.3172962937539723, 0, 0.0007873613453012804, 0.007008567876665055, 0.6827037062460277, 1, 0.000524578125624825],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3073157702165, 1269.983772233067, 1, 0, 0.3173198643895104, 0.001694032876240451, 0, -0.01507915580220703, 1, 0.3173198643895103, 0.0005244378846497432],
[589.5977217014376, 1270.693366301846, 0, 1, 0.3169384218973353, 0, 0.000786971921408816, 0.007005101483757378, 0.6830615781026647, 1, 0.0005243193410247056],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.6014920478938, 1270.68959595539, 0, 1, 0.3169404486481382, 0, 0.0007869742564848286, 0.007005122269053517, 0.6830595513518618, 1, 0.0005240980494273986],
[589.546901744332, 1270.770441261845, 0, 1, 0.3169066309899872, 0, 0.0007869241898694336, 0.007004676609288221, 0.6830933690100127, 1, 0.0005240905309789465],
[589.6014920478938, 1270.68959595539, 0, 1, 0.3169404486481382, 0, 0.0007869742564848286, 0.007005122269053517, 0.6830595513518618, 1, 0.0005241644314551365],
[589.6014920478938, 1270.640383320002, 0, 1, 0.3169488332969011, 0, 0.0007870047364519795, 0.00700539358148196, 0.683051166703099, 1, 0.0005241644314496193],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157273, 0, 0.0007872050057638287, 0.007007176245914351, 0.6828593296842727, 1, 0.0005240675993057291],
[589.425836128378, 1270.801115088602, 1, 0, 0.3168569489560236, 0.00169656628316204, 0, -0.01510170650840454, 1, 0.3168569489560236, 0.0005242496428824561],
[588.5416275779303, 1268.699343116971, 1, 0, 0.3168902888017395, 0.001699115157096662, 0, -0.01512439489168176, 1, 0.3168902888017395, 0.0005249952720301573],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.5298964587281, 1270.777900064707, 0, 1, 0.3168991161357537, 0, 0.000786919571035254, 0.007004635495493326, 0.6831008838642463, 1, 0.000524635950338352],
[589.4515796779577, 1270.775371539022, 1, 0, 0.3168707878854956, 0.001696492187782994, 0, -0.01510104696054066, 1, 0.3168707878854956, 0.0005246876811193035],
[589.4515796779577, 1270.775371539022, 1, 0, 0.3168707878854956, 0.001696492187782994, 0, -0.01510104696054066, 1, 0.3168707878854956, 0.0005246876828360196],
[589.8240502617991, 1270.40290095518, 0, 1, 0.3170710164563147, 0, 0.0007871518549336812, 0.007006703132517291, 0.6829289835436853, 1, 0.0005244647096375819],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.00052410202754687],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.4563628574469, 1267.79183735402, 1, 0, 0.3173815771044124, 0.001696478421494007, 0, -0.01510092442217712, 1, 0.3173815771044124, 0.0005247708673568062],
[589.4213894005445, 1267.869698602739, 0, 1, 0.3173554179028626, 0, 0.000788724583529407, 0.007020702518162135, 0.6826445820971374, 1, 0.0005248340555224657],
[589.5354630308725, 1267.755624972411, 1, 0, 0.3174168372630614, 0.001696250798652349, 0, -0.01509889827478551, 1, 0.3174168372630615, 0.0005250601825236646],
[589.4963455855125, 1267.794742417771, 0, 1, 0.3173957757043146, 0, 0.0007887712155146913, 0.00702111760513083, 0.6826042242956853, 1, 0.0005256624684638289],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[589.0838922736056, 1268.23926412283, 0, 1, 0.3171682268887133, 0, 0.0007884947488135405, 0.007018656682135034, 0.6828317731112867, 1, 0.0005247853558535013],
[589.4213894005445, 1267.869698602739, 0, 1, 0.3173554179028627, 0, 0.0007887245835294071, 0.007020702518162136, 0.6826445820971373, 1, 0.000525086486890877],
[589.4963455855125, 1267.794742417771, 0, 1, 0.3173957757043146, 0, 0.0007887712155146913, 0.00702111760513083, 0.6826042242956853, 1, 0.0005250188087632887],
[589.4234064729158, 1267.813091226806, 0, 1, 0.3173658320859759, 0, 0.0007887597997843237, 0.007021015989879306, 0.6826341679140242, 1, 0.0005250864869027639],
[589.5392333773286, 1267.751854625955, 0, 1, 0.3174188672875851, 0, 0.0007887978994872354, 0.007021355128135878, 0.6825811327124149, 1, 0.0005250188105007698],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005248619661227125],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.0005252559206700627],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005242956724619834],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.000524285812435698],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.1987953094118, 1270.092292693872, 0, 1, 0.3172615291851413, 0, 0.0007873443573765773, 0.007008416661439573, 0.6827384708148587, 1, 0.0005244210622651385],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.2480079448001, 1270.043080058483, 1, 0, 0.3172879834511997, 0.001694203091818854, 0, -0.01508067094826039, 1, 0.3172879834511997, 0.0005245134156932552],
[590.2480079448001, 1270.043080058483, 1, 0, 0.3172879834511997, 0.001694203091818854, 0, -0.01508067094826039, 1, 0.3172879834511997, 0.0005263834614907134],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005244015765885927],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005243407053531128],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242809028653883],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3206896659967, 1269.983772233067, 1, 0, 0.3173247722382909, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173247722382909, 0.0005241742035470193],
[590.3464332155766, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173536790257417, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826463209742583, 1, 0.0005241318585037676],
[590.3822719551845, 1269.908816048099, 1, 1, 0.3173601571079195, 0.001693817798234818, 0.0007874581130257499, -0.008067812081922629, 0.8992825306804368, 0.5340028448962755, 0.001049389684867526],
[590.3956458509648, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173673462493751, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826326537506249, 1, 0.0005240092298605386],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005244245834366922],
[590.3206896659968, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0005244985269792388],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243570957983285],
[590.4339799036695, 1269.911698403176, 0, 1, 0.3173786392435629, 0, 0.0007874563257094406, 0.007009413329190146, 0.6826213607564371, 1, 0.0005243709145709871],
[590.2734941029797, 1269.963003596742, 0, 1, 0.3173109950443845, 0, 0.0007874245132872667, 0.007009130156131859, 0.6826890049556155, 1, 0.0005244320985770702],
[590.6439476144499, 1269.621396839254, 0, 1, 0.3175052147132816, 0, 0.0007876363792304688, 0.007011016046076224, 0.6824947852867185, 1, 0.0005244985290939478],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269708075],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244245834208674],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985291197561],
[589.973962631735, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157273, 0, 0.0007872050057638287, 0.007007176245914351, 0.6828593296842727, 1, 0.0005244985269429219],
[590.3590237187017, 1270.012909591037, 0, 1, 0.3173338691841096, 0, 0.0007873935709220585, 0.007008854727742948, 0.6826661308158903, 1, 0.0005240705712609322],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244321006923589],
[589.9739626317352, 1270.317125371548, 0, 1, 0.3171406703157273, 0, 0.0007872050057638287, 0.007007176245914351, 0.6828593296842727, 1, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.9709097906, 0, 1, 0.3173364132925875, 0, 0.0007874196111821848, 0.007009086520847487, 0.6826635867074125, 1, 0.0005244245813074502],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270006093],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985271706322],
[590.473962631735, 1269.817125371548, 0, 1, 0.3174094454570073, 0, 0.0007875149736285058, 0.007009935374022607, 0.6825905545429927, 1, 0.0005243570957697921],
[590.4739626317352, 1269.87171567511, 0, 1, 0.3174001313396458, 0, 0.0007874811192785436, 0.007009634025079016, 0.6825998686603542, 1, 0.0005243709158172174],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005242880978568317],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005243570957682667],
[590.3206896659968, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173314449070457, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173314449070457, 0.000524498527196277],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985270094635],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005244985290950339],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005243570957540314],
[590.4247499963469, 1269.947183313392, 0, 1, 0.317369198827859, 0, 0.000787434322576252, 0.007009217471908897, 0.682630801172141, 1, 0.0005239772199389434],
[590.9722148340662, 1269.345620960778, 0, 1, 0.317672713481009, 0, 0.0007878074997754292, 0.007012539247540969, 0.682327286518991, 1, 0.000524456445528299],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.6839303425155, 1269.620531556548, 0, 1, 0.3175200309628483, 0, 0.0007876369160271891, 0.007011020824284187, 0.6824799690371517, 1, 0.0005241769903673165],
[590.2972205801883, 1269.993867423095, 0, 1, 0.3173144377172581, 0, 0.0007874053770267951, 0.007008959817847891, 0.6826855622827419, 1, 0.0005240729184223304],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270006093],
[590.3464332155766, 1269.9709097906, 0, 1, 0.3173364132925875, 0, 0.0007874196111821848, 0.007009086520847487, 0.6826635867074125, 1, 0.0005244245809580054],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985270006093],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005243570957864828],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005242805789266443],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005240785997066036],
[590.3206896659967, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0005246224838736083],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005241819000700896],
[590.3206896659967, 1269.970398337287, 1, 0, 0.3173270535309659, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173270535309659, 0.0005241238121742365],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005244985270037665],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005243570957527713],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985291109036],
[590.3035454237604, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173178376387075, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826821623612925, 1, 0.0005244985269746205],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.863809481252, 1, 0, 0.3173546837156028, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173546837156027, 0.000524334389712852],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005241044878091441],
[590.3502035620327, 1269.940884441251, 0, 1, 0.3173429187341195, 0, 0.0007874382282290098, 0.007009252237436338, 0.6826570812658805, 1, 0.000524357095669134],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985290939478],
[590.3206896659968, 1269.970398337286, 1, 0, 0.317327053530966, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.317327053530966, 0.0005244985270006093],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356673, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356672, 0.0005242805787177556],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.0005244985269834812],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358638, 0.007009503058452618, 0.6826507127742056, 1, 0.0005246337488551687],
[590.3864159436421, 1269.904672059641, 1, 0, 0.3173623847100858, 0.001693805909137753, 0, -0.01507713549176821, 1, 0.3173623847100857, 0.0005243646128479167],
[590.3893210073927, 1269.901766995891, 0, 1, 0.3173639463279258, 0, 0.0007874624840987688, 0.007009468147082688, 0.6826360536720741, 1, 0.0005242805789044966],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005244985270138045],
[590.2714770306086, 1270.019610972675, 0, 1, 0.3173005992649075, 0, 0.0007873894161635238, 0.007008817744841292, 0.6826994007350925, 1, 0.0005244985269834812],
[590.3721767651563, 1269.918911238127, 1, 0, 0.3173547304356674, 0.001693846762019392, 0, -0.01507749913699367, 1, 0.3173547304356674, 0.000524280578910944],
[590.3206896659967, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173314449070456, 0.001693994497407502, 0, -0.01507881417932021, 1, 0.3173314449070457, 0.0005244985269708075],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 0, 1, 0.3173408919833166, 0, 0.0007874358903988357, 0.00700923142762448, 0.6826591080166834, 1, 0.0005241693971346392],
[590.3956458509647, 1269.908816048099, 1, 1, 0.3173650646670321, 0.001693779429146456, 0.0007874581130257498, -0.008067470545775654, 0.8992794157288906, 0.5340095450629547, 0.001049177228708343],
[590.4213894005445, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173811847017258, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826188152982742, 1, 0.0005240792553689429],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.4213894005445, 1269.869698602739, 0, 1, 0.3173811847017258, 0, 0.0007874823701205868, 0.007009645159244308, 0.6826188152982742, 1, 0.0005243111601158681],
[590.3572526142409, 1269.835410118266, 0, 1, 0.3173634991910155, 0, 0.0007875036339606131, 0.007009834435828728, 0.6826365008089845, 1, 0.0005242749250140838],
[590.3572526142409, 1269.803341725114, 0, 1, 0.3173689704054338, 0, 0.0007875235220608508, 0.00701001146649106, 0.6826310295945662, 1, 0.0005245614685739588],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.1026260071835, 1270.090036725323, 1, 0, 0.3172266173442269, 0.001694620487907855, 0, -0.0150843863310877, 1, 0.3172266173442269, 0.0005245441338667471],
[591.0105255799792, 1269.63292451714, 0, 1, 0.3176377105184395, 0, 0.0007876292278575833, 0.00701095238930341, 0.6823622894815604, 1, 0.0005247598662539393],
[590.3930913538489, 1269.799571378658, 1, 0, 0.3173827653349618, 0.001693786757746214, 0, -0.01507696501879753, 1, 0.3173827653349618, 0.0005242736564369271],
[590.4322087992089, 1269.841299239753, 1, 0, 0.317390000044468, 0.001693674540611105, 0, -0.01507596613637458, 1, 0.317390000044468, 0.0005241623292858059],
[589.5860886030182, 1267.594320390934, 0, 1, 0.3174630131503493, 0, 0.0007888959298047294, 0.007022227728928675, 0.6825369868496507, 1, 0.0005243132177648087],
[590.0597382153675, 1270.13292451714, 0, 1, 0.3172035617797818, 0, 0.0007873191700625864, 0.007008192460695163, 0.6827964382202183, 1, 0.0005242681228175694],
[590.3893210073927, 1269.803341725114, 0, 1, 0.3173807384769208, 0, 0.0007875235220608508, 0.00701001146649106, 0.6826192615230793, 1, 0.000524310337587667],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.895442152319, 0, 1, 0.3173492872257944, 0, 0.0007874664061358637, 0.007009503058452617, 0.6826507127742056, 1, 0.000524044895879371],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.0005244770363078606],
[0, 0, 0, 0, null, null, null, null, 1, 1, 0],
[590.3464332155766, 1269.944654787707, 1, 0, 0.3173408919833166, 0.001693920626492259, 0, -0.01507815662948406, 1, 0.3173408919833166, 0.000524195809017184],
[590.2714770306086, 1269.987542579523, 0, 1, 0.3173060691055357, 0, 0.0007874092984950542, 0.007008994724154422, 0.6826939308944643, 1, 0.0005241099009597436]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[1.024886792916657, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[0.9240120328085949, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3107191140532112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[1.024886792916657, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[1.024886792916657, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[0.8712435848744335, 2.049773585833315, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9063124276035882, 2.110009247138356, 1, 0, 0.3004694211472409, 1.103372269366464, 0, -9.874921660574724, 1, 0.300469421147241, 0.111734787099288],
[0.9062381692699846, 2.11008350547196, 2, 0, 0.3004448023095932, 2.206925362248966, 0, -19.75146164898389, 1, 0.09026707923485044, 0.111734787099288],
[0.906589112955865, 2.10973256178608, 1, 1, 0.3005611505389015, 1.103035527020147, 0.473993727031169, -5.62977579605543, 0.9096629947867318, 0.5107852958645347, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.097123367185864, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.00520956124256, 2.011112113499386, 0, 1, 0.3332567509824887, 0, 0.4972373212252074, 4.450156787638217, 0.6667432490175113, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972944406296881, 4.450667992840854, 0.6666666666666667, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.161257374806648, 0, 1, 0.2833955887363551, 0, 0.4626936206935848, 4.140998812504413, 0.7166044112636449, 1, 0.111734787099288],
[1.005209728756189, 2.010898801122714, 0, 1, 0.3332803573870561, 0, 0.4972900672284877, 4.45062885193126, 0.6667196426129439, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972944406296881, 4.450667992840854, 0.6666666666666667, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.024356798284318, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9063590299976239, 2.018646344135629, 1, 0, 0.3098657657222935, 1.103315537114053, 0, -9.874413920291827, 1, 0.3098657657222934, 0.111734787099288],
[0.9191983075560806, 2.097123367185864, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7491817000263402, 2.157365364139526, 1, 0, 0.2577566037938367, 1.334789677810925, 0, -11.94605290315563, 1, 0.2577566037938367, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005088478473733, 2.011233196268214, 0, 1, 0.3332166084572927, 0, 0.4972073859239554, 4.44988887375008, 0.6667833915427073, 1, 0.111734787099288],
[1.911920357299481, 1.104401317442465, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.00086573416944, 2.013498700390226, 0, 1, 0.3320320936295963, 0, 0.4966479490680552, 4.444882045792345, 0.6679679063704037, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.157553000669459, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 1.911920357299481, 0, 0, 0.3446404429733944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.018462834985984, 0, 0, 0.3099137017264122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.684107157680025, 1.267728790836543, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945888812593762, 0, -8.901335985681708, 1, 0.3333333333333333, 0.111734787099288],
[0.7495925427705716, 2.104282089344199, 0, 2, 0.2626578386924833, 0, 0.9504429135845096, 8.50623998361354, 0.5436734628416399, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 1.360847812193373, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.911920357299481, 1.104401317442465, 1, 0, 0.6338582430745059, 0.523034338842683, 0, -4.681034012960644, 1, 0.6338582430745059, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9193821268798004, 2.096939547862144, 1, 0, 0.3048024136744156, 1.087687013661883, 0, -9.734542320247675, 1, 0.3048024136744156, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 1, 0.3005249097411728, 0, 0.4739691687430682, 4.241912309027781, 0.6994750902588271, 1, 0.111734787099288],
[1.005239212541224, 2.011082462200722, 0, 1, 0.3332665812664775, 0, 0.4972446524672602, 4.450222400526048, 0.6667334187335225, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.077152487816543, 0, 0, 0.2853539124051121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9757241176166227, 2.040341335153615, 0, 1, 0.3235089333755758, 0, 0.4901140719793882, 4.386405386389388, 0.6764910666244242, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945888812593762, 0, -8.901335985681708, 1, 0.3333333333333333, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.018462834985984, 0, 0, 0.3099137017264122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.018409764630737, 0, 1, 0.3099193249234214, 0, 0.4954395373641821, 4.434067045958861, 0.6900806750765786, 1, 0.111734787099288],
[1.005088703559759, 2.011082437714433, 0, 1, 0.3332333135231696, 0, 0.4972446585215503, 4.450222454710517, 0.6667666864768305, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.024356798284318, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8548333748939961, 2.161488299847948, 1, 0, 0.2834025899996657, 1.169818621230138, 0, -10.46960084320591, 1, 0.2834025899996657, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9191983075560806, 2.097123367185864, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0, 1.357532522043301, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972944406296881, 4.450667992840854, 0.6666666666666667, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.077152487816543, 0, 0, 0.2853539124051121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.010881116494631, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.749181700026327, 2.104569674607313, 1, 0, 0.2625252173982766, 1.334789677810949, 0, -11.94605290315584, 1, 0.2625252173982766, 0.111734787099288],
[1.68391937577762, 1.267715146985208, 1, 0, 0.5705040250719848, 0.5938526596846171, 0, -5.314841287135737, 1, 0.5705040250719848, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 1.280447299340457, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.003692129869493, 2.012629544872454, 0, 1, 0.3327536775252463, 0, 0.4968624268423789, 4.446801571303529, 0.6672463224747537, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9191983075560806, 2.097123367185864, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.157553000669459, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.684107157680025, 1.267728790836543, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.077152487816543, 0, 0, 0.2853539124051121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.157553000669459, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.004426450010517, 2.011895224731429, 0, 7, 0.3329971264077623, 0, 3.479306434028859, 31.13897224270123, 0.05873458908053545, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.999770385471435, 0, 1, 0.3333588480115766, 0, 0.5000574102232519, 4.451179020527037, 0.6666411519884234, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 1, 0.2833625433546729, 0, 0.4651352371305147, 4.140325024478449, 0.7166374566453271, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924593070876615, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3308197690292202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245942218968, 2.085575405778105, 0, 1, 0.3048081980739654, 0, 0.4794839818447663, 4.268048022152778, 0.6951918019260346, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9704439336928588, 2.029300912798233, 0, 1, 0.3235088260349948, 0, 0.4927805401817344, 4.386405155363348, 0.6764911739650052, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8253152568833148, 2.065758941786397, 0, 1, 0.2854701056316964, 0, 0.4840835877661673, 4.308990659860898, 0.7145298943683036, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.090884577864143, 1.00754069291234, 0, 0, 0.5198586735759628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.001387701275354, 1.900066951888926, 0, 1, 0.3451329836167718, 0, 0.5262972438975707, 4.684748596270554, 0.6548670163832282, 1, 0.1123426867167529],
[1.006313113497069, 1.993457156909701, 0, 2, 0.3354633931219716, 0, 1.003282158870393, 8.930551584545469, 0.4416089018809632, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3099137017264123, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9013343081797057, 2.007906013825667, 1, 0, 0.3098177559832546, 1.109466255666618, 0, -9.875731906464821, 1, 0.3098177559832547, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.001389016669923, 1.900065522674907, 0, 1, 0.3451334505127363, 0, 0.5262976397741289, 4.684752120100807, 0.6548665494872636, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8502077699989927, 2.149792230001009, 1, 0, 0.2834025899996641, 1.17618308757774, 0, -10.46960084320597, 1, 0.2834025899996642, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149562419174525, 0, 1, 0.2833956015235219, 0, 0.4652109615798085, 4.140999073243943, 0.7166043984764781, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702715097223, 1.999852401085532, 1, 1, 0.333298678078309, 1.000229781277584, 0.5000369024519981, -4.452384872071921, 0.8889119911912517, 0.5555093473478696, 0.1123426867167529],
[0.8502077699989484, 2.149792230001053, 1, 0, 0.2834025899996493, 1.176183087577801, 0, -10.46960084320651, 1, 0.2834025899996493, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3099137017264123, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997998382704091, 2.000200161729595, 0, 1, 0.3332666127568026, 0, 0.4999499645751899, 4.450222610713437, 0.6667333872431973, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 1, 0.2833625433546729, 0, 0.4651352371305147, 4.140325024478449, 0.7166374566453271, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7453064447672513, 2.093380012696254, 0, 1, 0.2625532815741884, 0, 0.4776963541903743, 4.252135747783737, 0.7374467184258116, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393453149, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3106905612757658, 1.109318281015318, 0, -9.874414734376233, 1, 0.3106905612757658, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.7476425223094283, 1.352888405044052, 0, 1, 0.3559302615226925, 0, 0.7391592656656987, 6.579504970620156, 0.6440697384773075, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245650109502, 2.085575434989051, 0, 1, 0.3048081883369832, 0, 0.479483975129027, 4.268047962373726, 0.6951918116630168, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.09773598703989, 0, 1, 0.300593974587173, 0, 0.4767044118888847, 4.243306136079768, 0.6994060254128269, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9600120064091129, 2.039987993590891, 0, 3, 0.3200040021363706, 0, 1.470596890484265, 13.09027702169923, 0.3144264482691015, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.14956241917449, 0, 1, 0.2833956015235252, 0, 0.4652109615798161, 4.140999073244012, 0.7166043984764748, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 1, 0.2833625433546729, 0, 0.4651352371305147, 4.140325024478449, 0.7166374566453271, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492399384, 2.000349950760065, 0, 1, 0.3332166830799791, 0, 0.4999125276154975, 4.449889371756933, 0.6667833169200209, 1, 0.1123426867167529],
[0.9981604279519531, 2.00183957204805, 0, 2, 0.3327201426506506, 0, 0.9990810592048752, 8.893156184913362, 0.4452624080241681, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9989503793585822, 2.000600563003233, 0, 3, 0.3330333101700947, 0, 1.499549712960444, 13.34799582229349, 0.2966965072354176, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702391181615, 2.000017602758314, 1, 1, 0.3332803157481861, 1.000229813684033, 0.4999955993491533, -4.452752813328287, 0.8889242311347894, 0.5554848626311615, 0.1123426867167529],
[0.9997997681532279, 2.000200231846776, 0, 1, 0.3332665893844089, 0, 0.4999499470494035, 4.450222454710524, 0.6667334106155911, 1, 0.1123426867167529],
[0.9126855469919439, 2.087314453008058, 1, 0, 0.3042285156639811, 1.095667618815516, 0, -9.752905603708751, 1, 0.3042285156639811, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9995406831117369, 2.000459316888267, 0, 2, 0.3331802277039119, 0, 0.9997703942867576, 8.899292188083914, 0.4446486087250067, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3099137017264123, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8525368413156366, 2.147113452569247, 0, 2, 0.284212077339024, 0, 0.931483148972305, 8.291444474003301, 0.5123523502273154, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.9020339927253826, 2.097966007274619, 0, 3, 0.3006779975751274, 0, 1.42995643856841, 12.72852270458625, 0.3420043085823951, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9012091919584608, 2.098536012197453, 0, 1, 0.3004285799706941, 0, 0.4765226778037819, 4.241688459928218, 0.6995714200293059, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9018042757647566, 2.098195724235245, 0, 1, 0.3006014252549187, 0, 0.4765999608375345, 4.242376382177643, 0.6993985747450813, 1, 0.1123426867167529],
[0.8504478708757974, 2.149552129124204, 1, 0, 0.2834826236252657, 1.175851024202333, 0, -10.46664503553293, 1, 0.2834826236252657, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.004701095132855, 2.00940219026571, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1118170242482891],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093490779844479, 0, 1, 0.2624481338479034, 0, 0.4776710791505314, 4.251910766162045, 0.7375518661520966, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8524939011846554, 2.147506098815346, 2, 1, 0.2841646337282184, 2.346057839499766, 0.4656564191140793, -16.73808483080613, 0.9770538368087548, 0.1963562908031873, 0.1123426867167529],
[0.8718020987510687, 2.029129140199836, 0, 0, 0.3005249097411726, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1112925688299601],
[0.9014545393453079, 2.098545460654694, 1, 0, 0.3004848464484358, 1.109318281015326, 0, -9.874414734376307, 1, 0.3004848464484358, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492399469, 2.000349950760057, 0, 1, 0.3332166830799819, 0, 0.4999125276154995, 4.449889371756951, 0.6667833169200181, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9921115102093456, 2.007888489790657, 1, 1, 0.3307038367364483, 1.007951212852061, 0.4980356255263261, -4.538929967122593, 0.8906349723677925, 0.5520426458406891, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393453081, 2.098545460654694, 1, 0, 0.3004848464484358, 1.109318281015326, 0, -9.874414734376307, 1, 0.3004848464484358, 0.1123426867167529],
[0.8502078199422261, 2.149792180057776, 1, 0, 0.2834026066474085, 1.176183018485942, 0, -10.46960022819666, 1, 0.2834026066474085, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492398135, 2.00034995076019, 0, 1, 0.3332166830799375, 0, 0.4999125276154663, 4.449889371756655, 0.6667833169200625, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9919116665732065, 2.008088333426796, 1, 0, 0.3306372221910686, 1.008154288027216, 0, -8.973920043135985, 1, 0.3306372221910686, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245942218638, 2.085575405778138, 0, 1, 0.3048081980739544, 0, 0.4794839818447588, 4.26804802215271, 0.6951918019260456, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492399469, 2.000349950760057, 0, 1, 0.3332166830799819, 0, 0.4999125276154995, 4.449889371756951, 0.6667833169200181, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7455364242028263, 2.145537774467491, 0, 1, 0.2578752300946542, 0, 0.466083614047855, 4.14876684606076, 0.7421247699053457, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702391181362, 2.000229760881867, 0, 1, 0.3332567463727117, 0, 0.499942566377533, 4.450156756870405, 0.6667432536272884, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997453304525999, 1.83868653900567, 0, 1, 0.3522174836077382, 0, 0.5438664931657043, 4.841138387022403, 0.6477825163922618, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9986003349190906, 2.001399665080913, 0, 3, 0.3328667783063631, 0, 1.498950985323921, 13.34266634643689, 0.296918805114333, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901804490105376, 0, 1, 0.3446131548179135, 0, 0.5258164049999647, 4.680468487687977, 0.6553868451820865, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.090884577864143, 1.00754069291234, 0, 0, 0.5198586735759628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144248468372221, 2.08557515316278, 0, 1, 0.3048082822790739, 0, 0.4794840399222716, 4.268048539120165, 0.6951917177209261, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702730522005, 2.000229726947803, 1, 1, 0.3332567576840664, 1.000229779734397, 0.4999425748591004, -4.453224499932595, 0.8889399334579035, 0.5554534488260363, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997998382704155, 2.000200161729588, 0, 1, 0.3332666127568048, 0, 0.4999499645751916, 4.450222610713452, 0.6667333872431952, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996503289822306, 2.000349671017773, 0, 1, 0.3332167763274098, 0, 0.4999125975266127, 4.449889994059259, 0.6667832236725901, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249654144901728, 2.066108884868909, 0, 1, 0.2853490879404443, 0, 0.4840015970714188, 4.308260833139243, 0.7146509120595557, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982610325686126, 2.001738967431391, 0, 1, 0.3327536775228705, 0, 0.499565635814738, 4.446801571287694, 0.6672463224771294, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838686590673975, 1, 0, 0.3522755922704999, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3522755922704999, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8904789073062939, 2.000340485570161, 0, 1, 0.3080368526309904, 0, 0.4999148930962959, 4.449910427696287, 0.6919631473690095, 1, 0.1123426867167529],
[0.9993108334531352, 2.000689166546868, 0, 1, 0.3331036111510447, 0, 0.4998277677116487, 4.449134895374661, 0.6668963888489553, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.002332922084880754, 2.997667077915119, 0, 1, 0.0007776406949602515, 0, 0.3335927486302119, 2.96942113794458, 0.9992223593050398, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.67307018878554, 1.262942621662809, 0, 1, 0.569844308182719, 0, 0.7918016090734075, 7.048092156365809, 0.430155691817281, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.999540257547418, 2.000459742452585, 0, 2, 0.3331800858491389, 0, 0.9997701816023442, 8.899290294908491, 0.4446487979081617, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982610325756094, 2.001738967424394, 0, 1, 0.3327536775252027, 0, 0.4995656358164841, 4.446801571303237, 0.6672463224747973, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500985758366, 2.000349901424167, 0, 1, 0.3332166995252785, 0, 0.4999125399451572, 4.449889481507376, 0.6667833004747215, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9991993198026263, 2.000800680197377, 0, 2, 0.3330664399342084, 0, 0.9995998201093682, 8.89777385002049, 0.4448003735420309, 1, 0.1123426867167529],
[1.004725837799625, 1.904576853670288, 0, 1, 0.3453493652432539, 0, 0.5250510096628086, 4.673655446630077, 0.654650634756746, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997997681532168, 2.000200231846787, 0, 1, 0.3332665893844052, 0, 0.4999499470494007, 4.4502224547105, 0.6667334106155948, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9915462953188436, 2.008453704681159, 1, 0, 0.3305154317729476, 1.008525779099843, 0, -8.977226809989125, 1, 0.3305154317729476, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -17.80267197136341, 1, 0.1111111111111109, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.00226796481760855, 1.351773110585215, 0, 1, 0.001674960131422776, 0, 0.7397691167026367, 6.584933459601158, 0.9983250398685772, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8247199812647327, 2.01358940582455, 1, 0, 0.2905673303326852, 1.212532765929195, 0, -10.79316154318373, 1, 0.2905673303326852, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065790267309908, 0, 1, 0.2853660051134521, 0, 0.4840762471507864, 4.308925318577051, 0.7146339948865479, 1, 0.1123426867167529],
[0.850787793551481, 2.14921220644852, 0, 1, 0.2835959311838269, 0, 0.4652867674023016, 4.141673846339626, 0.7164040688161731, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.999650049239949, 2.000349950760055, 0, 1, 0.3332166830799826, 0, 0.4999125276155001, 4.449889371756956, 0.6667833169200174, 1, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.999649656947099, 2.000350343052904, 0, 1, 0.3332165523156992, 0, 0.4999124295766186, 4.449888499079933, 0.6667834476843008, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.745551567613999, 2.145563219877116, 1, 1, 0.2578768476574334, 1.341288843641381, 0.4660780865069423, -7.790545007536525, 0.9334995314422648, 0.4492532267571316, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924768995666895, 2.007523100433313, 0, 1, 0.3308256331888962, 0, 0.4981262730098376, 4.433989319355983, 0.6691743668111038, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7453069039840083, 2.093380027522468, 0, 1, 0.2625533995002675, 0, 0.4776963508071241, 4.252135717668291, 0.7374466004997325, 1, 0.1123426867167529],
[0.9143246271094613, 2.08567537289054, 0, 0.5, 0.3047748757031536, 0, 0.2397305000092365, 2.133921726597688, 0.8338016096751351, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9136192421397507, 2.086380757860251, 0, 1, 0.3045397473799167, 0, 0.4792988989342383, 4.266400536980959, 0.6954602526200833, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8502077699990513, 2.085593030432713, 1, 0, 0.2895999516976808, 1.176183087577659, 0, -10.46960084320524, 1, 0.2895999516976808, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7473478213495831, 2.090961565739699, 0, 1, 0.263307384582199, 0, 0.4782488671169046, 4.257053850979217, 0.736692615417801, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245650109285, 2.085575434989073, 0, 1, 0.304808188336976, 0, 0.479483975129022, 4.268047962373681, 0.695191811663024, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249653874079578, 2.066108794527195, 0, 1, 0.2853490901626619, 0, 0.4840016182346479, 4.308261021520256, 0.7146509098373381, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8502625436239514, 2.14973745637605, 0, 0.5, 0.2834208478746503, 0, 0.2325865414481273, 2.070330951177468, 0.8465099834764795, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.824965375561353, 1.275563428739739, 0, 1, 0.3927417581097363, 0, 0.7839672865096199, 6.978356219005328, 0.6072582418902637, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065790234650675, 0, 1, 0.2853660083375311, 0, 0.4840762548038185, 4.308925386699261, 0.7146339916624689, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996501692805875, 2.000349830719416, 0, 1, 0.3332167230935288, 0, 0.4999125576151621, 4.449889638794027, 0.6667832769064712, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.673067564527757, 1.262945449957578, 0, 1, 0.5698433747648204, 0, 0.7917998358785722, 7.048076372562812, 0.4301566252351796, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924593070876615, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3308197690292202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -4.450667992840853, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982610325756478, 2.001738967424356, 0, 1, 0.3327536775252156, 0, 0.4995656358164938, 4.446801571303323, 0.6672463224747844, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9012142296597527, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3106334652734156, 1.109614081856589, 0, -9.877047757049237, 1, 0.3106334652734156, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8247199812648586, 2.066099411611597, 1, 0, 0.2852893485138262, 1.21253276592901, 0, -10.79316154318208, 1, 0.2852893485138261, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997997681524183, 2.000200231847585, 1, 1, 0.3332665893841391, 1.000200271948404, 0.4999499470492011, -4.452896218874245, 0.8889333804002635, 0.5554665591685418, 0.1123426867167529],
[0.9997702715106626, 2.000229728489341, 0, 1, 0.3332567571702205, 0, 0.4999425744738045, 4.450156828938037, 0.6667432428297795, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.999770239118146, 0, 1, 0.3333588642755435, 0, 0.5000574468199794, 4.451179346286804, 0.6666411357244565, 1, 0.1123426867167529],
[0.7451277862138571, 2.145691606662599, 1, 0, 0.2577566028683762, 1.34205168361953, 0, -11.94605294604725, 1, 0.2577566028683762, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9176276518220454, 2.082372348177956, 0, 1, 0.3058758839406817, 0, 0.4802215131578101, 4.274613036170141, 0.6941241160593183, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924593070876615, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3308197690292202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098195450659577, 0, 1, 0.3005479337282612, 0, 0.4766000229795778, 4.242376935324849, 0.6994520662717388, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9989698066673977, 1.839835048062909, 0, 1, 0.3518980196905089, 0, 0.5435269868637741, 4.838116327359666, 0.6481019803094912, 1, 0.1123426867167529],
[0.7451277862138516, 2.09318160087543, 1, 0, 0.2625252164556974, 1.34205168361954, 0, -11.94605294604734, 1, 0.2625252164556975, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982607208258514, 2.001739279174152, 0, 2, 0.3327535736086167, 0, 0.999131116028822, 8.893601757521688, 0.4452177935320717, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249653576073885, 2.013721167034645, 0, 1, 0.2906151667139151, 0, 0.4965930816889485, 4.420341868278418, 0.7093848332860849, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093490779844561, 0, 1, 0.2624481338478958, 0, 0.4776710791505128, 4.251910766161878, 0.7375518661521041, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.995635634448424, 0, 1, 0.3338189693367456, 0, 0.501093477555782, 4.460401403957676, 0.6661810306632544, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982617964773487, 2.001738203522655, 0, 1, 0.3327539321591159, 0, 0.4995658264603244, 4.446803268288113, 0.6672460678408841, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.010565792665018, 1.989434207334985, 1, 0, 0.3368552642216723, 0.9895446761193504, 0, -8.808269634980933, 1, 0.3368552642216723, 0.1123426867167529],
[0.02707171088855068, 2.972928289111449, 0, 2, 0.009023903629516897, 0, 0.6727373839877455, 5.988261485003498, 0.9820336235776811, 1, 0.1123426867167529],
[1.655364553279677, 1.281250296375712, 0, 1, 0.5636982164937064, 0, 0.7804876243375021, 6.947382576894641, 0.4363017835062936, 1, 0.1123426867167529],
[0.9988465282241028, 2.001153471775901, 0, 1, 0.3329488427413672, 0, 0.4997117982723042, 4.448102612430985, 0.6670511572586328, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9922767562985652, 2.007723243701437, 1, 0, 0.3307589187661881, 1.007783356460192, 0, -8.970618256630212, 1, 0.3307589187661881, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393452633, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3106905612757535, 1.109318281015381, 0, -9.874414734376797, 1, 0.3106905612757536, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8518444927702633, 2.148155507229738, 0, 1, 0.2839481642567543, 0, 0.4655156466254159, 4.143711177204708, 0.7160518357432457, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393453128, 2.098545460654689, 1, 0, 0.3004848464484374, 1.10931828101532, 0, -9.874414734376254, 1, 0.3004848464484374, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982616166380434, 2.00173838336196, 1, 1, 0.3327538722126807, 1.001741410601172, 0.4995657815785495, -4.470033997751421, 0.889274860527467, 0.5547826049528284, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500985774791, 2.000349901422525, 0, 1, 0.333216699525826, 0, 0.4999125399455676, 4.44988948151103, 0.666783300474174, 1, 0.1123426867167529]
],
"RESOLVED": [
[1.024886792916657, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[0.9240120328085949, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3107191140532112, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[1.024886792916657, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[1.024886792916657, 2.049773585833315, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[0.8712435848744335, 2.049773585833315, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1096147276881619],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9063124276035882, 2.110009247138356, 1, 0, 0.3004694211472409, 1.103372269366464, 0, -9.874921660574724, 1, 0.300469421147241, 0.111734787099288],
[0.9062381692699846, 2.11008350547196, 2, 0, 0.3004448023095932, 2.206925362248966, 0, -19.75146164898389, 1, 0.09026707923485044, 0.111734787099288],
[0.906589112955865, 2.10973256178608, 1, 1, 0.3005611505389015, 1.103035527020147, 0.473993727031169, -5.62977579605543, 0.9096629947867318, 0.5107852958645347, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.097123367185864, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.00520956124256, 2.011112113499386, 0, 1, 0.3332567509824887, 0, 0.4972373212252074, 4.450156787638217, 0.6667432490175113, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972944406296881, 4.450667992840854, 0.6666666666666667, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.161257374806648, 0, 1, 0.2833955887363551, 0, 0.4626936206935848, 4.140998812504413, 0.7166044112636449, 1, 0.111734787099288],
[1.005209728756189, 2.010898801122714, 0, 1, 0.3332803573870561, 0, 0.4972900672284877, 4.45062885193126, 0.6667196426129439, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972944406296881, 4.450667992840854, 0.6666666666666667, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.024356798284318, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9063590299976239, 2.018646344135629, 1, 0, 0.3098657657222935, 1.103315537114053, 0, -9.874413920291827, 1, 0.3098657657222934, 0.111734787099288],
[0.9191983075560806, 2.097123367185864, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7491817000263402, 2.157365364139526, 1, 0, 0.2577566037938367, 1.334789677810925, 0, -11.94605290315563, 1, 0.2577566037938367, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005088478473733, 2.011233196268214, 0, 1, 0.3332166084572927, 0, 0.4972073859239554, 4.44988887375008, 0.6667833915427073, 1, 0.111734787099288],
[1.911920357299481, 1.104401317442465, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.00086573416944, 2.013498700390226, 0, 1, 0.3320320936295963, 0, 0.4966479490680552, 4.444882045792345, 0.6679679063704037, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.157553000669459, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 1.911920357299481, 0, 0, 0.3446404429733944, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.018462834985984, 0, 0, 0.3099137017264122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.684107157680025, 1.267728790836543, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945888812593762, 0, -8.901335985681708, 1, 0.3333333333333333, 0.111734787099288],
[0.7495925427705716, 2.104282089344199, 0, 2, 0.2626578386924833, 0, 0.9504429135845096, 8.50623998361354, 0.5436734628416399, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 1.360847812193373, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.911920357299481, 1.104401317442465, 1, 0, 0.6338582430745059, 0.523034338842683, 0, -4.681034012960644, 1, 0.6338582430745059, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9193821268798004, 2.096939547862144, 1, 0, 0.3048024136744156, 1.087687013661883, 0, -9.734542320247675, 1, 0.3048024136744156, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 1, 0.3005249097411728, 0, 0.4739691687430682, 4.241912309027781, 0.6994750902588271, 1, 0.111734787099288],
[1.005239212541224, 2.011082462200722, 0, 1, 0.3332665812664775, 0, 0.4972446524672602, 4.450222400526048, 0.6667334187335225, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.077152487816543, 0, 0, 0.2853539124051121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9757241176166227, 2.040341335153615, 0, 1, 0.3235089333755758, 0, 0.4901140719793882, 4.386405386389388, 0.6764910666244242, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9945888812593762, 0, -8.901335985681708, 1, 0.3333333333333333, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.018462834985984, 0, 0, 0.3099137017264122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.018409764630737, 0, 1, 0.3099193249234214, 0, 0.4954395373641821, 4.434067045958861, 0.6900806750765786, 1, 0.111734787099288],
[1.005088703559759, 2.011082437714433, 0, 1, 0.3332333135231696, 0, 0.4972446585215503, 4.450222454710517, 0.6667666864768305, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.024356798284318, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8548333748939961, 2.161488299847948, 1, 0, 0.2834025899996657, 1.169818621230138, 0, -10.46960084320591, 1, 0.2834025899996657, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9191983075560806, 2.097123367185864, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0, 1.357532522043301, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4972944406296881, 4.450667992840854, 0.6666666666666667, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.077152487816543, 0, 0, 0.2853539124051121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.010881116494631, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.749181700026327, 2.104569674607313, 1, 0, 0.2625252173982766, 1.334789677810949, 0, -11.94605290315584, 1, 0.2625252173982766, 0.111734787099288],
[1.68391937577762, 1.267715146985208, 1, 0, 0.5705040250719848, 0.5938526596846171, 0, -5.314841287135737, 1, 0.5705040250719848, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 1.280447299340457, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.003692129869493, 2.012629544872454, 0, 1, 0.3327536775252463, 0, 0.4968624268423789, 4.446801571303529, 0.6672463224747537, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.104757311137233, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9191983075560806, 2.097123367185864, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.157553000669459, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.684107157680025, 1.267728790836543, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.005440558247315, 2.010881116494631, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8293945763493221, 2.077152487816543, 0, 0, 0.2853539124051121, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.7489940634964068, 2.157553000669459, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8547125813307038, 2.16160909341124, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[1.004426450010517, 2.011895224731429, 0, 7, 0.3329971264077623, 0, 3.479306434028859, 31.13897224270123, 0.05873458908053545, 1, 0.111734787099288],
[0.9064797990521659, 2.109841875689778, 0, 0, 0.3005249097411728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.111734787099288],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.999770385471435, 0, 1, 0.3333588480115766, 0, 0.5000574102232519, 4.451179020527037, 0.6666411519884234, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 1, 0.2833625433546729, 0, 0.4651352371305147, 4.140325024478449, 0.7166374566453271, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924593070876615, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3308197690292202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245942218968, 2.085575405778105, 0, 1, 0.3048081980739654, 0, 0.4794839818447663, 4.268048022152778, 0.6951918019260346, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9704439336928588, 2.029300912798233, 0, 1, 0.3235088260349948, 0, 0.4927805401817344, 4.386405155363348, 0.6764911739650052, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8253152568833148, 2.065758941786397, 0, 1, 0.2854701056316964, 0, 0.4840835877661673, 4.308990659860898, 0.7145298943683036, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.090884577864143, 1.00754069291234, 0, 0, 0.5198586735759628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.001387701275354, 1.900066951888926, 0, 1, 0.3451329836167718, 0, 0.5262972438975707, 4.684748596270554, 0.6548670163832282, 1, 0.1123426867167529],
[1.006313113497069, 1.993457156909701, 0, 2, 0.3354633931219716, 0, 1.003282158870393, 8.930551584545469, 0.4416089018809632, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3099137017264123, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9013343081797057, 2.007906013825667, 1, 0, 0.3098177559832546, 1.109466255666618, 0, -9.875731906464821, 1, 0.3098177559832547, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.001389016669923, 1.900065522674907, 0, 1, 0.3451334505127363, 0, 0.5262976397741289, 4.684752120100807, 0.6548665494872636, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8502077699989927, 2.149792230001009, 1, 0, 0.2834025899996641, 1.17618308757774, 0, -10.46960084320597, 1, 0.2834025899996642, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149562419174525, 0, 1, 0.2833956015235219, 0, 0.4652109615798085, 4.140999073243943, 0.7166043984764781, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702715097223, 1.999852401085532, 1, 1, 0.333298678078309, 1.000229781277584, 0.5000369024519981, -4.452384872071921, 0.8889119911912517, 0.5555093473478696, 0.1123426867167529],
[0.8502077699989484, 2.149792230001053, 1, 0, 0.2834025899996493, 1.176183087577801, 0, -10.46960084320651, 1, 0.2834025899996493, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3099137017264123, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997998382704091, 2.000200161729595, 0, 1, 0.3332666127568026, 0, 0.4999499645751899, 4.450222610713437, 0.6667333872431973, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 1, 0.2833625433546729, 0, 0.4651352371305147, 4.140325024478449, 0.7166374566453271, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7453064447672513, 2.093380012696254, 0, 1, 0.2625532815741884, 0, 0.4776963541903743, 4.252135747783737, 0.7374467184258116, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393453149, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3106905612757658, 1.109318281015318, 0, -9.874414734376233, 1, 0.3106905612757658, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.7476425223094283, 1.352888405044052, 0, 1, 0.3559302615226925, 0, 0.7391592656656987, 6.579504970620156, 0.6440697384773075, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245650109502, 2.085575434989051, 0, 1, 0.3048081883369832, 0, 0.479483975129027, 4.268047962373726, 0.6951918116630168, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.09773598703989, 0, 1, 0.300593974587173, 0, 0.4767044118888847, 4.243306136079768, 0.6994060254128269, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9600120064091129, 2.039987993590891, 0, 3, 0.3200040021363706, 0, 1.470596890484265, 13.09027702169923, 0.3144264482691015, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.14956241917449, 0, 1, 0.2833956015235252, 0, 0.4652109615798161, 4.140999073244012, 0.7166043984764748, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 1, 0.2833625433546729, 0, 0.4651352371305147, 4.140325024478449, 0.7166374566453271, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492399384, 2.000349950760065, 0, 1, 0.3332166830799791, 0, 0.4999125276154975, 4.449889371756933, 0.6667833169200209, 1, 0.1123426867167529],
[0.9981604279519531, 2.00183957204805, 0, 2, 0.3327201426506506, 0, 0.9990810592048752, 8.893156184913362, 0.4452624080241681, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9989503793585822, 2.000600563003233, 0, 3, 0.3330333101700947, 0, 1.499549712960444, 13.34799582229349, 0.2966965072354176, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702391181615, 2.000017602758314, 1, 1, 0.3332803157481861, 1.000229813684033, 0.4999955993491533, -4.452752813328287, 0.8889242311347894, 0.5554848626311615, 0.1123426867167529],
[0.9997997681532279, 2.000200231846776, 0, 1, 0.3332665893844089, 0, 0.4999499470494035, 4.450222454710524, 0.6667334106155911, 1, 0.1123426867167529],
[0.9126855469919439, 2.087314453008058, 1, 0, 0.3042285156639811, 1.095667618815516, 0, -9.752905603708751, 1, 0.3042285156639811, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9995406831117369, 2.000459316888267, 0, 2, 0.3331802277039119, 0, 0.9997703942867576, 8.899292188083914, 0.4446486087250067, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3099137017264123, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8525368413156366, 2.147113452569247, 0, 2, 0.284212077339024, 0, 0.931483148972305, 8.291444474003301, 0.5123523502273154, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.9020339927253826, 2.097966007274619, 0, 3, 0.3006779975751274, 0, 1.42995643856841, 12.72852270458625, 0.3420043085823951, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9012091919584608, 2.098536012197453, 0, 1, 0.3004285799706941, 0, 0.4765226778037819, 4.241688459928218, 0.6995714200293059, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9018042757647566, 2.098195724235245, 0, 1, 0.3006014252549187, 0, 0.4765999608375345, 4.242376382177643, 0.6993985747450813, 1, 0.1123426867167529],
[0.8504478708757974, 2.149552129124204, 1, 0, 0.2834826236252657, 1.175851024202333, 0, -10.46664503553293, 1, 0.2834826236252657, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.004701095132855, 2.00940219026571, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1118170242482891],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093490779844479, 0, 1, 0.2624481338479034, 0, 0.4776710791505314, 4.251910766162045, 0.7375518661520966, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8524939011846554, 2.147506098815346, 2, 1, 0.2841646337282184, 2.346057839499766, 0.4656564191140793, -16.73808483080613, 0.9770538368087548, 0.1963562908031873, 0.1123426867167529],
[0.8718020987510687, 2.029129140199836, 0, 0, 0.3005249097411726, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1112925688299601],
[0.9014545393453079, 2.098545460654694, 1, 0, 0.3004848464484358, 1.109318281015326, 0, -9.874414734376307, 1, 0.3004848464484358, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492399469, 2.000349950760057, 0, 1, 0.3332166830799819, 0, 0.4999125276154995, 4.449889371756951, 0.6667833169200181, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9921115102093456, 2.007888489790657, 1, 1, 0.3307038367364483, 1.007951212852061, 0.4980356255263261, -4.538929967122593, 0.8906349723677925, 0.5520426458406891, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393453081, 2.098545460654694, 1, 0, 0.3004848464484358, 1.109318281015326, 0, -9.874414734376307, 1, 0.3004848464484358, 0.1123426867167529],
[0.8502078199422261, 2.149792180057776, 1, 0, 0.2834026066474085, 1.176183018485942, 0, -10.46960022819666, 1, 0.2834026066474085, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492398135, 2.00034995076019, 0, 1, 0.3332166830799375, 0, 0.4999125276154663, 4.449889371756655, 0.6667833169200625, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9919116665732065, 2.008088333426796, 1, 0, 0.3306372221910686, 1.008154288027216, 0, -8.973920043135985, 1, 0.3306372221910686, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245942218638, 2.085575405778138, 0, 1, 0.3048081980739544, 0, 0.4794839818447588, 4.26804802215271, 0.6951918019260456, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500492399469, 2.000349950760057, 0, 1, 0.3332166830799819, 0, 0.4999125276154995, 4.449889371756951, 0.6667833169200181, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7455364242028263, 2.145537774467491, 0, 1, 0.2578752300946542, 0, 0.466083614047855, 4.14876684606076, 0.7421247699053457, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702391181362, 2.000229760881867, 0, 1, 0.3332567463727117, 0, 0.499942566377533, 4.450156756870405, 0.6667432536272884, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997453304525999, 1.83868653900567, 0, 1, 0.3522174836077382, 0, 0.5438664931657043, 4.841138387022403, 0.6477825163922618, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9986003349190906, 2.001399665080913, 0, 3, 0.3328667783063631, 0, 1.498950985323921, 13.34266634643689, 0.296918805114333, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901804490105376, 0, 1, 0.3446131548179135, 0, 0.5258164049999647, 4.680468487687977, 0.6553868451820865, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.090884577864143, 1.00754069291234, 0, 0, 0.5198586735759628, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144248468372221, 2.08557515316278, 0, 1, 0.3048082822790739, 0, 0.4794840399222716, 4.268048539120165, 0.6951917177209261, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997702730522005, 2.000229726947803, 1, 1, 0.3332567576840664, 1.000229779734397, 0.4999425748591004, -4.453224499932595, 0.8889399334579035, 0.5554534488260363, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997998382704155, 2.000200161729588, 0, 1, 0.3332666127568048, 0, 0.4999499645751916, 4.450222610713452, 0.6667333872431952, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996503289822306, 2.000349671017773, 0, 1, 0.3332167763274098, 0, 0.4999125975266127, 4.449889994059259, 0.6667832236725901, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249654144901728, 2.066108884868909, 0, 1, 0.2853490879404443, 0, 0.4840015970714188, 4.308260833139243, 0.7146509120595557, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982610325686126, 2.001738967431391, 0, 1, 0.3327536775228705, 0, 0.499565635814738, 4.446801571287694, 0.6672463224771294, 1, 0.1123426867167529],
[0.2550588323171947, 2.744941167682807, 0, 0, 0.08501961077239817, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838686590673975, 1, 0, 0.3522755922704999, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3522755922704999, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8904789073062939, 2.000340485570161, 0, 1, 0.3080368526309904, 0, 0.4999148930962959, 4.449910427696287, 0.6919631473690095, 1, 0.1123426867167529],
[0.9993108334531352, 2.000689166546868, 0, 1, 0.3331036111510447, 0, 0.4998277677116487, 4.449134895374661, 0.6668963888489553, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.002332922084880754, 2.997667077915119, 0, 1, 0.0007776406949602515, 0, 0.3335927486302119, 2.96942113794458, 0.9992223593050398, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.67307018878554, 1.262942621662809, 0, 1, 0.569844308182719, 0, 0.7918016090734075, 7.048092156365809, 0.430155691817281, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.999540257547418, 2.000459742452585, 0, 2, 0.3331800858491389, 0, 0.9997701816023442, 8.899290294908491, 0.4446487979081617, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3107191140532113, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982610325756094, 2.001738967424394, 0, 1, 0.3327536775252027, 0, 0.4995656358164841, 4.446801571303237, 0.6672463224747973, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500985758366, 2.000349901424167, 0, 1, 0.3332166995252785, 0, 0.4999125399451572, 4.449889481507376, 0.6667833004747215, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9991993198026263, 2.000800680197377, 0, 2, 0.3330664399342084, 0, 0.9995998201093682, 8.89777385002049, 0.4448003735420309, 1, 0.1123426867167529],
[1.004725837799625, 1.904576853670288, 0, 1, 0.3453493652432539, 0, 0.5250510096628086, 4.673655446630077, 0.654650634756746, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 1.273518646962616, 0, 0, 0.3931074579122973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997997681532168, 2.000200231846787, 0, 1, 0.3332665893844052, 0, 0.4999499470494007, 4.4502224547105, 0.6667334106155948, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9915462953188436, 2.008453704681159, 1, 0, 0.3305154317729476, 1.008525779099843, 0, -8.977226809989125, 1, 0.3305154317729476, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.000000000000002, 0, 0, 0.2982671904880776, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 2, 0, 0.3333333333333333, 1.999999999999998, 0, -17.80267197136341, 1, 0.1111111111111109, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.00226796481760855, 1.351773110585215, 0, 1, 0.001674960131422776, 0, 0.7397691167026367, 6.584933459601158, 0.9983250398685772, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8247199812647327, 2.01358940582455, 1, 0, 0.2905673303326852, 1.212532765929195, 0, -10.79316154318373, 1, 0.2905673303326852, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065790267309908, 0, 1, 0.2853660051134521, 0, 0.4840762471507864, 4.308925318577051, 0.7146339948865479, 1, 0.1123426867167529],
[0.850787793551481, 2.14921220644852, 0, 1, 0.2835959311838269, 0, 0.4652867674023016, 4.141673846339626, 0.7164040688161731, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.999650049239949, 2.000349950760055, 0, 1, 0.3332166830799826, 0, 0.4999125276155001, 4.449889371756956, 0.6667833169200174, 1, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.999649656947099, 2.000350343052904, 0, 1, 0.3332165523156992, 0, 0.4999124295766186, 4.449888499079933, 0.6667834476843008, 1, 0.1123426867167529],
[0, 1.350186752372268, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.745551567613999, 2.145563219877116, 1, 1, 0.2578768476574334, 1.341288843641381, 0.4660780865069423, -7.790545007536525, 0.9334995314422648, 0.4492532267571316, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924768995666895, 2.007523100433313, 0, 1, 0.3308256331888962, 0, 0.4981262730098376, 4.433989319355983, 0.6691743668111038, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7453069039840083, 2.093380027522468, 0, 1, 0.2625533995002675, 0, 0.4776963508071241, 4.252135717668291, 0.7374466004997325, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9136192421397507, 2.086380757860251, 0, 1, 0.3045397473799167, 0, 0.4792988989342383, 4.266400536980959, 0.6954602526200833, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8502077699990513, 2.085593030432713, 1, 0, 0.2895999516976808, 1.176183087577659, 0, -10.46960084320524, 1, 0.2895999516976808, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7473478213495831, 2.090961565739699, 0, 1, 0.263307384582199, 0, 0.4782488671169046, 4.257053850979217, 0.736692615417801, 1, 0.1123426867167529],
[0.9144245650109285, 2.085575434989073, 0, 1, 0.304808188336976, 0, 0.479483975129022, 4.268047962373681, 0.695191811663024, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249653874079578, 2.066108794527195, 0, 1, 0.2853490901626619, 0, 0.4840016182346479, 4.308261021520256, 0.7146509098373381, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.824965375561353, 1.275563428739739, 0, 1, 0.3927417581097363, 0, 0.7839672865096199, 6.978356219005328, 0.6072582418902637, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065790234650675, 0, 1, 0.2853660083375311, 0, 0.4840762548038185, 4.308925386699261, 0.7146339916624689, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996501692805875, 2.000349830719416, 0, 1, 0.3332167230935288, 0, 0.4999125576151621, 4.449889638794027, 0.6667832769064712, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.673067564527757, 1.262945449957578, 0, 1, 0.5698433747648204, 0, 0.7917998358785722, 7.048076372562812, 0.4301566252351796, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924593070876615, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3308197690292202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 1, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.4999999999999994, -4.450667992840853, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982610325756478, 2.001738967424356, 0, 1, 0.3327536775252156, 0, 0.4995656358164938, 4.446801571303323, 0.6672463224747844, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.901574729223519, 0, 0, 0.3446404429733945, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.838309387089283, 0, 0, 0.352322408736953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9012142296597527, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3106334652734156, 1.109614081856589, 0, -9.877047757049237, 1, 0.3106334652734156, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8247199812648586, 2.066099411611597, 1, 0, 0.2852893485138262, 1.21253276592901, 0, -10.79316154318208, 1, 0.2852893485138261, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8908193928764526, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3081546343128893, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9997997681524183, 2.000200231847585, 1, 1, 0.3332665893841391, 1.000200271948404, 0.4999499470492011, -4.452896218874245, 0.8889333804002635, 0.5554665591685418, 0.1123426867167529],
[0.9997702715106626, 2.000229728489341, 0, 1, 0.3332567571702205, 0, 0.4999425744738045, 4.450156828938037, 0.6667432428297795, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.901574729223519, 1.098425270776483, 0, 0, 0.6338582430745059, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 2, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0.9999999999999989, 0, 0.7407407407407408, 0.7037037037037037, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.999770239118146, 0, 1, 0.3333588642755435, 0, 0.5000574468199794, 4.451179346286804, 0.6666411357244565, 1, 0.1123426867167529],
[0.7451277862138571, 2.145691606662599, 1, 0, 0.2577566028683762, 1.34205168361953, 0, -11.94605294604725, 1, 0.2577566028683762, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9176276518220454, 2.082372348177956, 0, 1, 0.3058758839406817, 0, 0.4802215131578101, 4.274613036170141, 0.6941241160593183, 1, 0.1123426867167529],
[0.9924593070876615, 2.007540692912341, 0, 0, 0.3308197690292202, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098195450659577, 0, 1, 0.3005479337282612, 0, 0.4766000229795778, 4.242376935324849, 0.6994520662717388, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.013402763275415, 0, 0, 0.2906330886851692, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9989698066673977, 1.839835048062909, 0, 1, 0.3518980196905089, 0, 0.5435269868637741, 4.838116327359666, 0.6481019803094912, 1, 0.1123426867167529],
[0.7451277862138516, 2.09318160087543, 1, 0, 0.2625252164556974, 1.34205168361954, 0, -11.94605294604734, 1, 0.2625252164556975, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982607208258514, 2.001739279174152, 0, 2, 0.3327535736086167, 0, 0.999131116028822, 8.893601757521688, 0.4452177935320717, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249653576073885, 2.013721167034645, 0, 1, 0.2906151667139151, 0, 0.4965930816889485, 4.420341868278418, 0.7093848332860849, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093490779844561, 0, 1, 0.2624481338478958, 0, 0.4776710791505128, 4.251910766161878, 0.7375518661521041, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 1.995635634448424, 0, 1, 0.3338189693367456, 0, 0.501093477555782, 4.460401403957676, 0.6661810306632544, 1, 0.1123426867167529],
[1.595028797746825, 1.255058832317195, 0, 0, 0.5596420197476513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 1.353484103093678, 0, 0, 0.3550000936688846, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.674994253877885, 1.26086895981842, 0, 0, 0.5705287106237613, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982617964773487, 2.001738203522655, 0, 1, 0.3327539321591159, 0, 0.4995658264603244, 4.446803268288113, 0.6672460678408841, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9142244163677151, 2.085775583632286, 0, 0, 0.3047414721225715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.010565792665018, 1.989434207334985, 1, 0, 0.3368552642216723, 0.9895446761193504, 0, -8.808269634980933, 1, 0.3368552642216723, 0.1123426867167529],
[0.02707171088855068, 2.972928289111449, 0, 2, 0.009023903629516897, 0, 0.6727373839877455, 5.988261485003498, 0.9820336235776811, 1, 0.1123426867167529],
[1.655364553279677, 1.281250296375712, 0, 1, 0.5636982164937064, 0, 0.7804876243375021, 6.947382576894641, 0.4363017835062936, 1, 0.1123426867167529],
[0.9988465282241028, 2.001153471775901, 0, 1, 0.3329488427413672, 0, 0.4997117982723042, 4.448102612430985, 0.6670511572586328, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9922767562985652, 2.007723243701437, 1, 0, 0.3307589187661881, 1.007783356460192, 0, -8.970618256630212, 1, 0.3307589187661881, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.093368219406476, 0, 0, 0.2624594665653245, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.8249066238138675, 2.065912769062588, 0, 0, 0.2853539124051122, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393452633, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3106905612757535, 1.109318281015381, 0, -9.874414734376797, 1, 0.3106905612757536, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.085775583632286, 0, 0, 0.2895528736142115, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 1, 0, 0.3333333333333333, 0.9999999999999989, 0, -8.901335985681706, 1, 0.3333333333333333, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4999999999999994, 4.450667992840853, 0.6666666666666667, 1, 0.1123426867167529],
[0.8518444927702633, 2.148155507229738, 0, 1, 0.2839481642567543, 0, 0.4655156466254159, 4.143711177204708, 0.7160518357432457, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9014545393453128, 2.098545460654689, 1, 0, 0.3004848464484374, 1.10931828101532, 0, -9.874414734376254, 1, 0.3004848464484374, 0.1123426867167529],
[0.8500876300640192, 2.149912369935982, 0, 0, 0.2833625433546729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9015747292235188, 2.098425270776483, 0, 0, 0.3005249097411727, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9982616166380434, 2.00173838336196, 1, 1, 0.3327538722126807, 1.001741410601172, 0.4995657815785495, -4.470033997751421, 0.889274860527467, 0.5547826049528284, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.7449411676828062, 2.14587822519365, 0, 0, 0.2576920472854468, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[1.000000000000001, 2.000000000000002, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.1123426867167529],
[0.9996500985774791, 2.000349901422525, 0, 1, 0.333216699525826, 0, 0.4999125399455676, 4.44988948151103, 0.666783300474174, 1, 0.1123426867167529]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node158":{
"Global MG94xREV":0.0005244271012632142,
"Nucleotide GTR":0.0005228077007461036,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "S", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "TCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node169":{
"Global MG94xREV":0.0005242307711016086,
"Nucleotide GTR":0.0005226119768406666,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "H", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAT", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node187":{
"Global MG94xREV":0.0005244976484551196,
"Nucleotide GTR":0.000522878030092366,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node20":{
"Global MG94xREV":0.0005241769903673165,
"Nucleotide GTR":0.000522558362178168,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node213":{
"Global MG94xREV":0.000524592555361846,
"Nucleotide GTR":0.0005229726439320601,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node235":{
"Global MG94xREV":0.0005243708326535697,
"Nucleotide GTR":0.0005227516058906673,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node243":{
"Global MG94xREV":1.703464776569788e-06,
"Nucleotide GTR":1.698204575993937e-06,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node248":{
"Global MG94xREV":0.0005241391755309445,
"Nucleotide GTR":0.0005225206641118205,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node251":{
"Global MG94xREV":0.000524527490215798,
"Nucleotide GTR":0.0005229077797034161,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node254":{
"Global MG94xREV":0.0005241438038556564,
"Nucleotide GTR":0.0005225252781445334,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "L", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CTA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node258":{
"Global MG94xREV":0.0005253988225473985,
"Nucleotide GTR":0.0005237764214112381,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "I", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATT", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node262":{
"Global MG94xREV":0.0005241404121495669,
"Nucleotide GTR":0.0005225218969118368,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node264":{
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node265":{
"Global MG94xREV":0.0005244637830424875,
"Nucleotide GTR":0.0005228442692541669,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node270":{
"Global MG94xREV":0.0005240675993057291,
"Nucleotide GTR":0.0005224493089098432,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node281":{
"Global MG94xREV":0.00052410202754687,
"Nucleotide GTR":0.0005224836308385698,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node282":{
"Global MG94xREV":0.0005244647096375819,
"Nucleotide GTR":0.0005228451929879894,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node294":{
"Global MG94xREV":0.0005244378846497432,
"Nucleotide GTR":0.0005228184508341596,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node300":{
"Global MG94xREV":0.0005248619661227125,
"Nucleotide GTR":0.0005232412227681005,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.000524285812435698,
"Nucleotide GTR":0.0005226668482103039,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node328":{
"Global MG94xREV":0.0005244015765885927,
"Nucleotide GTR":0.0005227822548901994,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node339":{
"Global MG94xREV":0.0005242809028653883,
"Nucleotide GTR":0.0005226619538004635,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node349":{
"Global MG94xREV":0.0005241742035470193,
"Nucleotide GTR":0.0005225555839634106,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node363":{
"Global MG94xREV":0.0003220796386175657,
"Nucleotide GTR":0.0003210850753463853,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node37":{
"Global MG94xREV":0.0005241819000700896,
"Nucleotide GTR":0.0005225632567200632,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.0005242776338799424,
"Nucleotide GTR":0.0005226586949094548,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node437":{
"Global MG94xREV":0.0005240569645454774,
"Nucleotide GTR":0.0005224387069891151,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"Global MG94xREV":0.0005242027429990842,
"Nucleotide GTR":0.000522584035287299,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node69":{
"Global MG94xREV":0.0005243111601158681,
"Nucleotide GTR":0.000522692117618306,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node74":{
"Global MG94xREV":0.000524044895879371,
"Nucleotide GTR":0.000522426675590351,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node75":{
"Global MG94xREV":0.000524310337587667,
"Nucleotide GTR":0.0005226912976300246,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node94":{
"Global MG94xREV":0.000524195809017184,
"Nucleotide GTR":0.0005225771227171349,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244245809580054,
"Nucleotide GTR":0.0005228051882234515,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "N", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AAC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406034_California_20200123_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001049389684867526,
"Nucleotide GTR":0.001046149230294848,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "S", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATT", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TCT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269708075,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058952486,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAT", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269429219,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058674496,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "I", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ATA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244900837908154,
"Nucleotide GTR":0.0005228704887873067,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCT", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244245809592742,
"Nucleotide GTR":0.0005228051882247165,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "S"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "AGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270006093,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059249588,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAT", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243709158172174,
"Nucleotide GTR":0.0005227516887975108,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "T", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "ACA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270038641,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059282031,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "F", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TTC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006078996174649437,
"Nucleotide GTR":0.0006060224586520165,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "N", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAC", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269708075,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058952486,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "I", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ATA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957682667,
"Nucleotide GTR":0.00052273791142407,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACG", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269834812,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059078835,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "C", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "TGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269676515,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058921022,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "F", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "TTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242805789044966,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308399445,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "T", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ACT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270037665,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059281054,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "I", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ATT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413693_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270006093,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059249588,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "V", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GTT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413693_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243570956663491,
"Nucleotide GTR":0.000522737911322467,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "V", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "GTT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "HY", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "YAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005240705712609322,
"Nucleotide GTR":0.0005224522716878206,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "D", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAT", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "SF", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TYC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTY", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414525_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACW", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414525_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240018305792919,
"Nucleotide GTR":0.0005223837432734237,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "L", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TTA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000525086486890877,
"Nucleotide GTR":0.0005234650502291366,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "S", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "AGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242805789266443,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308620231,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "P", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CCC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "AV", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GYT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244770363078606,
"Nucleotide GTR":0.0005228574815942243,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAC", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005247853558535013,
"Nucleotide GTR":0.000523164849066964,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "F", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTT", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005247708673568062,
"Nucleotide GTR":0.0005231504053099072,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTA", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246876811193035,
"Nucleotide GTR":0.0005230674759466883,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCT", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242496428824561,
"Nucleotide GTR":0.0005226307903465477,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTT", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241623292858059,
"Nucleotide GTR":0.0005225437463692277,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGG", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524913962655474,
"Nucleotide GTR":0.0005232930587385797,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "R", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "AGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243504399410822,
"Nucleotide GTR":0.0005227312761496945,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "K", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAA", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243646128845376,
"Nucleotide GTR":0.0005227454053279216,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAG", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005243570956663491,
"Nucleotide GTR":0.000522737911322467,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "D", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "GAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005242880978568317,
"Nucleotide GTR":0.0005226691265741896,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGC", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002120059411126014,
"Nucleotide GTR":0.002113512790445252,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "N", "V", "T", "C", "A", "K", "G", "I", "K", "E", "S", "G", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "R", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "AAT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GGA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GGT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "AGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240905309789465,
"Nucleotide GTR":0.0005224721697713817,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "R", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "AGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241644314551365,
"Nucleotide GTR":0.0005225458420471806,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "S", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "TCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242805789266443,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308620231,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTC", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246337488551687,
"Nucleotide GTR":0.0005230137102222626,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "Y", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TAC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240092298605386,
"Nucleotide GTR":0.0005223911197061196,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "T", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "ACC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524280578910944,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308463712,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCC", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244852906641995,
"Nucleotide GTR":0.0005228657104615886,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "Y", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "TAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957697921,
"Nucleotide GTR":0.000522737911425591,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "G", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GGA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241348653432995,
"Nucleotide GTR":0.0005225163672337855,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "G", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "GGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524635950338352,
"Nucleotide GTR":0.0005230159049073932,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "D", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAC", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005249952720301573,
"Nucleotide GTR":0.0005233741170346229,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "TI", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCA", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "AYT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242805789321469,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308675094,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAC", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240792553689429,
"Nucleotide GTR":0.000522460928979809,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "H", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CAT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245623206697512,
"Nucleotide GTR":0.0005229425026029449,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "I", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ATT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243186126904956,
"Nucleotide GTR":0.0005226995471798145,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "F", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "TTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269834812,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059078835,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "V", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GTA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005240729184223304,
"Nucleotide GTR":0.0005224546116013205,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "S", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "AGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244245812903562,
"Nucleotide GTR":0.0005228051885547762,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "S", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "AGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270094635,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059337849,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCT", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985290950339,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080129153,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "I", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ATT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244245809580054,
"Nucleotide GTR":0.0005228051882234515,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAA", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244985290894313,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080073306,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "V", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GTC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242805789321469,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308675094,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "A", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GCA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "SL", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TYA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270025062,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059268494,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "V", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GTT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417232_England_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241318585037676,
"Nucleotide GTR":0.0005225133696791994,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "Y", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "TAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417232_England_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243238766166193,
"Nucleotide GTR":0.0005227047948512395,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATT", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0005242572988310375,
"Nucleotide GTR":0.0005226384226540038,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242736564369271,
"Nucleotide GTR":0.0005226547297485535,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATT", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524334389712852,
"Nucleotide GTR":0.0005227152754836396,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGA", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246876828360196,
"Nucleotide GTR":0.0005230674776581036,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCT", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005246224838736083,
"Nucleotide GTR":0.0005230024800263116,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "TP", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "MCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005243193410247056,
"Nucleotide GTR":0.0005227002732649709,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241099009597436,
"Nucleotide GTR":0.0005224914799387998,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005250188087632887,
"Nucleotide GTR":0.0005233975810876856,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "D", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "GAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001049177228708343,
"Nucleotide GTR":0.001045937430187978,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGT", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985290950339,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080129153,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCT", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005243148580985716,
"Nucleotide GTR":0.0005226958041818529,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "I", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ATT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242409365739476,
"Nucleotide GTR":0.0005226221109226152,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "T", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "ACA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957540314,
"Nucleotide GTR":0.0005227379114098785,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "A", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "GCT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0005239772199389434,
"Nucleotide GTR":0.0005223592086293075,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "D", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAC", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002633147307273081,
"Nucleotide GTR":0.002625016300883911,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "F", "M", "F", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "T", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTA", "TTT", "ATG", "TTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "ACT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "AV", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GYC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417938_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "DY", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "KAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417939_California_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524587383009373,
"Nucleotide GTR":0.0005229674875515129,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "L", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CTA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524291235980993,
"Nucleotide GTR":0.0005226722550080052,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "V", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GTC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242409345037437,
"Nucleotide GTR":0.0005226221088588044,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTA", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244298589926073,
"Nucleotide GTR":0.0005228104499597884,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "F", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "TTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "EA", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GMG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957540314,
"Nucleotide GTR":0.0005227379114098785,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAG", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005256624684638289,
"Nucleotide GTR":0.0005240392532043476,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "S", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "-", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "TCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "---", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985290926877,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080105763,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "I", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ATA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240866262032845,
"Nucleotide GTR":0.0005224682770534408,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "C", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "TGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242805787177556,
"Nucleotide GTR":0.0005226616306537797,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAC", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524578125624825,
"Nucleotide GTR":0.0005229582587532314,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "N", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAT", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418687_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "LF", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "YTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418687_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "PL", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CYA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418691_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418710_England_20200316_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270006093,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059249588,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAT", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418710_England_20200316_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418722_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270082032,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059325289,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCT", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418722_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418729_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005241044878091441,
"Nucleotide GTR":0.000522486083503695,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "S", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "TCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418729_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418730_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418730_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418741_England_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005250864869027639,
"Nucleotide GTR":0.0005234650502409859,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "K", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AAG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418741_England_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418751_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269823945,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059067995,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "I", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ATA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418751_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418765_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243132177648087,
"Nucleotide GTR":0.000522694168913346,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "SG", "V", "Q", "T", "F", "F", "E", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "RGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "GAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418765_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243407053531128,
"Nucleotide GTR":0.0005227215716215696,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "V", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GTC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000524498527196277,
"Nucleotide GTR":0.0005228789061200215,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAT", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269708075,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058952486,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "F", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "TTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269834812,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059078835,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "V", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GTT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005244985290737734,
"Nucleotide GTR":0.0005228789079917207,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "Y", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "TAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243148599516395,
"Nucleotide GTR":0.0005226958060291988,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "V", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GTT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGT", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270138045,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059381129,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "L", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CTT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001049500842892937,
"Nucleotide GTR":0.001046260045070714,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "D", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "T", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GAC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "ACC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005244245809580054,
"Nucleotide GTR":0.0005228051882234515,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "K", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "AAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "HY", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "YAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245134156932552,
"Nucleotide GTR":0.0005228937486421836,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCT", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005241238121742365,
"Nucleotide GTR":0.0005225053481962692,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAT", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002021815211553752,
"Nucleotide GTR":0.0002015571963271568,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAT", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "TI", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "AYC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242749250140838,
"Nucleotide GTR":0.0005226559944084177,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242805789378355,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308731801,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACC", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAY", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAY", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243709145709871,
"Nucleotide GTR":0.000522751687555128,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "T", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "ACG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "YTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244245834379601,
"Nucleotide GTR":0.0005228051906957484,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "K", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AAA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957697921,
"Nucleotide GTR":0.000522737911425591,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAG", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241693971346392,
"Nucleotide GTR":0.0005225507923929523,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "A", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "GCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524357095669134,
"Nucleotide GTR":0.0005227379113252438,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "V", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "GTC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241734698777238,
"Nucleotide GTR":0.0005225548525596424,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "S", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AGT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATY", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005244985290939478,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080118316,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "S", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "TCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "PL", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CYA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "TI", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "AYT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005243646128479167,
"Nucleotide GTR":0.0005227454052914129,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAG", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243630072944567,
"Nucleotide GTR":0.0005227438046958094,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957527713,
"Nucleotide GTR":0.0005227379114086228,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "V", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "GTT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "TI", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "AYA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985291267329,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080445166,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "Y", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "TAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244245813074502,
"Nucleotide GTR":0.000522805188571817,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "K", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "AAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243223650359359,
"Nucleotide GTR":0.0005227032879382295,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "I", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAY", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242726280433731,
"Nucleotide GTR":0.0005226537045306192,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "Y", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "G", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TAC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "GGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "I", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ATA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0005241644314496193,
"Nucleotide GTR":0.0005225458420416814,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "S", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "TCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005244985290939478,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080118316,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "L", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TTA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005245533001221142,
"Nucleotide GTR":0.0005229335099102355,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "K", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "AAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524280746747473,
"Nucleotide GTR":0.0005226617981646311,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCT", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269708075,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058952486,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "F", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TTT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244210622651385,
"Nucleotide GTR":0.0005228016803961045,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "F", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TTC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269834812,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059078835,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "S", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "TCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005250188105007698,
"Nucleotide GTR":0.0005233975828198022,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "V", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "GTT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005245614685739588,
"Nucleotide GTR":0.0005229416531383747,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "C", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "TGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269460787,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058705956,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "C", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "TGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243364761244565,
"Nucleotide GTR":0.0005227173554525268,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "N", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAT", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420306_Alaska_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242805791669286,
"Nucleotide GTR":0.0005226616311015659,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGC", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420306_Alaska_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.000524456445528299,
"Nucleotide GTR":0.0005228369543977977,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "S", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "AGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269834812,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059078835,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTC", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005240705690848085,
"Nucleotide GTR":0.0005224522695184172,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "F", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTT", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243148602008354,
"Nucleotide GTR":0.0005226958062776253,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGT", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "L", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TTG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12":{
"Global MG94xREV":0.0005240785997066036,
"Nucleotide GTR":0.0005224602753421171,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "V", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GTC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270006093,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059249588,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCT", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420458_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "TI", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "AYT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420458_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420477_England_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "S", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "TCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420477_England_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420485_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957983285,
"Nucleotide GTR":0.0005227379114540393,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAG", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420485_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420488_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCY", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420488_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420489_England_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269834812,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059078835,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "F", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TTT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420489_England_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420492_England_20200320_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420492_England_20200320_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420500_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524280578910944,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308463712,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAC", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420500_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420509_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420509_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420510_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244669573834046,
"Nucleotide GTR":0.0005228474337929038,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "S", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "V", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "AGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GTC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420510_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420511_England_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "H", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAT", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420511_England_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420526_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "S", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "SRGC", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "TCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "NGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420526_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420527_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGY", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420527_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005242805789611265,
"Nucleotide GTR":0.0005226616308963997,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "T", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ACT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420539_Western_Australia_20200314_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005240980494273986,
"Nucleotide GTR":0.0005224796650033003,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "H", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "CAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420539_Western_Australia_20200314_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243570957864828,
"Nucleotide GTR":0.0005227379114422305,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "A", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "GCA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005250601825236646,
"Nucleotide GTR":0.0005234388270882861,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATC", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420640_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420656_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244320985770702,
"Nucleotide GTR":0.0005228126826285443,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "K", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AAG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420656_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420693_England_20200328_null_27":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "R", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CGT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420693_England_20200328_null_27",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420694_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005247598662539393,
"Nucleotide GTR":0.000523139438177809,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "L", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CTA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420694_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420702_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269866377,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059110301,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "P", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "CCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420702_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420729_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "V", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GTT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420729_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420734_England_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0005244245813116977,
"Nucleotide GTR":0.0005228051885760515,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAA", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420734_England_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420738_England_20200327_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269834812,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059078835,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTT", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420738_England_20200327_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420746_England_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005245441338667471,
"Nucleotide GTR":0.0005229243719597344,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATA", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420746_England_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420761_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241922414815626,
"Nucleotide GTR":0.0005225735661978562,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "V", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "GTC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420761_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "IV", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "RTT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420769_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "GV", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GKT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244321006923589,
"Nucleotide GTR":0.0005228126847373014,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "N", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "AAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985270006093,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059249588,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "S", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "TCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420825_Utah_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005224311241959323,
"Nucleotide GTR":0.0005208178871404109,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "L", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "CTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420825_Utah_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420840_SudKivu_20200320_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "C", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "TGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420840_SudKivu_20200320_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985271706322,
"Nucleotide GTR":0.0005228789060944556,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "F", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "TTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420910_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "EAGV", "I", "K", "E", "S", "V", "H", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GNA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAT", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420910_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005252559206700627,
"Nucleotide GTR":0.0005236339608066235,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420944_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005248340555224657,
"Nucleotide GTR":0.0005232133983541715,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "F", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "TTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420944_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005263834614907134,
"Nucleotide GTR":0.0005247580198465215,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCC", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244245834208674,
"Nucleotide GTR":0.0005228051906787078,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "S", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "AGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420983_Wales_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005242681228175694,
"Nucleotide GTR":0.0005226492132166919,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "I", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ATA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420983_Wales_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985291197561,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080375611,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACT", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421200_Li_ge_20200331_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATT", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421200_Li_ge_20200331_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421212_Li_ge_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269708075,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058952486,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCT", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421212_Li_ge_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244245834366922,
"Nucleotide GTR":0.0005228051906944839,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "S", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "AGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421250_Jiangxi_20200203_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421250_Jiangxi_20200203_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005242956724619834,
"Nucleotide GTR":0.0005226766777893997,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "Y", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "TAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCT", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_46":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "I", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "ATA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_46",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269792388,
"Nucleotide GTR":0.0005228789059036534,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAT", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "L", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CTA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421348_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005243351837769301,
"Nucleotide GTR":0.0005227160670956938,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "S", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "AGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421348_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421354_New_York_20200313_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0005241734698327051,
"Nucleotide GTR":0.0005225548525147639,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "V", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "GTG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421354_New_York_20200313_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000524421592923265,
"Nucleotide GTR":0.0005228022094155893,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "I", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ATT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421365_New_York_20200314_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0005244985291109036,
"Nucleotide GTR":0.0005228789080287352,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "L", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CTT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421365_New_York_20200314_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005241734719793905,
"Nucleotide GTR":0.0005225548546548191,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "E", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "GAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421418_New_York_20200318_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0005243148580817223,
"Nucleotide GTR":0.0005226958041650557,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "I", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ATT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421418_New_York_20200318_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005231710656578562,
"Nucleotide GTR":0.0005215555437059531,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "I", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATT", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_139":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "V", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "S", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "GTT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "TCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_139",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_110":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "-", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAC", "---", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_110",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421461_Portugal_20200320_null_99":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "D", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GAC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421461_Portugal_20200320_null_99",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421463_Portugal_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCT", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421463_Portugal_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005244321006923589,
"Nucleotide GTR":0.0005228126847373014,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTA", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005244985269746205,
"Nucleotide GTR":0.0005228789058990496,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "I", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ATT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_69":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAT", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_69",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_520":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "I", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ATC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_520",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_2828":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["A", "Y", "T", "R", "Y", "V", "D", "N", "N", "F", "C", "G", "P", "D", "G", "Y", "P", "L", "E", "C", "I", "K", "D", "L", "L", "A", "R", "A", "G", "K", "A", "S", "C", "T", "L", "S", "E", "Q", "L", "D", "F", "I", "D", "T", "K", "R", "G", "V", "Y", "C", "C", "R", "E", "H", "E", "H", "E", "I", "A", "W", "Y", "T", "E", "R", "S", "E", "K", "S", "Y", "E", "L", "Q", "T", "P", "F", "E", "I", "K", "L", "A", "K", "K", "F", "D", "T", "F", "N", "G", "E", "C", "P", "N", "F", "V", "F", "P", "L", "N", "S", "I", "I", "K", "T", "I", "Q", "P", "R", "V", "E", "K", "K", "K", "L", "D", "G", "F", "M", "G", "R", "I", "R", "S", "V", "Y", "P", "V", "A", "S", "P", "N", "E", "C", "N", "Q", "M", "C", "L", "S", "T", "L", "M", "K", "C", "D", "H", "C", "G", "E", "T", "S", "W", "Q", "T", "G", "D", "F", "V", "K", "A", "T", "C", "E", "F", "C", "G", "T", "E", "N", "L", "T", "K", "E", "G", "A", "T", "T", "C", "G", "Y", "L", "P", "Q", "N", "A", "V", "V", "K", "I", "Y", "C", "P", "A", "C", "H", "N", "S", "E", "V", "G", "P", "E", "H", "S", "L", "A", "E", "Y", "H", "N", "E", "S", "G", "L", "K", "T", "I", "L", "R", "K", "G", "G", "R", "T", "I", "A", "F", "G", "G", "C", "V", "F", "S", "Y", "V", "G", "C", "H", "N", "K", "C", "A", "Y", "W", "V", "P", "R", "A", "S", "A", "N", "I", "G", "C", "N", "H", "T", "G", "V", "V", "G", "E", "G", "S", "E", "G", "L", "N", "D", "N", "L", "L", "E", "I", "L", "Q", "K", "E", "K", "V", "N", "I", "N", "I", "V", "G", "D", "F", "K", "L", "N", "E", "E", "I", "A", "I", "I", "L", "A", "S", "F", "S", "A", "S", "T", "S", "A", "F", "V", "E", "T", "V", "K", "G", "L", "D", "Y", "K", "A", "F", "K", "Q", "I", "V", "E", "S", "C", "G", "N", "F", "K", "V", "T", "K", "G", "K", "A", "K", "K", "G", "A", "W", "N", "I", "G", "E", "Q", "K", "S", "I", "L", "S", "P", "L", "Y", "A", "F", "A", "S", "E", "A", "A", "R", "V", "V", "R", "S", "I", "F", "S", "R", "T", "L", "E", "T", "A", "Q", "N", "S", "V", "R", "V", "L", "Q", "K", "A", "A", "I", "T", "I", "L", "D", "G", "I", "S", "Q", "Y", "S", "L", "R", "L", "I", "D", "A", "M", "M", "F", "T", "S", "D", "L", "A", "T", "N", "N", "L", "V", "V", "M", "A", "Y", "I", "T", "G", "G", "V", "V", "Q", "L", "T", "S", "Q", "W", "L", "T", "N", "I", "F", "G", "T", "V", "Y", "E", "K", "L", "K", "P", "V", "L", "D", "W", "L", "E", "E", "K", "F", "K", "E", "G", "V", "E", "F", "L", "R", "D", "G", "W", "E", "I", "V", "K", "F", "I", "S", "T", "C", "A", "C", "E", "I", "V", "G", "G", "Q", "I", "V", "T", "C", "A", "K", "E", "I", "K", "E", "S", "V", "Q", "T", "F", "F", "K", "L", "V", "N", "K", "F", "L", "A", "L", "C", "A", "D", "S", "I", "I", "I", "G", "G", "A", "K", "L", "K", "A", "L", "N", "L", "G", "E", "T", "F", "V", "T", "H", "S", "K", "G", "L", "Y", "R", "K", "C", "V", "K", "S", "R", "E", "E", "T", "G", "L", "L", "M", "P", "L", "K", "A", "P", "K", "E", "I", "I", "F", "L", "E", "G", "E", "T", "L", "P", "T", "E", "V", "L", "T", "E", "E", "V", "V", "L", "K", "T", "G", "D", "L", "Q", "P", "L", "E", "Q", "P", "T", "S", "E", "A", "V", "E", "A", "P", "L", "V", "G", "T", "P", "V", "C", "I", "N", "G", "L", "M", "L", "L", "E", "I", "K", "D", "T", "E", "K", "Y", "C", "A", "L", "A", "P", "N", "M", "M", "V", "T", "N", "N", "T", "F", "T", "L", "K", "G", "G"]
],
"codon": [
["GCA", "TAC", "ACT", "CGC", "TAT", "GTC", "GAT", "AAC", "AAC", "TTC", "TGT", "GGC", "CCT", "GAT", "GGC", "TAC", "CCT", "CTT", "GAG", "TGC", "ATT", "AAA", "GAC", "CTT", "CTA", "GCA", "CGT", "GCT", "GGT", "AAA", "GCT", "TCA", "TGC", "ACT", "TTG", "TCC", "GAA", "CAA", "CTG", "GAC", "TTT", "ATT", "GAC", "ACT", "AAG", "AGG", "GGT", "GTA", "TAC", "TGC", "TGC", "CGT", "GAA", "CAT", "GAG", "CAT", "GAA", "ATT", "GCT", "TGG", "TAC", "ACG", "GAA", "CGT", "TCT", "GAA", "AAG", "AGC", "TAT", "GAA", "TTG", "CAG", "ACA", "CCT", "TTT", "GAA", "ATT", "AAA", "TTG", "GCA", "AAG", "AAA", "TTT", "GAC", "ACC", "TTC", "AAT", "GGG", "GAA", "TGT", "CCA", "AAT", "TTT", "GTA", "TTT", "CCC", "TTA", "AAT", "TCC", "ATA", "ATC", "AAG", "ACT", "ATT", "CAA", "CCA", "AGG", "GTT", "GAA", "AAG", "AAA", "AAG", "CTT", "GAT", "GGC", "TTT", "ATG", "GGT", "AGA", "ATT", "CGA", "TCT", "GTC", "TAT", "CCA", "GTT", "GCG", "TCA", "CCA", "AAT", "GAA", "TGC", "AAC", "CAA", "ATG", "TGC", "CTT", "TCA", "ACT", "CTC", "ATG", "AAG", "TGT", "GAT", "CAT", "TGT", "GGT", "GAA", "ACT", "TCA", "TGG", "CAG", "ACG", "GGC", "GAT", "TTT", "GTT", "AAA", "GCC", "ACT", "TGC", "GAA", "TTT", "TGT", "GGC", "ACT", "GAG", "AAT", "TTG", "ACT", "AAA", "GAA", "GGT", "GCC", "ACT", "ACT", "TGT", "GGT", "TAC", "TTA", "CCC", "CAA", "AAT", "GCT", "GTT", "GTT", "AAA", "ATT", "TAT", "TGT", "CCA", "GCA", "TGT", "CAC", "AAT", "TCA", "GAA", "GTA", "GGA", "CCT", "GAG", "CAT", "AGT", "CTT", "GCC", "GAA", "TAC", "CAT", "AAT", "GAA", "TCT", "GGC", "TTG", "AAA", "ACC", "ATT", "CTT", "CGT", "AAG", "GGT", "GGT", "CGC", "ACT", "ATT", "GCC", "TTT", "GGA", "GGC", "TGT", "GTG", "TTC", "TCT", "TAT", "GTT", "GGT", "TGC", "CAT", "AAC", "AAG", "TGT", "GCC", "TAT", "TGG", "GTT", "CCA", "CGT", "GCT", "AGC", "GCT", "AAC", "ATA", "GGT", "TGT", "AAC", "CAT", "ACA", "GGT", "GTT", "GTT", "GGA", "GAA", "GGT", "TCC", "GAA", "GGT", "CTT", "AAT", "GAC", "AAC", "CTT", "CTT", "GAA", "ATA", "CTC", "CAA", "AAA", "GAG", "AAA", "GTC", "AAC", "ATC", "AAT", "ATT", "GTT", "GGT", "GAC", "TTT", "AAA", "CTT", "AAT", "GAA", "GAG", "ATC", "GCC", "ATT", "ATT", "TTG", "GCA", "TCT", "TTT", "TCT", "GCT", "TCC", "ACA", "AGT", "GCT", "TTT", "GTG", "GAA", "ACT", "GTG", "AAA", "GGT", "TTG", "GAT", "TAT", "AAA", "GCA", "TTC", "AAA", "CAA", "ATT", "GTT", "GAA", "TCC", "TGT", "GGT", "AAT", "TTT", "AAA", "GTT", "ACA", "AAA", "GGA", "AAA", "GCT", "AAA", "AAA", "GGT", "GCC", "TGG", "AAT", "ATT", "GGT", "GAA", "CAG", "AAA", "TCA", "ATA", "CTG", "AGT", "CCT", "CTT", "TAT", "GCA", "TTT", "GCA", "TCA", "GAG", "GCT", "GCT", "CGT", "GTT", "GTA", "CGA", "TCA", "ATT", "TTC", "TCC", "CGC", "ACT", "CTT", "GAA", "ACT", "GCT", "CAA", "AAT", "TCT", "GTG", "CGT", "GTT", "TTA", "CAG", "AAG", "GCC", "GCT", "ATA", "ACA", "ATA", "CTA", "GAT", "GGA", "ATT", "TCA", "CAG", "TAT", "TCA", "CTG", "AGA", "CTC", "ATT", "GAT", "GCT", "ATG", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "GAT", "TTG", "GCT", "ACT", "AAC", "AAT", "CTA", "GTT", "GTA", "ATG", "GCC", "TAC", "ATT", "ACA", "GGT", "GGT", "GTT", "GTT", "CAG", "TTG", "ACT", "TCG", "CAG", "TGG", "CTA", "ACT", "AAC", "ATC", "TTT", "GGC", "ACT", "GTT", "TAT", "GAA", "AAA", "CTC", "AAA", "CCC", "GTC", "CTT", "GAT", "TGG", "CTT", "GAA", "GAG", "AAG", "TTT", "AAG", "GAA", "GGT", "GTA", "GAG", "TTT", "CTT", "AGA", "GAC", "GGT", "TGG", "GAA", "ATT", "GTT", "AAA", "TTT", "ATC", "TCA", "ACC", "TGT", "GCT", "TGT", "GAA", "ATT", "GTC", "GGT", "GGA", "CAA", "ATT", "GTC", "ACC", "TGT", "GCA", "AAG", "GAA", "ATT", "AAG", "GAG", "AGT", "GTT", "CAG", "ACA", "TTC", "TTT", "AAG", "CTT", "GTA", "AAT", "AAA", "TTT", "TTG", "GCT", "TTG", "TGT", "GCT", "GAC", "TCT", "ATC", "ATT", "ATT", "GGT", "GGA", "GCT", "AAA", "CTT", "AAA", "GCC", "TTG", "AAT", "TTA", "GGT", "GAA", "ACA", "TTT", "GTC", "ACG", "CAC", "TCA", "AAG", "GGA", "TTG", "TAC", "AGA", "AAG", "TGT", "GTT", "AAA", "TCC", "AGA", "GAA", "GAA", "ACT", "GGC", "CTA", "CTC", "ATG", "CCT", "CTA", "AAA", "GCC", "CCA", "AAA", "GAA", "ATT", "ATC", "TTC", "TTA", "GAG", "GGA", "GAA", "ACA", "CTT", "CCC", "ACA", "GAA", "GTG", "TTA", "ACA", "GAG", "GAA", "GTT", "GTC", "TTG", "AAA", "ACT", "GGT", "GAT", "TTA", "CAA", "CCA", "TTA", "GAA", "CAA", "CCT", "ACT", "AGT", "GAA", "GCT", "GTT", "GAA", "GCT", "CCA", "TTG", "GTT", "GGT", "ACA", "CCA", "GTT", "TGT", "ATT", "AAC", "GGG", "CTT", "ATG", "TTG", "CTC", "GAA", "ATC", "AAA", "GAC", "ACA", "GAA", "AAG", "TAC", "TGT", "GCC", "CTT", "GCA", "CCT", "AAT", "ATG", "ATG", "GTA", "ACA", "AAC", "AAT", "ACC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "GGC", "GGT"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_2828",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500, 501, 502, 503, 504, 505, 506, 507, 508, 509, 510, 511, 512, 513, 514, 515, 516, 517, 518, 519, 520, 521, 522, 523, 524, 525, 526, 527, 528, 529, 530, 531, 532, 533, 534, 535, 536, 537, 538, 539, 540, 541, 542, 543, 544, 545, 546, 547, 548, 549, 550, 551, 552, 553, 554, 555, 556, 557, 558, 559, 560, 561, 562, 563, 564, 565, 566, 567, 568, 569, 570, 571, 572, 573, 574, 575, 576, 577, 578, 579, 580, 581, 582, 583, 584, 585, 586, 587, 588, 589, 590, 591, 592, 593, 594, 595, 596, 597, 598, 599, 600, 601, 602, 603, 604, 605, 606, 607, 608, 609, 610, 611, 612, 613, 614, 615, 616, 617, 618, 619, 620, 621, 622, 623, 624, 625, 626, 627, 628, 629, 630, 631, 632, 633, 634, 635, 636, 637]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":9365.089049613664,
"Equilibrium frequencies": [
[0.03084384564187223],
[0.01739853697484525],
[0.01458119299622431],
[0.0391004142967103],
[0.01905364340714885],
[0.01074786598188517],
[0.009007464731431278],
[0.02415410061804734],
[0.01597751986913136],
[0.00901267220167987],
[0.007553250768981335],
[0.02025453160318161],
[0.02523822192088497],
[0.01423649120697691],
[0.01193117709713791],
[0.03199422486666995],
[0.01554633596121258],
[0.008769448018418531],
[0.00734941186214623],
[0.01970792435992622],
[0.009603677347242066],
[0.005417286072578479],
[0.00454006528561735],
[0.01217447938914997],
[0.008053207586257001],
[0.004542690025830766],
[0.003807092520734822],
[0.01020896540256922],
[0.01272091300162211],
[0.007175670562689192],
[0.006013714687802205],
[0.01612616579563588],
[0.03418965346478631],
[0.01928585549516202],
[0.01616289814935729],
[0.04334185920445929],
[0.02112050076037429],
[0.01191374829433604],
[0.009984555795657473],
[0.02677423365014908],
[0.01771069256068228],
[0.009990328149899377],
[0.008372594952087404],
[0.02245165614706103],
[0.02797595577287597],
[0.01578080459137821],
[0.01322541991405775],
[0.03546482088410219],
[0.01549157289756882],
[0.03481481915855268],
[0.01696527163363708],
[0.009569847717219061],
[0.008020202888955203],
[0.02150669398471194],
[0.008024839595195768],
[0.006725377833232029],
[0.01803453665618286],
[0.0224719903321576],
[0.0126761026894011],
[0.01062346219232951],
[0.02848750257218884]
],
"Log Likelihood":-4403.018017467271,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[1.266831317659953, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":279
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":9941.366663052253,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2983641871423763],
[0.1841052395377539],
[0.2141467519353753],
[0.3033838213844946]
],
"Log Likelihood":-4499.184303489583,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.227779082202706,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1034528844090004,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.026331166597941,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.222182127576611,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.1927677118391379
},
"display order":0,
"estimated parameters":471
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-04-08/sequences.nsp2.compressed.fas",
"number of sequences":233,
"number of sites":638,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1,epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1,epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2,(epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1)Node448,epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1,epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2,epi_isl_418751_England_20200318_null_1,epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3,epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2,epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1,epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1,epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1,epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1,epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1,(epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1,epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4)Node437,epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4,epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_3,epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1,epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1,epi_isl_418710_England_20200316_null_2,epi_isl_418722_England_20200317_null_1,epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1,(epi_isl_420509_England_20200323_null_1,epi_isl_420510_England_20200323_null_1)Node426,epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1,epi_isl_420734_England_20200327_null_3,epi_isl_420738_England_20200327_null_6,epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1,epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1,epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1,epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1,epi_isl_406034_California_20200123_null_1,epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1,epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1,epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1,epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1,epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1,epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_5,epi_isl_420306_Alaska_20200318_null_1,epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2,(epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1,epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1)Node363,epi_isl_414525_England_20200302_null_1,epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1,epi_isl_420527_England_20200327_null_2,epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1,epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_418687_England_20200317_null_1,epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1,epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1,(epi_isl_420477_England_20200318_null_6,epi_isl_420526_England_20200327_null_1)Node158,epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1,epi_isl_414483_USA_20200217_null_1,epi_isl_420769_England_20200331_null_1,epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1,epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_2828,epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1,(epi_isl_420511_England_20200323_null_7,epi_isl_420910_England_20200325_null_1)Node169,epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1,(epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1,epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2)Node258,epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2,(epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1,epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1)Node254,(epi_isl_413609_USA_20200221_null_1,epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1)Node251,(epi_isl_421348_New_York_20200317_null_1,epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1,epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1,(epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1,epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1)Node235,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_520,epi_isl_417939_California_20200318_null_1,epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_417938_California_20200318_null_1,epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1,epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1,epi_isl_421354_New_York_20200313_null_4,epi_isl_421418_New_York_20200318_null_6,epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3,epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1,epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2,epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1,epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1,epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1,epi_isl_420702_England_20200327_null_2,epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1,epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1,(epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6)Node213,epi_isl_420761_England_20200325_null_1,epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4,epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1,epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1,(epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1,epi_isl_420825_Utah_20200325_null_5)Node243,epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1)Node187,(epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1,epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1)Node248,(epi_isl_418730_England_20200318_null_3,epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1)Node262,(epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_69)Node265,(epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7,epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1,epi_isl_421200_Li_ge_20200331_null_11)Node294,(epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6,epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_46,epi_isl_420539_Western_Australia_20200314_null_3,epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1,epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1,epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8)Node270,((epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2,epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_420840_SudKivu_20200320_null_13,epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1,epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1)Node282,epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1)Node281,(epi_isl_420458_England_20200311_null_1,epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1,epi_isl_420944_Wales_20200321_null_1,epi_isl_420640_England_20200323_null_2,epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1,epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_110,epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1,epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5,epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1,epi_isl_418741_England_20200318_null_2,epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1)Node300,(epi_isl_420943_Wales_20200321_null_5,epi_isl_421250_Jiangxi_20200203_null_6,epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1)Node321,epi_isl_414482_USA_20200218_null_1,(epi_isl_418691_England_20200317_null_1,epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1,epi_isl_421461_Portugal_20200320_null_99,epi_isl_420488_England_20200320_null_1,epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1,epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1)Node328,(epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1,epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1)Node339,epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1,(epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2)Node349,epi_isl_417232_England_20200304_null_1,epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1,epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1,epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1,epi_isl_420485_England_20200318_null_1,epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1,epi_isl_420656_England_20200325_null_1,epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5,epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1,epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1,epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1,epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3,epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1,epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1,epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1,epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1,epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3,epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1,epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5,epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1,epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4,epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2,epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1,epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2,epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9,(epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2,epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2)Node20,epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2,epi_isl_413693_China_20200101_null_1,epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4,epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3,epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12,(epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1,epi_isl_420729_England_20200328_null_1)Node37,epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5,epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1,epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1,epi_isl_421365_New_York_20200314_null_5,epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2,epi_isl_421212_Li_ge_20200331_null_1,epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1,epi_isl_418729_England_20200318_null_3,epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2,epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5,epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1,epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1,epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1,epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1,epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1,epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1,epi_isl_420489_England_20200320_null_2,epi_isl_420500_England_20200322_null_1,epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1,epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1,(epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1,epi_isl_416675_USA_20200311_null_1,epi_isl_420693_England_20200328_null_27)Node69,((epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3,epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5,epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_139,epi_isl_420746_England_20200325_null_2,epi_isl_420694_England_20200328_null_2,epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1,epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1,epi_isl_418765_England_20200318_null_1,epi_isl_420983_Wales_20200323_null_2)Node75,epi_isl_420492_England_20200320_null_17)Node74,(epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1,epi_isl_421463_Portugal_20200320_null_4)Node94,epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node158":"test",
"Node169":"test",
"Node187":"test",
"Node20":"test",
"Node213":"test",
"Node235":"test",
"Node243":"test",
"Node248":"test",
"Node251":"test",
"Node254":"test",
"Node258":"test",
"Node262":"test",
"Node265":"test",
"Node270":"test",
"Node281":"test",
"Node282":"test",
"Node294":"test",
"Node300":"test",
"Node321":"test",
"Node328":"test",
"Node339":"test",
"Node349":"test",
"Node363":"test",
"Node37":"test",
"Node426":"test",
"Node437":"test",
"Node448":"test",
"Node69":"test",
"Node74":"test",
"Node75":"test",
"Node94":"test",
"epi_isl_406034_California_20200123_null_1":"test",
"epi_isl_406592_Guandong_20200113_null_1":"test",
"epi_isl_408478_Chongqinq_20200121_null_1":"test",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"test",
"epi_isl_410545_Rome_20200129_null_1":"test",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_412028_Hong_Kong_20200122_null_1":"test",
"epi_isl_412869_Seoul_20200130_null_1":"test",
"epi_isl_412871_Seoul_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"test",
"epi_isl_413016_Sao_Paulo_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413018_South_Korea_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_413021_Zurich_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_413485_Anhui_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_413522_Kerala_20200127_null_1":"test",
"epi_isl_413570_Diemen_20200228_null_1":"test",
"epi_isl_413609_USA_20200221_null_1":"test",
"epi_isl_413693_China_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_413851_Guangdong_20200130_null_2":"test",
"epi_isl_413855_Guangdong_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_414461_Utrecht_20200304_null_3":"test",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"test",
"epi_isl_414483_USA_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_414525_England_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_414532_Noord_Brabant_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_414553_Utrecht_20200309_null_5":"test",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"test",
"epi_isl_414579_Santiago_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_414630_Hauts_de_France_20200303_null_1":"test",
"epi_isl_415485_Netherlands_20200312_null_1":"test",
"epi_isl_415492_Netherlands_20200310_null_4":"test",
"epi_isl_415509_Noord_Brabant_20200101_null_1":"test",
"epi_isl_415510_Noord_Brabant_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_415579_British_Columbia_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_415585_British_Columbia_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_415590_British_Columbia_20200305_null_1":"test",
"epi_isl_415615_Washington_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_416334_Shanghai_20200206_null_1":"test",
"epi_isl_416342_Shanghai_20200204_null_1":"test",
"epi_isl_416348_Shanghai_20200206_null_3":"test",
"epi_isl_416350_Shanghai_20200129_null_5":"test",
"epi_isl_416360_Shanghai_20200201_null_1":"test",
"epi_isl_416373_Shanghai_20200207_null_1":"test",
"epi_isl_416382_Shanghai_20200208_null_1":"test",
"epi_isl_416386_Shanghai_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_416408_Shanghai_20200212_null_1":"test",
"epi_isl_416409_Shanghai_20200202_null_1":"test",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_416480_Tbilisi_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_416509_Bretagne_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_416541_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416543_Dasman_20200302_null_1":"test",
"epi_isl_416605_unknown_20200216_null_1":"test",
"epi_isl_416675_USA_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_416691_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416700_Washington_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_416748_ARA_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_416907_Selangor_20200220_null_1":"test",
"epi_isl_417012_Li_ge_20200308_null_2":"test",
"epi_isl_417015_Li_ge_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_417028_Utah_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_417030_New_South_Wales_20200124_null_1":"test",
"epi_isl_417076_Washington_20200302_null_2":"test",
"epi_isl_417149_Washington_20200228_null_2":"test",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"test",
"epi_isl_417189_Minnesota_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_417200_Wisconsin_20200321_null_2":"test",
"epi_isl_417212_Otago_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_417232_England_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417338_ARA_20200307_null_1":"test",
"epi_isl_417398_New_South_Wales_20200311_null_7":"test",
"epi_isl_417409_New_South_Wales_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417432_Cork_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417448_Washington_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417483_Oslo_20200227_null_1":"test",
"epi_isl_417521_Taoyuan_20200310_null_6":"test",
"epi_isl_417615_Reykjavik_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417666_Reykjavik_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417668_Reykjavik_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_417672_Reykjavik_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_3":"test",
"epi_isl_417715_Reykjavik_20200304_null_1":"test",
"epi_isl_417755_Reykjavik_20200313_null_2":"test",
"epi_isl_417822_Reykjavik_20200316_null_9":"test",
"epi_isl_417877_Kostoliste_20200306_null_1":"test",
"epi_isl_417919_Kuala_Lumpur_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_417938_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_417939_California_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418042_Idaho_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418071_Washington_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418184_Wisconsin_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418237_Hauts_de_France_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_418259_Abruzzo_20200314_null_1":"test",
"epi_isl_418331_Ontario_20200308_null_1":"test",
"epi_isl_418379_Ontario_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418385_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418389_Finland_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418412_ARA_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_418650_Li_ge_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418687_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418710_England_20200316_null_2":"test",
"epi_isl_418722_England_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_418729_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418730_England_20200318_null_3":"test",
"epi_isl_418741_England_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_418751_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418765_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_418800_Gierle_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_418809_Tokyo_20200201_null_4":"test",
"epi_isl_418856_British_Columbia_20200313_null_1":"test",
"epi_isl_418899_Washington_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_418938_Washington_20200324_null_4":"test",
"epi_isl_418964_Utah_20200314_null_2":"test",
"epi_isl_418993_Singapore_20200129_null_2":"test",
"epi_isl_419226_Hong_Kong_20200213_null_1":"test",
"epi_isl_419229_Hong_Kong_20200217_null_1":"test",
"epi_isl_419251_Hong_Kong_20200226_null_4":"test",
"epi_isl_419453_Wales_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_419499_Wales_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419513_Connecticut_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_419524_Connecticut_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419532_Duesseldorf_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419552_Duesseldorf_20200316_null_3":"test",
"epi_isl_419556_Georgia_20200229_null_2":"test",
"epi_isl_419587_Luxembourg_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_419589_Luxembourg_20200315_null_1":"test",
"epi_isl_419669_Austria_20200316_null_1":"test",
"epi_isl_419673_Austria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419685_Comunitat_Valenciana_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419733_Victoria_20200131_null_1":"test",
"epi_isl_419746_Victoria_20200310_null_1":"test",
"epi_isl_419816_Victoria_20200311_null_2":"test",
"epi_isl_419818_Victoria_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_419822_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419860_Victoria_20200318_null_5":"test",
"epi_isl_419864_Victoria_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_419920_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419922_Victoria_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_419923_Victoria_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_419929_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419932_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419935_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419944_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419946_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419953_Victoria_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_419961_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419979_Victoria_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_419999_Victoria_20200323_null_6":"test",
"epi_isl_420005_Victoria_20200324_null_8":"test",
"epi_isl_420032_Kinshasa_20200322_null_5":"test",
"epi_isl_420057_Hauts_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420062_Ile_de_France_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420115_Comunitat_Valenciana_20200309_null_1":"test",
"epi_isl_420184_South_Yorkshire_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420193_South_Yorkshire_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420239_South_Yorkshire_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420269_South_Yorkshire_20200323_null_5":"test",
"epi_isl_420279_South_Yorkshire_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_420301_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420306_Alaska_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420319_Montigny_le_Tilleul_20200304_null_2":"test",
"epi_isl_420322_Elsene_20200305_null_4":"test",
"epi_isl_420379_Tienen_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420417_Saint_Ghislain_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_420425_Montigny_le_Tilleul_20200324_null_2":"test",
"epi_isl_420455_Hong_Kong_20200304_null_12":"test",
"epi_isl_420456_Western_Australia_20200222_null_3":"test",
"epi_isl_420458_England_20200311_null_1":"test",
"epi_isl_420477_England_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_420485_England_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_420488_England_20200320_null_1":"test",
"epi_isl_420489_England_20200320_null_2":"test",
"epi_isl_420492_England_20200320_null_17":"test",
"epi_isl_420500_England_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420509_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420510_England_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420511_England_20200323_null_7":"test",
"epi_isl_420526_England_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_420527_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420537_Western_Australia_20200313_null_3":"test",
"epi_isl_420539_Western_Australia_20200314_null_3":"test",
"epi_isl_420610_ARA_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420640_England_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_420656_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420693_England_20200328_null_27":"test",
"epi_isl_420694_England_20200328_null_2":"test",
"epi_isl_420702_England_20200327_null_2":"test",
"epi_isl_420729_England_20200328_null_1":"test",
"epi_isl_420734_England_20200327_null_3":"test",
"epi_isl_420738_England_20200327_null_6":"test",
"epi_isl_420746_England_20200325_null_2":"test",
"epi_isl_420761_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420769_England_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":"test",
"epi_isl_420797_Texas_20200301_null_1":"test",
"epi_isl_420807_Utah_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420825_Utah_20200325_null_5":"test",
"epi_isl_420840_SudKivu_20200320_null_13":"test",
"epi_isl_420879_Queensland_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420910_England_20200325_null_1":"test",
"epi_isl_420943_Wales_20200321_null_5":"test",
"epi_isl_420944_Wales_20200321_null_1":"test",
"epi_isl_420970_Wales_20200322_null_1":"test",
"epi_isl_420981_Wales_20200323_null_1":"test",
"epi_isl_420983_Wales_20200323_null_2":"test",
"epi_isl_421178_Madrid_20200327_null_1":"test",
"epi_isl_421200_Li_ge_20200331_null_11":"test",
"epi_isl_421212_Li_ge_20200331_null_1":"test",
"epi_isl_421239_Jiangxi_20200126_null_1":"test",
"epi_isl_421250_Jiangxi_20200203_null_6":"test",
"epi_isl_421251_Jiangxi_20200203_null_1":"test",
"epi_isl_421262_Jiangxi_20200129_null_46":"test",
"epi_isl_421301_Wisconsin_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421336_Wisconsin_20200324_null_1":"test",
"epi_isl_421348_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421354_New_York_20200313_null_4":"test",
"epi_isl_421362_New_York_20200317_null_1":"test",
"epi_isl_421365_New_York_20200314_null_5":"test",
"epi_isl_421409_New_York_20200318_null_1":"test",
"epi_isl_421418_New_York_20200318_null_6":"test",
"epi_isl_421419_New_York_20200318_null_2":"test",
"epi_isl_421446_Portugal_20200318_null_139":"test",
"epi_isl_421459_Portugal_20200320_null_110":"test",
"epi_isl_421461_Portugal_20200320_null_99":"test",
"epi_isl_421463_Portugal_20200320_null_4":"test",
"epi_isl_421465_Portugal_20200319_null_1":"test",
"epi_isl_421487_Portugal_20200322_null_2":"test",
"epi_isl_421510_Hauts_de_France_20200323_null_69":"test",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_520":"test",
"epi_isl_421519_Comunitat_Valenciana_20200321_null_2828":"test"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":4
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":8
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":13
}
}
}